MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 3096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007413	TTACA	2	10	349	358	40 %	40 %	0 %	20 %	75906226
2	NC_007413	CTCAT	2	10	612	621	20 %	40 %	0 %	40 %	75906226
3	NC_007413	TACAT	2	10	841	850	40 %	40 %	0 %	20 %	75906226
4	NC_007413	TGCAG	2	10	8278	8287	20 %	20 %	40 %	20 %	75906234
5	NC_007413	GTAAA	2	10	12023	12032	60 %	20 %	20 %	0 %	75906238
6	NC_007413	GTCAT	2	10	15890	15899	20 %	40 %	20 %	20 %	75906242
7	NC_007413	GTTGG	2	10	16059	16068	0 %	40 %	60 %	0 %	75906242
8	NC_007413	TAGTT	2	10	16541	16550	20 %	60 %	20 %	0 %	75906243
9	NC_007413	AGCGA	2	10	18600	18609	40 %	0 %	40 %	20 %	75906246
10	NC_007413	ACCAA	2	10	19627	19636	60 %	0 %	0 %	40 %	75906247
11	NC_007413	TGATT	2	10	23264	23273	20 %	60 %	20 %	0 %	75906249
12	NC_007413	AGCAA	2	10	28882	28891	60 %	0 %	20 %	20 %	75906255
13	NC_007413	TGATT	2	10	29432	29441	20 %	60 %	20 %	0 %	75906255
14	NC_007413	AGCCG	2	10	31282	31291	20 %	0 %	40 %	40 %	75906256
15	NC_007413	TGAGT	2	10	32519	32528	20 %	40 %	40 %	0 %	75906258
16	NC_007413	AGAGA	2	10	32529	32538	60 %	0 %	40 %	0 %	75906258
17	NC_007413	CTGGG	2	10	33243	33252	0 %	20 %	60 %	20 %	75906259
18	NC_007413	GTCCT	2	10	33573	33582	0 %	40 %	20 %	40 %	75906259
19	NC_007413	TGAGT	2	10	34652	34661	20 %	40 %	40 %	0 %	75906259
20	NC_007413	AAATC	2	10	38996	39005	60 %	20 %	0 %	20 %	75906262
21	NC_007413	TGGTG	2	10	39015	39024	0 %	40 %	60 %	0 %	75906262
22	NC_007413	GTTCC	2	10	41920	41929	0 %	40 %	20 %	40 %	75906264
23	NC_007413	ATAAA	2	10	44821	44830	80 %	20 %	0 %	0 %	75906264
24	NC_007413	AGAAA	2	10	46452	46461	80 %	0 %	20 %	0 %	75906265
25	NC_007413	ATGTT	2	10	47827	47836	20 %	60 %	20 %	0 %	75906267
26	NC_007413	CCAAG	2	10	48175	48184	40 %	0 %	20 %	40 %	75906267
27	NC_007413	ATCTT	2	10	48274	48283	20 %	60 %	0 %	20 %	75906267
28	NC_007413	ACCAA	2	10	48663	48672	60 %	0 %	0 %	40 %	75906267
29	NC_007413	GTCAT	2	10	53976	53985	20 %	40 %	20 %	20 %	75906272
30	NC_007413	ATTAC	2	10	54578	54587	40 %	40 %	0 %	20 %	75906273
31	NC_007413	TGCTC	2	10	54900	54909	0 %	40 %	20 %	40 %	75906273
32	NC_007413	CGTTG	2	10	55681	55690	0 %	40 %	40 %	20 %	75906274
33	NC_007413	ATTCA	2	10	57457	57466	40 %	40 %	0 %	20 %	75906274
34	NC_007413	GATTT	2	10	58505	58514	20 %	60 %	20 %	0 %	75906275
35	NC_007413	AACCG	2	10	60728	60737	40 %	0 %	20 %	40 %	75906277
36	NC_007413	TTTAG	2	10	65166	65175	20 %	60 %	20 %	0 %	75906279
37	NC_007413	ATGCT	2	10	68551	68560	20 %	40 %	20 %	20 %	75906280
38	NC_007413	TCGCT	2	10	71341	71350	0 %	40 %	20 %	40 %	75906282
39	NC_007413	TTGAT	2	10	81023	81032	20 %	60 %	20 %	0 %	75906289
40	NC_007413	ATTCC	2	10	84352	84361	20 %	40 %	0 %	40 %	75906289
41	NC_007413	ATTAC	2	10	86927	86936	40 %	40 %	0 %	20 %	75906290
42	NC_007413	TAGCC	2	10	88873	88882	20 %	20 %	20 %	40 %	75906292
43	NC_007413	TGGAT	2	10	89500	89509	20 %	40 %	40 %	0 %	75906292
44	NC_007413	TTTAC	2	10	90477	90486	20 %	60 %	0 %	20 %	75906292
45	NC_007413	CCACC	2	10	94108	94117	20 %	0 %	0 %	80 %	75906294
46	NC_007413	AACAG	2	10	95977	95986	60 %	0 %	20 %	20 %	75906296
