MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 5333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007412	GA	3	6	24829	24834	50 %	0 %	50 %	0 %	75812670
502	NC_007412	TGT	2	6	24860	24865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
503	NC_007412	AGC	2	6	25094	25099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812670
504	NC_007412	CTT	2	6	25200	25205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812670
505	NC_007412	TCTT	2	8	25219	25226	0 %	75 %	0 %	25 %	75812670
506	NC_007412	TGC	2	6	25249	25254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812670
507	NC_007412	CTG	2	6	25285	25290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812670
508	NC_007412	ATA	2	6	25315	25320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812670
509	NC_007412	AAT	3	9	25333	25341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812670
510	NC_007412	CTT	2	6	25419	25424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812670
511	NC_007412	GACAAT	2	12	25561	25572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812670
512	NC_007412	TG	3	6	25613	25618	0 %	50 %	50 %	0 %	75812670
513	NC_007412	TGG	2	6	25690	25695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812670
514	NC_007412	GTT	2	6	25697	25702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
515	NC_007412	CAAT	2	8	25719	25726	50 %	25 %	0 %	25 %	75812670
516	NC_007412	GTT	2	6	25878	25883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
517	NC_007412	CGCA	2	8	25898	25905	25 %	0 %	25 %	50 %	75812670
518	NC_007412	GCC	2	6	25927	25932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812670
519	NC_007412	TGC	2	6	26111	26116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812670
520	NC_007412	CAA	2	6	26131	26136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812670
521	NC_007412	CTAT	2	8	26228	26235	25 %	50 %	0 %	25 %	75812670
522	NC_007412	TCA	2	6	26264	26269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812670
523	NC_007412	CAT	2	6	26272	26277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812670
524	NC_007412	TGC	2	6	26318	26323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812670
525	NC_007412	GTT	2	6	26342	26347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
526	NC_007412	GATT	2	8	26405	26412	25 %	50 %	25 %	0 %	75812670
527	NC_007412	A	6	6	26464	26469	100 %	0 %	0 %	0 %	75812670
528	NC_007412	TGG	2	6	26491	26496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812670
529	NC_007412	T	6	6	26521	26526	0 %	100 %	0 %	0 %	75812670
530	NC_007412	TAA	2	6	26542	26547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812670
531	NC_007412	TCCA	2	8	26611	26618	25 %	25 %	0 %	50 %	75812670
532	NC_007412	TTG	2	6	26635	26640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812670
533	NC_007412	CAAG	2	8	27602	27609	50 %	0 %	25 %	25 %	75812671
534	NC_007412	AC	3	6	27642	27647	50 %	0 %	0 %	50 %	75812671
535	NC_007412	GCA	2	6	27701	27706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812671
536	NC_007412	TCA	2	6	27776	27781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812671
537	NC_007412	AT	3	6	27831	27836	50 %	50 %	0 %	0 %	75812671
538	NC_007412	AGTTG	2	10	27976	27985	20 %	40 %	40 %	0 %	75812671
539	NC_007412	GAC	2	6	27989	27994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812671
540	NC_007412	ACC	3	9	28039	28047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812671
541	NC_007412	TAG	2	6	28072	28077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
542	NC_007412	ACC	2	6	28084	28089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812671
543	NC_007412	AGAA	2	8	28110	28117	75 %	0 %	25 %	0 %	75812671
544	NC_007412	TAG	2	6	28128	28133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
545	NC_007412	CAAT	2	8	28214	28221	50 %	25 %	0 %	25 %	75812671
546	NC_007412	AGT	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
547	NC_007412	GGT	2	6	28319	28324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812671
548	NC_007412	TTA	2	6	28342	28347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812671
549	NC_007412	TGT	2	6	28470	28475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812671
550	NC_007412	GGA	2	6	28478	28483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812671
551	NC_007412	AGA	2	6	28531	28536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812671
552	NC_007412	TTA	2	6	28540	28545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812671
553	NC_007412	AATGAA	2	12	28682	28693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812671
554	NC_007412	AAC	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812671
555	NC_007412	TAG	2	6	28831	28836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
556	NC_007412	ATG	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
557	NC_007412	AGTT	2	8	28885	28892	25 %	50 %	25 %	0 %	75812671
558	NC_007412	CAT	2	6	28948	28953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812671
559	NC_007412	GAA	3	9	29039	29047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812671
560	NC_007412	AAG	2	6	29049	29054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812671
561	NC_007412	TTG	2	6	29118	29123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812671
562	NC_007412	GCAA	2	8	29244	29251	50 %	0 %	25 %	25 %	75812671
563	NC_007412	ATG	2	6	29340	29345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
564	NC_007412	CAA	2	6	29356	29361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812671
565	NC_007412	ACT	2	6	29393	29398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812671
566	NC_007412	T	6	6	29486	29491	0 %	100 %	0 %	0 %	75812671
567	NC_007412	ACA	2	6	29525	29530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812671
