MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 3723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003065	TTCCGT	2	12	142173	142184	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16119942
2502	NC_003065	CAG	2	6	142221	142226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2503	NC_003065	GAA	2	6	142245	142250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119942
2504	NC_003065	GTC	2	6	142251	142256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2505	NC_003065	GCGG	2	8	142257	142264	0 %	0 %	75 %	25 %	16119942
2506	NC_003065	GGCGAC	2	12	142299	142310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16119942
2507	NC_003065	CCG	2	6	142372	142377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2508	NC_003065	CGGC	2	8	142405	142412	0 %	0 %	50 %	50 %	16119942
2509	NC_003065	CGC	2	6	142475	142480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2510	NC_003065	GTC	2	6	142513	142518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2511	NC_003065	CCG	2	6	142525	142530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2512	NC_003065	CGA	2	6	142554	142559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2513	NC_003065	AGCAG	2	10	142577	142586	40 %	0 %	40 %	20 %	16119942
2514	NC_003065	GCC	2	6	142596	142601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2515	NC_003065	GGC	2	6	142641	142646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119942
2516	NC_003065	GAT	3	9	142680	142688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119942
2517	NC_003065	GCC	2	6	142689	142694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2518	NC_003065	GCC	2	6	142714	142719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2519	NC_003065	GCC	2	6	142764	142769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2520	NC_003065	TGT	2	6	142785	142790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119942
2521	NC_003065	TGA	2	6	142841	142846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119942
2522	NC_003065	ATC	2	6	142864	142869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119942
2523	NC_003065	CGGC	2	8	142904	142911	0 %	0 %	50 %	50 %	16119942
2524	NC_003065	GCT	2	6	142914	142919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2525	NC_003065	CGC	2	6	142973	142978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2526	NC_003065	CGG	2	6	143000	143005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119942
2527	NC_003065	GCC	2	6	143131	143136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2528	NC_003065	GCT	2	6	143141	143146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2529	NC_003065	CGC	2	6	143169	143174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2530	NC_003065	CTT	2	6	143268	143273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119943
2531	NC_003065	CGG	2	6	143288	143293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119943
2532	NC_003065	CCG	2	6	143294	143299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119943
2533	NC_003065	CCG	2	6	143363	143368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119943
2534	NC_003065	T	6	6	143376	143381	0 %	100 %	0 %	0 %	16119943
2535	NC_003065	CTT	2	6	143392	143397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119943
2536	NC_003065	GCGT	2	8	143398	143405	0 %	25 %	50 %	25 %	16119943
2537	NC_003065	CT	3	6	143502	143507	0 %	50 %	0 %	50 %	16119944
2538	NC_003065	GCC	2	6	143540	143545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119944
2539	NC_003065	CTC	2	6	143591	143596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119944
2540	NC_003065	TTCG	2	8	143641	143648	0 %	50 %	25 %	25 %	16119944
2541	NC_003065	TTC	2	6	143696	143701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119944
2542	NC_003065	GAT	2	6	143712	143717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119944
2543	NC_003065	TTC	2	6	143721	143726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119944
2544	NC_003065	CCG	2	6	143982	143987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161979
2545	NC_003065	CAGC	2	8	144006	144013	25 %	0 %	25 %	50 %	159161979
2546	NC_003065	GTG	2	6	144041	144046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161979
2547	NC_003065	GCAA	2	8	144117	144124	50 %	0 %	25 %	25 %	159161979
2548	NC_003065	CGG	2	6	144153	144158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161979
2549	NC_003065	CG	3	6	144176	144181	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2550	NC_003065	TGA	2	6	144420	144425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161979
2551	NC_003065	AAG	2	6	144464	144469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161979
2552	NC_003065	GACG	2	8	144547	144554	25 %	0 %	50 %	25 %	159161979
2553	NC_003065	CGT	2	6	144562	144567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2554	NC_003065	GATG	2	8	144572	144579	25 %	25 %	50 %	0 %	159161979
2555	NC_003065	GGC	2	6	144611	144616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161979
2556	NC_003065	CGA	2	6	144672	144677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2557	NC_003065	AAC	2	6	144720	144725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159161979
2558	NC_003065	GAA	2	6	144764	144769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161979
2559	NC_003065	CGC	2	6	144770	144775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161979
2560	NC_003065	CGC	2	6	144788	144793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161979
2561	NC_003065	TGC	2	6	144873	144878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2562	NC_003065	CGA	2	6	144889	144894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2563	NC_003065	CCG	2	6	144897	144902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161979
2564	NC_003065	CAG	2	6	144908	144913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2565	NC_003065	CAT	2	6	144925	144930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161979
