MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	CTTCTG	2	12	4063	4074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75812663
2	NC_007412	GTATCA	2	12	6894	6905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812663
3	NC_007412	CCACAA	2	12	7360	7371	50 %	0 %	0 %	50 %	75812663
4	NC_007412	ACCTGA	2	12	8460	8471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812663
5	NC_007412	CGGTTA	2	12	9354	9365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812663
6	NC_007412	TCTGCT	2	12	9882	9893	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75812663
7	NC_007412	ATAAAC	2	12	10894	10905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812664
8	NC_007412	TAACTT	2	12	11932	11943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812665
9	NC_007412	TTCAAA	2	12	13484	13495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812666
10	NC_007412	TCATTT	2	12	13629	13640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75812666
11	NC_007412	CTAAAT	2	12	15713	15724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812668
12	NC_007412	TATTCA	2	12	16858	16869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812668
13	NC_007412	AATTAA	2	12	19315	19326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812670
14	NC_007412	TTTCAA	2	12	21021	21032	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812670
15	NC_007412	ACTCTA	2	12	23544	23555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812670
16	NC_007412	GACAAT	2	12	25561	25572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812670
17	NC_007412	AATGAA	2	12	28682	28693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812671
18	NC_007412	CTATGC	2	12	29740	29751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812671
19	NC_007412	AGGATT	2	12	29866	29877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
20	NC_007412	AAGTGG	2	12	31689	31700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75812672
21	NC_007412	CTTTAA	2	12	32327	32338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812673
22	NC_007412	TTTGCT	2	12	32416	32427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812673
23	NC_007412	GTTTGA	2	12	32986	32997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75812674
24	NC_007412	ACCGTA	2	12	40397	40408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812684
25	NC_007412	GCCAAA	2	12	43835	43846	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812687
26	NC_007412	CAAAAC	2	12	49826	49837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812692
27	NC_007412	GCCGTC	2	12	50418	50429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	75812693
28	NC_007412	AAAGCC	2	12	51348	51359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812694
29	NC_007412	GCAGAA	2	12	59689	59700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75812699
30	NC_007412	ACAGCC	2	12	64588	64599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75812704
31	NC_007412	AGATTT	2	12	67473	67484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812705
32	NC_007412	GACAGT	2	12	75838	75849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812711
33	NC_007412	GCCATC	2	12	76426	76437	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75812711
34	NC_007412	CTGGAA	2	12	81788	81799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812712
35	NC_007412	GGCGTA	2	12	85737	85748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75812715
36	NC_007412	CACCAT	2	12	87153	87164	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75812717
37	NC_007412	AGATAT	2	12	88145	88156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812719
38	NC_007412	CTGTTT	2	12	88322	88333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812719
39	NC_007412	TGGCTT	2	12	89182	89193	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812720
40	NC_007412	AATTTA	2	12	91986	91997	50 %	50 %	0 %	0 %	75812721
41	NC_007412	AAATAG	2	12	94396	94407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812724
42	NC_007412	AAGATA	2	12	95217	95228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812725
43	NC_007412	TCAAAT	2	12	96759	96770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812728
44	NC_007412	CGGTAG	2	12	100571	100582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75812732
45	NC_007412	ATCTGC	2	12	102943	102954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812735
46	NC_007412	ATTCTG	2	12	114788	114799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75812749
47	NC_007412	CACCCA	2	12	119171	119182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812757
48	NC_007412	CCAGCG	2	12	121445	121456	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75812760
49	NC_007412	TAAGCG	2	12	123312	123323	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812762
50	NC_007412	GTGCCA	2	12	123907	123918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75812762
51	NC_007412	TAAAAC	2	12	128814	128825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812767
52	NC_007412	CACCCG	2	12	129920	129931	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	75812768
53	NC_007412	GACATC	2	12	134630	134641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812772
54	NC_007412	GCTGAA	2	12	137486	137497	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812775
55	NC_007412	AAATCG	2	12	140206	140217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812777
