MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_000854	ACG	2	6	1507156	1507161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431849
30003	NC_000854	CCT	2	6	1507200	1507205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431849
30004	NC_000854	GTA	2	6	1507239	1507244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431849
30005	NC_000854	CAG	2	6	1507247	1507252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431849
30006	NC_000854	CTT	2	6	1507323	1507328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431849
30007	NC_000854	TTG	2	6	1507441	1507446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431849
30008	NC_000854	CCG	2	6	1507454	1507459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431849
30009	NC_000854	C	6	6	1507483	1507488	0 %	0 %	0 %	100 %	118431849
30010	NC_000854	AGG	2	6	1507504	1507509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431849
30011	NC_000854	ACA	2	6	1507516	1507521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431849
30012	NC_000854	CCAG	3	12	1507541	1507552	25 %	0 %	25 %	50 %	118431849
30013	NC_000854	C	6	6	1507631	1507636	0 %	0 %	0 %	100 %	118431849
30014	NC_000854	GGGT	2	8	1507639	1507646	0 %	25 %	75 %	0 %	118431849
30015	NC_000854	GCT	2	6	1507693	1507698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431849
30016	NC_000854	CGC	2	6	1507706	1507711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431849
30017	NC_000854	CCG	2	6	1507759	1507764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431849
30018	NC_000854	AGG	2	6	1507765	1507770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431849
30019	NC_000854	GTC	2	6	1507993	1507998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431850
30020	NC_000854	CCA	2	6	1507999	1508004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431850
30021	NC_000854	GTA	2	6	1508035	1508040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431850
30022	NC_000854	GCG	2	6	1508059	1508064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431850
30023	NC_000854	CCT	3	9	1508068	1508076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431850
30024	NC_000854	GTC	2	6	1508152	1508157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431850
30025	NC_000854	CTG	2	6	1508197	1508202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431850
30026	NC_000854	GAG	2	6	1508203	1508208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431850
30027	NC_000854	CCT	2	6	1508227	1508232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431850
30028	NC_000854	GAG	2	6	1508236	1508241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431850
30029	NC_000854	CTA	2	6	1508280	1508285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431850
30030	NC_000854	GTG	2	6	1508294	1508299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431850
30031	NC_000854	ACT	3	9	1508393	1508401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431850
30032	NC_000854	TCC	2	6	1508441	1508446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431851
30033	NC_000854	CCT	2	6	1508487	1508492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431851
30034	NC_000854	ACG	2	6	1508530	1508535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431851
30035	NC_000854	AG	3	6	1508559	1508564	50 %	0 %	50 %	0 %	118431851
30036	NC_000854	C	6	6	1508576	1508581	0 %	0 %	0 %	100 %	118431851
30037	NC_000854	CCT	3	9	1508603	1508611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431851
30038	NC_000854	GGT	2	6	1508636	1508641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431851
30039	NC_000854	ACG	2	6	1508692	1508697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431851
30040	NC_000854	C	6	6	1508761	1508766	0 %	0 %	0 %	100 %	118431851
30041	NC_000854	GCCTC	2	10	1508768	1508777	0 %	20 %	20 %	60 %	118431851
30042	NC_000854	TGTGG	2	10	1508814	1508823	0 %	40 %	60 %	0 %	118431851
30043	NC_000854	C	6	6	1508845	1508850	0 %	0 %	0 %	100 %	118431851
30044	NC_000854	TATCTC	2	12	1508877	1508888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118431851
30045	NC_000854	C	6	6	1508922	1508927	0 %	0 %	0 %	100 %	118431851
30046	NC_000854	CCG	2	6	1508935	1508940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431851
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30049	NC_000854	CGG	2	6	1509003	1509008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431851
30050	NC_000854	TC	3	6	1509019	1509024	0 %	50 %	0 %	50 %	118431851
30051	NC_000854	GGC	2	6	1509025	1509030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431851
30052	NC_000854	GC	3	6	1509086	1509091	0 %	0 %	50 %	50 %	118431851
30053	NC_000854	GAT	2	6	1509099	1509104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431851
30054	NC_000854	TGA	2	6	1509131	1509136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431851
30055	NC_000854	GAC	2	6	1509180	1509185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431851
30056	NC_000854	AGG	2	6	1509295	1509300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431851
30057	NC_000854	TGG	2	6	1509332	1509337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431851
30058	NC_000854	CTC	2	6	1509379	1509384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431851
30059	NC_000854	GAGG	2	8	1509387	1509394	25 %	0 %	75 %	0 %	118431851
30060	NC_000854	CA	3	6	1509418	1509423	50 %	0 %	0 %	50 %	118431851
