MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_004842	AGC	2	6	1097087	1097092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18503	NC_004842	CAG	2	6	1097116	1097121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18504	NC_004842	GAT	2	6	1097138	1097143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417226
18505	NC_004842	GAA	2	6	1097164	1097169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417226
18506	NC_004842	GAG	2	6	1097222	1097227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417226
18507	NC_004842	CTC	2	6	1097257	1097262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417226
18508	NC_004842	AGC	2	6	1097300	1097305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18509	NC_004842	TGA	2	6	1097332	1097337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417226
18510	NC_004842	GAG	2	6	1097386	1097391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417226
18511	NC_004842	TAG	2	6	1097461	1097466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417226
18512	NC_004842	AAG	2	6	1097487	1097492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417226
18513	NC_004842	CAG	2	6	1097566	1097571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18514	NC_004842	AGC	2	6	1097576	1097581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18515	NC_004842	GCA	2	6	1097606	1097611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18516	NC_004842	GTT	2	6	1097650	1097655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417226
18517	NC_004842	TG	3	6	1097675	1097680	0 %	50 %	50 %	0 %	56417226
18518	NC_004842	GCA	2	6	1097712	1097717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18519	NC_004842	CAT	2	6	1097869	1097874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417226
18520	NC_004842	CAA	2	6	1097952	1097957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417226
18521	NC_004842	AGT	2	6	1098009	1098014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417226
18522	NC_004842	GCA	2	6	1098061	1098066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18523	NC_004842	A	7	7	1098097	1098103	100 %	0 %	0 %	0 %	56417226
18524	NC_004842	GTA	2	6	1098117	1098122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417226
18525	NC_004842	GAC	2	6	1098137	1098142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417226
18526	NC_004842	CAT	2	6	1098166	1098171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417226
18527	NC_004842	GAAA	2	8	1098284	1098291	75 %	0 %	25 %	0 %	56417226
18528	NC_004842	CTGG	2	8	1098313	1098320	0 %	25 %	50 %	25 %	56417226
18529	NC_004842	CTTG	2	8	1098339	1098346	0 %	50 %	25 %	25 %	56417226
18530	NC_004842	GGT	2	6	1098740	1098745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417227
18531	NC_004842	CT	3	6	1098751	1098756	0 %	50 %	0 %	50 %	56417227
18532	NC_004842	CAT	2	6	1098864	1098869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417227
18533	NC_004842	GGC	2	6	1098874	1098879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417227
18534	NC_004842	TTG	2	6	1098895	1098900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417227
18535	NC_004842	CATG	2	8	1098966	1098973	25 %	25 %	25 %	25 %	56417227
18536	NC_004842	ATA	2	6	1098991	1098996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417227
18537	NC_004842	GT	3	6	1099009	1099014	0 %	50 %	50 %	0 %	56417227
18538	NC_004842	TG	3	6	1099052	1099057	0 %	50 %	50 %	0 %	56417227
18539	NC_004842	CAA	2	6	1099130	1099135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417227
18540	NC_004842	GTG	2	6	1099150	1099155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417227
18541	NC_004842	AGT	2	6	1099162	1099167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417227
18542	NC_004842	CAAGT	2	10	1099190	1099199	40 %	20 %	20 %	20 %	56417227
18543	NC_004842	TTG	2	6	1099222	1099227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417227
18544	NC_004842	CG	3	6	1099251	1099256	0 %	0 %	50 %	50 %	56417227
18545	NC_004842	T	6	6	1099339	1099344	0 %	100 %	0 %	0 %	56417227
18546	NC_004842	GGT	2	6	1099382	1099387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417227
18547	NC_004842	A	6	6	1099764	1099769	100 %	0 %	0 %	0 %	56417228
18548	NC_004842	GC	3	6	1099778	1099783	0 %	0 %	50 %	50 %	56417228
18549	NC_004842	CAG	2	6	1099824	1099829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417228
18550	NC_004842	TGC	2	6	1099914	1099919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417228
18551	NC_004842	GCA	2	6	1100274	1100279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161544978
18552	NC_004842	TTG	2	6	1100301	1100306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161544978
18553	NC_004842	AC	3	6	1100307	1100312	50 %	0 %	0 %	50 %	161544978
18554	NC_004842	T	6	6	1100393	1100398	0 %	100 %	0 %	0 %	161544978
18555	NC_004842	ACTCT	2	10	1100412	1100421	20 %	40 %	0 %	40 %	161544978
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18557	NC_004842	CAAC	2	8	1100633	1100640	50 %	0 %	0 %	50 %	56417230
18558	NC_004842	AAT	2	6	1100747	1100752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417230
18559	NC_004842	AAT	2	6	1100860	1100865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417230