56	NC_007412	AAAAAG	2	12	151950	151961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812783
57	NC_007412	TGCGAG	2	12	154850	154861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75812786
58	NC_007412	CCTTTG	2	12	163695	163706	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75812794
59	NC_007412	CGCTAC	2	12	165644	165655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75812796
60	NC_007412	GGGGAC	2	12	166950	166961	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	75812798
61	NC_007412	GGTTGC	2	12	168570	168581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75812799
62	NC_007412	CCGCAC	2	12	168877	168888	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	75812800
63	NC_007412	ACACCC	2	12	169131	169142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812800
64	NC_007412	GCCAGG	2	12	173636	173647	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	75812804
65	NC_007412	GGCGAA	2	12	176650	176661	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	75812806
66	NC_007412	GTCCTA	2	12	182760	182771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812812
67	NC_007412	ATCCCG	2	12	183981	183992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75812814
68	NC_007412	ATTGGA	2	12	186506	186517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812816
69	NC_007412	ATGTTT	2	12	190199	190210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75812819
70	NC_007412	CAGCAC	2	12	193337	193348	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75812821
71	NC_007412	TGGTAA	2	12	200874	200885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812829
72	NC_007412	GCACTA	2	12	206691	206702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812836
73	NC_007412	AGATAA	2	12	209522	209533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812838
74	NC_007412	GAAATT	2	12	215974	215985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812843
75	NC_007412	CTATTG	2	12	217022	217033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75812843
76	NC_007412	ACCAAT	2	12	219570	219581	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75812843
77	NC_007412	AGGGTA	2	12	220355	220366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75812843
78	NC_007412	GTTAAA	2	12	221719	221730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812844
79	NC_007412	GAAAAA	2	12	222237	222248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812845
80	NC_007412	AATTCA	2	12	223132	223143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812845
81	NC_007412	TCGGTA	2	12	229695	229706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812850
82	NC_007412	TTCGGT	2	12	229823	229834	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812850
83	NC_007412	GTTTTG	2	12	229913	229924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812850
84	NC_007412	GTTGCT	2	12	230152	230163	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812850
85	NC_007412	CTTTTT	2	12	233233	233244	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	75812854
86	NC_007412	CCTTAG	2	12	236031	236042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812857
87	NC_007412	TAAAAC	2	12	244301	244312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812864
88	NC_007412	CATCAA	2	12	245204	245215	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75812864
89	NC_007412	TCAAAG	2	12	247214	247225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812865
90	NC_007412	CAACTG	2	12	251264	251275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812872
91	NC_007412	CTTCTA	2	12	253219	253230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75812876
92	NC_007412	ATCTTC	2	12	256560	256571	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75812879
93	NC_007412	CCTTCC	2	12	260653	260664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812880
94	NC_007412	AACCAA	2	12	261107	261118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812880
95	NC_007412	CTGAAG	2	12	262870	262881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812882
96	NC_007412	TCCGTA	2	12	263858	263869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812883
97	NC_007412	GCTGTC	2	12	264074	264085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812883
98	NC_007412	CGCCCG	2	12	267735	267746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812884
99	NC_007412	AATTAG	2	12	270212	270223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812887
100	NC_007412	AAATCA	2	12	275923	275934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812890
101	NC_007412	AAATTA	2	12	277543	277554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812891
102	NC_007412	AGGCGA	2	12	279252	279263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	75812891
103	NC_007412	CAATGG	2	12	279293	279304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812891
104	NC_007412	GTCCAA	2	12	284746	284757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812892
105	NC_007412	TAAATA	2	12	285807	285818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
106	NC_007412	CCCAGA	2	12	286426	286437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75812893
107	NC_007412	ACTATC	2	12	289021	289032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
108	NC_007412	TTCATC	2	12	289791	289802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75812894

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.