MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	75812285
2	NC_007410	AT	3	6	609	614	50 %	50 %	0 %	0 %	75812285
3	NC_007410	TG	3	6	984	989	0 %	50 %	50 %	0 %	75812285
4	NC_007410	GA	3	6	3157	3162	50 %	0 %	50 %	0 %	75812286
5	NC_007410	CT	4	8	4524	4531	0 %	50 %	0 %	50 %	75812287
6	NC_007410	AC	3	6	5090	5095	50 %	0 %	0 %	50 %	75812288
7	NC_007410	TC	3	6	6315	6320	0 %	50 %	0 %	50 %	75812289
8	NC_007410	GA	3	6	6975	6980	50 %	0 %	50 %	0 %	75812290
9	NC_007410	AT	3	6	7457	7462	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
10	NC_007410	AT	3	6	7887	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
11	NC_007410	AT	3	6	8205	8210	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
12	NC_007410	CT	3	6	9496	9501	0 %	50 %	0 %	50 %	75812291
13	NC_007410	AT	3	6	9667	9672	50 %	50 %	0 %	0 %	75812291
14	NC_007410	TA	3	6	10294	10299	50 %	50 %	0 %	0 %	75812291
15	NC_007410	GA	3	6	10752	10757	50 %	0 %	50 %	0 %	75812291
16	NC_007410	CT	3	6	11347	11352	0 %	50 %	0 %	50 %	75812291
17	NC_007410	TA	3	6	11535	11540	50 %	50 %	0 %	0 %	75812292
18	NC_007410	TA	3	6	12714	12719	50 %	50 %	0 %	0 %	75812293
19	NC_007410	AT	3	6	13323	13328	50 %	50 %	0 %	0 %	75812293
20	NC_007410	GT	3	6	15204	15209	0 %	50 %	50 %	0 %	75812294
21	NC_007410	GA	3	6	18100	18105	50 %	0 %	50 %	0 %	75812295
22	NC_007410	TG	4	8	18244	18251	0 %	50 %	50 %	0 %	75812295
23	NC_007410	TC	3	6	20564	20569	0 %	50 %	0 %	50 %	75812295
24	NC_007410	TG	3	6	21438	21443	0 %	50 %	50 %	0 %	75812296
25	NC_007410	GA	3	6	21697	21702	50 %	0 %	50 %	0 %	75812296
26	NC_007410	AT	3	6	22791	22796	50 %	50 %	0 %	0 %	75812297
27	NC_007410	TG	3	6	22940	22945	0 %	50 %	50 %	0 %	75812297
28	NC_007410	CT	3	6	24067	24072	0 %	50 %	0 %	50 %	75812298
29	NC_007410	CT	4	8	24926	24933	0 %	50 %	0 %	50 %	75812298
30	NC_007410	AT	3	6	26255	26260	50 %	50 %	0 %	0 %	75812299
31	NC_007410	GA	3	6	26730	26735	50 %	0 %	50 %	0 %	75812300
32	NC_007410	AT	3	6	27209	27214	50 %	50 %	0 %	0 %	75812300
33	NC_007410	AT	3	6	27504	27509	50 %	50 %	0 %	0 %	75812300
34	NC_007410	CT	3	6	28052	28057	0 %	50 %	0 %	50 %	75812300
35	NC_007410	TC	3	6	28103	28108	0 %	50 %	0 %	50 %	75812300
36	NC_007410	TA	3	6	28709	28714	50 %	50 %	0 %	0 %	75812300
37	NC_007410	TC	3	6	30810	30815	0 %	50 %	0 %	50 %	75812302
38	NC_007410	AT	3	6	31936	31941	50 %	50 %	0 %	0 %	75812303
39	NC_007410	CA	3	6	32130	32135	50 %	0 %	0 %	50 %	75812304
40	NC_007410	CA	3	6	32765	32770	50 %	0 %	0 %	50 %	75812304
41	NC_007410	CT	3	6	33524	33529	0 %	50 %	0 %	50 %	75812304
42	NC_007410	CT	3	6	36237	36242	0 %	50 %	0 %	50 %	75812307
43	NC_007410	TA	3	6	36613	36618	50 %	50 %	0 %	0 %	75812307
44	NC_007410	TC	3	6	37003	37008	0 %	50 %	0 %	50 %	75812307
45	NC_007410	TA	4	8	37423	37430	50 %	50 %	0 %	0 %	75812308
