MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 41441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_003063	TCG	2	6	1496685	1496690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890623
30003	NC_003063	GGAA	2	8	1496715	1496722	50 %	0 %	50 %	0 %	15890623
30004	NC_003063	TGT	2	6	1496757	1496762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890623
30005	NC_003063	GGC	2	6	1496782	1496787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890623
30006	NC_003063	TGG	2	6	1496844	1496849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890623
30007	NC_003063	CAT	2	6	1496854	1496859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890623
30008	NC_003063	GCC	2	6	1496912	1496917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890623
30009	NC_003063	GAAG	2	8	1496971	1496978	50 %	0 %	50 %	0 %	15890623
30010	NC_003063	GAC	2	6	1497001	1497006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890623
30011	NC_003063	AGA	2	6	1497039	1497044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890623
30012	NC_003063	GAA	2	6	1497076	1497081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890623
30013	NC_003063	AGA	2	6	1497204	1497209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890623
30014	NC_003063	CGA	3	9	1497255	1497263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890623
30015	NC_003063	TCA	2	6	1497276	1497281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890623
30016	NC_003063	CGA	2	6	1497333	1497338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890623
30017	NC_003063	TGT	2	6	1497396	1497401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890623
30018	NC_003063	AAGGC	2	10	1497441	1497450	40 %	0 %	40 %	20 %	15890623
30019	NC_003063	CGT	2	6	1497477	1497482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890623
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30021	NC_003063	GCC	2	6	1497664	1497669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890622
30022	NC_003063	CG	3	6	1497752	1497757	0 %	0 %	50 %	50 %	15890622
30023	NC_003063	CGA	2	6	1497779	1497784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890622
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30026	NC_003063	GCA	2	6	1498004	1498009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890622
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30029	NC_003063	GCC	2	6	1498387	1498392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890622
30030	NC_003063	TTG	2	6	1498405	1498410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890622
30031	NC_003063	TAA	2	6	1498411	1498416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15890622
30032	NC_003063	TCG	2	6	1498430	1498435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890622
30033	NC_003063	AGT	2	6	1498493	1498498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890622
30034	NC_003063	TGA	2	6	1498508	1498513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890622
30035	NC_003063	GAT	2	6	1498596	1498601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890622
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30037	NC_003063	CAC	2	6	1498644	1498649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890622
30038	NC_003063	ATC	2	6	1498650	1498655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890622
30039	NC_003063	AATTGC	2	12	1498657	1498668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15890622
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30041	NC_003063	CGG	2	6	1498796	1498801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890622
30042	NC_003063	TCA	2	6	1498829	1498834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890622
30043	NC_003063	CGA	3	9	1498928	1498936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890621
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30045	NC_003063	TCGA	2	8	1499035	1499042	25 %	25 %	25 %	25 %	15890621
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30049	NC_003063	GCTC	2	8	1499429	1499436	0 %	25 %	25 %	50 %	15890621
30050	NC_003063	GCCG	2	8	1499486	1499493	0 %	0 %	50 %	50 %	15890621
30051	NC_003063	ATG	2	6	1499523	1499528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890621
30052	NC_003063	GTC	2	6	1499689	1499694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890621
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30055	NC_003063	GGAT	2	8	1499795	1499802	25 %	25 %	50 %	0 %	15890621
30056	NC_003063	TGC	2	6	1499835	1499840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186131
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30058	NC_003063	TGT	2	6	1499906	1499911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186131
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30102	NC_003063	CGAG	2	8	1501678	1501685	25 %	0 %	50 %	25 %	15890619
30103	NC_003063	CGC	2	6	1501700	1501705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890619
30104	NC_003063	CGGT	2	8	1501768	1501775	0 %	25 %	50 %	25 %	15890619
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30117	NC_003063	TGC	2	6	1502507	1502512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186132
30118	NC_003063	CCT	2	6	1502607	1502612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186132
30119	NC_003063	TGG	2	6	1502624	1502629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186132
30120	NC_003063	CAG	2	6	1502651	1502656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186132
30121	NC_003063	GTC	2	6	1502680	1502685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186132
30122	NC_003063	AAT	2	6	1502700	1502705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159186132
30123	NC_003063	CGT	2	6	1502706	1502711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186132
30124	NC_003063	ATC	2	6	1502734	1502739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186132
30125	NC_003063	CGCGG	2	10	1502743	1502752	0 %	0 %	60 %	40 %	159186132
30126	NC_003063	GGC	2	6	1502833	1502838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186132
30127	NC_003063	CGCTG	2	10	1502860	1502869	0 %	20 %	40 %	40 %	159186132
30128	NC_003063	ACG	2	6	1502917	1502922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186132
30129	NC_003063	GTG	2	6	1503117	1503122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186133
30130	NC_003063	CCA	2	6	1503158	1503163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186133
30131	NC_003063	CCGT	2	8	1503165	1503172	0 %	25 %	25 %	50 %	159186133
30132	NC_003063	AGA	2	6	1503292	1503297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186133
30133	NC_003063	GA	3	6	1503440	1503445	50 %	0 %	50 %	0 %	159186133