47	NC_007413	AATCC	2	10	97365	97374	40 %	20 %	0 %	40 %	75906298
48	NC_007413	TTGAG	2	10	97595	97604	20 %	40 %	40 %	0 %	75906299
49	NC_007413	AATCA	2	10	99614	99623	60 %	20 %	0 %	20 %	75906301
50	NC_007413	TAACG	2	10	99756	99765	40 %	20 %	20 %	20 %	75906301
51	NC_007413	TTTGT	2	10	100471	100480	0 %	80 %	20 %	0 %	75906302
52	NC_007413	TACGA	2	10	100961	100970	40 %	20 %	20 %	20 %	75906303
53	NC_007413	TTACT	2	10	103015	103024	20 %	60 %	0 %	20 %	75906306
54	NC_007413	TGCAA	2	10	106518	106527	40 %	20 %	20 %	20 %	75906307
55	NC_007413	ATTTA	2	10	108694	108703	40 %	60 %	0 %	0 %	75906308
56	NC_007413	AATTC	2	10	109315	109324	40 %	40 %	0 %	20 %	75906308
57	NC_007413	TCAAT	2	10	109696	109705	40 %	40 %	0 %	20 %	75906308
58	NC_007413	TGCGT	2	10	115397	115406	0 %	40 %	40 %	20 %	75906311
59	NC_007413	GTGTT	2	10	115703	115712	0 %	60 %	40 %	0 %	75906311
60	NC_007413	AGCAA	2	10	117349	117358	60 %	0 %	20 %	20 %	75906313
61	NC_007413	AACAA	2	10	118988	118997	80 %	0 %	0 %	20 %	75906314
62	NC_007413	AGGAG	2	10	119532	119541	40 %	0 %	60 %	0 %	75906314
63	NC_007413	TGTTT	2	10	123076	123085	0 %	80 %	20 %	0 %	75906316
64	NC_007413	CCGTG	2	10	137510	137519	0 %	20 %	40 %	40 %	75906328
65	NC_007413	CTCCA	2	10	141768	141777	20 %	20 %	0 %	60 %	75906331
66	NC_007413	TCCTA	2	10	143090	143099	20 %	40 %	0 %	40 %	75906332
67	NC_007413	CCCAT	2	10	145212	145221	20 %	20 %	0 %	60 %	75906333
68	NC_007413	GTAAT	2	10	145719	145728	40 %	40 %	20 %	0 %	75906334
69	NC_007413	GCTGT	2	10	146395	146404	0 %	40 %	40 %	20 %	75906335
70	NC_007413	CTTCT	2	10	149827	149836	0 %	60 %	0 %	40 %	75906337
71	NC_007413	GTCAT	2	10	150117	150126	20 %	40 %	20 %	20 %	75906337
72	NC_007413	GTGCT	2	10	153919	153928	0 %	40 %	40 %	20 %	75906340
73	NC_007413	TTCTT	2	10	159131	159140	0 %	80 %	0 %	20 %	75906344
74	NC_007413	GTTGG	2	10	160378	160387	0 %	40 %	60 %	0 %	75906345
75	NC_007413	TGATT	2	10	163648	163657	20 %	60 %	20 %	0 %	75906348
76	NC_007413	ACTCT	2	10	164241	164250	20 %	40 %	0 %	40 %	75906348
77	NC_007413	CATCT	2	10	166795	166804	20 %	40 %	0 %	40 %	75906349
78	NC_007413	CCAAA	2	10	166842	166851	60 %	0 %	0 %	40 %	75906349
79	NC_007413	GGATT	2	10	167448	167457	20 %	40 %	40 %	0 %	75906350
80	NC_007413	CCATC	2	10	169510	169519	20 %	20 %	0 %	60 %	75906351
81	NC_007413	TAATT	2	10	174287	174296	40 %	60 %	0 %	0 %	75906355
82	NC_007413	TTGCC	2	10	176450	176459	0 %	40 %	20 %	40 %	75906357
83	NC_007413	ATAGG	2	10	177802	177811	40 %	20 %	40 %	0 %	75906358
84	NC_007413	TTGAA	2	10	179313	179322	40 %	40 %	20 %	0 %	75906359
85	NC_007413	CATTG	2	10	181486	181495	20 %	40 %	20 %	20 %	75906362
86	NC_007413	CTTGT	2	10	182348	182357	0 %	60 %	20 %	20 %	75906363
87	NC_007413	AAAAC	2	10	186408	186417	80 %	0 %	0 %	20 %	75906365
88	NC_007413	CCTCA	2	10	191546	191555	20 %	20 %	0 %	60 %	75906368
89	NC_007413	AACGC	2	10	195088	195097	40 %	0 %	20 %	40 %	75906370
90	NC_007413	GTAGC	2	10	195874	195883	20 %	20 %	40 %	20 %	75906371
91	NC_007413	AGTTT	2	10	202637	202646	20 %	60 %	20 %	0 %	75906377
92	NC_007413	CTGGG	2	10	203906	203915	0 %	20 %	60 %	20 %	75906378
