MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004842	GC	3	6	162759	162764	0 %	0 %	50 %	50 %	56416500
2502	NC_004842	CCA	2	6	162780	162785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416500
2503	NC_004842	CAG	2	6	162844	162849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416500
2504	NC_004842	AAG	2	6	162866	162871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416500
2505	NC_004842	GT	3	6	162877	162882	0 %	50 %	50 %	0 %	56416500
2506	NC_004842	C	6	6	162920	162925	0 %	0 %	0 %	100 %	56416500
2507	NC_004842	ATT	2	6	162938	162943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416500
2508	NC_004842	GAA	2	6	162951	162956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416500
2509	NC_004842	A	6	6	162955	162960	100 %	0 %	0 %	0 %	56416500
2510	NC_004842	CCTC	2	8	163001	163008	0 %	25 %	0 %	75 %	56416500
2511	NC_004842	CAA	2	6	163074	163079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416500
2512	NC_004842	GCTG	2	8	163129	163136	0 %	25 %	50 %	25 %	56416500
2513	NC_004842	T	6	6	163165	163170	0 %	100 %	0 %	0 %	56416500
2514	NC_004842	T	6	6	163172	163177	0 %	100 %	0 %	0 %	56416500
2515	NC_004842	TGA	2	6	163291	163296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416500
2516	NC_004842	GCC	2	6	163330	163335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416500
2517	NC_004842	AT	3	6	163348	163353	50 %	50 %	0 %	0 %	56416500
2518	NC_004842	CCG	2	6	163443	163448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416500
2519	NC_004842	AGC	2	6	163475	163480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416500
2520	NC_004842	TGCACA	2	12	163494	163505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56416500
2521	NC_004842	TCA	2	6	163515	163520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416500
2522	NC_004842	GCT	2	6	163926	163931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416501
2523	NC_004842	GCAA	2	8	163933	163940	50 %	0 %	25 %	25 %	56416501
2524	NC_004842	CA	3	6	164019	164024	50 %	0 %	0 %	50 %	56416501
2525	NC_004842	CCG	2	6	164045	164050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416501
2526	NC_004842	CA	3	6	164058	164063	50 %	0 %	0 %	50 %	56416501
2527	NC_004842	TCA	2	6	164138	164143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2528	NC_004842	CGA	2	6	164193	164198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416501
2529	NC_004842	GTT	2	6	164231	164236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416501
2530	NC_004842	AGT	2	6	164297	164302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416501
2531	NC_004842	GTT	2	6	164347	164352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416501
2532	NC_004842	CGC	2	6	164369	164374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416501
2533	NC_004842	TGG	2	6	164649	164654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416501
2534	NC_004842	TTGC	2	8	164698	164705	0 %	50 %	25 %	25 %	56416501
2535	NC_004842	CTTG	2	8	164781	164788	0 %	50 %	25 %	25 %	56416501
2536	NC_004842	CTA	2	6	164796	164801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2537	NC_004842	TCT	2	6	164903	164908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416501
2538	NC_004842	TCA	2	6	164961	164966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2539	NC_004842	TAC	2	6	165033	165038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2540	NC_004842	A	7	7	165090	165096	100 %	0 %	0 %	0 %	56416501
2541	NC_004842	GCA	2	6	165170	165175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416501
2542	NC_004842	GCC	2	6	165226	165231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416501
2543	NC_004842	T	6	6	165272	165277	0 %	100 %	0 %	0 %	56416501
2544	NC_004842	T	6	6	165284	165289	0 %	100 %	0 %	0 %	56416501
2545	NC_004842	CGC	2	6	165331	165336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416501
2546	NC_004842	TAA	2	6	165403	165408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416501
2547	NC_004842	CCT	2	6	165444	165449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416501
2548	NC_004842	CT	3	6	165448	165453	0 %	50 %	0 %	50 %	56416501
2549	NC_004842	CCT	2	6	165465	165470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416501
2550	NC_004842	GC	3	6	165504	165509	0 %	0 %	50 %	50 %	56416501
2551	NC_004842	CG	3	6	165633	165638	0 %	0 %	50 %	50 %	56416501
2552	NC_004842	TTG	2	6	165677	165682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416501
2553	NC_004842	TAC	2	6	165688	165693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2554	NC_004842	TCC	2	6	165695	165700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416501
2555	NC_004842	GCA	2	6	166035	166040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416501
2556	NC_004842	CTT	2	6	166071	166076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416501
2557	NC_004842	GGT	2	6	166083	166088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416501
2558	NC_004842	TCG	2	6	166190	166195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416501
2559	NC_004842	CAT	2	6	166222	166227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416501
2560	NC_004842	GAAC	2	8	166253	166260	50 %	0 %	25 %	25 %	56416501
2561	NC_004842	TTG	2	6	166339	166344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416501
2562	NC_004842	CA	3	6	166386	166391	50 %	0 %	0 %	50 %	56416501
2563	NC_004842	GGA	2	6	166415	166420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416501
2564	NC_004842	CAAG	2	8	166470	166477	50 %	0 %	25 %	25 %	56416501
2565	NC_004842	CCA	2	6	166493	166498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416501
2566	NC_004842	CGTGT	2	10	166895	166904	0 %	40 %	40 %	20 %	56416502
2567	NC_004842	TGTC	2	8	166907	166914	0 %	50 %	25 %	25 %	56416502
2568	NC_004842	CAG	2	6	166958	166963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416502
2569	NC_004842	T	6	6	167143	167148	0 %	100 %	0 %	0 %	56416502
2570	NC_004842	ACC	2	6	167205	167210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416502
2571	NC_004842	GAT	2	6	167294	167299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416502
