MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022784	TCG	2	6	166425	166430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625415
3002	NC_022784	CAT	2	6	166457	166462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625415
3003	NC_022784	GAAC	2	8	166488	166495	50 %	0 %	25 %	25 %	557625415
3004	NC_022784	TTG	2	6	166574	166579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625415
3005	NC_022784	CA	3	6	166621	166626	50 %	0 %	0 %	50 %	557625415
3006	NC_022784	GGA	2	6	166650	166655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625415
3007	NC_022784	CAAG	2	8	166705	166712	50 %	0 %	25 %	25 %	557625415
3008	NC_022784	CCA	2	6	166728	166733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625415
3009	NC_022784	CAT	2	6	166832	166837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625415
3010	NC_022784	ATA	2	6	166841	166846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625415
3011	NC_022784	TGC	2	6	166885	166890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_022784	CG	3	6	166913	166918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_022784	CCA	2	6	166919	166924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_022784	TTC	2	6	167025	167030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_022784	TG	3	6	167033	167038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_022784	GCC	2	6	167053	167058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_022784	CGTGT	2	10	167130	167139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_022784	TGTC	2	8	167142	167149	0 %	50 %	25 %	25 %	557625416
3019	NC_022784	CAG	2	6	167193	167198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625416
3020	NC_022784	T	6	6	167378	167383	0 %	100 %	0 %	0 %	557625416
3021	NC_022784	ACC	2	6	167440	167445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625416
3022	NC_022784	GAT	2	6	167529	167534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625416
3023	NC_022784	CAAGCT	2	12	167564	167575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	557625416
3024	NC_022784	CAG	2	6	167591	167596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625416
3025	NC_022784	ACA	2	6	167638	167643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625416
3026	NC_022784	GCC	2	6	167660	167665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625417
3027	NC_022784	CTC	2	6	167691	167696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625417
3028	NC_022784	GCAC	2	8	167859	167866	25 %	0 %	25 %	50 %	557625417
3029	NC_022784	CTC	2	6	167867	167872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625417
3030	NC_022784	TTG	2	6	167892	167897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625417
3031	NC_022784	TGC	2	6	167956	167961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625417
3032	NC_022784	AT	3	6	168006	168011	50 %	50 %	0 %	0 %	557625417
3033	NC_022784	CCT	2	6	168022	168027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625417
3034	NC_022784	GGA	2	6	168198	168203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625417
3035	NC_022784	CA	4	8	168225	168232	50 %	0 %	0 %	50 %	557625417
3036	NC_022784	CAA	2	6	168235	168240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625417
3037	NC_022784	TG	3	6	168298	168303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022784	TTGCT	2	10	168327	168336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_022784	TGG	2	6	168372	168377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022784	CT	3	6	168517	168522	0 %	50 %	0 %	50 %	557625418
3041	NC_022784	CTATC	2	10	168552	168561	20 %	40 %	0 %	40 %	557625418
3042	NC_022784	GC	3	6	168608	168613	0 %	0 %	50 %	50 %	557625418
3043	NC_022784	TGC	2	6	168776	168781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625418
3044	NC_022784	CTA	2	6	168870	168875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625418
3045	NC_022784	CAA	2	6	168878	168883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625418
3046	NC_022784	TCAA	2	8	168902	168909	50 %	25 %	0 %	25 %	557625418
3047	NC_022784	CAA	2	6	168925	168930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625418
3048	NC_022784	A	6	6	168982	168987	100 %	0 %	0 %	0 %	557625418
3049	NC_022784	TCA	2	6	169145	169150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625418
3050	NC_022784	A	7	7	169150	169156	100 %	0 %	0 %	0 %	557625418
3051	NC_022784	CTC	2	6	169157	169162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625418
3052	NC_022784	GTAA	2	8	169333	169340	50 %	25 %	25 %	0 %	557625418
3053	NC_022784	CGC	2	6	169417	169422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625418
3054	NC_022784	TCTG	2	8	169486	169493	0 %	50 %	25 %	25 %	557625418
3055	NC_022784	CCA	2	6	169551	169556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625418
3056	NC_022784	GAG	2	6	169578	169583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625418
3057	NC_022784	TA	3	6	169630	169635	50 %	50 %	0 %	0 %	557625418
3058	NC_022784	T	6	6	169754	169759	0 %	100 %	0 %	0 %	557625418
3059	NC_022784	TGC	2	6	169790	169795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625418
3060	NC_022784	CTC	2	6	169931	169936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625418
3061	NC_022784	TAA	2	6	169959	169964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625418
3062	NC_022784	TGG	2	6	170292	170297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_022784	TAG	2	6	170322	170327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022784	TGG	2	6	170335	170340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022784	ATTA	2	8	170419	170426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022784	ATGG	2	8	170460	170467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022784	TAA	2	6	170493	170498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_022784	ACTC	2	8	170508	170515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_022784	ATTT	2	8	170548	170555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_022784	GTC	2	6	170560	170565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_022784	CAT	2	6	170566	170571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_022784	TGG	2	6	170694	170699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625419
3073	NC_022784	GAT	2	6	170732	170737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625419
3074	NC_022784	GATCAA	2	12	170749	170760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	557625419
3075	NC_022784	CCGT	2	8	170799	170806	0 %	25 %	25 %	50 %	557625419
