MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_008340	CTG	2	6	2443235	2443240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55002	NC_008340	GTG	2	6	2443301	2443306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321297
55003	NC_008340	CTG	2	6	2443310	2443315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55004	NC_008340	CTCGG	2	10	2443364	2443373	0 %	20 %	40 %	40 %	114321297
55005	NC_008340	CTG	2	6	2443376	2443381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55006	NC_008340	GTG	2	6	2443382	2443387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321297
55007	NC_008340	GGA	2	6	2443402	2443407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321297
55008	NC_008340	CTT	2	6	2443417	2443422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321297
55009	NC_008340	GGC	2	6	2443501	2443506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55010	NC_008340	GCG	2	6	2443521	2443526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55011	NC_008340	GCGG	2	8	2443546	2443553	0 %	0 %	75 %	25 %	114321297
55012	NC_008340	GTG	2	6	2443562	2443567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321297
55013	NC_008340	CCGG	2	8	2443614	2443621	0 %	0 %	50 %	50 %	114321297
55014	NC_008340	CTC	2	6	2443622	2443627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321297
55015	NC_008340	CAAC	2	8	2443699	2443706	50 %	0 %	0 %	50 %	114321297
55016	NC_008340	CGC	2	6	2443707	2443712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321297
55017	NC_008340	GGT	2	6	2443750	2443755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321297
55018	NC_008340	GAC	2	6	2443775	2443780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55019	NC_008340	GCG	2	6	2443781	2443786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55020	NC_008340	CTGG	2	8	2443844	2443851	0 %	25 %	50 %	25 %	114321297
55021	NC_008340	CAC	2	6	2443856	2443861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321297
55022	NC_008340	CAT	2	6	2443870	2443875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321297
55023	NC_008340	TGA	2	6	2443935	2443940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321297
55024	NC_008340	TGG	2	6	2444070	2444075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321297
55025	NC_008340	G	6	6	2444078	2444083	0 %	0 %	100 %	0 %	114321297
55026	NC_008340	TGA	2	6	2444091	2444096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321297
55027	NC_008340	GC	3	6	2444146	2444151	0 %	0 %	50 %	50 %	114321297
55028	NC_008340	TC	3	6	2444188	2444193	0 %	50 %	0 %	50 %	114321297
55029	NC_008340	GGC	2	6	2444197	2444202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55030	NC_008340	G	7	7	2444219	2444225	0 %	0 %	100 %	0 %	114321297
55031	NC_008340	TCC	2	6	2444256	2444261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321297
55032	NC_008340	TGC	2	6	2444274	2444279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55033	NC_008340	TGC	2	6	2444310	2444315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321297
55034	NC_008340	GGC	2	6	2444342	2444347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55035	NC_008340	TTC	2	6	2444348	2444353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321297
55036	NC_008340	CTA	2	6	2444356	2444361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321297
55037	NC_008340	GCG	2	6	2444375	2444380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321297
55038	NC_008340	CTG	2	6	2444463	2444468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321298
55039	NC_008340	CGT	2	6	2444474	2444479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321298
55040	NC_008340	CACCG	2	10	2444480	2444489	20 %	0 %	20 %	60 %	114321298
55041	NC_008340	ACC	2	6	2444493	2444498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321298
55042	NC_008340	CTC	2	6	2444541	2444546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321298
55043	NC_008340	ATC	2	6	2444559	2444564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321298
55044	NC_008340	GC	3	6	2444629	2444634	0 %	0 %	50 %	50 %	114321298
55045	NC_008340	GCT	2	6	2444678	2444683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321298
55046	NC_008340	CTT	2	6	2444691	2444696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321298
55047	NC_008340	TCA	2	6	2444743	2444748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321298
55048	NC_008340	TGC	2	6	2444794	2444799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321298
55049	NC_008340	CTC	2	6	2444868	2444873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321298
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55051	NC_008340	GCT	2	6	2445311	2445316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321299
55052	NC_008340	CG	3	6	2445336	2445341	0 %	0 %	50 %	50 %	114321299
55053	NC_008340	GGCC	2	8	2445344	2445351	0 %	0 %	50 %	50 %	114321299
55054	NC_008340	GCC	2	6	2445402	2445407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321299
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55056	NC_008340	CGA	2	6	2445442	2445447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321299
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55058	NC_008340	CTGA	2	8	2445495	2445502	25 %	25 %	25 %	25 %	114321299
55059	NC_008340	CAGG	2	8	2445522	2445529	25 %	0 %	50 %	25 %	114321299
55060	NC_008340	GACCTG	2	12	2445555	2445566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321299
55061	NC_008340	GTG	2	6	2445630	2445635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321299