2572	NC_004842	CAAGCT	2	12	167329	167340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56416502
2573	NC_004842	CAG	2	6	167356	167361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416503
2574	NC_004842	ACA	2	6	167403	167408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416503
2575	NC_004842	GCC	2	6	167425	167430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416503
2576	NC_004842	CTC	2	6	167456	167461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416503
2577	NC_004842	GCAC	2	8	167624	167631	25 %	0 %	25 %	50 %	56416503
2578	NC_004842	CTC	2	6	167632	167637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416503
2579	NC_004842	TTG	2	6	167657	167662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416503
2580	NC_004842	TGC	2	6	167721	167726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416503
2581	NC_004842	AT	3	6	167771	167776	50 %	50 %	0 %	0 %	56416503
2582	NC_004842	CCT	2	6	167787	167792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416503
2583	NC_004842	GGA	2	6	167963	167968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416503
2584	NC_004842	CT	3	6	168282	168287	0 %	50 %	0 %	50 %	56416504
2585	NC_004842	CTATC	2	10	168317	168326	20 %	40 %	0 %	40 %	56416504
2586	NC_004842	GC	3	6	168373	168378	0 %	0 %	50 %	50 %	56416504
2587	NC_004842	TGC	2	6	168541	168546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416504
2588	NC_004842	CTA	2	6	168635	168640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416504
2589	NC_004842	TCAA	2	8	168667	168674	50 %	25 %	0 %	25 %	56416504
2590	NC_004842	CAA	2	6	168690	168695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416504
2591	NC_004842	A	6	6	168747	168752	100 %	0 %	0 %	0 %	56416504
2592	NC_004842	TCA	2	6	168910	168915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416504
2593	NC_004842	A	7	7	168915	168921	100 %	0 %	0 %	0 %	56416504
2594	NC_004842	CTC	2	6	168922	168927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416504
2595	NC_004842	GTAA	2	8	169099	169106	50 %	25 %	25 %	0 %	56416504
2596	NC_004842	CGC	2	6	169183	169188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416505
2597	NC_004842	TCTG	2	8	169252	169259	0 %	50 %	25 %	25 %	56416505
2598	NC_004842	CCA	2	6	169317	169322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416505
2599	NC_004842	GAG	2	6	169344	169349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416505
2600	NC_004842	TA	3	6	169396	169401	50 %	50 %	0 %	0 %	56416505
2601	NC_004842	T	6	6	169520	169525	0 %	100 %	0 %	0 %	56416505
2602	NC_004842	TGC	2	6	169556	169561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416505
2603	NC_004842	CTC	2	6	169697	169702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416505
2604	NC_004842	TAA	2	6	169725	169730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416505
2605	NC_004842	TGG	2	6	170460	170465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416506
2606	NC_004842	GAT	2	6	170498	170503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416506
2607	NC_004842	GATCAA	2	12	170515	170526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56416506
2608	NC_004842	CCGT	2	8	170565	170572	0 %	25 %	25 %	50 %	56416506
2609	NC_004842	GAAG	2	8	170579	170586	50 %	0 %	50 %	0 %	56416506
2610	NC_004842	GTGGC	2	10	170642	170651	0 %	20 %	60 %	20 %	56416506
2611	NC_004842	GTC	2	6	170672	170677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416506
2612	NC_004842	TGG	2	6	170763	170768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416506
2613	NC_004842	TAA	2	6	170907	170912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416506
2614	NC_004842	GATG	2	8	170985	170992	25 %	25 %	50 %	0 %	56416507
2615	NC_004842	CGT	2	6	170997	171002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416507
2616	NC_004842	AGA	2	6	171033	171038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416507
2617	NC_004842	CGT	2	6	171046	171051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416507
2618	NC_004842	T	7	7	171064	171070	0 %	100 %	0 %	0 %	56416507
2619	NC_004842	TG	4	8	171093	171100	0 %	50 %	50 %	0 %	56416507
2620	NC_004842	C	6	6	171213	171218	0 %	0 %	0 %	100 %	56416507
2621	NC_004842	ACTT	2	8	171244	171251	25 %	50 %	0 %	25 %	56416507
2622	NC_004842	CAA	2	6	171279	171284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416507
2623	NC_004842	ACC	2	6	171302	171307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416507
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2625	NC_004842	TCG	2	6	171487	171492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416507
2626	NC_004842	GCA	2	6	171528	171533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416507
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2729	NC_004842	CTTC	2	8	178906	178913	0 %	50 %	0 %	50 %	56416512
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2742	NC_004842	ATG	2	6	179685	179690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416513
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2744	NC_004842	TCC	2	6	179738	179743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416513
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2746	NC_004842	GAAGA	2	10	179906	179915	60 %	0 %	40 %	0 %	56416513
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2748	NC_004842	TAG	2	6	180007	180012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416513
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2993	NC_004842	TCGC	2	8	193098	193105	0 %	25 %	25 %	50 %	161544993
2994	NC_004842	ATC	2	6	193107	193112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544993
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2996	NC_004842	CCCT	2	8	193177	193184	0 %	25 %	0 %	75 %	161544993
2997	NC_004842	CTT	3	9	193191	193199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161544993
2998	NC_004842	CCT	2	6	193480	193485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416524
2999	NC_004842	CTTT	2	8	193525	193532	0 %	75 %	0 %	25 %	56416524
3000	NC_004842	GGA	2	6	193571	193576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416524

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