MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_008340	GCC	2	6	2335251	2335256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321209
52503	NC_008340	GGC	2	6	2335352	2335357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
52504	NC_008340	ATC	2	6	2335360	2335365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321210
52505	NC_008340	TGG	2	6	2335408	2335413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321210
52506	NC_008340	GAG	2	6	2335416	2335421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321210
52507	NC_008340	GGT	2	6	2335463	2335468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321210
52508	NC_008340	TTC	2	6	2335503	2335508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321210
52509	NC_008340	GCT	2	6	2335556	2335561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
52510	NC_008340	GC	3	6	2335564	2335569	0 %	0 %	50 %	50 %	114321210
52511	NC_008340	CTG	2	6	2335596	2335601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
52512	NC_008340	GCG	2	6	2335658	2335663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
52513	NC_008340	TCG	3	9	2335687	2335695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
52514	NC_008340	GGCGGT	2	12	2335709	2335720	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321210
52515	NC_008340	GCC	2	6	2335758	2335763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321210
52516	NC_008340	GCTCT	2	10	2335814	2335823	0 %	40 %	20 %	40 %	114321210
52517	NC_008340	CGGC	2	8	2335900	2335907	0 %	0 %	50 %	50 %	114321210
52518	NC_008340	TGC	2	6	2335936	2335941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
52519	NC_008340	ATCT	2	8	2335971	2335978	25 %	50 %	0 %	25 %	114321210
52520	NC_008340	TGC	2	6	2335981	2335986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
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52522	NC_008340	GGC	2	6	2335994	2335999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
52523	NC_008340	GCT	2	6	2336009	2336014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
52524	NC_008340	GGC	3	9	2336015	2336023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
52525	NC_008340	CGG	3	9	2336063	2336071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
52526	NC_008340	CGA	2	6	2336117	2336122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321210
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52532	NC_008340	TGG	2	6	2336350	2336355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321210
52533	NC_008340	CTG	2	6	2336370	2336375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
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52539	NC_008340	CTG	2	6	2336556	2336561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321210
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52541	NC_008340	CGG	2	6	2336584	2336589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321210
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52543	NC_008340	CCGC	2	8	2336653	2336660	0 %	0 %	25 %	75 %	114321210
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52547	NC_008340	TCG	2	6	2336878	2336883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321211
52548	NC_008340	GCA	2	6	2336969	2336974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321211
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52550	NC_008340	CGG	2	6	2337003	2337008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321211
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52552	NC_008340	TGT	2	6	2337050	2337055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321211
52553	NC_008340	TGA	2	6	2337080	2337085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321211
52554	NC_008340	GTC	2	6	2337174	2337179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321211
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52558	NC_008340	CCAG	2	8	2337476	2337483	25 %	0 %	25 %	50 %	114321211
52559	NC_008340	GCAA	2	8	2337484	2337491	50 %	0 %	25 %	25 %	114321211
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52603	NC_008340	CAG	2	6	2339126	2339131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321212
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52614	NC_008340	CCGG	2	8	2339579	2339586	0 %	0 %	50 %	50 %	114321212
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52732	NC_008340	CGG	2	6	2344677	2344682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321216
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52847	NC_008340	CTA	2	6	2349839	2349844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321221
52848	NC_008340	TGA	2	6	2349847	2349852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321221
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52851	NC_008340	GAC	2	6	2349990	2349995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321221
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52857	NC_008340	GGC	2	6	2350259	2350264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321222
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52871	NC_008340	GC	3	6	2350828	2350833	0 %	0 %	50 %	50 %	114321222
52872	NC_008340	GCGG	2	8	2350841	2350848	0 %	0 %	75 %	25 %	114321222
52873	NC_008340	GCG	2	6	2350900	2350905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321222
52874	NC_008340	GGC	2	6	2350916	2350921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321222
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52912	NC_008340	CTTCGT	2	12	2351951	2351962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	114321222
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52933	NC_008340	GGT	2	6	2352731	2352736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321223
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52935	NC_008340	GGT	2	6	2352749	2352754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321223
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52945	NC_008340	CGC	2	6	2352960	2352965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321224
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52949	NC_008340	GGC	2	6	2353119	2353124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321224
52950	NC_008340	GGA	3	9	2353188	2353196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321224
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52952	NC_008340	TGG	2	6	2353313	2353318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321224
52953	NC_008340	ATG	2	6	2353330	2353335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321224
52954	NC_008340	ACC	2	6	2353396	2353401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321224
52955	NC_008340	AGC	2	6	2353469	2353474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321224
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52957	NC_008340	TGA	2	6	2353484	2353489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321224
52958	NC_008340	TGC	2	6	2353496	2353501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321224
52959	NC_008340	ATG	2	6	2353513	2353518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321224
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52961	NC_008340	GCGG	2	8	2353676	2353683	0 %	0 %	75 %	25 %	114321225
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