93	NC_007413	ATTTT	2	10	205867	205876	20 %	80 %	0 %	0 %	75906379
94	NC_007413	GTTGT	2	10	209573	209582	0 %	60 %	40 %	0 %	75906382
95	NC_007413	GATCA	2	10	211569	211578	40 %	20 %	20 %	20 %	75906383
96	NC_007413	CAATG	2	10	213313	213322	40 %	20 %	20 %	20 %	75906384
97	NC_007413	TGGGC	2	10	217155	217164	0 %	20 %	60 %	20 %	75906388
98	NC_007413	ATTTA	2	10	222421	222430	40 %	60 %	0 %	0 %	75906393
99	NC_007413	AAAAG	2	10	225423	225432	80 %	0 %	20 %	0 %	75906396
100	NC_007413	CCCAG	2	10	226874	226883	20 %	0 %	20 %	60 %	75906397
101	NC_007413	TGGGT	2	10	228006	228015	0 %	40 %	60 %	0 %	75906398
102	NC_007413	GGAAC	2	10	231489	231498	40 %	0 %	40 %	20 %	75906402
103	NC_007413	CAAAG	2	10	234943	234952	60 %	0 %	20 %	20 %	75906406
104	NC_007413	ACATC	2	10	235784	235793	40 %	20 %	0 %	40 %	75906407
105	NC_007413	GTAAA	2	10	236359	236368	60 %	20 %	20 %	0 %	75906407
106	NC_007413	AGTTA	2	10	236864	236873	40 %	40 %	20 %	0 %	75906407
107	NC_007413	AAGAA	2	10	237154	237163	80 %	0 %	20 %	0 %	75906407
108	NC_007413	CAGTG	2	10	237644	237653	20 %	20 %	40 %	20 %	75906407
109	NC_007413	CAATA	2	10	239576	239585	60 %	20 %	0 %	20 %	75906408
110	NC_007413	ATTTG	2	10	240488	240497	20 %	60 %	20 %	0 %	75906409
111	NC_007413	TCGCG	2	10	241737	241746	0 %	20 %	40 %	40 %	75906410
112	NC_007413	CTTTG	2	10	244890	244899	0 %	60 %	20 %	20 %	75906413
113	NC_007413	AAATT	2	10	245352	245361	60 %	40 %	0 %	0 %	75906414
114	NC_007413	GGCTA	2	10	246942	246951	20 %	20 %	40 %	20 %	75906416
115	NC_007413	GCTTT	2	10	248600	248609	0 %	60 %	20 %	20 %	75906417
116	NC_007413	ACTTA	2	10	249153	249162	40 %	40 %	0 %	20 %	75906419
117	NC_007413	CATGC	2	10	252133	252142	20 %	20 %	20 %	40 %	75906422
118	NC_007413	TCGCA	2	10	254105	254114	20 %	20 %	20 %	40 %	75906423
119	NC_007413	CAGAC	2	10	255089	255098	40 %	0 %	20 %	40 %	75906423
120	NC_007413	AAATT	2	10	255361	255370	60 %	40 %	0 %	0 %	75906423
121	NC_007413	TCCGC	2	10	255572	255581	0 %	20 %	20 %	60 %	75906423
122	NC_007413	GAGAT	2	10	264404	264413	40 %	20 %	40 %	0 %	75906429
123	NC_007413	TTTTC	2	10	267947	267956	0 %	80 %	0 %	20 %	75906433
124	NC_007413	GTCAG	2	10	270199	270208	20 %	20 %	40 %	20 %	75906436
125	NC_007413	TTTGA	2	10	270678	270687	20 %	60 %	20 %	0 %	75906436
126	NC_007413	GTAAA	2	10	275447	275456	60 %	20 %	20 %	0 %	75906441
127	NC_007413	AGCAT	2	10	276930	276939	40 %	20 %	20 %	20 %	75906443
128	NC_007413	AACTA	2	10	277238	277247	60 %	20 %	0 %	20 %	75906443
129	NC_007413	ACCCA	2	10	279315	279324	40 %	0 %	0 %	60 %	75906444
130	NC_007413	TAAAT	2	10	283048	283057	60 %	40 %	0 %	0 %	75906446
131	NC_007413	CCAGA	2	10	283140	283149	40 %	0 %	20 %	40 %	75906446
132	NC_007413	GATTG	2	10	283827	283836	20 %	40 %	40 %	0 %	75906447
133	NC_007413	TGTAA	2	10	284542	284551	40 %	40 %	20 %	0 %	75906448
134	NC_007413	CTATA	2	10	287694	287703	40 %	40 %	0 %	20 %	75906450
135	NC_007413	CAAAA	2	10	288985	288994	80 %	0 %	0 %	20 %	75906451
136	NC_007413	TCCGT	2	10	289172	289181	0 %	40 %	20 %	40 %	75906451
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