MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	TACA	2	8	114	121	50 %	25 %	0 %	25 %	10957042
2	NC_001880	AAAG	2	8	1319	1326	75 %	0 %	25 %	0 %	10957043
3	NC_001880	CAAA	2	8	1754	1761	75 %	0 %	0 %	25 %	10957044
4	NC_001880	AGAA	3	12	1877	1888	75 %	0 %	25 %	0 %	10957044
5	NC_001880	AGGA	2	8	1893	1900	50 %	0 %	50 %	0 %	10957044
6	NC_001880	AAAG	2	8	2224	2231	75 %	0 %	25 %	0 %	10957044
7	NC_001880	AAGC	2	8	2481	2488	50 %	0 %	25 %	25 %	10957045
8	NC_001880	AGGA	2	8	2583	2590	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
9	NC_001880	GAAA	2	8	2667	2674	75 %	0 %	25 %	0 %	10957045
10	NC_001880	TCAA	2	8	2999	3006	50 %	25 %	0 %	25 %	10957045
11	NC_001880	CTTT	2	8	3009	3016	0 %	75 %	0 %	25 %	10957045
12	NC_001880	GCCC	2	8	3049	3056	0 %	0 %	25 %	75 %	10957045
13	NC_001880	GGAA	2	8	4295	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
14	NC_001880	GAAA	2	8	4575	4582	75 %	0 %	25 %	0 %	10957046
15	NC_001880	GAAG	2	8	4986	4993	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
16	NC_001880	AAGA	3	12	6347	6358	75 %	0 %	25 %	0 %	10957047
17	NC_001880	GGAA	2	8	6425	6432	50 %	0 %	50 %	0 %	10957047
18	NC_001880	ATAC	2	8	6676	6683	50 %	25 %	0 %	25 %	10957047
19	NC_001880	AGGG	2	8	7443	7450	25 %	0 %	75 %	0 %	10957048
20	NC_001880	GAAG	2	8	7640	7647	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
21	NC_001880	GAAG	2	8	7949	7956	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
22	NC_001880	GAGG	2	8	8787	8794	25 %	0 %	75 %	0 %	10957049
23	NC_001880	AAAG	2	8	8961	8968	75 %	0 %	25 %	0 %	10957049
24	NC_001880	GAAA	2	8	9000	9007	75 %	0 %	25 %	0 %	10957049
25	NC_001880	GAAA	2	8	9042	9049	75 %	0 %	25 %	0 %	10957049
26	NC_001880	TTCC	2	8	9394	9401	0 %	50 %	0 %	50 %	10957049
27	NC_001880	CTTT	2	8	11315	11322	0 %	75 %	0 %	25 %	10957051
28	NC_001880	CCTC	2	8	11347	11354	0 %	25 %	0 %	75 %	10957051
29	NC_001880	CTGC	2	8	11881	11888	0 %	25 %	25 %	50 %	10957052
30	NC_001880	ATCA	2	8	12288	12295	50 %	25 %	0 %	25 %	10957052
31	NC_001880	TAAA	2	8	13164	13171	75 %	25 %	0 %	0 %	10957053
32	NC_001880	TCCT	2	8	13370	13377	0 %	50 %	0 %	50 %	10957053
33	NC_001880	TTTA	2	8	16592	16599	25 %	75 %	0 %	0 %	10957055
34	NC_001880	CGTC	2	8	16648	16655	0 %	25 %	25 %	50 %	10957055
35	NC_001880	ATGA	2	8	17612	17619	50 %	25 %	25 %	0 %	10957056
36	NC_001880	TGGA	2	8	17990	17997	25 %	25 %	50 %	0 %	10957056
37	NC_001880	CCAG	2	8	19208	19215	25 %	0 %	25 %	50 %	10957058
38	NC_001880	TCCT	2	8	19285	19292	0 %	50 %	0 %	50 %	10957058
39	NC_001880	GTTT	2	8	19403	19410	0 %	75 %	25 %	0 %	10957058
40	NC_001880	ATGT	2	8	19565	19572	25 %	50 %	25 %	0 %	10957058
41	NC_001880	GGAT	2	8	19573	19580	25 %	25 %	50 %	0 %	10957058
42	NC_001880	ATCC	2	8	19879	19886	25 %	25 %	0 %	50 %	10957059
43	NC_001880	CAAG	2	8	22084	22091	50 %	0 %	25 %	25 %	10957060
44	NC_001880	TTCT	2	8	22313	22320	0 %	75 %	0 %	25 %	10957060
45	NC_001880	TTTA	2	8	24688	24695	25 %	75 %	0 %	0 %	10957061
46	NC_001880	ATTT	2	8	25078	25085	25 %	75 %	0 %	0 %	10957062
47	NC_001880	GTAT	2	8	25833	25840	25 %	50 %	25 %	0 %	10957063
48	NC_001880	GGTA	2	8	26395	26402	25 %	25 %	50 %	0 %	10957064
49	NC_001880	TTCC	2	8	26576	26583	0 %	50 %	0 %	50 %	10957064
50	NC_001880	AAGT	2	8	26973	26980	50 %	25 %	25 %	0 %	10957064
51	NC_001880	TCTA	2	8	27137	27144	25 %	50 %	0 %	25 %	10957065
52	NC_001880	TTTC	2	8	28890	28897	0 %	75 %	0 %	25 %	10957066
53	NC_001880	ATTT	2	8	28909	28916	25 %	75 %	0 %	0 %	10957066
54	NC_001880	AGGG	2	8	30417	30424	25 %	0 %	75 %	0 %	10957067
55	NC_001880	ATTA	2	8	31214	31221	50 %	50 %	0 %	0 %	10957068
56	NC_001880	TACC	2	8	31825	31832	25 %	25 %	0 %	50 %	10957068
57	NC_001880	CCTA	2	8	33224	33231	25 %	25 %	0 %	50 %	10957069
58	NC_001880	TGTA	2	8	33549	33556	25 %	50 %	25 %	0 %	10957069
59	NC_001880	GAAA	2	8	34011	34018	75 %	0 %	25 %	0 %	10957070
60	NC_001880	CTTT	3	12	35246	35257	0 %	75 %	0 %	25 %	10957071
61	NC_001880	CTTT	2	8	35786	35793	0 %	75 %	0 %	25 %	10957071
62	NC_001880	TTCT	2	8	37271	37278	0 %	75 %	0 %	25 %	10957072
63	NC_001880	TCTT	2	8	37813	37820	0 %	75 %	0 %	25 %	10957072
64	NC_001880	GGAG	2	8	37830	37837	25 %	0 %	75 %	0 %	10957072
65	NC_001880	CTTC	2	8	38005	38012	0 %	50 %	0 %	50 %	10957072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.