MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 3723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003065	GCG	2	6	114085	114090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119907
2002	NC_003065	AGC	2	6	114122	114127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2003	NC_003065	GACG	2	8	114156	114163	25 %	0 %	50 %	25 %	16119907
2004	NC_003065	GCA	2	6	114210	114215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2005	NC_003065	CAT	2	6	114255	114260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119907
2006	NC_003065	CCG	2	6	114308	114313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119907
2007	NC_003065	TCA	2	6	114362	114367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119907
2008	NC_003065	GACCG	2	10	114381	114390	20 %	0 %	40 %	40 %	16119907
2009	NC_003065	TCG	2	6	114398	114403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2010	NC_003065	GCG	3	9	114426	114434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119907
2011	NC_003065	GAT	2	6	114453	114458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119907
2012	NC_003065	CAG	2	6	114511	114516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2013	NC_003065	GCCG	2	8	114576	114583	0 %	0 %	50 %	50 %	16119907
2014	NC_003065	TGA	2	6	114591	114596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119907
2015	NC_003065	TGT	2	6	114648	114653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119907
2016	NC_003065	CG	3	6	114659	114664	0 %	0 %	50 %	50 %	16119907
2017	NC_003065	TCG	3	9	114979	114987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2018	NC_003065	AGC	2	6	115251	115256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2019	NC_003065	TGG	2	6	115329	115334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119908
2020	NC_003065	GC	3	6	115358	115363	0 %	0 %	50 %	50 %	16119908
2021	NC_003065	GCT	2	6	115407	115412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2022	NC_003065	ATT	2	6	115478	115483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119908
2023	NC_003065	TCA	2	6	115502	115507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119908
2024	NC_003065	AAC	2	6	115597	115602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119908
2025	NC_003065	GGC	2	6	115624	115629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119908
2026	NC_003065	TGC	3	9	115698	115706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2027	NC_003065	CG	3	6	115724	115729	0 %	0 %	50 %	50 %	16119908
2028	NC_003065	ATC	2	6	115747	115752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119908
2029	NC_003065	ATG	2	6	115757	115762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119908
2030	NC_003065	CGA	2	6	115779	115784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2031	NC_003065	TGC	2	6	115801	115806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2032	NC_003065	CAG	2	6	115915	115920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2033	NC_003065	GAG	2	6	115930	115935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119908
2034	NC_003065	CTG	2	6	116008	116013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119908
2035	NC_003065	ATT	2	6	116030	116035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119908
2036	NC_003065	GATG	2	8	116432	116439	25 %	25 %	50 %	0 %	16119909
2037	NC_003065	CGA	2	6	116465	116470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119909
2038	NC_003065	GCC	2	6	116501	116506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119909
2039	NC_003065	CGA	2	6	116711	116716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119909
2040	NC_003065	CGA	3	9	116720	116728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119909
2041	NC_003065	CGGG	2	8	116761	116768	0 %	0 %	75 %	25 %	16119909
2042	NC_003065	CGC	2	6	116833	116838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161972
2043	NC_003065	CCT	2	6	116898	116903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161972
2044	NC_003065	AAG	2	6	117000	117005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161972
2045	NC_003065	GAA	2	6	117012	117017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161972
2046	NC_003065	GCAG	2	8	117053	117060	25 %	0 %	50 %	25 %	159161972
2047	NC_003065	CGG	3	9	117110	117118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161972
2048	NC_003065	ATC	2	6	117126	117131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161972
2049	NC_003065	GC	3	6	117294	117299	0 %	0 %	50 %	50 %	159161972
2050	NC_003065	GATC	2	8	117302	117309	25 %	25 %	25 %	25 %	159161972
2051	NC_003065	GCCG	2	8	117311	117318	0 %	0 %	50 %	50 %	159161972
2052	NC_003065	CGA	2	6	117386	117391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161972
2053	NC_003065	CG	3	6	117454	117459	0 %	0 %	50 %	50 %	159161972
2054	NC_003065	GCA	2	6	117460	117465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161972
2055	NC_003065	GGA	2	6	117509	117514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161972
2056	NC_003065	GTT	2	6	117560	117565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161972
2057	NC_003065	GCGCC	2	10	117585	117594	0 %	0 %	40 %	60 %	159161972
2058	NC_003065	CGG	3	9	117677	117685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161972
2059	NC_003065	GCG	2	6	117705	117710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161972
2060	NC_003065	GGC	2	6	117722	117727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161972
2061	NC_003065	TGG	2	6	117742	117747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161972
2062	NC_003065	CGC	2	6	117749	117754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161972
2063	NC_003065	ATA	2	6	117760	117765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159161972
2064	NC_003065	GC	3	6	117884	117889	0 %	0 %	50 %	50 %	159161972
2065	NC_003065	GAG	2	6	117896	117901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161972
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2068	NC_003065	GGAT	2	8	118071	118078	25 %	25 %	50 %	0 %	16119911
2069	NC_003065	TGG	2	6	118092	118097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119911
2070	NC_003065	TCG	2	6	118113	118118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119911
2071	NC_003065	CGT	2	6	118217	118222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119911
2072	NC_003065	CTGC	2	8	118230	118237	0 %	25 %	25 %	50 %	16119911
