MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	CTC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957042
2	NC_001880	CCG	2	6	167	172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957042
3	NC_001880	TTA	2	6	249	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957042
4	NC_001880	TAG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
5	NC_001880	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
6	NC_001880	AAG	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957043
7	NC_001880	TCT	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957043
8	NC_001880	TTA	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
9	NC_001880	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
10	NC_001880	TTC	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957044
11	NC_001880	TAG	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
12	NC_001880	AAG	2	6	2001	2006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
13	NC_001880	GAA	2	6	2071	2076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
14	NC_001880	CTC	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957044
15	NC_001880	TAG	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
16	NC_001880	GAC	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957044
17	NC_001880	TAA	2	6	2321	2326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
18	NC_001880	TAC	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957045
19	NC_001880	AGA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
20	NC_001880	TAA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
21	NC_001880	GAG	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957045
22	NC_001880	GAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
23	NC_001880	TAG	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957045
24	NC_001880	AAG	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
25	NC_001880	AGA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
26	NC_001880	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
27	NC_001880	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957045
28	NC_001880	AAG	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
29	NC_001880	CAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957045
30	NC_001880	TTC	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957045
31	NC_001880	GAC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957046
32	NC_001880	GAA	3	9	4188	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
33	NC_001880	TCT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
34	NC_001880	CAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957046
35	NC_001880	AAG	2	6	4340	4345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
36	NC_001880	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
37	NC_001880	AAG	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
38	NC_001880	AGA	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
39	NC_001880	AAG	2	6	4618	4623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
40	NC_001880	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957046
41	NC_001880	GAA	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
42	NC_001880	GAA	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
43	NC_001880	CTT	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
44	NC_001880	GAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
45	NC_001880	AAG	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
46	NC_001880	TTG	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957046
47	NC_001880	ACT	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957046
48	NC_001880	AAT	2	6	5873	5878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957047
49	NC_001880	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
50	NC_001880	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957047
51	NC_001880	TCT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
52	NC_001880	AAG	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
53	NC_001880	AAG	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
54	NC_001880	AGA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
55	NC_001880	TAC	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957047
56	NC_001880	GAA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
57	NC_001880	GAA	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
58	NC_001880	ACT	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957047
59	NC_001880	GAA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
60	NC_001880	CTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
61	NC_001880	CTT	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
62	NC_001880	GAA	2	6	7625	7630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
63	NC_001880	AAG	2	6	7651	7656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
64	NC_001880	AGA	2	6	7664	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
65	NC_001880	CTT	2	6	7699	7704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
66	NC_001880	GAG	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957048
67	NC_001880	GAA	2	6	8867	8872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
68	NC_001880	TAA	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957049
69	NC_001880	AAG	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
70	NC_001880	CTT	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957049
71	NC_001880	GAA	3	9	9289	9297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
72	NC_001880	AGA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
73	NC_001880	GAA	2	6	9550	9555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
74	NC_001880	GAA	2	6	9624	9629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
75	NC_001880	AAG	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
76	NC_001880	AGG	2	6	10408	10413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957050
77	NC_001880	AGA	2	6	10444	10449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
78	NC_001880	AAG	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
79	NC_001880	TTG	2	6	10536	10541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957050
80	NC_001880	CTT	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957050
81	NC_001880	GAA	2	6	10737	10742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
82	NC_001880	GGA	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957051
83	NC_001880	TTC	2	6	11240	11245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957051
84	NC_001880	CTT	2	6	11844	11849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957052
85	NC_001880	GGC	2	6	11892	11897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957052
86	NC_001880	GGA	2	6	11901	11906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957052
87	NC_001880	AGG	3	9	11909	11917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957052
88	NC_001880	GCT	2	6	12090	12095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957052
89	NC_001880	GCA	2	6	12316	12321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957052
90	NC_001880	ATA	2	6	12445	12450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957052
91	NC_001880	GGA	2	6	12477	12482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957052
92	NC_001880	ACA	2	6	12676	12681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957052
93	NC_001880	TAA	2	6	12716	12721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957052
94	NC_001880	TCC	2	6	12839	12844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957052
95	NC_001880	ATC	2	6	13095	13100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957053
96	NC_001880	CTT	2	6	13133	13138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957053
97	NC_001880	AAC	2	6	13188	13193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957053
98	NC_001880	TGC	2	6	13286	13291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957053
99	NC_001880	CCT	2	6	13303	13308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957053
100	NC_001880	TTG	2	6	13340	13345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957053
101	NC_001880	CCT	2	6	13477	13482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957053
102	NC_001880	CAA	2	6	15646	15651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957054
103	NC_001880	TCT	2	6	15801	15806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957054
104	NC_001880	TTA	2	6	15808	15813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957054
105	NC_001880	TCT	2	6	15867	15872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957054
106	NC_001880	TCT	2	6	15915	15920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957054
107	NC_001880	TGT	2	6	16492	16497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957055
108	NC_001880	ATG	2	6	16559	16564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957055
109	NC_001880	TAT	2	6	16571	16576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957055
110	NC_001880	TTC	2	6	16583	16588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957055
111	NC_001880	TCT	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957055
112	NC_001880	TTC	2	6	16715	16720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957055
113	NC_001880	GTT	2	6	16869	16874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957055
114	NC_001880	TGA	2	6	16941	16946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957055
115	NC_001880	CAA	2	6	17050	17055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957055
116	NC_001880	CAA	2	6	17068	17073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957055
117	NC_001880	GTC	2	6	17126	17131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957055
118	NC_001880	ATT	2	6	17139	17144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957055
119	NC_001880	TTC	2	6	17241	17246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957055
120	NC_001880	AGG	2	6	17599	17604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957056
121	NC_001880	TAT	2	6	17690	17695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957056
122	NC_001880	GAA	2	6	17702	17707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
123	NC_001880	TAT	2	6	17711	17716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957056
124	NC_001880	GAA	3	9	17717	17725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
125	NC_001880	GAA	3	9	17738	17746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
126	NC_001880	TAC	2	6	17892	17897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957056
127	NC_001880	GAA	2	6	17951	17956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
128	NC_001880	TTA	2	6	17971	17976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957056
129	NC_001880	CAG	2	6	17977	17982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957056
130	NC_001880	AGA	2	6	18058	18063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
131	NC_001880	GAA	2	6	18077	18082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
132	NC_001880	AGA	2	6	18199	18204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957056
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136	NC_001880	TGA	2	6	18452	18457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957057
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141	NC_001880	GAA	2	6	18687	18692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957057
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.