18560	NC_004842	CTT	2	6	1100879	1100884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417230
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18565	NC_004842	GCAA	2	8	1101104	1101111	50 %	0 %	25 %	25 %	56417230
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18567	NC_004842	CACG	2	8	1101183	1101190	25 %	0 %	25 %	50 %	56417230
18568	NC_004842	AGG	2	6	1101203	1101208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417230
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18571	NC_004842	AGA	2	6	1101423	1101428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417231
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18573	NC_004842	AGAT	2	8	1101576	1101583	50 %	25 %	25 %	0 %	56417231
18574	NC_004842	GTT	2	6	1101637	1101642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417231
18575	NC_004842	TTG	3	9	1101656	1101664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417231
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18577	NC_004842	CTGT	2	8	1101703	1101710	0 %	50 %	25 %	25 %	56417231
18578	NC_004842	AG	3	6	1101721	1101726	50 %	0 %	50 %	0 %	56417231
18579	NC_004842	TAG	2	6	1101749	1101754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417231
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18584	NC_004842	GAAAA	2	10	1102214	1102223	80 %	0 %	20 %	0 %	56417232
18585	NC_004842	CGG	2	6	1102229	1102234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417232
18586	NC_004842	GCT	2	6	1102248	1102253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417232
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18588	NC_004842	GC	3	6	1102322	1102327	0 %	0 %	50 %	50 %	56417232
18589	NC_004842	GGC	2	6	1102335	1102340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417232
18590	NC_004842	CAAGAA	2	12	1102345	1102356	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	56417232
18591	NC_004842	GATG	2	8	1102392	1102399	25 %	25 %	50 %	0 %	56417232
18592	NC_004842	GA	3	6	1102479	1102484	50 %	0 %	50 %	0 %	56417232
18593	NC_004842	A	6	6	1102516	1102521	100 %	0 %	0 %	0 %	56417232
18594	NC_004842	GCCG	2	8	1102613	1102620	0 %	0 %	50 %	50 %	56417232
18595	NC_004842	C	6	6	1102716	1102721	0 %	0 %	0 %	100 %	56417232
18596	NC_004842	TCG	2	6	1102769	1102774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417232
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18598	NC_004842	CT	3	6	1102836	1102841	0 %	50 %	0 %	50 %	56417232
18599	NC_004842	GGA	2	6	1102986	1102991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417232
18600	NC_004842	GAT	2	6	1102998	1103003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417232
18601	NC_004842	TGAGAA	2	12	1103016	1103027	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56417232
18602	NC_004842	CG	3	6	1103245	1103250	0 %	0 %	50 %	50 %	56417233
18603	NC_004842	ACAA	2	8	1103305	1103312	75 %	0 %	0 %	25 %	56417233
18604	NC_004842	T	6	6	1103322	1103327	0 %	100 %	0 %	0 %	56417233
18605	NC_004842	TAA	2	6	1103349	1103354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417233
18606	NC_004842	TGG	2	6	1103390	1103395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417233
18607	NC_004842	ACA	2	6	1103414	1103419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417233
18608	NC_004842	TGG	2	6	1103524	1103529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417233
18609	NC_004842	CAG	2	6	1103558	1103563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417233
18610	NC_004842	G	6	6	1103617	1103622	0 %	0 %	100 %	0 %	56417233
18611	NC_004842	GC	3	6	1103629	1103634	0 %	0 %	50 %	50 %	56417233
18612	NC_004842	CTA	2	6	1103643	1103648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417233
18613	NC_004842	GAT	2	6	1103737	1103742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417233
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18616	NC_004842	CAA	2	6	1103828	1103833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417233
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18619	NC_004842	TCG	2	6	1104083	1104088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417234
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18733	NC_004842	CTTA	2	8	1111684	1111691	25 %	50 %	0 %	25 %	56417240
18734	NC_004842	AGC	2	6	1111903	1111908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417240
18735	NC_004842	GATC	2	8	1111976	1111983	25 %	25 %	25 %	25 %	56417240
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18737	NC_004842	TGCG	2	8	1112037	1112044	0 %	25 %	50 %	25 %	56417240
18738	NC_004842	AAT	2	6	1112121	1112126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417240
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18831	NC_004842	GCA	2	6	1117138	1117143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417245
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18848	NC_004842	ACG	2	6	1117992	1117997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417246
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18851	NC_004842	GTA	2	6	1118272	1118277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417246
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18853	NC_004842	CTG	2	6	1118359	1118364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417246
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