MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000854	GCC	2	6	185630	185635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430957
3502	NC_000854	GTT	2	6	185683	185688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430957
3503	NC_000854	CCT	2	6	185745	185750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430957
3504	NC_000854	TTA	2	6	185751	185756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430957
3505	NC_000854	CTT	2	6	185907	185912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430958
3506	NC_000854	GGA	2	6	185932	185937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430958
3507	NC_000854	TGA	2	6	185953	185958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430958
3508	NC_000854	GGC	2	6	185960	185965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430958
3509	NC_000854	TCC	2	6	186012	186017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430958
3510	NC_000854	CAG	2	6	186034	186039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430958
3511	NC_000854	GCC	2	6	186119	186124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430958
3512	NC_000854	ATCT	2	8	186161	186168	25 %	50 %	0 %	25 %	118430958
3513	NC_000854	AGC	2	6	186230	186235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430958
3514	NC_000854	CAG	2	6	186298	186303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430958
3515	NC_000854	ACA	2	6	186306	186311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430958
3516	NC_000854	CCT	2	6	186403	186408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430958
3517	NC_000854	CCT	2	6	186481	186486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430958
3518	NC_000854	GAGC	2	8	186496	186503	25 %	0 %	50 %	25 %	118430958
3519	NC_000854	CT	3	6	186515	186520	0 %	50 %	0 %	50 %	118430958
3520	NC_000854	CCA	2	6	186639	186644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430958
3521	NC_000854	CTC	2	6	186647	186652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430958
3522	NC_000854	C	7	7	186772	186778	0 %	0 %	0 %	100 %	118430959
3523	NC_000854	CTCC	2	8	186782	186789	0 %	25 %	0 %	75 %	118430959
3524	NC_000854	GCA	2	6	186826	186831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430959
3525	NC_000854	CT	3	6	186904	186909	0 %	50 %	0 %	50 %	118430959
3526	NC_000854	TAG	2	6	186974	186979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430959
3527	NC_000854	CT	3	6	187009	187014	0 %	50 %	0 %	50 %	118430959
3528	NC_000854	GCGG	2	8	187035	187042	0 %	0 %	75 %	25 %	118430959
3529	NC_000854	CCA	2	6	187056	187061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430959
3530	NC_000854	TG	3	6	187121	187126	0 %	50 %	50 %	0 %	118430959
3531	NC_000854	CCA	2	6	187151	187156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430959
3532	NC_000854	TC	4	8	187188	187195	0 %	50 %	0 %	50 %	118430959
3533	NC_000854	C	6	6	187199	187204	0 %	0 %	0 %	100 %	118430959
3534	NC_000854	G	6	6	187210	187215	0 %	0 %	100 %	0 %	118430959
3535	NC_000854	CCT	3	9	187250	187258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
3536	NC_000854	GGT	2	6	187271	187276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430959
3537	NC_000854	TTC	2	6	187306	187311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430959
3538	NC_000854	ATG	2	6	187334	187339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430959
3539	NC_000854	GCA	2	6	187381	187386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430959
3540	NC_000854	GGA	2	6	187391	187396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430959
3541	NC_000854	ACC	2	6	187495	187500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430959
3542	NC_000854	CTC	2	6	187624	187629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
3543	NC_000854	GCGAG	2	10	187676	187685	20 %	0 %	60 %	20 %	118430959
3544	NC_000854	CGC	2	6	187764	187769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430959
3545	NC_000854	TCC	2	6	187792	187797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
3546	NC_000854	GCT	2	6	187860	187865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430959
3547	NC_000854	CT	3	6	187918	187923	0 %	50 %	0 %	50 %	118430959
3548	NC_000854	TCC	2	6	187954	187959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
3549	NC_000854	CA	3	6	187989	187994	50 %	0 %	0 %	50 %	118430959
3550	NC_000854	CCAG	2	8	188001	188008	25 %	0 %	25 %	50 %	118430959
3551	NC_000854	ATA	2	6	188096	188101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600575
3552	NC_000854	GGA	2	6	188121	188126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
3553	NC_000854	TCT	2	6	188133	188138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600575
3554	NC_000854	AGG	2	6	188225	188230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
3555	NC_000854	GA	3	6	188324	188329	50 %	0 %	50 %	0 %	14600575
3556	NC_000854	GTT	2	6	188354	188359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600575
3557	NC_000854	GCTA	2	8	188395	188402	25 %	25 %	25 %	25 %	14600575
3558	NC_000854	AG	3	6	188410	188415	50 %	0 %	50 %	0 %	14600575
3559	NC_000854	TGGCC	2	10	188420	188429	0 %	20 %	40 %	40 %	14600575
3560	NC_000854	AG	3	6	188474	188479	50 %	0 %	50 %	0 %	14600575
3561	NC_000854	GTT	2	6	188492	188497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600575
3562	NC_000854	ACA	2	6	188501	188506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600575
3563	NC_000854	TCA	2	6	188601	188606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600575
3564	NC_000854	GGT	3	9	188632	188640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600575
3565	NC_000854	GGA	2	6	188656	188661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
3566	NC_000854	AGT	2	6	188751	188756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600575
3567	NC_000854	CAGTAG	2	12	188885	188896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118430960
3568	NC_000854	AGT	2	6	188925	188930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430960
3569	NC_000854	GGAG	2	8	188947	188954	25 %	0 %	75 %	0 %	118430960
3570	NC_000854	CTC	2	6	189042	189047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430960
