MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_000854	TGC	2	6	315028	315033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600721
6002	NC_000854	AGG	2	6	315054	315059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600721
6003	NC_000854	GCC	2	6	315078	315083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600721
6004	NC_000854	GCG	2	6	315091	315096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600721
6005	NC_000854	GCC	2	6	315097	315102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600721
6006	NC_000854	GAG	2	6	315204	315209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600721
6007	NC_000854	AGG	2	6	315240	315245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600721
6008	NC_000854	G	6	6	315272	315277	0 %	0 %	100 %	0 %	14600721
6009	NC_000854	C	7	7	315306	315312	0 %	0 %	0 %	100 %	14600721
6010	NC_000854	GTT	2	6	315321	315326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600721
6011	NC_000854	TGC	2	6	315377	315382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600721
6012	NC_000854	TGG	2	6	315391	315396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600721
6013	NC_000854	GCG	2	6	315412	315417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600721
6014	NC_000854	CAA	2	6	315470	315475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600721
6015	NC_000854	CAT	2	6	315476	315481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600721
6016	NC_000854	AGC	2	6	315482	315487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600721
6017	NC_000854	GGC	2	6	315540	315545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600721
6018	NC_000854	TCC	2	6	315573	315578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600721
6019	NC_000854	GCG	2	6	315607	315612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600721
6020	NC_000854	TA	3	6	315678	315683	50 %	50 %	0 %	0 %	14600721
6021	NC_000854	GGGT	2	8	315704	315711	0 %	25 %	75 %	0 %	14600721
6022	NC_000854	AGT	2	6	315724	315729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600721
6023	NC_000854	GTC	2	6	315810	315815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600722
6024	NC_000854	CTC	2	6	315880	315885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600722
6025	NC_000854	CCT	2	6	315929	315934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600722
6026	NC_000854	GGT	2	6	315964	315969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600722
6027	NC_000854	CAG	2	6	316294	316299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6028	NC_000854	GTC	2	6	316351	316356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6029	NC_000854	CCT	2	6	316446	316451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431054
6030	NC_000854	CCGT	2	8	316529	316536	0 %	25 %	25 %	50 %	118431054
6031	NC_000854	GGC	2	6	316540	316545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431054
6032	NC_000854	TGC	2	6	316566	316571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6033	NC_000854	GCCC	2	8	316581	316588	0 %	0 %	25 %	75 %	118431054
6034	NC_000854	GCT	2	6	316590	316595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6035	NC_000854	TTGG	2	8	316603	316610	0 %	50 %	50 %	0 %	118431054
6036	NC_000854	GGC	2	6	316645	316650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431054
6037	NC_000854	CAGC	2	8	316656	316663	25 %	0 %	25 %	50 %	118431054
6038	NC_000854	GAT	2	6	316673	316678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431054
6039	NC_000854	ACG	2	6	316679	316684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6040	NC_000854	GGC	2	6	316720	316725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431054
6041	NC_000854	CAG	2	6	316729	316734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431054
6042	NC_000854	CTC	2	6	316735	316740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431054
6043	NC_000854	ACC	2	6	316751	316756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431054
6044	NC_000854	G	6	6	316839	316844	0 %	0 %	100 %	0 %	14600724
6045	NC_000854	CAC	2	6	316880	316885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600724
6046	NC_000854	CCA	2	6	316918	316923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600724
6047	NC_000854	AGG	2	6	316944	316949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600724
6048	NC_000854	CAGGC	2	10	316953	316962	20 %	0 %	40 %	40 %	14600724
6049	NC_000854	CCT	2	6	316970	316975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600724
6050	NC_000854	CCCT	2	8	317049	317056	0 %	25 %	0 %	75 %	14600724
6051	NC_000854	CGAG	2	8	317131	317138	25 %	0 %	50 %	25 %	14600724
6052	NC_000854	CCTC	2	8	317215	317222	0 %	25 %	0 %	75 %	14600724
6053	NC_000854	TCGA	2	8	317229	317236	25 %	25 %	25 %	25 %	14600724
6054	NC_000854	ACC	2	6	317250	317255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600724
6055	NC_000854	GCC	2	6	317262	317267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600724
6056	NC_000854	ACA	2	6	317301	317306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600724
6057	NC_000854	CCA	2	6	317316	317321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600724
6058	NC_000854	ACC	2	6	317451	317456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600724
6059	NC_000854	CCT	2	6	317495	317500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600724
6060	NC_000854	CCT	2	6	317512	317517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600724
6061	NC_000854	CCCAG	2	10	317542	317551	20 %	0 %	20 %	60 %	14600724
6062	NC_000854	CTAGGG	2	12	317681	317692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	14600726
6063	NC_000854	GTT	2	6	317752	317757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600726
6064	NC_000854	TGG	2	6	317777	317782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600726
6065	NC_000854	TA	3	6	317803	317808	50 %	50 %	0 %	0 %	14600726
6066	NC_000854	GTT	2	6	317860	317865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600726
6067	NC_000854	CTA	2	6	317919	317924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600726
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6069	NC_000854	CCG	2	6	317939	317944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600726
6070	NC_000854	GCG	2	6	317975	317980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600726
6071	NC_000854	TTC	2	6	317992	317997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600726
6072	NC_000854	TTC	2	6	318049	318054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600726
6073	NC_000854	ATA	2	6	318073	318078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600726
6074	NC_000854	GGA	2	6	318101	318106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600726
