MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 3723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003065	CT	3	6	168561	168566	0 %	50 %	0 %	50 %	16119967
3002	NC_003065	GAA	2	6	168588	168593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119967
3003	NC_003065	GAG	2	6	168612	168617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119967
3004	NC_003065	TGC	2	6	168679	168684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119967
3005	NC_003065	TGC	2	6	168694	168699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119967
3006	NC_003065	TGT	2	6	168707	168712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119967
3007	NC_003065	CT	3	6	168719	168724	0 %	50 %	0 %	50 %	16119967
3008	NC_003065	GGA	2	6	168758	168763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119967
3009	NC_003065	GCTTC	2	10	168767	168776	0 %	40 %	20 %	40 %	16119967
3010	NC_003065	CAT	2	6	168869	168874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119967
3011	NC_003065	GA	3	6	168891	168896	50 %	0 %	50 %	0 %	16119967
3012	NC_003065	CAAA	2	8	168932	168939	75 %	0 %	0 %	25 %	16119967
3013	NC_003065	AAG	2	6	169012	169017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119967
3014	NC_003065	CG	3	6	169038	169043	0 %	0 %	50 %	50 %	16119967
3015	NC_003065	GAT	2	6	169076	169081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119967
3016	NC_003065	GC	3	6	169100	169105	0 %	0 %	50 %	50 %	16119967
3017	NC_003065	CGA	2	6	169254	169259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119968
3018	NC_003065	GC	4	8	169296	169303	0 %	0 %	50 %	50 %	16119968
3019	NC_003065	GGT	2	6	169311	169316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119968
3020	NC_003065	GCG	2	6	169534	169539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119968
3021	NC_003065	GCA	2	6	169586	169591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119968
3022	NC_003065	GGGC	2	8	169712	169719	0 %	0 %	75 %	25 %	16119968
3023	NC_003065	GGC	2	6	169730	169735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119968
3024	NC_003065	GAACC	2	10	169816	169825	40 %	0 %	20 %	40 %	16119968
3025	NC_003065	CGG	2	6	169905	169910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119968
3026	NC_003065	ATC	2	6	169945	169950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119968
3027	NC_003065	GAG	2	6	169981	169986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119968
3028	NC_003065	GCA	2	6	169995	170000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119968
3029	NC_003065	GAG	2	6	170020	170025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119968
3030	NC_003065	GGA	2	6	170073	170078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119968
3031	NC_003065	TGA	2	6	170120	170125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119968
3032	NC_003065	TGA	2	6	170148	170153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119968
3033	NC_003065	GAC	2	6	170164	170169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119968
3034	NC_003065	AAT	2	6	170197	170202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119968
3035	NC_003065	CGGCTT	2	12	170346	170357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119968
3036	NC_003065	TA	3	6	170388	170393	50 %	50 %	0 %	0 %	16119968
3037	NC_003065	GAC	2	6	170733	170738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3038	NC_003065	GA	3	6	170749	170754	50 %	0 %	50 %	0 %	159161990
3039	NC_003065	TTG	2	6	170815	170820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161990
3040	NC_003065	ACCCA	2	10	170829	170838	40 %	0 %	0 %	60 %	159161990
3041	NC_003065	TCT	2	6	170839	170844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161990
3042	NC_003065	GTC	2	6	170913	170918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3043	NC_003065	TC	3	6	170917	170922	0 %	50 %	0 %	50 %	159161990
3044	NC_003065	TCG	2	6	170936	170941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3045	NC_003065	GAA	2	6	171036	171041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161990
3046	NC_003065	CAG	2	6	171108	171113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3047	NC_003065	CTG	2	6	171126	171131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3048	NC_003065	TACT	2	8	171158	171165	25 %	50 %	0 %	25 %	159161990
3049	NC_003065	ATC	2	6	171372	171377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161990
3050	NC_003065	GCA	2	6	171478	171483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161990
3051	NC_003065	ATG	2	6	171534	171539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161990
3052	NC_003065	T	6	6	171586	171591	0 %	100 %	0 %	0 %	159161990
3053	NC_003065	GC	3	6	171719	171724	0 %	0 %	50 %	50 %	159161991
3054	NC_003065	GCA	2	6	171808	171813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161991
3055	NC_003065	GATA	2	8	171861	171868	50 %	25 %	25 %	0 %	159161991
3056	NC_003065	AG	4	8	171878	171885	50 %	0 %	50 %	0 %	159161991
3057	NC_003065	TGA	2	6	172515	172520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119971
3058	NC_003065	CG	3	6	172713	172718	0 %	0 %	50 %	50 %	16119971
3059	NC_003065	ACA	2	6	173109	173114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119971
3060	NC_003065	AG	3	6	173115	173120	50 %	0 %	50 %	0 %	16119971
3061	NC_003065	AGC	2	6	173122	173127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119971
3062	NC_003065	A	6	6	173180	173185	100 %	0 %	0 %	0 %	16119971
3063	NC_003065	CGG	2	6	173219	173224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119971
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3065	NC_003065	CGT	2	6	173279	173284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119971
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3069	NC_003065	CCG	2	6	174100	174105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161992
3070	NC_003065	ATC	2	6	174165	174170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161992
3071	NC_003065	GA	3	6	174180	174185	50 %	0 %	50 %	0 %	159161992
3072	NC_003065	TCA	2	6	174193	174198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161992
3073	NC_003065	GACT	2	8	174236	174243	25 %	25 %	25 %	25 %	159161992
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3079	NC_003065	TTC	2	6	174614	174619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161993
