MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006824	CATCCG	2	12	4196	4207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58616425
2	NC_006824	GAGCTC	2	12	6297	6308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616427
3	NC_006824	GGCTCG	2	12	6737	6748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616428
4	NC_006824	GCGCCA	2	12	7078	7089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58616428
5	NC_006824	CTCGAT	2	12	7826	7837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616428
6	NC_006824	CGACGG	2	12	7963	7974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616428
7	NC_006824	GGCGAC	2	12	8869	8880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616429
8	NC_006824	ATCGGC	2	12	8890	8901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616429
9	NC_006824	ACGACT	2	12	9377	9388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616429
10	NC_006824	GGGCAA	2	12	12168	12179	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	58616432
11	NC_006824	GGCGCA	2	12	12895	12906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616433
12	NC_006824	GATGCG	2	12	15042	15053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616436
13	NC_006824	GCGCGA	2	12	18304	18315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616438
14	NC_006824	ATGAAA	2	12	20556	20567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58616441
15	NC_006824	AGGCCG	2	12	21223	21234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616441
16	NC_006824	AAGAAA	2	12	23423	23434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	58616444
17	NC_006824	GCCGAA	2	12	28107	28118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616449
18	NC_006824	CATCAC	2	12	28604	28615	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	58616449
19	NC_006824	ACCCGG	2	12	30147	30158	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58616450
20	NC_006824	GCCGAT	2	12	30542	30553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616450
21	NC_006824	GACGGT	2	12	35157	35168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616453
22	NC_006824	CCGCTT	2	12	41034	41045	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616459
23	NC_006824	ACGCGC	2	12	41391	41402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58616459
24	NC_006824	ATCAGC	2	12	41744	41755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616459
25	NC_006824	GCCGCT	2	12	43500	43511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616460
26	NC_006824	TCTGCT	2	12	49004	49015	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	58616465
27	NC_006824	CGGCTG	2	12	50040	50051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616465
28	NC_006824	GGTCAT	2	12	51217	51228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616466
29	NC_006824	GAGCGT	2	12	52689	52700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616467
30	NC_006824	ACGGAA	2	12	52879	52890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	58616467
31	NC_006824	GGTCGG	2	12	52976	52987	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	58616467
32	NC_006824	CGCCAC	2	12	55459	55470	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	58616469
33	NC_006824	TGAAGA	2	12	57631	57642	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58616470
34	NC_006824	CCCGGT	2	12	61844	61855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616477
35	NC_006824	TCGAGA	2	12	68580	68591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616482
36	NC_006824	TCGGCG	2	12	69576	69587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616483
37	NC_006824	CGAACA	2	12	72022	72033	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58616485
38	NC_006824	ATGTCG	2	12	75157	75168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616487
39	NC_006824	CGATGA	2	12	75743	75754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616488
40	NC_006824	GATCAG	2	12	75849	75860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616488
41	NC_006824	TGCGGA	2	12	77245	77256	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616489
42	NC_006824	TGATGC	2	12	78075	78086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616490
43	NC_006824	TCGGCG	2	12	79703	79714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616491
44	NC_006824	GAGCGG	2	12	81718	81729	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	58616493
45	NC_006824	CTTGGC	2	12	84101	84112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616495
46	NC_006824	TGGCGT	2	12	84289	84300	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	58616495
47	NC_006824	AGTTCG	2	12	90922	90933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616502
48	NC_006824	GAACAC	2	12	97920	97931	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58616509
49	NC_006824	AACCCG	2	12	100873	100884	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58616512
50	NC_006824	CTCGCG	2	12	103018	103029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616513
51	NC_006824	AGCGCA	2	12	103076	103087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616513
52	NC_006824	AAGCCG	2	12	103189	103200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616513
53	NC_006824	GTTCGA	2	12	109830	109841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616520
54	NC_006824	GCGAAG	2	12	111032	111043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	58616520
55	NC_006824	GCCTCG	2	12	112541	112552	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616520
56	NC_006824	AGGGGA	2	12	113511	113522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616520
57	NC_006824	ATCTCG	2	12	122954	122965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616525
58	NC_006824	CGATCT	2	12	123384	123395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616526
59	NC_006824	CTGCCG	2	12	125821	125832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616527
60	NC_006824	CGAGAT	2	12	128814	128825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616529
61	NC_006824	CTCGAA	2	12	139747	139758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616540
62	NC_006824	CTCGTC	2	12	140734	140745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616541
63	NC_006824	TCGGCC	2	12	143620	143631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616544
64	NC_006824	CCGAGG	2	12	155142	155153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616556
65	NC_006824	TTGCTT	2	12	160757	160768	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	58616560
66	NC_006824	CGGTGG	2	12	161787	161798	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	58616561
67	NC_006824	GCGGCA	2	12	162027	162038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616561
68	NC_006824	AGTTCG	2	12	163879	163890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616562
69	NC_006824	GACGCT	2	12	163898	163909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616562
70	NC_006824	GAGACC	2	12	164052	164063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616562
71	NC_006824	TCGGCT	2	12	168542	168553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616567
72	NC_006824	CGCGAG	2	12	168714	168725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616567
73	NC_006824	CGGGTT	2	12	170859	170870	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	58616568
74	NC_006824	TCATCG	2	12	172728	172739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616570
75	NC_006824	GGTCTC	2	12	186592	186603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616584
76	NC_006824	TCAGCG	2	12	186744	186755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616584
77	NC_006824	CGAACT	2	12	186765	186776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616584
78	NC_006824	ACCACG	2	12	188674	188685	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58616586
79	NC_006824	TCGTCC	2	12	192537	192548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616590
80	NC_006824	GAGGTG	2	12	199109	199120	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	58616596
81	NC_006824	AAGGCG	2	12	199853	199864	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	58616596
82	NC_006824	CCGTGG	2	12	201626	201637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616598
83	NC_006824	GATCGT	2	12	209475	209486	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616605
84	NC_006824	CCCGTC	2	12	213044	213055	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	58616608
85	NC_006824	TGAACG	2	12	213474	213485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616608
86	NC_006824	CCGCAG	2	12	214090	214101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58616610
87	NC_006824	GGTCGA	2	12	215241	215252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616611
88	NC_006824	CGATGT	2	12	221305	221316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616615
89	NC_006824	CTCGAT	2	12	221419	221430	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616615
90	NC_006824	CCGGTG	2	12	221492	221503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616615
91	NC_006824	CCGTCG	2	12	222021	222032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616616

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.