MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 1174

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003064	CGGC	2	8	460060	460067	0 %	0 %	50 %	50 %	159186637
1002	NC_003064	AGGC	2	8	460669	460676	25 %	0 %	50 %	25 %	159186637
1003	NC_003064	TGTT	2	8	461397	461404	0 %	75 %	25 %	0 %	159186638
1004	NC_003064	TCAT	2	8	461951	461958	25 %	50 %	0 %	25 %	16119697
1005	NC_003064	CCGT	2	8	462109	462116	0 %	25 %	25 %	50 %	16119697
1006	NC_003064	TTCT	2	8	463572	463579	0 %	75 %	0 %	25 %	16119699
1007	NC_003064	AGCA	2	8	463587	463594	50 %	0 %	25 %	25 %	16119699
1008	NC_003064	TCGA	2	8	465365	465372	25 %	25 %	25 %	25 %	16119702
1009	NC_003064	CCAG	2	8	465615	465622	25 %	0 %	25 %	50 %	16119702
1010	NC_003064	GAGC	2	8	465965	465972	25 %	0 %	50 %	25 %	16119702
1011	NC_003064	GCCA	2	8	466274	466281	25 %	0 %	25 %	50 %	159186639
1012	NC_003064	AGGA	2	8	466550	466557	50 %	0 %	50 %	0 %	159186639
1013	NC_003064	CGGC	2	8	466745	466752	0 %	0 %	50 %	50 %	159186639
1014	NC_003064	ACGA	2	8	467283	467290	50 %	0 %	25 %	25 %	16119704
1015	NC_003064	CTGC	2	8	467643	467650	0 %	25 %	25 %	50 %	16119705
1016	NC_003064	ACCA	2	8	468348	468355	50 %	0 %	0 %	50 %	16119705
1017	NC_003064	TCGG	2	8	468376	468383	0 %	25 %	50 %	25 %	16119705
1018	NC_003064	GGAT	2	8	468565	468572	25 %	25 %	50 %	0 %	16119705
1019	NC_003064	CGAT	2	8	468897	468904	25 %	25 %	25 %	25 %	16119706
1020	NC_003064	CGAG	2	8	469201	469208	25 %	0 %	50 %	25 %	16119706
1021	NC_003064	CCTC	2	8	469249	469256	0 %	25 %	0 %	75 %	16119706
1022	NC_003064	CGGC	2	8	469843	469850	0 %	0 %	50 %	50 %	16119706
1023	NC_003064	CGAG	2	8	470513	470520	25 %	0 %	50 %	25 %	159186640
1024	NC_003064	CGAG	2	8	471278	471285	25 %	0 %	50 %	25 %	16119709
1025	NC_003064	CGTT	2	8	472349	472356	0 %	50 %	25 %	25 %	16119710
1026	NC_003064	GAAA	2	8	472641	472648	75 %	0 %	25 %	0 %	16119710
1027	NC_003064	GCGG	2	8	473376	473383	0 %	0 %	75 %	25 %	16119711
1028	NC_003064	TTCA	2	8	473508	473515	25 %	50 %	0 %	25 %	16119711
1029	NC_003064	TGCC	2	8	474269	474276	0 %	25 %	25 %	50 %	16119712
1030	NC_003064	CAAT	2	8	474617	474624	50 %	25 %	0 %	25 %	16119712
1031	NC_003064	GCCA	2	8	474950	474957	25 %	0 %	25 %	50 %	159186641
1032	NC_003064	TTCT	2	8	475158	475165	0 %	75 %	0 %	25 %	159186641
1033	NC_003064	CGAC	2	8	475401	475408	25 %	0 %	25 %	50 %	159186641
1034	NC_003064	GCCG	2	8	475463	475470	0 %	0 %	50 %	50 %	159186641
1035	NC_003064	TTCT	2	8	475638	475645	0 %	75 %	0 %	25 %	159186641
1036	NC_003064	GCAG	2	8	476274	476281	25 %	0 %	50 %	25 %	16119714
1037	NC_003064	ATCG	2	8	477731	477738	25 %	25 %	25 %	25 %	17939068
1038	NC_003064	TGGT	2	8	477746	477753	0 %	50 %	50 %	0 %	17939068
1039	NC_003064	TGGC	2	8	478425	478432	0 %	25 %	50 %	25 %	17939070
1040	NC_003064	CAAA	2	8	478436	478443	75 %	0 %	0 %	25 %	17939070
1041	NC_003064	TTGC	2	8	478669	478676	0 %	50 %	25 %	25 %	17939070
1042	NC_003064	ATTG	2	8	479653	479660	25 %	50 %	25 %	0 %	16119717
1043	NC_003064	ACCG	2	8	479667	479674	25 %	0 %	25 %	50 %	16119717
