MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022784	CCT	2	6	865107	865112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625867
16502	NC_022784	CAC	2	6	865158	865163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16503	NC_022784	CAT	2	6	865197	865202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_022784	T	6	6	865214	865219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_022784	AAT	2	6	865356	865361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625868
16506	NC_022784	ATTTC	2	10	865398	865407	20 %	60 %	0 %	20 %	557625868
16507	NC_022784	GCGT	2	8	865416	865423	0 %	25 %	50 %	25 %	557625868
16508	NC_022784	CA	4	8	865438	865445	50 %	0 %	0 %	50 %	557625868
16509	NC_022784	CT	3	6	865482	865487	0 %	50 %	0 %	50 %	557625868
16510	NC_022784	GAGCA	2	10	865581	865590	40 %	0 %	40 %	20 %	557625868
16511	NC_022784	GCT	2	6	865683	865688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625868
16512	NC_022784	A	9	9	865816	865824	100 %	0 %	0 %	0 %	557625868
16513	NC_022784	CAC	2	6	865840	865845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625868
16514	NC_022784	TA	3	6	865871	865876	50 %	50 %	0 %	0 %	557625868
16515	NC_022784	A	6	6	865909	865914	100 %	0 %	0 %	0 %	557625868
16516	NC_022784	GGA	2	6	865920	865925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625868
16517	NC_022784	GGA	2	6	865985	865990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_022784	AAG	2	6	866165	866170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625869
16519	NC_022784	AG	3	6	866185	866190	50 %	0 %	50 %	0 %	557625869
16520	NC_022784	AGG	2	6	866205	866210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625869
16521	NC_022784	GGTTT	2	10	866227	866236	0 %	60 %	40 %	0 %	557625869
16522	NC_022784	AGG	2	6	866251	866256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625869
16523	NC_022784	TGT	3	9	866271	866279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625869
16524	NC_022784	GGT	2	6	866313	866318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625869
16525	NC_022784	GGA	2	6	866328	866333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625869
16526	NC_022784	GTTG	2	8	866338	866345	0 %	50 %	50 %	0 %	557625869
16527	NC_022784	GGAT	2	8	866412	866419	25 %	25 %	50 %	0 %	557625869
16528	NC_022784	ACTG	2	8	866541	866548	25 %	25 %	25 %	25 %	557625870
16529	NC_022784	A	6	6	866607	866612	100 %	0 %	0 %	0 %	557625870
16530	NC_022784	AGG	2	6	866630	866635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625870
16531	NC_022784	CTA	2	6	866702	866707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625870
16532	NC_022784	TAA	2	6	866780	866785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625870
16533	NC_022784	TC	3	6	866859	866864	0 %	50 %	0 %	50 %	557625870
16534	NC_022784	TGG	2	6	866897	866902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625870
16535	NC_022784	GAAAA	2	10	866932	866941	80 %	0 %	20 %	0 %	557625870
16536	NC_022784	ATC	2	6	867007	867012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625870
16537	NC_022784	ACG	2	6	867170	867175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625870
16538	NC_022784	CAG	2	6	867297	867302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625870
16539	NC_022784	TCT	3	9	867334	867342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625870
16540	NC_022784	TGG	2	6	867411	867416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625870
16541	NC_022784	TGG	3	9	867507	867515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625870
16542	NC_022784	ATG	3	9	867566	867574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625870
16543	NC_022784	GC	3	6	867600	867605	0 %	0 %	50 %	50 %	557625870
16544	NC_022784	ATC	2	6	867628	867633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625870
16545	NC_022784	GT	3	6	867660	867665	0 %	50 %	50 %	0 %	557625870
16546	NC_022784	AGT	2	6	867831	867836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625870
16547	NC_022784	AGG	2	6	867854	867859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625870
16548	NC_022784	CAG	2	6	867863	867868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625870
16549	NC_022784	AGC	2	6	867876	867881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625870
16550	NC_022784	GGA	2	6	867892	867897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625870
16551	NC_022784	GCGCC	2	10	867951	867960	0 %	0 %	40 %	60 %	557625870
16552	NC_022784	C	7	7	867994	868000	0 %	0 %	0 %	100 %	557625870
16553	NC_022784	G	7	7	868012	868018	0 %	0 %	100 %	0 %	557625870
16554	NC_022784	GTG	2	6	868040	868045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625870
16555	NC_022784	TG	3	6	868074	868079	0 %	50 %	50 %	0 %	557625870
16556	NC_022784	TGC	2	6	868094	868099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625870
