MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_008340	CCCG	2	8	2243278	2243285	0 %	0 %	25 %	75 %	114321122
50502	NC_008340	GCC	2	6	2243286	2243291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321122
50503	NC_008340	GCA	2	6	2243302	2243307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321122
50504	NC_008340	GGC	2	6	2243325	2243330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321122
50505	NC_008340	CGC	2	6	2243430	2243435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321123
50506	NC_008340	GC	4	8	2243490	2243497	0 %	0 %	50 %	50 %	114321123
50507	NC_008340	CGG	2	6	2243531	2243536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50508	NC_008340	GCC	2	6	2243540	2243545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321123
50509	NC_008340	GAC	2	6	2243555	2243560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321123
50510	NC_008340	C	6	6	2243569	2243574	0 %	0 %	0 %	100 %	114321123
50511	NC_008340	CCA	2	6	2243597	2243602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321123
50512	NC_008340	GGC	2	6	2243608	2243613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50513	NC_008340	AGC	3	9	2243695	2243703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321123
50514	NC_008340	GC	3	6	2243707	2243712	0 %	0 %	50 %	50 %	114321123
50515	NC_008340	TCG	2	6	2243767	2243772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321123
50516	NC_008340	TGCATG	2	12	2243821	2243832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321123
50517	NC_008340	CGG	4	12	2243855	2243866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50518	NC_008340	GCG	2	6	2243911	2243916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50519	NC_008340	CGG	2	6	2243924	2243929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50520	NC_008340	TCA	2	6	2243936	2243941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321123
50521	NC_008340	CCGG	2	8	2244053	2244060	0 %	0 %	50 %	50 %	114321123
50522	NC_008340	GAT	2	6	2244081	2244086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321123
50523	NC_008340	CCA	2	6	2244101	2244106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321123
50524	NC_008340	GCC	2	6	2244130	2244135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321123
50525	NC_008340	C	7	7	2244149	2244155	0 %	0 %	0 %	100 %	114321123
50526	NC_008340	GCG	2	6	2244239	2244244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321123
50527	NC_008340	TGG	2	6	2244289	2244294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321124
50528	NC_008340	GCC	2	6	2244299	2244304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321124
50529	NC_008340	GTCATC	2	12	2244350	2244361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321124
50530	NC_008340	CGG	2	6	2244386	2244391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321124
50531	NC_008340	ATG	2	6	2244411	2244416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50532	NC_008340	TCG	2	6	2244417	2244422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50533	NC_008340	CGAT	2	8	2244432	2244439	25 %	25 %	25 %	25 %	114321124
50534	NC_008340	GAT	2	6	2244497	2244502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50535	NC_008340	CCG	3	9	2244508	2244516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321124
50536	NC_008340	GAT	2	6	2244530	2244535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50537	NC_008340	CCT	2	6	2244544	2244549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321124
50538	NC_008340	CTC	2	6	2244623	2244628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321124
50539	NC_008340	GGCG	2	8	2244652	2244659	0 %	0 %	75 %	25 %	114321124
50540	NC_008340	GGT	2	6	2244728	2244733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321124
50541	NC_008340	CTC	2	6	2244758	2244763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321124
50542	NC_008340	GCC	2	6	2244773	2244778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321124
50543	NC_008340	GAT	2	6	2244878	2244883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50544	NC_008340	CGA	2	6	2244925	2244930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50545	NC_008340	GGCC	2	8	2244937	2244944	0 %	0 %	50 %	50 %	114321124
50546	NC_008340	TCC	2	6	2244972	2244977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321124
50547	NC_008340	TCA	2	6	2244979	2244984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321124
50548	NC_008340	CAT	2	6	2245007	2245012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321124
50549	NC_008340	TCC	2	6	2245038	2245043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321124
50550	NC_008340	CCA	2	6	2245048	2245053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321124
50551	NC_008340	TTG	2	6	2245059	2245064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321124
50552	NC_008340	GCGG	2	8	2245067	2245074	0 %	0 %	75 %	25 %	114321124
50553	NC_008340	GGC	2	6	2245082	2245087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321124
50554	NC_008340	TCG	2	6	2245161	2245166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50555	NC_008340	CTT	2	6	2245178	2245183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321124
50556	NC_008340	CAC	3	9	2245232	2245240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321124
