MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	TAAAA	2	10	1368	1377	80 %	20 %	0 %	0 %	56416371
2	NC_004842	CCAAA	2	10	3829	3838	60 %	0 %	0 %	40 %	56416374
3	NC_004842	TAAAC	2	10	5183	5192	60 %	20 %	0 %	20 %	56416377
4	NC_004842	ATACT	2	10	14359	14368	40 %	40 %	0 %	20 %	56416387
5	NC_004842	TCTTG	2	10	15513	15522	0 %	60 %	20 %	20 %	56416388
6	NC_004842	AATGA	2	10	17043	17052	60 %	20 %	20 %	0 %	56416389
7	NC_004842	ATACA	2	10	18934	18943	60 %	20 %	0 %	20 %	56416390
8	NC_004842	GAGCT	2	10	20099	20108	20 %	20 %	40 %	20 %	56416390
9	NC_004842	TCCAA	2	10	23125	23134	40 %	20 %	0 %	40 %	56416392
10	NC_004842	CTAAG	2	10	26950	26959	40 %	20 %	20 %	20 %	56416395
11	NC_004842	TCCTC	2	10	37594	37603	0 %	40 %	0 %	60 %	56416404
12	NC_004842	GCTGC	2	10	39595	39604	0 %	20 %	40 %	40 %	56416407
13	NC_004842	GGCAA	2	10	39699	39708	40 %	0 %	40 %	20 %	56416407
14	NC_004842	GCTTT	2	10	40761	40770	0 %	60 %	20 %	20 %	56416408
15	NC_004842	CAAGC	2	10	44559	44568	40 %	0 %	20 %	40 %	56416412
16	NC_004842	AAGGT	2	10	45012	45021	40 %	20 %	40 %	0 %	56416412
17	NC_004842	AGCTC	2	10	52172	52181	20 %	20 %	20 %	40 %	56416417
18	NC_004842	CAGCT	2	10	53044	53053	20 %	20 %	20 %	40 %	56416417
19	NC_004842	ATCGT	2	10	53738	53747	20 %	40 %	20 %	20 %	56416417
20	NC_004842	CGGAA	2	10	55447	55456	40 %	0 %	40 %	20 %	56416418
21	NC_004842	AGAGA	2	10	58444	58453	60 %	0 %	40 %	0 %	56416418
22	NC_004842	GTGCA	2	10	60224	60233	20 %	20 %	40 %	20 %	56416418
23	NC_004842	GACAA	2	10	60523	60532	60 %	0 %	20 %	20 %	56416418
24	NC_004842	GTGAG	2	10	62600	62609	20 %	20 %	60 %	0 %	56416420
25	NC_004842	AAAGC	2	10	63653	63662	60 %	0 %	20 %	20 %	56416421
26	NC_004842	GCTGA	2	10	70428	70437	20 %	20 %	40 %	20 %	56416425
27	NC_004842	TGCTG	2	10	76556	76565	0 %	40 %	40 %	20 %	56416429
28	NC_004842	TAGTA	2	10	79555	79564	40 %	40 %	20 %	0 %	56416433
29	NC_004842	GCCAT	2	10	80676	80685	20 %	20 %	20 %	40 %	56416434
30	NC_004842	TGCCT	2	10	91112	91121	0 %	40 %	20 %	40 %	56416441
31	NC_004842	ACGTG	2	10	102053	102062	20 %	20 %	40 %	20 %	56416451
32	NC_004842	CCCTT	2	10	102596	102605	0 %	40 %	0 %	60 %	56416451
33	NC_004842	GCGCT	2	10	103639	103648	0 %	20 %	40 %	40 %	56416451
34	NC_004842	GTGCT	2	10	105524	105533	0 %	40 %	40 %	20 %	56416452
35	NC_004842	GGTGC	2	10	105982	105991	0 %	20 %	60 %	20 %	56416453
36	NC_004842	GGGCA	2	10	107911	107920	20 %	0 %	60 %	20 %	56416453
37	NC_004842	GAATA	2	10	108269	108278	60 %	20 %	20 %	0 %	56416453
38	NC_004842	AGGGT	2	10	109500	109509	20 %	20 %	60 %	0 %	56416454
39	NC_004842	CAGTG	2	10	111685	111694	20 %	20 %	40 %	20 %	56416457
40	NC_004842	GCGGG	2	10	115134	115143	0 %	0 %	80 %	20 %	56416459
41	NC_004842	TGCAG	2	10	121377	121386	20 %	20 %	40 %	20 %	56416463
42	NC_004842	CTGCC	2	10	124257	124266	0 %	20 %	20 %	60 %	56416466
43	NC_004842	CGAGC	2	10	125719	125728	20 %	0 %	40 %	40 %	56416468
44	NC_004842	CAAAA	2	10	126084	126093	80 %	0 %	0 %	20 %	56416468
45	NC_004842	GGGCG	2	10	126627	126636	0 %	0 %	80 %	20 %	56416469
46	NC_004842	TGCCC	2	10	127534	127543	0 %	20 %	20 %	60 %	56416470
47	NC_004842	GCTTC	2	10	130332	130341	0 %	40 %	20 %	40 %	56416472
48	NC_004842	CATAA	2	10	133382	133391	60 %	20 %	0 %	20 %	56416475