568	NC_007412	CAG	2	6	29637	29642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812671
569	NC_007412	A	6	6	29673	29678	100 %	0 %	0 %	0 %	75812671
570	NC_007412	GTG	2	6	29682	29687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812671
571	NC_007412	TAC	2	6	29712	29717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812671
572	NC_007412	CTATGC	2	12	29740	29751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812671
573	NC_007412	ATA	2	6	29772	29777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812671
574	NC_007412	AGGATT	2	12	29866	29877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812671
575	NC_007412	CTTC	2	8	29936	29943	0 %	50 %	0 %	50 %	75812671
576	NC_007412	TTTG	2	8	30013	30020	0 %	75 %	25 %	0 %	75812671
577	NC_007412	ACA	2	6	30033	30038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812671
578	NC_007412	CAT	2	6	30134	30139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812672
579	NC_007412	TGG	2	6	30154	30159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812672
580	NC_007412	A	6	6	30209	30214	100 %	0 %	0 %	0 %	75812672
581	NC_007412	TGGGG	2	10	30232	30241	0 %	20 %	80 %	0 %	75812672
582	NC_007412	TTGGG	2	10	30270	30279	0 %	40 %	60 %	0 %	75812672
583	NC_007412	CCT	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812672
584	NC_007412	A	6	6	30381	30386	100 %	0 %	0 %	0 %	75812672
585	NC_007412	AGC	2	6	30559	30564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812672
586	NC_007412	ATCGC	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	75812672
587	NC_007412	CAA	2	6	30690	30695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812672
588	NC_007412	TTG	2	6	30700	30705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812672
589	NC_007412	TAC	2	6	30720	30725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812672
590	NC_007412	AAC	2	6	30730	30735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812672
591	NC_007412	T	6	6	30830	30835	0 %	100 %	0 %	0 %	75812672
592	NC_007412	CAGT	2	8	30843	30850	25 %	25 %	25 %	25 %	75812672
593	NC_007412	GAAT	2	8	30856	30863	50 %	25 %	25 %	0 %	75812672
594	NC_007412	ACT	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812672
595	NC_007412	CAG	2	6	30967	30972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812672
596	NC_007412	GCG	2	6	31098	31103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812672
597	NC_007412	AGG	2	6	31148	31153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812672
598	NC_007412	GA	3	6	31157	31162	50 %	0 %	50 %	0 %	75812672
599	NC_007412	GTAA	2	8	31227	31234	50 %	25 %	25 %	0 %	75812672
600	NC_007412	GCC	2	6	31488	31493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812672
601	NC_007412	CAG	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812672
602	NC_007412	GCA	2	6	31572	31577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812672
603	NC_007412	AAGTGG	2	12	31689	31700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75812672
604	NC_007412	TGA	2	6	31826	31831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812673
605	NC_007412	AAC	2	6	31895	31900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812673
606	NC_007412	AATT	2	8	31904	31911	50 %	50 %	0 %	0 %	75812673
607	NC_007412	T	6	6	31951	31956	0 %	100 %	0 %	0 %	75812673
608	NC_007412	AATC	2	8	32008	32015	50 %	25 %	0 %	25 %	75812673
609	NC_007412	AAT	2	6	32136	32141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812673
610	NC_007412	TGC	2	6	32204	32209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812673
611	NC_007412	TGT	2	6	32251	32256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812673
612	NC_007412	AGA	2	6	32280	32285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812673
613	NC_007412	CAT	2	6	32308	32313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812673
614	NC_007412	CTTTAA	2	12	32327	32338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812673
615	NC_007412	TTTGCT	2	12	32416	32427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812673
616	NC_007412	TAT	2	6	32451	32456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812673
617	NC_007412	CAT	2	6	32458	32463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812673
618	NC_007412	CATTA	2	10	32490	32499	40 %	40 %	0 %	20 %	75812673
619	NC_007412	ATT	2	6	32520	32525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812673
620	NC_007412	CTA	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812673
621	NC_007412	CAT	2	6	32723	32728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812673
622	NC_007412	GTT	2	6	32742	32747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812674
623	NC_007412	TCG	2	6	32795	32800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812674
624	NC_007412	TAGG	2	8	32953	32960	25 %	25 %	50 %	0 %	75812674
625	NC_007412	GTTTGA	2	12	32986	32997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75812674
626	NC_007412	TGGG	2	8	33003	33010	0 %	25 %	75 %	0 %	75812674
627	NC_007412	GGC	2	6	33075	33080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812674
628	NC_007412	T	6	6	33117	33122	0 %	100 %	0 %	0 %	75812674
629	NC_007412	ATTA	2	8	33140	33147	50 %	50 %	0 %	0 %	75812674
630	NC_007412	GGT	2	6	33171	33176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812674
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756	NC_007412	TGG	2	6	41200	41205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812684
757	NC_007412	GCT	2	6	41244	41249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812684
758	NC_007412	CTT	2	6	41296	41301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812684
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