50557	NC_008340	GCA	2	6	2245264	2245269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50558	NC_008340	TGG	2	6	2245297	2245302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321124
50559	NC_008340	CGATGA	2	12	2245306	2245317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321124
50560	NC_008340	CCA	2	6	2245348	2245353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321124
50561	NC_008340	TCG	2	6	2245380	2245385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
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50563	NC_008340	GGC	2	6	2245414	2245419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321124
50564	NC_008340	TCG	2	6	2245434	2245439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50565	NC_008340	GAT	2	6	2245445	2245450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50566	NC_008340	CTT	2	6	2245463	2245468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321124
50567	NC_008340	CGA	2	6	2245510	2245515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50568	NC_008340	CGA	2	6	2245522	2245527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50569	NC_008340	GAA	2	6	2245547	2245552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321124
50570	NC_008340	AGC	2	6	2245587	2245592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50571	NC_008340	G	7	7	2245607	2245613	0 %	0 %	100 %	0 %	114321124
50572	NC_008340	CCA	2	6	2245684	2245689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321124
50573	NC_008340	CGT	2	6	2245699	2245704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50574	NC_008340	TCG	2	6	2245713	2245718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50575	NC_008340	CGT	2	6	2245729	2245734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50576	NC_008340	TGCTC	2	10	2245747	2245756	0 %	40 %	20 %	40 %	114321124
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50580	NC_008340	CAG	2	6	2245946	2245951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321124
50581	NC_008340	GC	3	6	2246013	2246018	0 %	0 %	50 %	50 %	114321124
50582	NC_008340	ATC	2	6	2246043	2246048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321124
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50584	NC_008340	GAT	3	9	2246165	2246173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321124
50585	NC_008340	CTA	2	6	2246287	2246292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321125
50586	NC_008340	CAG	2	6	2246311	2246316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321125
50587	NC_008340	CCA	2	6	2246514	2246519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321125
50588	NC_008340	AGC	2	6	2246591	2246596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321125
50589	NC_008340	CCT	2	6	2246610	2246615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321125
50590	NC_008340	CAC	2	6	2246688	2246693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321125
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50596	NC_008340	CCAG	2	8	2246877	2246884	25 %	0 %	25 %	50 %	114321125
50597	NC_008340	ACG	2	6	2246908	2246913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321125
50598	NC_008340	TGC	2	6	2246934	2246939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321126
50599	NC_008340	ACC	2	6	2246946	2246951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321126
50600	NC_008340	CGG	2	6	2246952	2246957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321126
50601	NC_008340	GCC	3	9	2246978	2246986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321126
50602	NC_008340	GATCAG	2	12	2246999	2247010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321126
50603	NC_008340	CCA	4	12	2247040	2247051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321126
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50605	NC_008340	CAG	2	6	2247068	2247073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321126
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50612	NC_008340	GGC	2	6	2247587	2247592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321128
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50832	NC_008340	TGG	2	6	2257095	2257100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321136
50833	NC_008340	GCG	2	6	2257291	2257296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321136
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50843	NC_008340	GC	3	6	2257662	2257667	0 %	0 %	50 %	50 %	114321136
50844	NC_008340	CAA	2	6	2257723	2257728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321136
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50847	NC_008340	CGGAC	2	10	2257891	2257900	20 %	0 %	40 %	40 %	114321136
50848	NC_008340	CTG	2	6	2257907	2257912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321136
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50862	NC_008340	CG	3	6	2258486	2258491	0 %	0 %	50 %	50 %	114321137
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50952	NC_008340	GCCC	2	8	2262384	2262391	0 %	0 %	25 %	75 %	114321142
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50960	NC_008340	CAC	2	6	2262798	2262803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321142
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