49	NC_004842	TTTCT	2	10	138111	138120	0 %	80 %	0 %	20 %	56416478
50	NC_004842	GAGCT	2	10	141649	141658	20 %	20 %	40 %	20 %	56416484
51	NC_004842	GCAAG	2	10	142964	142973	40 %	0 %	40 %	20 %	56416484
52	NC_004842	CAGGG	2	10	146436	146445	20 %	0 %	60 %	20 %	56416487
53	NC_004842	GCCAC	2	10	150078	150087	20 %	0 %	20 %	60 %	56416491
54	NC_004842	CGCTA	2	10	152173	152182	20 %	20 %	20 %	40 %	56416493
55	NC_004842	CGAAA	2	10	158835	158844	60 %	0 %	20 %	20 %	56416496
56	NC_004842	GCACG	2	10	159401	159410	20 %	0 %	40 %	40 %	56416496
57	NC_004842	CCCGC	2	10	159526	159535	0 %	0 %	20 %	80 %	56416497
58	NC_004842	CGTGT	2	10	166895	166904	0 %	40 %	40 %	20 %	56416502
59	NC_004842	CTATC	2	10	168317	168326	20 %	40 %	0 %	40 %	56416504
60	NC_004842	GTGGC	2	10	170642	170651	0 %	20 %	60 %	20 %	56416506
61	NC_004842	AGCCA	2	10	173015	173024	40 %	0 %	20 %	40 %	56416508
62	NC_004842	TGCAT	2	10	175393	175402	20 %	40 %	20 %	20 %	56416510
63	NC_004842	TATGT	2	10	177959	177968	20 %	60 %	20 %	0 %	56416512
64	NC_004842	TCGGC	2	10	178102	178111	0 %	20 %	40 %	40 %	56416512
65	NC_004842	CACCC	2	10	178889	178898	20 %	0 %	0 %	80 %	56416512
66	NC_004842	GAAGA	2	10	179906	179915	60 %	0 %	40 %	0 %	56416513
67	NC_004842	CACAC	2	10	181058	181067	40 %	0 %	0 %	60 %	56416513
68	NC_004842	GCCAT	2	10	181335	181344	20 %	20 %	20 %	40 %	56416513
69	NC_004842	GCGGT	2	10	181446	181455	0 %	20 %	60 %	20 %	56416513
70	NC_004842	TTGTG	2	10	183334	183343	0 %	60 %	40 %	0 %	56416515
71	NC_004842	AAAAG	2	10	185398	185407	80 %	0 %	20 %	0 %	56416517
72	NC_004842	CGATG	2	10	185540	185549	20 %	20 %	40 %	20 %	56416518
73	NC_004842	GGGCG	2	10	189422	189431	0 %	0 %	80 %	20 %	56416520
74	NC_004842	GACAC	2	10	192352	192361	40 %	0 %	20 %	40 %	56416522
75	NC_004842	ACTTC	2	10	192677	192686	20 %	40 %	0 %	40 %	56416522
76	NC_004842	ATGCT	2	10	193929	193938	20 %	40 %	20 %	20 %	56416524
77	NC_004842	TTCTG	2	10	199589	199598	0 %	60 %	20 %	20 %	56416529
78	NC_004842	CTTCC	2	10	199630	199639	0 %	40 %	0 %	60 %	56416529
79	NC_004842	AAGCG	2	10	200874	200883	40 %	0 %	40 %	20 %	56416530
80	NC_004842	TTTGG	2	10	201691	201700	0 %	60 %	40 %	0 %	56416531
81	NC_004842	AGGGA	2	10	202086	202095	40 %	0 %	60 %	0 %	56416531
82	NC_004842	CATGT	2	10	202807	202816	20 %	40 %	20 %	20 %	56416531
83	NC_004842	CAGAA	2	10	209539	209548	60 %	0 %	20 %	20 %	56416538
84	NC_004842	AGGTG	2	10	209550	209559	20 %	20 %	60 %	0 %	56416538
85	NC_004842	AAAAT	2	10	211007	211016	80 %	20 %	0 %	0 %	56416538
86	NC_004842	CAGTA	2	10	211432	211441	40 %	20 %	20 %	20 %	56416538
87	NC_004842	TAATG	2	10	211485	211494	40 %	40 %	20 %	0 %	56416538
88	NC_004842	CGGTG	2	10	217982	217991	0 %	20 %	60 %	20 %	56416546
89	NC_004842	TGAAA	2	10	220558	220567	60 %	20 %	20 %	0 %	56416547
90	NC_004842	CGTCC	2	10	221431	221440	0 %	20 %	20 %	60 %	56416547
91	NC_004842	GGAAG	2	10	222046	222055	40 %	0 %	60 %	0 %	56416547
92	NC_004842	GAAGG	2	10	222497	222506	40 %	0 %	60 %	0 %	56416547
93	NC_004842	AGGTT	2	10	227387	227396	20 %	40 %	40 %	0 %	56416549
94	NC_004842	GGTAC	2	10	227695	227704	20 %	20 %	40 %	20 %	56416549
95	NC_004842	TTTCT	2	10	234891	234900	0 %	80 %	0 %	20 %	56416556
