MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 3723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003065	TCG	2	6	34855	34860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119835
502	NC_003065	GTG	2	6	34902	34907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119835
503	NC_003065	CGG	4	12	34919	34930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
504	NC_003065	CCG	2	6	34934	34939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119835
505	NC_003065	CAGCG	2	10	34980	34989	20 %	0 %	40 %	40 %	16119835
506	NC_003065	CGC	2	6	35058	35063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119835
507	NC_003065	GCG	2	6	35080	35085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
508	NC_003065	CG	3	6	35121	35126	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
509	NC_003065	G	6	6	35180	35185	0 %	0 %	100 %	0 %	16119835
510	NC_003065	TCT	2	6	35195	35200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119835
511	NC_003065	GTC	2	6	35211	35216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119835
512	NC_003065	TCGG	2	8	35241	35248	0 %	25 %	50 %	25 %	16119835
513	NC_003065	GGC	2	6	35342	35347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
514	NC_003065	CG	4	8	35351	35358	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
515	NC_003065	GCC	2	6	35391	35396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119835
516	NC_003065	GTC	2	6	35409	35414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119835
517	NC_003065	CGA	2	6	35435	35440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119835
518	NC_003065	GGC	2	6	35441	35446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
519	NC_003065	CGC	2	6	35460	35465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119835
520	NC_003065	GAC	2	6	35487	35492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119835
521	NC_003065	GCA	2	6	35537	35542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119835
522	NC_003065	CAGC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	25 %	50 %	16119835
523	NC_003065	TCG	2	6	35602	35607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119835
524	NC_003065	TCA	2	6	35615	35620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119835
525	NC_003065	GAA	2	6	35679	35684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119835
526	NC_003065	GCCG	2	8	35685	35692	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
527	NC_003065	GCG	2	6	35699	35704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
528	NC_003065	CGA	2	6	35866	35871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119836
529	NC_003065	AAC	2	6	35957	35962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119836
530	NC_003065	CAG	2	6	36074	36079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119836
531	NC_003065	GTT	2	6	36094	36099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119836
532	NC_003065	TGG	2	6	36412	36417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119836
533	NC_003065	GAT	2	6	36434	36439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119836
534	NC_003065	CCG	2	6	36450	36455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119836
535	NC_003065	CCG	2	6	36465	36470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119836
536	NC_003065	TCG	2	6	36498	36503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119836
537	NC_003065	CG	3	6	36522	36527	0 %	0 %	50 %	50 %	16119836
538	NC_003065	ATG	2	6	36538	36543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119836
539	NC_003065	CGC	2	6	36567	36572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119836
540	NC_003065	CTG	2	6	36623	36628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119836
541	NC_003065	TTC	2	6	36683	36688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119836
542	NC_003065	AGC	2	6	36703	36708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119836
543	NC_003065	GC	3	6	36897	36902	0 %	0 %	50 %	50 %	16119837
544	NC_003065	CCA	2	6	36917	36922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119837
545	NC_003065	AACG	2	8	36950	36957	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
546	NC_003065	CGA	2	6	36982	36987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119837
547	NC_003065	GAT	2	6	37019	37024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
548	NC_003065	AAGC	2	8	37066	37073	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
549	NC_003065	TGA	3	9	37084	37092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
550	NC_003065	TCC	2	6	37150	37155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119837
551	NC_003065	GAA	2	6	37162	37167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119837
552	NC_003065	GCT	2	6	37191	37196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119837
553	NC_003065	GCC	2	6	37226	37231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119837
554	NC_003065	GAT	2	6	37235	37240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
555	NC_003065	GAC	2	6	37308	37313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119837
556	NC_003065	GA	3	6	37329	37334	50 %	0 %	50 %	0 %	16119837
557	NC_003065	GTA	2	6	37358	37363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
558	NC_003065	GCG	2	6	37387	37392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119837
559	NC_003065	TGA	2	6	37399	37404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
560	NC_003065	GAA	2	6	37428	37433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119837
561	NC_003065	TTC	2	6	37443	37448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119837
562	NC_003065	ACA	2	6	37479	37484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119837
563	NC_003065	GAG	2	6	37493	37498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119837
564	NC_003065	CGT	2	6	37520	37525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119837
565	NC_003065	CGG	2	6	37531	37536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119837
566	NC_003065	GAT	2	6	37559	37564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
567	NC_003065	CTC	2	6	37588	37593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119838
568	NC_003065	GGA	2	6	37644	37649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119838