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55063	NC_008340	GAC	2	6	2445651	2445656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321299
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55067	NC_008340	GCCG	2	8	2445851	2445858	0 %	0 %	50 %	50 %	114321299
55068	NC_008340	GGA	2	6	2445972	2445977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321300
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55070	NC_008340	CAG	2	6	2446005	2446010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321300
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55081	NC_008340	CGA	2	6	2446670	2446675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321300
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55103	NC_008340	ACG	2	6	2447488	2447493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321301
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55106	NC_008340	CAG	2	6	2447639	2447644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321301
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55110	NC_008340	TGA	2	6	2447731	2447736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321301
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55116	NC_008340	CCCG	2	8	2448023	2448030	0 %	0 %	25 %	75 %	114321301
55117	NC_008340	CCG	2	6	2448063	2448068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321301
55118	NC_008340	GCT	2	6	2448118	2448123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321301
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55145	NC_008340	CAAGT	2	10	2449629	2449638	40 %	20 %	20 %	20 %	114321302
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55147	NC_008340	ATT	2	6	2449692	2449697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114321302
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55228	NC_008340	CGT	2	6	2453179	2453184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321306
55229	NC_008340	AGC	3	9	2453217	2453225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321306
55230	NC_008340	GCC	2	6	2453226	2453231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321306
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55451	NC_008340	CGG	2	6	2461784	2461789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321315
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55464	NC_008340	GCC	2	6	2462187	2462192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321315
55465	NC_008340	CATG	2	8	2462303	2462310	25 %	25 %	25 %	25 %	114321315
55466	NC_008340	ACG	2	6	2462311	2462316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55467	NC_008340	ACC	2	6	2462387	2462392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321316
55468	NC_008340	CGCC	2	8	2462393	2462400	0 %	0 %	25 %	75 %	114321316
55469	NC_008340	CGA	2	6	2462403	2462408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55470	NC_008340	CCA	2	6	2462421	2462426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321316
55471	NC_008340	GGTG	2	8	2462445	2462452	0 %	25 %	75 %	0 %	114321316
55472	NC_008340	ACC	2	6	2462456	2462461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321316
55473	NC_008340	CGC	2	6	2462504	2462509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321316
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55475	NC_008340	AGG	2	6	2462549	2462554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321316
55476	NC_008340	GCA	3	9	2462568	2462576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
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55478	NC_008340	GCA	2	6	2462589	2462594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55479	NC_008340	CCG	2	6	2462606	2462611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321316
55480	NC_008340	C	7	7	2462623	2462629	0 %	0 %	0 %	100 %	114321316
55481	NC_008340	CCT	2	6	2462673	2462678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321316
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55483	NC_008340	CCGC	2	8	2462688	2462695	0 %	0 %	25 %	75 %	114321316
55484	NC_008340	GCC	2	6	2462699	2462704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321316
55485	NC_008340	TCG	2	6	2462714	2462719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55486	NC_008340	GC	3	6	2462730	2462735	0 %	0 %	50 %	50 %	114321316
55487	NC_008340	CAG	3	9	2462737	2462745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55488	NC_008340	CTG	2	6	2462779	2462784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55489	NC_008340	CGGC	2	8	2462865	2462872	0 %	0 %	50 %	50 %	114321316
55490	NC_008340	AGC	2	6	2462876	2462881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55491	NC_008340	CCA	2	6	2462928	2462933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321316
55492	NC_008340	GCC	2	6	2463014	2463019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321316
55493	NC_008340	CGG	2	6	2463062	2463067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321316
55494	NC_008340	CCT	2	6	2463069	2463074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321316
55495	NC_008340	GGT	2	6	2463078	2463083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321316
55496	NC_008340	CG	3	6	2463126	2463131	0 %	0 %	50 %	50 %	114321316
55497	NC_008340	TGC	2	6	2463134	2463139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321316
55498	NC_008340	GCGAG	2	10	2463186	2463195	20 %	0 %	60 %	20 %	114321316
55499	NC_008340	GGC	2	6	2463202	2463207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321316
55500	NC_008340	GGT	2	6	2463220	2463225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321316

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