1044	NC_003064	GCAG	2	8	480207	480214	25 %	0 %	50 %	25 %	16119718
1045	NC_003064	ATCA	2	8	480654	480661	50 %	25 %	0 %	25 %	159186643
1046	NC_003064	GAAT	2	8	481206	481213	50 %	25 %	25 %	0 %	159186643
1047	NC_003064	GCCG	2	8	481484	481491	0 %	0 %	50 %	50 %	159186643
1048	NC_003064	GGAA	2	8	481802	481809	50 %	0 %	50 %	0 %	159186643
1049	NC_003064	TGAA	2	8	481975	481982	50 %	25 %	25 %	0 %	159186643
1050	NC_003064	ATGG	2	8	482430	482437	25 %	25 %	50 %	0 %	159186643
1051	NC_003064	ATCA	2	8	482549	482556	50 %	25 %	0 %	25 %	16119720
1052	NC_003064	AGCC	2	8	482891	482898	25 %	0 %	25 %	50 %	16119720
1053	NC_003064	TCGC	2	8	484358	484365	0 %	25 %	25 %	50 %	159186645
1054	NC_003064	CCAT	2	8	486338	486345	25 %	25 %	0 %	50 %	159186647
1055	NC_003064	CGCA	2	8	486859	486866	25 %	0 %	25 %	50 %	159186647
1056	NC_003064	GTTG	2	8	487178	487185	0 %	50 %	50 %	0 %	16119725
1057	NC_003064	CTGG	2	8	487664	487671	0 %	25 %	50 %	25 %	16119725
1058	NC_003064	CGGC	2	8	487802	487809	0 %	0 %	50 %	50 %	16119725
1059	NC_003064	TGAT	2	8	487829	487836	25 %	50 %	25 %	0 %	16119725
1060	NC_003064	CGCA	2	8	487945	487952	25 %	0 %	25 %	50 %	16119725
1061	NC_003064	TCGC	2	8	488003	488010	0 %	25 %	25 %	50 %	16119725
1062	NC_003064	TCCG	2	8	489258	489265	0 %	25 %	25 %	50 %	16119727
1063	NC_003064	GGTC	2	8	489445	489452	0 %	25 %	50 %	25 %	16119727
1064	NC_003064	CCAG	2	8	490468	490475	25 %	0 %	25 %	50 %	16119728
1065	NC_003064	CGCC	2	8	490808	490815	0 %	0 %	25 %	75 %	16119728
1066	NC_003064	GGCC	2	8	491561	491568	0 %	0 %	50 %	50 %	16119728
1067	NC_003064	GCAC	2	8	491670	491677	25 %	0 %	25 %	50 %	16119728
1068	NC_003064	GCCC	2	8	492632	492639	0 %	0 %	25 %	75 %	159186648
1069	NC_003064	GGCT	2	8	492975	492982	0 %	25 %	50 %	25 %	159186648
1070	NC_003064	GCTG	2	8	493825	493832	0 %	25 %	50 %	25 %	16119730
1071	NC_003064	CTGC	2	8	494229	494236	0 %	25 %	25 %	50 %	16119731
1072	NC_003064	TCGT	2	8	494559	494566	0 %	50 %	25 %	25 %	16119731
1073	NC_003064	TCGA	2	8	494715	494722	25 %	25 %	25 %	25 %	16119731
1074	NC_003064	ACCG	2	8	495146	495153	25 %	0 %	25 %	50 %	16119731
1075	NC_003064	ACGG	2	8	496150	496157	25 %	0 %	50 %	25 %	16119732
1076	NC_003064	TGGT	2	8	496871	496878	0 %	50 %	50 %	0 %	16119733
1077	NC_003064	ACGG	2	8	497292	497299	25 %	0 %	50 %	25 %	16119734
1078	NC_003064	GTCT	2	8	497783	497790	0 %	50 %	25 %	25 %	16119734
1079	NC_003064	GATC	2	8	497893	497900	25 %	25 %	25 %	25 %	16119734
1080	NC_003064	CCTC	2	8	499126	499133	0 %	25 %	0 %	75 %	159186649
1081	NC_003064	CGAC	2	8	499336	499343	25 %	0 %	25 %	50 %	159186649
1082	NC_003064	GCTG	2	8	500979	500986	0 %	25 %	50 %	25 %	159186650
1083	NC_003064	AGGC	2	8	501487	501494	25 %	0 %	50 %	25 %	159186651
1084	NC_003064	ATCA	2	8	501589	501596	50 %	25 %	0 %	25 %	159186651
1085	NC_003064	GTCA	2	8	501646	501653	25 %	25 %	25 %	25 %	159186651
1086	NC_003064	CTTC	2	8	502035	502042	0 %	50 %	0 %	50 %	159186651
1087	NC_003064	ATCA	2	8	502330	502337	50 %	25 %	0 %	25 %	159186651