2073	NC_003065	CGT	2	6	118320	118325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119911
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2076	NC_003065	GGTC	2	8	118465	118472	0 %	25 %	50 %	25 %	16119911
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2079	NC_003065	CGAGC	2	10	118783	118792	20 %	0 %	40 %	40 %	16119912
2080	NC_003065	GC	3	6	118903	118908	0 %	0 %	50 %	50 %	16119912
2081	NC_003065	CGT	2	6	118920	118925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119912
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2086	NC_003065	GCA	2	6	119465	119470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223335
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2088	NC_003065	CGA	2	6	119579	119584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223335
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2103	NC_003065	CGAT	2	8	120479	120486	25 %	25 %	25 %	25 %	16119916
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2109	NC_003065	CGC	2	6	120685	120690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119916
2110	NC_003065	CG	5	10	120700	120709	0 %	0 %	50 %	50 %	16119916
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2115	NC_003065	CGGAC	2	10	121235	121244	20 %	0 %	40 %	40 %	16119916
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2118	NC_003065	TCGA	2	8	121309	121316	25 %	25 %	25 %	25 %	16119916
2119	NC_003065	TCC	2	6	121381	121386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119916
2120	NC_003065	GC	3	6	121387	121392	0 %	0 %	50 %	50 %	16119916
2121	NC_003065	CGG	2	6	121409	121414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119916
2122	NC_003065	GCC	2	6	121423	121428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119916
2123	NC_003065	CGT	3	9	121473	121481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2124	NC_003065	TTC	2	6	121492	121497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119916
2125	NC_003065	CGCAAG	2	12	121498	121509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2126	NC_003065	TC	3	6	121530	121535	0 %	50 %	0 %	50 %	16119916
2127	NC_003065	GAG	2	6	121549	121554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119916
2128	NC_003065	CGA	2	6	121572	121577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
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2131	NC_003065	GCC	2	6	121717	121722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119916
2132	NC_003065	CCCA	2	8	121759	121766	25 %	0 %	0 %	75 %	16119916
2133	NC_003065	GATC	2	8	121767	121774	25 %	25 %	25 %	25 %	16119916
2134	NC_003065	CGA	2	6	121794	121799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
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2142	NC_003065	GCTG	2	8	122195	122202	0 %	25 %	50 %	25 %	16119916
2143	NC_003065	ACCG	2	8	122263	122270	25 %	0 %	25 %	50 %	16119916
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2243	NC_003065	CAGT	2	8	126791	126798	25 %	25 %	25 %	25 %	159161973
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2246	NC_003065	GAT	2	6	126872	126877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161973
2247	NC_003065	TCG	2	6	126882	126887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161973
2248	NC_003065	GAC	2	6	126992	126997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161973
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2251	NC_003065	CGG	2	6	127196	127201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161973
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2353	NC_003065	CG	3	6	132689	132694	0 %	0 %	50 %	50 %	16119926
2354	NC_003065	ATCG	2	8	132702	132709	25 %	25 %	25 %	25 %	16119926
2355	NC_003065	ATG	2	6	132712	132717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119926
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2359	NC_003065	TCGA	2	8	133067	133074	25 %	25 %	25 %	25 %	16119926
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2365	NC_003065	GCC	2	6	133799	133804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161975
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2367	NC_003065	CAC	2	6	133915	133920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159161975
2368	NC_003065	CAA	2	6	133927	133932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159161975
2369	NC_003065	CAT	2	6	133936	133941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161975
2370	NC_003065	CG	3	6	134004	134009	0 %	0 %	50 %	50 %	159161975
2371	NC_003065	CGG	2	6	134032	134037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161975
2372	NC_003065	ACG	2	6	134079	134084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161975
2373	NC_003065	CGA	2	6	134110	134115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161975
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2375	NC_003065	TCA	2	6	134301	134306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161976
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2452	NC_003065	CTT	2	6	139520	139525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223342
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2484	NC_003065	TCG	2	6	141424	141429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
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2488	NC_003065	TGGTC	2	10	141527	141536	0 %	40 %	40 %	20 %	16119942
2489	NC_003065	GGT	2	6	141546	141551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119942
2490	NC_003065	CGG	2	6	141578	141583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119942
2491	NC_003065	CGCC	2	8	141652	141659	0 %	0 %	25 %	75 %	16119942
2492	NC_003065	ATC	2	6	141694	141699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119942
2493	NC_003065	ATG	2	6	141706	141711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119942
2494	NC_003065	TCG	2	6	141775	141780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2495	NC_003065	AGC	2	6	141835	141840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2496	NC_003065	GAC	2	6	141849	141854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2497	NC_003065	CG	3	6	141856	141861	0 %	0 %	50 %	50 %	16119942
2498	NC_003065	CCG	2	6	141916	141921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119942
2499	NC_003065	TCG	2	6	141931	141936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119942
2500	NC_003065	CG	4	8	142111	142118	0 %	0 %	50 %	50 %	16119942

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