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3081	NC_003065	GA	3	6	174694	174699	50 %	0 %	50 %	0 %	159161993
3082	NC_003065	TTC	2	6	174748	174753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161993
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3085	NC_003065	CAG	2	6	175035	175040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161994
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3087	NC_003065	TCG	2	6	175060	175065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161994
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3089	NC_003065	TCGG	2	8	175102	175109	0 %	25 %	50 %	25 %	159161994
3090	NC_003065	TCG	2	6	175189	175194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3091	NC_003065	GAC	2	6	175218	175223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119973
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3093	NC_003065	CGA	2	6	175283	175288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119973
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3099	NC_003065	CCTG	2	8	175435	175442	0 %	25 %	25 %	50 %	16119973
3100	NC_003065	TTTC	2	8	175659	175666	0 %	75 %	0 %	25 %	16119974
3101	NC_003065	CGA	2	6	175692	175697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119974
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3104	NC_003065	CGAA	2	8	175844	175851	50 %	0 %	25 %	25 %	16119974
3105	NC_003065	GAT	2	6	176071	176076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161995
3106	NC_003065	CGT	2	6	176116	176121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161995
3107	NC_003065	GCCT	2	8	176155	176162	0 %	25 %	25 %	50 %	159161995
3108	NC_003065	CCT	2	6	176217	176222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161995
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3111	NC_003065	AAT	2	6	176691	176696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159162009
3112	NC_003065	GCA	2	6	176730	176735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159162009
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3123	NC_003065	GCG	2	6	178080	178085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119976
3124	NC_003065	TTGC	2	8	178352	178359	0 %	50 %	25 %	25 %	159161996
3125	NC_003065	TGT	2	6	178370	178375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161996
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3128	NC_003065	CG	3	6	178603	178608	0 %	0 %	50 %	50 %	159161996
3129	NC_003065	TCG	2	6	178696	178701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161996
3130	NC_003065	GCT	2	6	178711	178716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161996
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3132	NC_003065	TCT	2	6	179311	179316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223351
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3153	NC_003065	TGC	2	6	181342	181347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
3154	NC_003065	AGC	2	6	181594	181599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119781
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3164	NC_003065	GCGT	2	8	181955	181962	0 %	25 %	50 %	25 %	16119781
3165	NC_003065	CAT	2	6	181973	181978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119781
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3171	NC_003065	TGG	2	6	182249	182254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119781
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3230	NC_003065	GTCATC	2	12	185090	185101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16119784
3231	NC_003065	TGG	2	6	185160	185165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119784
3232	NC_003065	CGT	2	6	185188	185193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119784
3233	NC_003065	T	7	7	185199	185205	0 %	100 %	0 %	0 %	16119784
3234	NC_003065	CGG	2	6	185211	185216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119784
3235	NC_003065	GCG	2	6	185244	185249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119784
3236	NC_003065	CG	3	6	185281	185286	0 %	0 %	50 %	50 %	16119784
3237	NC_003065	TCTA	2	8	185345	185352	25 %	50 %	0 %	25 %	16119786
3238	NC_003065	AGA	2	6	185391	185396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119786
3239	NC_003065	GATC	2	8	185399	185406	25 %	25 %	25 %	25 %	16119786
3240	NC_003065	TGA	2	6	185508	185513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119786
3241	NC_003065	AT	3	6	185524	185529	50 %	50 %	0 %	0 %	16119786
3242	NC_003065	GCC	2	6	185556	185561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119786
3243	NC_003065	CG	3	6	185568	185573	0 %	0 %	50 %	50 %	16119786
3244	NC_003065	GAG	2	6	185617	185622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119786
3245	NC_003065	TC	3	6	185628	185633	0 %	50 %	0 %	50 %	16119786
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3247	NC_003065	CGT	2	6	185818	185823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119786
3248	NC_003065	CGT	2	6	185913	185918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119786
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3252	NC_003065	CTCG	2	8	186122	186129	0 %	25 %	25 %	50 %	16119786
3253	NC_003065	GGA	2	6	186219	186224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119786
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3264	NC_003065	CG	3	6	186673	186678	0 %	0 %	50 %	50 %	16119786
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3493	NC_003065	GGATT	2	10	199844	199853	20 %	40 %	40 %	0 %	159162000
3494	NC_003065	GCGG	2	8	199872	199879	0 %	0 %	75 %	25 %	159162000
3495	NC_003065	TGA	2	6	199954	199959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223312
3496	NC_003065	GAT	2	6	200075	200080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223312
3497	NC_003065	TCT	2	6	200143	200148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223312
3498	NC_003065	GTC	2	6	200166	200171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223312
3499	NC_003065	TTG	2	6	200182	200187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223312
3500	NC_003065	CAT	2	6	200229	200234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223312

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