MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_000854	AGA	2	6	1612622	1612627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431918
23502	NC_000854	CCT	2	6	1612633	1612638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431918
23503	NC_000854	AGC	2	6	1612639	1612644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431918
23504	NC_000854	GTA	2	6	1612739	1612744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431918
23505	NC_000854	CCT	2	6	1613565	1613570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602130
23506	NC_000854	CAT	2	6	1613669	1613674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602130
23507	NC_000854	GAT	2	6	1613735	1613740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602130
23508	NC_000854	GAG	2	6	1613750	1613755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602130
23509	NC_000854	AGG	2	6	1614019	1614024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602130
23510	NC_000854	CCA	2	6	1614029	1614034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602130
23511	NC_000854	CAC	2	6	1614040	1614045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602130
23512	NC_000854	TAC	2	6	1614260	1614265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602130
23513	NC_000854	AGG	2	6	1614267	1614272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602130
23514	NC_000854	AGC	2	6	1614326	1614331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602130
23515	NC_000854	TCC	2	6	1614378	1614383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602130
23516	NC_000854	CCT	2	6	1614400	1614405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602130
23517	NC_000854	CAT	2	6	1614446	1614451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602130
23518	NC_000854	CTA	2	6	1614478	1614483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602130
23519	NC_000854	GTC	2	6	1614566	1614571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602130
23520	NC_000854	GAA	2	6	1614572	1614577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602130
23521	NC_000854	AGG	2	6	1614598	1614603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602130
23522	NC_000854	TAT	2	6	1614701	1614706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14602130
23523	NC_000854	CAA	2	6	1614754	1614759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602130
23524	NC_000854	GGT	2	6	1614891	1614896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602130
23525	NC_000854	GAG	2	6	1615428	1615433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431919
23526	NC_000854	CTA	2	6	1615483	1615488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431919
23527	NC_000854	GCT	2	6	1615503	1615508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431919
23528	NC_000854	CTC	2	6	1615512	1615517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431919
23529	NC_000854	GGT	2	6	1615698	1615703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431919
23530	NC_000854	CCG	2	6	1615722	1615727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431919
23531	NC_000854	TTC	2	6	1615753	1615758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431919
23532	NC_000854	GAA	2	6	1615766	1615771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431919
23533	NC_000854	GAG	2	6	1615783	1615788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431919
23534	NC_000854	TGT	2	6	1615847	1615852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431919
23535	NC_000854	CGA	2	6	1615981	1615986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602134
23536	NC_000854	GCT	2	6	1616288	1616293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23537	NC_000854	TAG	2	6	1616331	1616336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23538	NC_000854	GAG	2	6	1616359	1616364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23539	NC_000854	GAG	2	6	1616545	1616550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23540	NC_000854	GCA	2	6	1616592	1616597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23541	NC_000854	ACG	2	6	1616636	1616641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23542	NC_000854	GGA	2	6	1616642	1616647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23543	NC_000854	CTA	2	6	1616658	1616663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431920
23544	NC_000854	GAG	2	6	1616692	1616697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23545	NC_000854	TTG	2	6	1616702	1616707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431920
23546	NC_000854	TAG	2	6	1616722	1616727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23547	NC_000854	TCA	2	6	1616763	1616768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431920
23548	NC_000854	GCT	2	6	1616909	1616914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23549	NC_000854	TAT	2	6	1616986	1616991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431920
23550	NC_000854	CAG	2	6	1616992	1616997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23551	NC_000854	GGC	2	6	1617061	1617066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431920
23552	NC_000854	CGG	3	9	1617102	1617110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431920
23553	NC_000854	CTA	2	6	1617153	1617158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431920
23554	NC_000854	GCC	2	6	1617232	1617237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431920
23555	NC_000854	GCA	2	6	1617260	1617265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23556	NC_000854	GGC	2	6	1617275	1617280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431920
23557	NC_000854	CTT	2	6	1617289	1617294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431920