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2567	NC_003065	GC	3	6	144998	145003	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2568	NC_003065	GAT	2	6	145018	145023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161979
2569	NC_003065	CGA	2	6	145035	145040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2570	NC_003065	CGG	2	6	145092	145097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161979
2571	NC_003065	GGC	2	6	145116	145121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161979
2572	NC_003065	GGC	2	6	145125	145130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161979
2573	NC_003065	GGA	2	6	145135	145140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161979
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2576	NC_003065	GTC	2	6	145190	145195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2577	NC_003065	CG	3	6	145199	145204	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2578	NC_003065	GAT	2	6	145222	145227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161979
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2580	NC_003065	GTC	2	6	145268	145273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2581	NC_003065	GC	3	6	145278	145283	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2582	NC_003065	CTC	2	6	145342	145347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161979
2583	NC_003065	TGG	2	6	145422	145427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161979
2584	NC_003065	CGT	2	6	145459	145464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
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2588	NC_003065	CAATGC	2	12	145663	145674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159161979
2589	NC_003065	TTG	2	6	145680	145685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161979
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2591	NC_003065	GC	3	6	145811	145816	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2592	NC_003065	TCG	2	6	145839	145844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2593	NC_003065	GAA	2	6	145915	145920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161979
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2599	NC_003065	CGA	2	6	146070	146075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
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2601	NC_003065	GAC	2	6	146263	146268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2602	NC_003065	GCGCT	2	10	146303	146312	0 %	20 %	40 %	40 %	159161979
2603	NC_003065	CAT	2	6	146335	146340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161979
2604	NC_003065	TGC	2	6	146358	146363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2605	NC_003065	A	6	6	146391	146396	100 %	0 %	0 %	0 %	159161979
2606	NC_003065	GCCTCG	2	12	146442	146453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159161979
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2608	NC_003065	CGGT	2	8	146538	146545	0 %	25 %	50 %	25 %	159161979
2609	NC_003065	AGC	2	6	146574	146579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161979
2610	NC_003065	GAG	2	6	146585	146590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161979
2611	NC_003065	GC	3	6	146597	146602	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2612	NC_003065	AGG	2	6	146673	146678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161979
2613	NC_003065	ATCG	2	8	146719	146726	25 %	25 %	25 %	25 %	159161979
2614	NC_003065	GC	3	6	146777	146782	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2615	NC_003065	GAA	2	6	146873	146878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161979
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2617	NC_003065	GCCG	2	8	146923	146930	0 %	0 %	50 %	50 %	159161979
2618	NC_003065	GTG	2	6	146936	146941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161979
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2622	NC_003065	AAGC	2	8	147164	147171	50 %	0 %	25 %	25 %	159161979
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2865	NC_003065	TCG	2	6	160588	160593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161985
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2868	NC_003065	GAC	2	6	160680	160685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
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2985	NC_003065	TGC	2	6	167295	167300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161988
2986	NC_003065	GCA	2	6	167358	167363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161988
2987	NC_003065	GGC	2	6	167547	167552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161989
2988	NC_003065	CCA	2	6	167643	167648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159161989
2989	NC_003065	CGA	2	6	167694	167699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161989
2990	NC_003065	TTG	2	6	167780	167785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161989
2991	NC_003065	TTA	2	6	167804	167809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159161989
2992	NC_003065	AGC	2	6	167892	167897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119967
2993	NC_003065	GACC	2	8	167906	167913	25 %	0 %	25 %	50 %	16119967
2994	NC_003065	GGAG	2	8	168034	168041	25 %	0 %	75 %	0 %	16119967
2995	NC_003065	CG	3	6	168063	168068	0 %	0 %	50 %	50 %	16119967
2996	NC_003065	GAT	2	6	168069	168074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119967
2997	NC_003065	CTG	2	6	168081	168086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119967
2998	NC_003065	GAT	2	6	168248	168253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119967
2999	NC_003065	TTC	2	6	168408	168413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119967
3000	NC_003065	GCT	2	6	168439	168444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119967

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