MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_000854	CTT	2	6	1555291	1555296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431875
31002	NC_000854	CAG	2	6	1555363	1555368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431875
31003	NC_000854	TGC	2	6	1555491	1555496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431875
31004	NC_000854	CTTCCT	2	12	1555499	1555510	0 %	50 %	0 %	50 %	118431875
31005	NC_000854	CTC	2	6	1555523	1555528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431875
31006	NC_000854	AGA	2	6	1555545	1555550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431875
31007	NC_000854	CCT	2	6	1555609	1555614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431875
31008	NC_000854	CAA	2	6	1555624	1555629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431875
31009	NC_000854	GCT	2	6	1555641	1555646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431875
31010	NC_000854	CAGC	2	8	1555689	1555696	25 %	0 %	25 %	50 %	118431875
31011	NC_000854	GCC	2	6	1555709	1555714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431875
31012	NC_000854	CT	3	6	1555773	1555778	0 %	50 %	0 %	50 %	118431875
31013	NC_000854	CCT	2	6	1555834	1555839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431875
31014	NC_000854	GAA	2	6	1555874	1555879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431875
31015	NC_000854	GGC	2	6	1555905	1555910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431875
31016	NC_000854	TCG	2	6	1556253	1556258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31017	NC_000854	GT	3	6	1556273	1556278	0 %	50 %	50 %	0 %	14602074
31018	NC_000854	CGC	2	6	1556334	1556339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602074
31019	NC_000854	GCG	2	6	1556354	1556359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602074
31020	NC_000854	GTCAC	2	10	1556379	1556388	20 %	20 %	20 %	40 %	14602074
31021	NC_000854	GGC	3	9	1556394	1556402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602074
31022	NC_000854	GCT	2	6	1556454	1556459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31023	NC_000854	ACG	2	6	1556591	1556596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31024	NC_000854	C	6	6	1556608	1556613	0 %	0 %	0 %	100 %	14602074
31025	NC_000854	GC	3	6	1556762	1556767	0 %	0 %	50 %	50 %	14602074
31026	NC_000854	TGG	2	6	1556804	1556809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602074
31027	NC_000854	AAG	2	6	1556818	1556823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602074
31028	NC_000854	TGGCTG	2	12	1556840	1556851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	14602074
31029	NC_000854	GCT	2	6	1557037	1557042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31030	NC_000854	GAG	2	6	1557064	1557069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602074
31031	NC_000854	GCGG	2	8	1557111	1557118	0 %	0 %	75 %	25 %	14602074
31032	NC_000854	TA	3	6	1557156	1557161	50 %	50 %	0 %	0 %	14602074
31033	NC_000854	AC	3	6	1557211	1557216	50 %	0 %	0 %	50 %	14602074
31034	NC_000854	AGC	2	6	1557341	1557346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31035	NC_000854	AG	3	6	1557436	1557441	50 %	0 %	50 %	0 %	14602074
31036	NC_000854	GCT	2	6	1557451	1557456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602074
31037	NC_000854	GGT	2	6	1557463	1557468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602074
31038	NC_000854	G	6	6	1557521	1557526	0 %	0 %	100 %	0 %	14602074
31039	NC_000854	GCTATG	2	12	1557536	1557547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14602074
31040	NC_000854	TGG	2	6	1557610	1557615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602074
31041	NC_000854	CTT	2	6	1557616	1557621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14602074
31042	NC_000854	GGT	2	6	1557669	1557674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602074
31043	NC_000854	C	6	6	1557694	1557699	0 %	0 %	0 %	100 %	14602074
31044	NC_000854	CTC	2	6	1557766	1557771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431876
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31046	NC_000854	TCT	2	6	1557870	1557875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431876
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31048	NC_000854	TCT	2	6	1557984	1557989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431876
31049	NC_000854	CGC	2	6	1558008	1558013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431876
31050	NC_000854	AGG	2	6	1558014	1558019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431876
31051	NC_000854	TACG	2	8	1558024	1558031	25 %	25 %	25 %	25 %	118431876
31052	NC_000854	TC	3	6	1558034	1558039	0 %	50 %	0 %	50 %	118431876
31053	NC_000854	CTT	2	6	1558042	1558047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431876
31054	NC_000854	CCT	2	6	1558048	1558053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431876
31055	NC_000854	CTT	2	6	1558087	1558092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431877
31056	NC_000854	TTC	2	6	1558094	1558099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431877
31057	NC_000854	TCT	2	6	1558136	1558141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431877
31058	NC_000854	TAT	2	6	1558205	1558210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431877
31059	NC_000854	ATG	2	6	1558245	1558250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431877
31060	NC_000854	TCA	2	6	1558258	1558263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431877
31061	NC_000854	GTA	2	6	1558285	1558290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431877
31062	NC_000854	ACA	2	6	1558299	1558304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431877
31063	NC_000854	GTA	2	6	1558376	1558381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431877
31064	NC_000854	CAT	2	6	1558418	1558423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431877