1088	NC_003064	CTGA	2	8	502501	502508	25 %	25 %	25 %	25 %	159186651
1089	NC_003064	ACCG	2	8	503222	503229	25 %	0 %	25 %	50 %	159186651
1090	NC_003064	CCTG	2	8	503722	503729	0 %	25 %	25 %	50 %	16119739
1091	NC_003064	CTCC	2	8	504754	504761	0 %	25 %	0 %	75 %	16119739
1092	NC_003064	GCAA	2	8	505612	505619	50 %	0 %	25 %	25 %	16119741
1093	NC_003064	CTGT	2	8	505751	505758	0 %	50 %	25 %	25 %	16119741
1094	NC_003064	TGAA	2	8	506085	506092	50 %	25 %	25 %	0 %	16119742
1095	NC_003064	CCCA	2	8	506808	506815	25 %	0 %	0 %	75 %	159186653
1096	NC_003064	GTTC	2	8	506917	506924	0 %	50 %	25 %	25 %	159186653
1097	NC_003064	TCGA	2	8	507154	507161	25 %	25 %	25 %	25 %	159186653
1098	NC_003064	ATCA	2	8	508322	508329	50 %	25 %	0 %	25 %	16119745
1099	NC_003064	TCCA	2	8	508535	508542	25 %	25 %	0 %	50 %	16119745
1100	NC_003064	CAGG	2	8	509478	509485	25 %	0 %	50 %	25 %	16119746
1101	NC_003064	TTGC	2	8	510360	510367	0 %	50 %	25 %	25 %	16119747
1102	NC_003064	AGAC	2	8	510814	510821	50 %	0 %	25 %	25 %	16119747
1103	NC_003064	AGCT	2	8	511741	511748	25 %	25 %	25 %	25 %	159186655
1104	NC_003064	CGTG	2	8	513404	513411	0 %	25 %	50 %	25 %	159186656
1105	NC_003064	TTGA	2	8	513916	513923	25 %	50 %	25 %	0 %	159186657
1106	NC_003064	CCTT	2	8	514552	514559	0 %	50 %	0 %	50 %	159186657
1107	NC_003064	GTCG	2	8	514641	514648	0 %	25 %	50 %	25 %	159186657
1108	NC_003064	CGCC	2	8	515174	515181	0 %	0 %	25 %	75 %	16119752
1109	NC_003064	GAAC	2	8	515441	515448	50 %	0 %	25 %	25 %	16119752
1110	NC_003064	AGCC	2	8	515461	515468	25 %	0 %	25 %	50 %	16119752
1111	NC_003064	TTCG	2	8	515768	515775	0 %	50 %	25 %	25 %	16119752
1112	NC_003064	GACC	2	8	516043	516050	25 %	0 %	25 %	50 %	16119752
1113	NC_003064	GCCG	2	8	516648	516655	0 %	0 %	50 %	50 %	16119753
1114	NC_003064	ATCG	2	8	517709	517716	25 %	25 %	25 %	25 %	159186658
1115	NC_003064	GATC	2	8	518692	518699	25 %	25 %	25 %	25 %	16119756
1116	NC_003064	CAGG	2	8	518959	518966	25 %	0 %	50 %	25 %	16119756
1117	NC_003064	CGCT	2	8	519094	519101	0 %	25 %	25 %	50 %	16119756
1118	NC_003064	GATC	2	8	519734	519741	25 %	25 %	25 %	25 %	16119757
1119	NC_003064	TCGA	2	8	519769	519776	25 %	25 %	25 %	25 %	16119757
1120	NC_003064	CGTG	2	8	519804	519811	0 %	25 %	50 %	25 %	16119757
1121	NC_003064	CGTT	2	8	520860	520867	0 %	50 %	25 %	25 %	159186659
1122	NC_003064	GTCT	2	8	521105	521112	0 %	50 %	25 %	25 %	159186659
1123	NC_003064	TTCA	2	8	521161	521168	25 %	50 %	0 %	25 %	159186659
1124	NC_003064	GCCG	2	8	521292	521299	0 %	0 %	50 %	50 %	159186659
1125	NC_003064	TCGC	2	8	521566	521573	0 %	25 %	25 %	50 %	159186659
1126	NC_003064	CAGG	2	8	521742	521749	25 %	0 %	50 %	25 %	159186659
1127	NC_003064	GTTC	2	8	522141	522148	0 %	50 %	25 %	25 %	159186659
1128	NC_003064	GAGC	2	8	522461	522468	25 %	0 %	50 %	25 %	159186659
1129	NC_003064	CAGT	2	8	523649	523656	25 %	25 %	25 %	25 %	159186660
1130	NC_003064	ACCA	2	8	523956	523963	50 %	0 %	0 %	50 %	159186660