30134	NC_003063	GGC	2	6	1503484	1503489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186133
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30140	NC_003063	CGG	2	6	1503718	1503723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186133
30141	NC_003063	GCATCG	2	12	1503732	1503743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159186133
30142	NC_003063	TGT	2	6	1503760	1503765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186133
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30144	NC_003063	CCG	2	6	1503819	1503824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186133
30145	NC_003063	T	6	6	1503828	1503833	0 %	100 %	0 %	0 %	159186133
30146	NC_003063	CCG	2	6	1503837	1503842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186133
30147	NC_003063	GAT	2	6	1503845	1503850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186133
30148	NC_003063	CG	3	6	1504051	1504056	0 %	0 %	50 %	50 %	159186134
30149	NC_003063	GCC	2	6	1504083	1504088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186134
30150	NC_003063	GCG	2	6	1504122	1504127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186134
30151	NC_003063	GC	3	6	1504155	1504160	0 %	0 %	50 %	50 %	159186134
30152	NC_003063	CAC	2	6	1504172	1504177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186134
30153	NC_003063	CCGA	2	8	1504191	1504198	25 %	0 %	25 %	50 %	159186134
30154	NC_003063	CGG	2	6	1504276	1504281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186134
30155	NC_003063	CCGG	2	8	1504291	1504298	0 %	0 %	50 %	50 %	159186134
30156	NC_003063	GCCGG	2	10	1504313	1504322	0 %	0 %	60 %	40 %	159186134
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30185	NC_003063	CGATC	2	10	1505983	1505992	20 %	20 %	20 %	40 %	15890614
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30191	NC_003063	GC	3	6	1506361	1506366	0 %	0 %	50 %	50 %	15890614
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30202	NC_003063	GCT	2	6	1506911	1506916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186136
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30207	NC_003063	TGA	2	6	1507303	1507308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186136
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30220	NC_003063	TCG	2	6	1507657	1507662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186136
30221	NC_003063	GGCC	2	8	1507667	1507674	0 %	0 %	50 %	50 %	159186136
30222	NC_003063	GCAGGG	2	12	1507676	1507687	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	159186136
30223	NC_003063	ATC	2	6	1507764	1507769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186136
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30225	NC_003063	CGGC	2	8	1507911	1507918	0 %	0 %	50 %	50 %	159186136
30226	NC_003063	CAG	2	6	1508013	1508018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186136
30227	NC_003063	GCT	4	12	1508057	1508068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186136
30228	NC_003063	GAT	2	6	1508070	1508075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186136
30229	NC_003063	GCA	2	6	1508129	1508134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186136
30230	NC_003063	TTC	2	6	1508155	1508160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186136
30231	NC_003063	CGG	2	6	1508219	1508224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186136
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30233	NC_003063	CGC	2	6	1508279	1508284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186136
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30466	NC_003063	TGA	2	6	1520055	1520060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186143
30467	NC_003063	GTC	2	6	1520077	1520082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186143
30468	NC_003063	CAC	2	6	1520089	1520094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186143
30469	NC_003063	GTC	2	6	1520152	1520157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186143
30470	NC_003063	ATC	2	6	1520162	1520167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186143
30471	NC_003063	CGA	2	6	1520196	1520201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186143
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30473	NC_003063	TGC	2	6	1520311	1520316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186143
30474	NC_003063	CTT	2	6	1520320	1520325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186143
30475	NC_003063	CGCC	2	8	1520337	1520344	0 %	0 %	25 %	75 %	159186143
30476	NC_003063	GAT	2	6	1520353	1520358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186143
30477	NC_003063	TGC	2	6	1520383	1520388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186143
30478	NC_003063	TCA	2	6	1520430	1520435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186143
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30481	NC_003063	CGG	2	6	1520789	1520794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186144
30482	NC_003063	GC	3	6	1520872	1520877	0 %	0 %	50 %	50 %	159186144
30483	NC_003063	GGC	2	6	1520965	1520970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186144
30484	NC_003063	GCCG	2	8	1521018	1521025	0 %	0 %	50 %	50 %	159186144
30485	NC_003063	TGC	2	6	1521031	1521036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186144
30486	NC_003063	CCG	2	6	1521064	1521069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186144
30487	NC_003063	GCT	2	6	1521098	1521103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186144
30488	NC_003063	GC	4	8	1521112	1521119	0 %	0 %	50 %	50 %	159186144
30489	NC_003063	GGGC	2	8	1521161	1521168	0 %	0 %	75 %	25 %	159186144
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30492	NC_003063	TCA	2	6	1521274	1521279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186144
30493	NC_003063	TCG	2	6	1521280	1521285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186144
30494	NC_003063	CCG	2	6	1521373	1521378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186144
30495	NC_003063	GAC	2	6	1521503	1521508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186144
30496	NC_003063	CCGG	2	8	1521509	1521516	0 %	0 %	50 %	50 %	159186144
30497	NC_003063	TGG	2	6	1521526	1521531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186144
30498	NC_003063	GGC	2	6	1521584	1521589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186144
30499	NC_003063	ATG	2	6	1521651	1521656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186144
30500	NC_003063	TGA	2	6	1521664	1521669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186144

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