MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmid pAsa2

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004925	GAA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453781
2	NC_004925	GTT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453781
3	NC_004925	TGA	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453781
4	NC_004925	ATG	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453781
5	NC_004925	TGA	2	6	775	780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453781
6	NC_004925	TGA	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453781
7	NC_004925	ACG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453781
8	NC_004925	CAT	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453781
9	NC_004925	GGT	2	6	983	988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453781
10	NC_004925	TGG	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453781
11	NC_004925	GAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453781
12	NC_004925	AAC	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453781
13	NC_004925	ATA	2	6	1180	1185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32453781
14	NC_004925	CTT	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453782
15	NC_004925	TAT	2	6	1283	1288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32453782
16	NC_004925	ATT	2	6	1306	1311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32453782
17	NC_004925	ACA	2	6	1330	1335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453782
18	NC_004925	ATC	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453782
19	NC_004925	TTC	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453782
20	NC_004925	TCA	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453782
21	NC_004925	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453782
22	NC_004925	GCA	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453782
23	NC_004925	TCA	2	6	1847	1852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453782
24	NC_004925	GAC	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453783
25	NC_004925	TGC	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453783
26	NC_004925	GCC	3	9	3064	3072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453783
27	NC_004925	GGT	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453783
28	NC_004925	GTG	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453784
29	NC_004925	AGC	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453784
30	NC_004925	CGG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453784
31	NC_004925	CTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453784
32	NC_004925	CAA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453784
33	NC_004925	GCG	2	6	3503	3508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453784
34	NC_004925	TGA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453784
35	NC_004925	CTG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453785
36	NC_004925	GCT	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453785
37	NC_004925	GGT	3	9	4194	4202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453785
38	NC_004925	GAT	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453785
39	NC_004925	TGA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453785
40	NC_004925	GGC	3	9	4329	4337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453785
41	NC_004925	GTG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453785
42	NC_004925	GGT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453785
43	NC_004925	AGC	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453785
44	NC_004925	GAA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453785
45	NC_004925	CGC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453785
46	NC_004925	CTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453785
47	NC_004925	GTG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453785
48	NC_004925	GGC	2	6	4811	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453785
49	NC_004925	GCG	2	6	4836	4841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453785
50	NC_004925	GAT	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453785
51	NC_004925	CTA	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453785
52	NC_004925	GCA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453785
53	NC_004925	GTG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453785

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.