23558	NC_000854	GCA	2	6	1617335	1617340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23559	NC_000854	GAT	2	6	1617591	1617596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23560	NC_000854	GAG	2	6	1617676	1617681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23561	NC_000854	GCT	2	6	1617806	1617811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23562	NC_000854	GCT	2	6	1617842	1617847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431920
23563	NC_000854	AGG	2	6	1617890	1617895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23564	NC_000854	CCT	2	6	1617944	1617949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431920
23565	NC_000854	GTA	2	6	1617958	1617963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23566	NC_000854	TAG	2	6	1617965	1617970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23567	NC_000854	AGG	2	6	1617971	1617976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431920
23568	NC_000854	ATG	2	6	1618001	1618006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431920
23569	NC_000854	CTC	2	6	1618094	1618099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431921
23570	NC_000854	TCC	2	6	1618200	1618205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431921
23571	NC_000854	GGT	2	6	1618259	1618264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431921
23572	NC_000854	CGA	2	6	1618336	1618341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431921
23573	NC_000854	CTC	2	6	1618494	1618499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431921
23574	NC_000854	CTG	2	6	1618539	1618544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431921
23575	NC_000854	TGG	2	6	1618549	1618554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431921
23576	NC_000854	TCG	2	6	1618695	1618700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431921
23577	NC_000854	TGT	2	6	1619027	1619032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431921
23578	NC_000854	CTC	2	6	1619084	1619089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431921
23579	NC_000854	ACT	2	6	1619136	1619141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431921
23580	NC_000854	GGA	2	6	1619371	1619376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602137
23581	NC_000854	CTA	2	6	1619500	1619505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602137
23582	NC_000854	CTG	2	6	1619592	1619597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602137
23583	NC_000854	ATT	2	6	1619739	1619744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14602137
23584	NC_000854	GCC	2	6	1619751	1619756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602137
23585	NC_000854	TCC	2	6	1620289	1620294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602138
23586	NC_000854	TGC	2	6	1620331	1620336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602138
23587	NC_000854	TAG	2	6	1620369	1620374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602138
23588	NC_000854	GTA	2	6	1620558	1620563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602138
23589	NC_000854	ACT	2	6	1620614	1620619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602138
23590	NC_000854	GCC	2	6	1620662	1620667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602138
23591	NC_000854	CTC	2	6	1620680	1620685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602138
23592	NC_000854	AGG	2	6	1620695	1620700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602138
23593	NC_000854	CAC	2	6	1620784	1620789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602138
23594	NC_000854	AGG	2	6	1620838	1620843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602139
23595	NC_000854	GCT	2	6	1620924	1620929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
23596	NC_000854	ACC	2	6	1620943	1620948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602139
23597	NC_000854	CCT	2	6	1620986	1620991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
23598	NC_000854	GGA	2	6	1621133	1621138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602139
23599	NC_000854	CGT	2	6	1621157	1621162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
23600	NC_000854	TCT	2	6	1621223	1621228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14602139
23601	NC_000854	TGC	2	6	1621286	1621291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
23602	NC_000854	ACA	2	6	1621309	1621314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602139
23603	NC_000854	CTC	2	6	1621323	1621328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
23604	NC_000854	CTC	2	6	1621488	1621493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
23605	NC_000854	GCT	2	6	1621593	1621598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
23606	NC_000854	TGC	2	6	1621635	1621640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
23607	NC_000854	TGA	2	6	1621838	1621843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602139
23608	NC_000854	CTC	2	6	1621974	1621979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
23609	NC_000854	AGG	2	6	1622004	1622009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602139
23610	NC_000854	CGG	2	6	1622027	1622032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602139
23611	NC_000854	ACG	2	6	1622175	1622180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602140
23612	NC_000854	GAG	2	6	1622345	1622350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602140
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23614	NC_000854	CTC	2	6	1622438	1622443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602140
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