3076	NC_022784	GAAG	2	8	170813	170820	50 %	0 %	50 %	0 %	557625419
3077	NC_022784	GTGGC	2	10	170876	170885	0 %	20 %	60 %	20 %	557625419
3078	NC_022784	GTC	2	6	170906	170911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625419
3079	NC_022784	TGG	2	6	170997	171002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625419
3080	NC_022784	TAA	2	6	171141	171146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625419
3081	NC_022784	GATG	2	8	171219	171226	25 %	25 %	50 %	0 %	557625419
3082	NC_022784	CGT	2	6	171231	171236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625419
3083	NC_022784	AGA	2	6	171267	171272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625420
3084	NC_022784	CGT	2	6	171280	171285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625420
3085	NC_022784	T	7	7	171298	171304	0 %	100 %	0 %	0 %	557625420
3086	NC_022784	GTTG	2	8	171339	171346	0 %	50 %	50 %	0 %	557625420
3087	NC_022784	C	6	6	171447	171452	0 %	0 %	0 %	100 %	557625420
3088	NC_022784	ACTT	2	8	171478	171485	25 %	50 %	0 %	25 %	557625420
3089	NC_022784	CAA	2	6	171513	171518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625420
3090	NC_022784	ACC	2	6	171536	171541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625420
3091	NC_022784	GTGA	2	8	171604	171611	25 %	25 %	50 %	0 %	557625420
3092	NC_022784	TCG	2	6	171721	171726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625420
3093	NC_022784	GCA	2	6	171762	171767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625420
3094	NC_022784	TGA	2	6	171774	171779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625420
3095	NC_022784	GTT	2	6	171804	171809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625420
3096	NC_022784	AG	3	6	171916	171921	50 %	0 %	50 %	0 %	557625420
3097	NC_022784	AGG	2	6	171993	171998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625420
3098	NC_022784	AG	3	6	172071	172076	50 %	0 %	50 %	0 %	557625420
3099	NC_022784	CTTGC	2	10	172151	172160	0 %	40 %	20 %	40 %	557625420
3100	NC_022784	GT	3	6	172191	172196	0 %	50 %	50 %	0 %	557625420
3101	NC_022784	GC	3	6	172219	172224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_022784	G	6	6	172232	172237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_022784	G	6	6	172249	172254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_022784	CG	3	6	172275	172280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_022784	TG	3	6	172310	172315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_022784	GCGG	2	8	172348	172355	0 %	0 %	75 %	25 %	557625421
3107	NC_022784	AG	3	6	172358	172363	50 %	0 %	50 %	0 %	557625421
3108	NC_022784	AG	3	6	172417	172422	50 %	0 %	50 %	0 %	557625421
3109	NC_022784	GCAC	2	8	172535	172542	25 %	0 %	25 %	50 %	557625421
3110	NC_022784	GCA	2	6	172552	172557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625421
3111	NC_022784	AGG	2	6	172643	172648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625421
3112	NC_022784	AGG	2	6	172664	172669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625421
3113	NC_022784	CGTG	2	8	172698	172705	0 %	25 %	50 %	25 %	557625421
3114	NC_022784	CGA	2	6	172712	172717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625421
3115	NC_022784	T	6	6	172733	172738	0 %	100 %	0 %	0 %	557625421
3116	NC_022784	TC	3	6	172758	172763	0 %	50 %	0 %	50 %	557625421
3117	NC_022784	AGA	2	6	172782	172787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625421
3118	NC_022784	GAT	2	6	172791	172796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
3119	NC_022784	AAG	2	6	172820	172825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625421
3120	NC_022784	ATT	2	6	172869	172874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625421
3121	NC_022784	AT	3	6	172960	172965	50 %	50 %	0 %	0 %	557625421
3122	NC_022784	GCT	2	6	173067	173072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625421
3123	NC_022784	ACCC	2	8	173083	173090	25 %	0 %	0 %	75 %	557625421
3124	NC_022784	TGA	2	6	173193	173198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
3125	NC_022784	TGA	2	6	173217	173222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
3126	NC_022784	AGCCA	2	10	173249	173258	40 %	0 %	20 %	40 %	557625421
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3130	NC_022784	CTC	2	6	173413	173418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625422
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3147	NC_022784	ATA	2	6	174188	174193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_022784	GT	3	6	174211	174216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3157	NC_022784	TGG	2	6	174642	174647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625423
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3238	NC_022784	CTA	2	6	178990	178995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
3239	NC_022784	TAG	2	6	179084	179089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625425
3240	NC_022784	CACCC	2	10	179123	179132	20 %	0 %	0 %	80 %	557625425
3241	NC_022784	CTTC	2	8	179140	179147	0 %	50 %	0 %	50 %	557625425
3242	NC_022784	GGC	2	6	179177	179182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625425
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3246	NC_022784	AC	3	6	179259	179264	50 %	0 %	0 %	50 %	557625425
3247	NC_022784	TGGG	2	8	179355	179362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_022784	GATT	2	8	179379	179386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_022784	ATT	2	6	179434	179439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_022784	TGGA	2	8	179460	179467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_022784	TGT	2	6	179515	179520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_022784	AGG	2	6	179580	179585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_022784	A	6	6	179617	179622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_022784	GCA	2	6	179692	179697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3256	NC_022784	AGT	2	6	179749	179754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_022784	CTTCCT	2	12	191303	191314	0 %	50 %	0 %	50 %	557625433
3497	NC_022784	CCT	2	6	191320	191325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625433
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3499	NC_022784	C	7	7	191414	191420	0 %	0 %	0 %	100 %	557625433
3500	NC_022784	CTG	2	6	191453	191458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625433

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