6075	NC_000854	CAGC	2	8	318128	318135	25 %	0 %	25 %	50 %	14600726
6076	NC_000854	GGC	2	6	318249	318254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600726
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6078	NC_000854	TA	3	6	318274	318279	50 %	50 %	0 %	0 %	14600726
6079	NC_000854	AGGGCG	2	12	318335	318346	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	14600726
6080	NC_000854	CGT	2	6	318351	318356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600726
6081	NC_000854	CCCG	2	8	318357	318364	0 %	0 %	25 %	75 %	14600726
6082	NC_000854	G	6	6	318523	318528	0 %	0 %	100 %	0 %	14600726
6083	NC_000854	GAG	2	6	318552	318557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600726
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6087	NC_000854	GAG	2	6	318724	318729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600726
6088	NC_000854	AGG	2	6	318815	318820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600726
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6090	NC_000854	GAG	3	9	318916	318924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600726
6091	NC_000854	TGG	2	6	318950	318955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600726
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6093	NC_000854	TC	3	6	319339	319344	0 %	50 %	0 %	50 %	14600727
6094	NC_000854	GAG	2	6	319391	319396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600727
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6098	NC_000854	ACA	2	6	319507	319512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600727
6099	NC_000854	CCCT	2	8	319513	319520	0 %	25 %	0 %	75 %	14600727
6100	NC_000854	CTAG	2	8	319528	319535	25 %	25 %	25 %	25 %	14600727
6101	NC_000854	TCC	2	6	319538	319543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600727
6102	NC_000854	AAG	2	6	319566	319571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600727
6103	NC_000854	CCTC	2	8	319580	319587	0 %	25 %	0 %	75 %	14600727
6104	NC_000854	CCT	2	6	319599	319604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600727
6105	NC_000854	GCC	2	6	319624	319629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600727
6106	NC_000854	TCACCT	2	12	319643	319654	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	14600727
6107	NC_000854	TC	3	6	319658	319663	0 %	50 %	0 %	50 %	14600727
6108	NC_000854	ACC	2	6	319910	319915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431055
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6110	NC_000854	GCT	3	9	319996	320004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431055
6111	NC_000854	TGG	2	6	320270	320275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600729
6112	NC_000854	AGG	2	6	320284	320289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600729
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6114	NC_000854	GTC	2	6	320419	320424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600729
6115	NC_000854	AAG	2	6	320440	320445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600729
6116	NC_000854	G	6	6	320450	320455	0 %	0 %	100 %	0 %	14600729
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6118	NC_000854	AGG	2	6	320506	320511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600729
6119	NC_000854	TGG	2	6	320514	320519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600729
6120	NC_000854	AGG	2	6	320593	320598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600729
6121	NC_000854	GGC	2	6	320599	320604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600729
6122	NC_000854	CCT	2	6	320646	320651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600729
6123	NC_000854	G	7	7	320665	320671	0 %	0 %	100 %	0 %	14600729
6124	NC_000854	AGG	2	6	320674	320679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600729
6125	NC_000854	CTT	2	6	320745	320750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600730
6126	NC_000854	CCT	2	6	320763	320768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
6127	NC_000854	GGA	2	6	320781	320786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600730
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6129	NC_000854	GAG	2	6	320844	320849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600730
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6131	NC_000854	CCCCTC	2	12	320881	320892	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	14600730
6132	NC_000854	TGA	2	6	320960	320965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600730
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6139	NC_000854	TCG	2	6	321238	321243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600730
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6142	NC_000854	TGT	2	6	321479	321484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600730
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6145	NC_000854	CTC	3	9	321645	321653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
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6148	NC_000854	CCT	2	6	321779	321784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
6149	NC_000854	TCC	2	6	321803	321808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
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6152	NC_000854	TCC	2	6	321833	321838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
6153	NC_000854	CTC	2	6	321847	321852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
6154	NC_000854	GGC	2	6	321885	321890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600730
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6157	NC_000854	TCC	2	6	322000	322005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600730
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6491	NC_000854	G	6	6	338781	338786	0 %	0 %	100 %	0 %	14600751
6492	NC_000854	TCC	2	6	338797	338802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600751
6493	NC_000854	CAT	2	6	338808	338813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600751
6494	NC_000854	TCC	2	6	338819	338824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600751
6495	NC_000854	TG	3	6	338839	338844	0 %	50 %	50 %	0 %	14600751
6496	NC_000854	CTC	2	6	338869	338874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600751
6497	NC_000854	CTT	2	6	338889	338894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600751
6498	NC_000854	CTC	2	6	338895	338900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600751
6499	NC_000854	CCT	2	6	338903	338908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600751
6500	NC_000854	GCG	2	6	338935	338940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600751

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