1131	NC_003064	TGCC	2	8	524257	524264	0 %	25 %	25 %	50 %	16119760
1132	NC_003064	CTGG	2	8	524498	524505	0 %	25 %	50 %	25 %	16119760
1133	NC_003064	CGAT	2	8	524665	524672	25 %	25 %	25 %	25 %	16119760
1134	NC_003064	CGGC	2	8	525179	525186	0 %	0 %	50 %	50 %	159186661
1135	NC_003064	TCGA	2	8	525832	525839	25 %	25 %	25 %	25 %	159186661
1136	NC_003064	ACGA	2	8	527186	527193	50 %	0 %	25 %	25 %	159186662
1137	NC_003064	AACG	2	8	527289	527296	50 %	0 %	25 %	25 %	16119763
1138	NC_003064	TCCT	2	8	527625	527632	0 %	50 %	0 %	50 %	16119763
1139	NC_003064	AACG	2	8	527813	527820	50 %	0 %	25 %	25 %	16119763
1140	NC_003064	GTGG	2	8	528168	528175	0 %	25 %	75 %	0 %	16119763
1141	NC_003064	AGCC	2	8	528373	528380	25 %	0 %	25 %	50 %	16119763
1142	NC_003064	CGGC	2	8	528944	528951	0 %	0 %	50 %	50 %	159186663
1143	NC_003064	GTTC	2	8	529041	529048	0 %	50 %	25 %	25 %	159186663
1144	NC_003064	GAAG	2	8	529099	529106	50 %	0 %	50 %	0 %	159186663
1145	NC_003064	GCGG	2	8	529394	529401	0 %	0 %	75 %	25 %	16119765
1146	NC_003064	CGAC	2	8	529550	529557	25 %	0 %	25 %	50 %	16119765
1147	NC_003064	CAGG	2	8	530014	530021	25 %	0 %	50 %	25 %	159186664
1148	NC_003064	GACC	2	8	530114	530121	25 %	0 %	25 %	50 %	159186664
1149	NC_003064	CGGC	2	8	530247	530254	0 %	0 %	50 %	50 %	159186664
1150	NC_003064	TTCG	2	8	530980	530987	0 %	50 %	25 %	25 %	159186664
1151	NC_003064	CGGA	2	8	531035	531042	25 %	0 %	50 %	25 %	159186664
1152	NC_003064	GGGT	2	8	531179	531186	0 %	25 %	75 %	0 %	159186664
1153	NC_003064	CGAC	2	8	532378	532385	25 %	0 %	25 %	50 %	16119768
1154	NC_003064	GCCT	2	8	532422	532429	0 %	25 %	25 %	50 %	16119768
1155	NC_003064	GCAA	2	8	533799	533806	50 %	0 %	25 %	25 %	16119769
1156	NC_003064	ATGA	2	8	533838	533845	50 %	25 %	25 %	0 %	16119769
1157	NC_003064	AGCG	2	8	535133	535140	25 %	0 %	50 %	25 %	17939122
1158	NC_003064	CGAA	2	8	535227	535234	50 %	0 %	25 %	25 %	17939122
1159	NC_003064	GCAC	2	8	535759	535766	25 %	0 %	25 %	50 %	159186666
1160	NC_003064	TCCG	2	8	536145	536152	0 %	25 %	25 %	50 %	159186666
1161	NC_003064	TCCA	3	12	536755	536766	25 %	25 %	0 %	50 %	159186666
1162	NC_003064	TGCA	2	8	536990	536997	25 %	25 %	25 %	25 %	159186666
1163	NC_003064	AGGC	2	8	537396	537403	25 %	0 %	50 %	25 %	159186667
1164	NC_003064	CGGA	2	8	537547	537554	25 %	0 %	50 %	25 %	159186667
1165	NC_003064	ATCG	2	8	537625	537632	25 %	25 %	25 %	25 %	159186667
1166	NC_003064	TTCT	2	8	538009	538016	0 %	75 %	0 %	25 %	159186668
1167	NC_003064	TCAG	2	8	538110	538117	25 %	25 %	25 %	25 %	159186668
1168	NC_003064	TGAG	2	8	538301	538308	25 %	25 %	50 %	0 %	159186668
1169	NC_003064	TCGC	2	8	538312	538319	0 %	25 %	25 %	50 %	159186668
1170	NC_003064	CGAG	2	8	539966	539973	25 %	0 %	50 %	25 %	159186669
1171	NC_003064	TTGC	2	8	540699	540706	0 %	50 %	25 %	25 %	16119778
1172	NC_003064	AGAT	2	8	541063	541070	50 %	25 %	25 %	0 %	16119778
1173	NC_003064	CGGC	2	8	541886	541893	0 %	0 %	50 %	50 %	159186670
1174	NC_003064	CGGC	2	8	542396	542403	0 %	0 %	50 %	50 %	17939131

< Previous 1 23Next >