96	NC_004842	TCACC	2	10	238080	238089	20 %	20 %	0 %	60 %	56416559
97	NC_004842	GCGCA	2	10	241321	241330	20 %	0 %	40 %	40 %	56416563
98	NC_004842	GGACG	2	10	242915	242924	20 %	0 %	60 %	20 %	56416564
99	NC_004842	GCTGG	2	10	249504	249513	0 %	20 %	60 %	20 %	56416567
100	NC_004842	AGGGC	2	10	250246	250255	20 %	0 %	60 %	20 %	56416569
101	NC_004842	GGGTT	2	10	250983	250992	0 %	40 %	60 %	0 %	56416569
102	NC_004842	GGGTA	2	10	257118	257127	20 %	20 %	60 %	0 %	56416575
103	NC_004842	GAACA	2	10	257415	257424	60 %	0 %	20 %	20 %	56416575
104	NC_004842	GCCCG	2	10	259722	259731	0 %	0 %	40 %	60 %	56416579
105	NC_004842	GGGGA	2	10	261751	261760	20 %	0 %	80 %	0 %	56416580
106	NC_004842	ATTGT	2	10	269594	269603	20 %	60 %	20 %	0 %	56416586
107	NC_004842	ATATT	2	10	270633	270642	40 %	60 %	0 %	0 %	56416587
108	NC_004842	TTGCG	2	10	272337	272346	0 %	40 %	40 %	20 %	56416589
109	NC_004842	AAGGG	2	10	274512	274521	40 %	0 %	60 %	0 %	56416589
110	NC_004842	CTGCG	2	10	275202	275211	0 %	20 %	40 %	40 %	56416590
111	NC_004842	ACTTC	2	10	276787	276796	20 %	40 %	0 %	40 %	56416591
112	NC_004842	CTTGC	2	10	277206	277215	0 %	40 %	20 %	40 %	56416591
113	NC_004842	CTTTT	2	10	279508	279517	0 %	80 %	0 %	20 %	56416593
114	NC_004842	GGAAC	2	10	279570	279579	40 %	0 %	40 %	20 %	56416593
115	NC_004842	AAGCC	2	10	283300	283309	40 %	0 %	20 %	40 %	56416598
116	NC_004842	AGTTG	2	10	285098	285107	20 %	40 %	40 %	0 %	56416599
117	NC_004842	GGGTA	2	10	290621	290630	20 %	20 %	60 %	0 %	56416604
118	NC_004842	TTCTT	2	10	290647	290656	0 %	80 %	0 %	20 %	56416605
119	NC_004842	GAGTT	2	10	292225	292234	20 %	40 %	40 %	0 %	56416607
120	NC_004842	GTGAC	2	10	292918	292927	20 %	20 %	40 %	20 %	56416607
121	NC_004842	CTGTT	2	10	293853	293862	0 %	60 %	20 %	20 %	56416608
122	NC_004842	ACTGC	2	10	294747	294756	20 %	20 %	20 %	40 %	56416608
123	NC_004842	TGCGG	2	10	294945	294954	0 %	20 %	60 %	20 %	56416608
124	NC_004842	TGCGA	2	10	297072	297081	20 %	20 %	40 %	20 %	56416609
125	NC_004842	TGCGG	2	10	297496	297505	0 %	20 %	60 %	20 %	56416610
126	NC_004842	TGCTG	2	10	297689	297698	0 %	40 %	40 %	20 %	56416611
127	NC_004842	TGGTG	2	10	299712	299721	0 %	40 %	60 %	0 %	56416612
128	NC_004842	GGCAC	2	10	300321	300330	20 %	0 %	40 %	40 %	56416612
129	NC_004842	CGATC	2	10	300572	300581	20 %	20 %	20 %	40 %	56416612
130	NC_004842	GGCCT	2	10	301167	301176	0 %	20 %	40 %	40 %	56416613
131	NC_004842	CCAAG	2	10	301474	301483	40 %	0 %	20 %	40 %	56416613
132	NC_004842	CTGCC	2	10	303447	303456	0 %	20 %	20 %	60 %	56416613
133	NC_004842	ACCAC	2	10	306626	306635	40 %	0 %	0 %	60 %	56416615
134	NC_004842	CTTTT	2	10	306716	306725	0 %	80 %	0 %	20 %	56416615
135	NC_004842	AGACC	2	10	307788	307797	40 %	0 %	20 %	40 %	56416615
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151	NC_004842	GCAAG	2	10	326914	326923	40 %	0 %	40 %	20 %	56416620
152	NC_004842	ACTCT	2	10	327134	327143	20 %	40 %	0 %	40 %	56416620
153	NC_004842	GCAAG	2	10	327241	327250	40 %	0 %	40 %	20 %	56416620
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263	NC_004842	AGCAA	2	10	549780	549789	60 %	0 %	20 %	20 %	56416790
264	NC_004842	GCAGC	2	10	551593	551602	20 %	0 %	40 %	40 %	56416790
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