46	NC_007410	AT	3	6	37498	37503	50 %	50 %	0 %	0 %	75812308
47	NC_007410	AT	3	6	37531	37536	50 %	50 %	0 %	0 %	75812308
48	NC_007410	CT	3	6	38662	38667	0 %	50 %	0 %	50 %	75812309
49	NC_007410	AG	3	6	38824	38829	50 %	0 %	50 %	0 %	75812309
50	NC_007410	AG	3	6	40582	40587	50 %	0 %	50 %	0 %	75812309
51	NC_007410	GA	3	6	41496	41501	50 %	0 %	50 %	0 %	75812310
52	NC_007410	TC	3	6	41853	41858	0 %	50 %	0 %	50 %	75812310
53	NC_007410	AG	3	6	41955	41960	50 %	0 %	50 %	0 %	75812310
54	NC_007410	TA	3	6	42301	42306	50 %	50 %	0 %	0 %	75812311
55	NC_007410	AT	3	6	42479	42484	50 %	50 %	0 %	0 %	75812312
56	NC_007410	TA	3	6	42841	42846	50 %	50 %	0 %	0 %	75812312
57	NC_007410	AT	3	6	43179	43184	50 %	50 %	0 %	0 %	75812312
58	NC_007410	AC	3	6	45256	45261	50 %	0 %	0 %	50 %	75812315
59	NC_007410	TA	4	8	46571	46578	50 %	50 %	0 %	0 %	75812317
60	NC_007410	AG	3	6	47691	47696	50 %	0 %	50 %	0 %	75812318
61	NC_007410	TA	4	8	48662	48669	50 %	50 %	0 %	0 %	75812320
62	NC_007410	CA	3	6	48903	48908	50 %	0 %	0 %	50 %	75812320
63	NC_007410	TG	3	6	48913	48918	0 %	50 %	50 %	0 %	75812320
64	NC_007410	AC	3	6	51095	51100	50 %	0 %	0 %	50 %	75812322
65	NC_007410	AT	3	6	53198	53203	50 %	50 %	0 %	0 %	75812323
66	NC_007410	AT	3	6	53747	53752	50 %	50 %	0 %	0 %	75812325
67	NC_007410	GA	3	6	55775	55780	50 %	0 %	50 %	0 %	75812327
68	NC_007410	AT	3	6	56257	56262	50 %	50 %	0 %	0 %	75812328
69	NC_007410	TG	3	6	57521	57526	0 %	50 %	50 %	0 %	75812329
70	NC_007410	GA	3	6	58112	58117	50 %	0 %	50 %	0 %	75812330
71	NC_007410	TG	3	6	58169	58174	0 %	50 %	50 %	0 %	75812330
72	NC_007410	CG	3	6	58588	58593	0 %	0 %	50 %	50 %	75812331
73	NC_007410	GA	3	6	58751	58756	50 %	0 %	50 %	0 %	75812331
74	NC_007410	TG	3	6	60410	60415	0 %	50 %	50 %	0 %	75812332
75	NC_007410	AG	3	6	60653	60658	50 %	0 %	50 %	0 %	75812332
76	NC_007410	GT	3	6	61752	61757	0 %	50 %	50 %	0 %	75812333
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79	NC_007410	TC	3	6	63281	63286	0 %	50 %	0 %	50 %	75812334
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81	NC_007410	GA	3	6	64355	64360	50 %	0 %	50 %	0 %	75812335
82	NC_007410	AT	3	6	64436	64441	50 %	50 %	0 %	0 %	75812335
83	NC_007410	TA	3	6	68668	68673	50 %	50 %	0 %	0 %	75812340
84	NC_007410	GA	3	6	69424	69429	50 %	0 %	50 %	0 %	75812341
85	NC_007410	AT	3	6	69457	69462	50 %	50 %	0 %	0 %	75812341
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88	NC_007410	CG	3	6	74913	74918	0 %	0 %	50 %	50 %	75812346
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90	NC_007410	TG	3	6	78815	78820	0 %	50 %	50 %	0 %	75812351
91	NC_007410	TG	3	6	78876	78881	0 %	50 %	50 %	0 %	75812351
92	NC_007410	CA	3	6	79488	79493	50 %	0 %	0 %	50 %	75812351
93	NC_007410	TA	3	6	79500	79505	50 %	50 %	0 %	0 %	75812351