31065	NC_000854	AG	3	6	1558471	1558476	50 %	0 %	50 %	0 %	118431877
31066	NC_000854	ATT	2	6	1558551	1558556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431877
31067	NC_000854	GTA	2	6	1558562	1558567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431877
31068	NC_000854	GCC	2	6	1558569	1558574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431877
31069	NC_000854	GAG	2	6	1558583	1558588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431877
31070	NC_000854	AGG	2	6	1558602	1558607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431877
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31072	NC_000854	CGG	2	6	1558792	1558797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431877
31073	NC_000854	AGG	2	6	1558818	1558823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431877
31074	NC_000854	GAG	2	6	1558871	1558876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431877
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31079	NC_000854	CCCTC	2	10	1559124	1559133	0 %	20 %	0 %	80 %	14602214
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31083	NC_000854	AT	3	6	1559371	1559376	50 %	50 %	0 %	0 %	14602214
31084	NC_000854	ATCT	2	8	1559503	1559510	25 %	50 %	0 %	25 %	14602214
31085	NC_000854	CAA	2	6	1559568	1559573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602214
31086	NC_000854	CTA	2	6	1559637	1559642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602214
31087	NC_000854	GGAG	2	8	1559851	1559858	25 %	0 %	75 %	0 %	14602076
31088	NC_000854	GA	4	8	1559899	1559906	50 %	0 %	50 %	0 %	14602076
31089	NC_000854	AGT	2	6	1559982	1559987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602076
31090	NC_000854	AGA	2	6	1560016	1560021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602076
31091	NC_000854	CGG	2	6	1560081	1560086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602076
31092	NC_000854	ACC	2	6	1560094	1560099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602076
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31096	NC_000854	ATA	2	6	1560262	1560267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14602076
31097	NC_000854	CGA	2	6	1560378	1560383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602076
31098	NC_000854	AG	3	6	1560556	1560561	50 %	0 %	50 %	0 %	14602076
31099	NC_000854	GAC	2	6	1560634	1560639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602076
31100	NC_000854	GCC	2	6	1560655	1560660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602076
31101	NC_000854	AGG	2	6	1560731	1560736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602076
31102	NC_000854	CCT	2	6	1560762	1560767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602076
31103	NC_000854	TGA	2	6	1560917	1560922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602076
31104	NC_000854	GA	3	6	1560947	1560952	50 %	0 %	50 %	0 %	14602076
31105	NC_000854	ACA	2	6	1560965	1560970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602076
31106	NC_000854	AGG	2	6	1561186	1561191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431878
31107	NC_000854	TAG	2	6	1561206	1561211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431878
31108	NC_000854	GAG	2	6	1561232	1561237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431878
31109	NC_000854	TAG	2	6	1561303	1561308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431878
31110	NC_000854	TAG	2	6	1561353	1561358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431878
31111	NC_000854	TAC	2	6	1561363	1561368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431878
31112	NC_000854	GGA	2	6	1561390	1561395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431878
31113	NC_000854	AGT	3	9	1561420	1561428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431878
31114	NC_000854	GCT	2	6	1561467	1561472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431878
31115	NC_000854	AGGAT	2	10	1561540	1561549	40 %	20 %	40 %	0 %	118431879
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31117	NC_000854	CCT	2	6	1561664	1561669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431879
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31231	NC_000854	ACG	2	6	1568423	1568428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602084
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31234	NC_000854	GAA	2	6	1568493	1568498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602084
31235	NC_000854	GA	3	6	1568512	1568517	50 %	0 %	50 %	0 %	14602084
31236	NC_000854	GAG	3	9	1568521	1568529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602084
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31238	NC_000854	CT	3	6	1568656	1568661	0 %	50 %	0 %	50 %	14602085
31239	NC_000854	G	6	6	1568677	1568682	0 %	0 %	100 %	0 %	14602085
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31331	NC_000854	CT	3	6	1573007	1573012	0 %	50 %	0 %	50 %	118431888
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31468	NC_000854	GAT	2	6	1579508	1579513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431896
31469	NC_000854	GA	4	8	1579541	1579548	50 %	0 %	50 %	0 %	118431896
31470	NC_000854	GAC	3	9	1579637	1579645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431896
31471	NC_000854	TGAG	2	8	1579668	1579675	25 %	25 %	50 %	0 %	118431896
31472	NC_000854	GGT	2	6	1579696	1579701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431896
31473	NC_000854	TAA	2	6	1579728	1579733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431896
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31498	NC_000854	TA	3	6	1581047	1581052	50 %	50 %	0 %	0 %	118431898
31499	NC_000854	AGCT	2	8	1581077	1581084	25 %	25 %	25 %	25 %	118431898
31500	NC_000854	TA	3	6	1581175	1581180	50 %	50 %	0 %	0 %	118431898

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