16557	NC_022784	N	77	77	868146	868222	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_022784	GCA	2	6	868230	868235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_022784	TGG	2	6	868249	868254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_022784	ATG	2	6	868292	868297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_022784	CAA	2	6	868379	868384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_022784	CCT	2	6	868401	868406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16563	NC_022784	GTAC	2	8	868416	868423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16564	NC_022784	GCA	2	6	868437	868442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_022784	GTT	2	6	868456	868461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_022784	CAG	2	6	868499	868504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16567	NC_022784	TTC	2	6	868529	868534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_022784	GCA	2	6	868574	868579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16569	NC_022784	CTC	2	6	868580	868585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16570	NC_022784	GCA	2	6	868776	868781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625871
16571	NC_022784	AGT	2	6	868806	868811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625871
16572	NC_022784	TGA	2	6	868885	868890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625871
16573	NC_022784	TCA	2	6	868918	868923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625871
16574	NC_022784	CTTC	2	8	868924	868931	0 %	50 %	0 %	50 %	557625871
16575	NC_022784	GA	3	6	869028	869033	50 %	0 %	50 %	0 %	557625871
16576	NC_022784	CAC	2	6	869089	869094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625871
16577	NC_022784	TCA	2	6	869109	869114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625871
16578	NC_022784	CA	3	6	869113	869118	50 %	0 %	0 %	50 %	557625871
16579	NC_022784	ACC	2	6	869154	869159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625871
16580	NC_022784	CCT	2	6	869167	869172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625871
16581	NC_022784	TTC	2	6	869376	869381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625871
16582	NC_022784	T	7	7	869401	869407	0 %	100 %	0 %	0 %	557625871
16583	NC_022784	AT	3	6	869441	869446	50 %	50 %	0 %	0 %	557625871
16584	NC_022784	CAT	2	6	869475	869480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625871
16585	NC_022784	TCC	2	6	869545	869550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16586	NC_022784	CTA	2	6	869578	869583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16587	NC_022784	GTA	2	6	869695	869700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
16588	NC_022784	AG	3	6	869734	869739	50 %	0 %	50 %	0 %	557625872
16589	NC_022784	AGC	2	6	869760	869765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16590	NC_022784	TTG	3	9	869825	869833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625872
16591	NC_022784	AGC	2	6	869839	869844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16592	NC_022784	TGC	2	6	869855	869860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16593	NC_022784	AAC	2	6	869874	869879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625872
16594	NC_022784	GGC	2	6	870044	870049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625872
16595	NC_022784	AAC	2	6	870079	870084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625872
16596	NC_022784	AG	3	6	870249	870254	50 %	0 %	50 %	0 %	557625872
16597	NC_022784	TAA	2	6	870266	870271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625872
16598	NC_022784	TGA	2	6	870312	870317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
16599	NC_022784	TAG	2	6	870329	870334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
16600	NC_022784	CG	3	6	870468	870473	0 %	0 %	50 %	50 %	557625872
16601	NC_022784	TCG	2	6	870491	870496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16602	NC_022784	AACC	2	8	870500	870507	50 %	0 %	0 %	50 %	557625872
16603	NC_022784	CAT	2	6	870559	870564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625872
16604	NC_022784	TTG	2	6	870590	870595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625872
16605	NC_022784	ATAG	2	8	870694	870701	50 %	25 %	25 %	0 %	557625872
16606	NC_022784	A	6	6	870768	870773	100 %	0 %	0 %	0 %	557625872
16607	NC_022784	A	7	7	870776	870782	100 %	0 %	0 %	0 %	557625872
16608	NC_022784	CAG	2	6	870793	870798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16609	NC_022784	CTGA	2	8	870904	870911	25 %	25 %	25 %	25 %	557625872
16610	NC_022784	GAA	2	6	871030	871035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625872
16611	NC_022784	AGGA	2	8	871054	871061	50 %	0 %	50 %	0 %	557625872
16612	NC_022784	TGA	2	6	871124	871129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
16613	NC_022784	GCT	2	6	871146	871151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16614	NC_022784	AGA	2	6	871225	871230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625872
16615	NC_022784	TTTG	2	8	871335	871342	0 %	75 %	25 %	0 %	557625872
16616	NC_022784	TGC	2	6	871358	871363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16617	NC_022784	GC	3	6	871415	871420	0 %	0 %	50 %	50 %	557625872
16618	NC_022784	GGT	2	6	871488	871493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625872
16619	NC_022784	GTT	2	6	871494	871499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625872
16620	NC_022784	TGC	2	6	871541	871546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625872
16621	NC_022784	TGA	2	6	871554	871559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
16622	NC_022784	ACAG	2	8	871570	871577	50 %	0 %	25 %	25 %	557625872
16623	NC_022784	TGA	2	6	871743	871748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625872
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