3571	NC_000854	TCG	2	6	189055	189060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3572	NC_000854	GCA	2	6	189091	189096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3573	NC_000854	CGT	2	6	189203	189208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3574	NC_000854	GCT	2	6	189214	189219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3575	NC_000854	CGC	2	6	189246	189251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430960
3576	NC_000854	CGT	2	6	189260	189265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3577	NC_000854	TGG	3	9	189273	189281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430960
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3579	NC_000854	CAT	2	6	189320	189325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430960
3580	NC_000854	CGA	2	6	189341	189346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430960
3581	NC_000854	TAT	2	6	189405	189410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430960
3582	NC_000854	TG	3	6	189473	189478	0 %	50 %	50 %	0 %	118430960
3583	NC_000854	GGC	2	6	189510	189515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430960
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3586	NC_000854	CGC	2	6	189785	189790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430960
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3588	NC_000854	ACA	2	6	189844	189849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430960
3589	NC_000854	AG	3	6	189861	189866	50 %	0 %	50 %	0 %	118430960
3590	NC_000854	AT	3	6	189924	189929	50 %	50 %	0 %	0 %	118430960
3591	NC_000854	CTC	2	6	189969	189974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430960
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3593	NC_000854	AG	3	6	190037	190042	50 %	0 %	50 %	0 %	118430960
3594	NC_000854	CT	3	6	190727	190732	0 %	50 %	0 %	50 %	118430961
3595	NC_000854	CT	3	6	190757	190762	0 %	50 %	0 %	50 %	118430961
3596	NC_000854	TC	3	6	190810	190815	0 %	50 %	0 %	50 %	118430961
3597	NC_000854	TCT	2	6	190829	190834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430961
3598	NC_000854	TA	3	6	190903	190908	50 %	50 %	0 %	0 %	118430961
3599	NC_000854	GAT	2	6	191093	191098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430961
3600	NC_000854	TCA	2	6	191145	191150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430961
3601	NC_000854	TCG	2	6	191181	191186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430961
3602	NC_000854	AG	3	6	191742	191747	50 %	0 %	50 %	0 %	14600578
3603	NC_000854	TTG	2	6	191759	191764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600578
3604	NC_000854	GT	3	6	191784	191789	0 %	50 %	50 %	0 %	14600578
3605	NC_000854	CTA	2	6	191834	191839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600578
3606	NC_000854	ATA	2	6	191879	191884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600578
3607	NC_000854	TGC	2	6	191911	191916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600578
3608	NC_000854	CTC	2	6	191984	191989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600578
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3610	NC_000854	TCTAC	2	10	193023	193032	20 %	40 %	0 %	40 %	14600580
3611	NC_000854	TAT	2	6	193063	193068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
3612	NC_000854	TCT	2	6	193146	193151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600580
3613	NC_000854	TAT	3	9	193153	193161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
3614	NC_000854	GTC	3	9	193168	193176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600580
3615	NC_000854	TAT	2	6	193258	193263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
3616	NC_000854	ACG	2	6	193307	193312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600580
3617	NC_000854	CTC	2	6	193326	193331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600580
3618	NC_000854	TC	3	6	193330	193335	0 %	50 %	0 %	50 %	14600580
3619	NC_000854	AT	3	6	193433	193438	50 %	50 %	0 %	0 %	14600580
3620	NC_000854	TTGATC	2	12	193617	193628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118430962
3621	NC_000854	G	6	6	193819	193824	0 %	0 %	100 %	0 %	118430962
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3870	NC_000854	CCT	2	6	212333	212338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3871	NC_000854	TCC	2	6	212341	212346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3872	NC_000854	CTC	2	6	212396	212401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3873	NC_000854	ACA	2	6	212472	212477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600604
3874	NC_000854	GA	3	6	212761	212766	50 %	0 %	50 %	0 %	118430980
3875	NC_000854	GCG	2	6	212803	212808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430980
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3911	NC_000854	TCC	2	6	215005	215010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430982
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3989	NC_000854	CAT	2	6	219037	219042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430986
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3991	NC_000854	TCC	2	6	219124	219129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430986
3992	NC_000854	TGC	2	6	219144	219149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430986
3993	NC_000854	CTA	2	6	219150	219155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430986
3994	NC_000854	CAA	3	9	219180	219188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430986
3995	NC_000854	ATA	2	6	219232	219237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430986
3996	NC_000854	TA	3	6	219236	219241	50 %	50 %	0 %	0 %	118430986
3997	NC_000854	CTG	2	6	219284	219289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430986
3998	NC_000854	GAA	2	6	219305	219310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430986
3999	NC_000854	G	6	6	219360	219365	0 %	0 %	100 %	0 %	118430986
4000	NC_000854	ATT	3	9	219395	219403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430986

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