30061	NC_000854	CTA	2	6	1509593	1509598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431851
30062	NC_000854	CTC	2	6	1509720	1509725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431852
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30064	NC_000854	ATC	2	6	1509799	1509804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431852
30065	NC_000854	TCC	3	9	1509821	1509829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431852
30066	NC_000854	CGG	2	6	1509858	1509863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431852
30067	NC_000854	GGCC	2	8	1510007	1510014	0 %	0 %	50 %	50 %	118431852
30068	NC_000854	CAT	2	6	1510028	1510033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431852
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30073	NC_000854	CTG	2	6	1510258	1510263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431852
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30088	NC_000854	AGGAG	2	10	1510928	1510937	40 %	0 %	60 %	0 %	14602026
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30091	NC_000854	AGG	2	6	1511137	1511142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602026
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30100	NC_000854	GAGG	2	8	1511373	1511380	25 %	0 %	75 %	0 %	14602026
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30103	NC_000854	GAC	2	6	1511515	1511520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602026
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30108	NC_000854	GGA	3	9	1511829	1511837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602026
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30111	NC_000854	AAG	2	6	1511914	1511919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602026
30112	NC_000854	AGG	2	6	1511924	1511929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602026
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30114	NC_000854	CGG	2	6	1512039	1512044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602026
30115	NC_000854	GGGA	2	8	1512082	1512089	25 %	0 %	75 %	0 %	14602026
30116	NC_000854	GGA	2	6	1512095	1512100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602026
30117	NC_000854	GGATAG	2	12	1512114	1512125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	14602026
30118	NC_000854	GAG	2	6	1512133	1512138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602026
30119	NC_000854	TAGG	2	8	1512188	1512195	25 %	25 %	50 %	0 %	14602026
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30228	NC_000854	CGT	2	6	1517087	1517092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602032
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30231	NC_000854	TGT	2	6	1517210	1517215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14602032
30232	NC_000854	GC	3	6	1517224	1517229	0 %	0 %	50 %	50 %	14602032
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30234	NC_000854	TGG	2	6	1517355	1517360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602032
30235	NC_000854	TGCT	2	8	1517389	1517396	0 %	50 %	25 %	25 %	14602032
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30332	NC_000854	AGGCC	2	10	1521676	1521685	20 %	0 %	40 %	40 %	118431858
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30337	NC_000854	AGG	2	6	1521940	1521945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602037
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30339	NC_000854	GGC	2	6	1521957	1521962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602037
30340	NC_000854	G	6	6	1521979	1521984	0 %	0 %	100 %	0 %	14602037
30341	NC_000854	TGG	2	6	1521986	1521991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602037
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30343	NC_000854	C	6	6	1522078	1522083	0 %	0 %	0 %	100 %	14602037
30344	NC_000854	TGC	2	6	1522199	1522204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602037
30345	NC_000854	GCCC	2	8	1522266	1522273	0 %	0 %	25 %	75 %	14602037
30346	NC_000854	GCT	2	6	1522300	1522305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602037
30347	NC_000854	GCG	2	6	1522318	1522323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602037
30348	NC_000854	GCCCA	2	10	1522347	1522356	20 %	0 %	20 %	60 %	14602037
30349	NC_000854	TAA	2	6	1522373	1522378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14602037
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30352	NC_000854	GGA	2	6	1522524	1522529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602037
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30354	NC_000854	TGG	2	6	1522634	1522639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602037
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30453	NC_000854	GGCT	2	8	1526915	1526922	0 %	25 %	50 %	25 %	14602043
30454	NC_000854	CCCCT	2	10	1526947	1526956	0 %	20 %	0 %	80 %	14602043
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30469	NC_000854	TAG	2	6	1527393	1527398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431863
30470	NC_000854	GGC	2	6	1527451	1527456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431863
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30498	NC_000854	GGC	3	9	1530023	1530031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431864
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30500	NC_000854	CCCT	2	8	1530058	1530065	0 %	25 %	0 %	75 %	118431864

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