569	NC_003065	TCG	2	6	37700	37705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119838
570	NC_003065	CGA	2	6	37748	37753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
571	NC_003065	GGC	2	6	37821	37826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119838
572	NC_003065	GGCGCA	2	12	37844	37855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16119838
573	NC_003065	GCT	2	6	37882	37887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119838
574	NC_003065	GCA	2	6	38039	38044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
575	NC_003065	CCG	2	6	38053	38058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119838
576	NC_003065	GAT	2	6	38073	38078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
577	NC_003065	AAC	2	6	38100	38105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119838
578	NC_003065	GCA	2	6	38161	38166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
579	NC_003065	GAT	2	6	38181	38186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
580	NC_003065	TCA	2	6	38222	38227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119838
581	NC_003065	C	6	6	38264	38269	0 %	0 %	0 %	100 %	16119838
582	NC_003065	AGT	2	6	38275	38280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
583	NC_003065	CGT	2	6	38382	38387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223319
584	NC_003065	GGC	2	6	38434	38439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223319
585	NC_003065	TCT	2	6	38477	38482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223319
586	NC_003065	C	7	7	38518	38524	0 %	0 %	0 %	100 %	41223319
587	NC_003065	TTG	2	6	38555	38560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223319
588	NC_003065	ACG	2	6	38639	38644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223319
589	NC_003065	CAT	2	6	38683	38688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223319
590	NC_003065	GTC	2	6	38852	38857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223319
591	NC_003065	GAG	2	6	38875	38880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41223319
592	NC_003065	CG	3	6	38910	38915	0 %	0 %	50 %	50 %	41223319
593	NC_003065	CGC	2	6	38932	38937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223319
594	NC_003065	ATG	2	6	38939	38944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223319
595	NC_003065	CAT	2	6	38946	38951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223319
596	NC_003065	ATCCC	2	10	38978	38987	20 %	20 %	0 %	60 %	41223319
597	NC_003065	CGA	2	6	38997	39002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223319
598	NC_003065	CCGC	2	8	39071	39078	0 %	0 %	25 %	75 %	41223319
599	NC_003065	CTTGG	2	10	39139	39148	0 %	40 %	40 %	20 %	41223319
600	NC_003065	GAA	2	6	39205	39210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41223319
601	NC_003065	CTT	2	6	39337	39342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
602	NC_003065	CAC	2	6	39428	39433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
603	NC_003065	GTCC	2	8	39441	39448	0 %	25 %	25 %	50 %	41223320
604	NC_003065	CCA	2	6	39487	39492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
605	NC_003065	TCG	2	6	39519	39524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223320
606	NC_003065	GC	3	6	39553	39558	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
607	NC_003065	GCT	3	9	39574	39582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223320
608	NC_003065	CCG	2	6	39585	39590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223320
609	NC_003065	GGC	2	6	39608	39613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223320
610	NC_003065	GTTT	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	41223320
611	NC_003065	CG	3	6	39653	39658	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
612	NC_003065	GCATGC	2	12	39772	39783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41223320
613	NC_003065	GAC	2	6	39836	39841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223320
614	NC_003065	CTT	2	6	39844	39849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
615	NC_003065	GCCGGA	2	12	39920	39931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41223320
616	NC_003065	TCT	2	6	40020	40025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
617	NC_003065	CCA	2	6	40027	40032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
618	NC_003065	GGGT	2	8	40033	40040	0 %	25 %	75 %	0 %	41223320
619	NC_003065	CAG	2	6	40369	40374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161955
620	NC_003065	CTGAA	2	10	40558	40567	40 %	20 %	20 %	20 %	159161955
621	NC_003065	TTCC	2	8	40690	40697	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
622	NC_003065	TGGC	2	8	40753	40760	0 %	25 %	50 %	25 %	159161955
623	NC_003065	CAC	2	6	40775	40780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159161955
624	NC_003065	CCTT	2	8	40791	40798	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
625	NC_003065	CTGC	2	8	40808	40815	0 %	25 %	25 %	50 %	159161955
626	NC_003065	GCC	2	6	40817	40822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
627	NC_003065	CT	3	6	40890	40895	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
628	NC_003065	CGC	2	6	40925	40930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
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758	NC_003065	CGA	2	6	46287	46292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119848
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869	NC_003065	CT	3	6	51565	51570	0 %	50 %	0 %	50 %	16119854
870	NC_003065	GCGA	2	8	51589	51596	25 %	0 %	50 %	25 %	16119854
871	NC_003065	GAG	2	6	51606	51611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119854
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877	NC_003065	TGA	2	6	52402	52407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161958
878	NC_003065	CTGG	2	8	52440	52447	0 %	25 %	50 %	25 %	159161958
879	NC_003065	ACGG	2	8	52477	52484	25 %	0 %	50 %	25 %	159161958
880	NC_003065	CTCGA	2	10	52535	52544	20 %	20 %	20 %	40 %	159161958
881	NC_003065	GAC	3	9	52637	52645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161958
882	NC_003065	TCGATC	2	12	52699	52710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159161958
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