94	NC_007410	AC	3	6	79784	79789	50 %	0 %	0 %	50 %	75812351
95	NC_007410	TA	3	6	80373	80378	50 %	50 %	0 %	0 %	75812351
96	NC_007410	TG	4	8	80491	80498	0 %	50 %	50 %	0 %	75812351
97	NC_007410	TG	3	6	81322	81327	0 %	50 %	50 %	0 %	75812351
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99	NC_007410	CA	3	6	82989	82994	50 %	0 %	0 %	50 %	75812353
100	NC_007410	CT	3	6	83171	83176	0 %	50 %	0 %	50 %	75812353
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102	NC_007410	AC	3	6	88864	88869	50 %	0 %	0 %	50 %	75812359
103	NC_007410	GA	3	6	90592	90597	50 %	0 %	50 %	0 %	75812360
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105	NC_007410	GA	3	6	95490	95495	50 %	0 %	50 %	0 %	75812369
106	NC_007410	TA	3	6	96352	96357	50 %	50 %	0 %	0 %	75812369
107	NC_007410	TG	3	6	97611	97616	0 %	50 %	50 %	0 %	75812371
108	NC_007410	TC	3	6	97907	97912	0 %	50 %	0 %	50 %	75812371
109	NC_007410	AG	4	8	99202	99209	50 %	0 %	50 %	0 %	75812372
110	NC_007410	TA	3	6	99801	99806	50 %	50 %	0 %	0 %	75812372
111	NC_007410	AT	3	6	100038	100043	50 %	50 %	0 %	0 %	75812372
112	NC_007410	AT	3	6	100095	100100	50 %	50 %	0 %	0 %	75812372
113	NC_007410	TG	3	6	105344	105349	0 %	50 %	50 %	0 %	75812377
114	NC_007410	TC	3	6	107458	107463	0 %	50 %	0 %	50 %	75812380
115	NC_007410	AT	3	6	107569	107574	50 %	50 %	0 %	0 %	75812380
116	NC_007410	TA	3	6	108303	108308	50 %	50 %	0 %	0 %	75812380
117	NC_007410	TG	3	6	109101	109106	0 %	50 %	50 %	0 %	75812382
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122	NC_007410	TC	3	6	112597	112602	0 %	50 %	0 %	50 %	75812385
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124	NC_007410	TG	3	6	114184	114189	0 %	50 %	50 %	0 %	75812386
125	NC_007410	CT	3	6	116342	116347	0 %	50 %	0 %	50 %	75812388
126	NC_007410	AG	3	6	116870	116875	50 %	0 %	50 %	0 %	75812388
127	NC_007410	CT	3	6	117269	117274	0 %	50 %	0 %	50 %	75812388
128	NC_007410	TC	3	6	119773	119778	0 %	50 %	0 %	50 %	75812389
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130	NC_007410	AG	3	6	123448	123453	50 %	0 %	50 %	0 %	75812390
131	NC_007410	AG	3	6	124576	124581	50 %	0 %	50 %	0 %	75812390
132	NC_007410	TA	4	8	124613	124620	50 %	50 %	0 %	0 %	75812390
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134	NC_007410	AC	3	6	125533	125538	50 %	0 %	0 %	50 %	75812392
135	NC_007410	TG	3	6	125554	125559	0 %	50 %	50 %	0 %	75812392
136	NC_007410	GA	3	6	126389	126394	50 %	0 %	50 %	0 %	75812393
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141	NC_007410	CA	3	6	128573	128578	50 %	0 %	0 %	50 %	75812394
142	NC_007410	TA	3	6	129425	129430	50 %	50 %	0 %	0 %	75812395
143	NC_007410	TA	3	6	129598	129603	50 %	50 %	0 %	0 %	75812395
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.