MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 22308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022760	TCT	2	6	650946	650951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_022760	GCA	2	6	650990	650995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_022760	GAT	2	6	651005	651010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_022760	CAGCG	2	10	651034	651043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12005	NC_022760	AC	4	8	651050	651057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_022760	TCA	2	6	651084	651089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_022760	GC	3	6	651144	651149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_022760	ATA	2	6	651225	651230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_022760	CGG	2	6	651257	651262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_022760	CTA	2	6	651363	651368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_022760	AGCT	2	8	651388	651395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12012	NC_022760	AG	3	6	651471	651476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_022760	CCA	2	6	651481	651486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12014	NC_022760	GAG	2	6	651525	651530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_022760	CGTG	2	8	651641	651648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12016	NC_022760	GGAGGC	2	12	651662	651673	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12017	NC_022760	ATT	2	6	651682	651687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_022760	TAT	2	6	651700	651705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_022760	AG	3	6	651759	651764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_022760	TTC	2	6	651807	651812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_022760	AGC	2	6	651817	651822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_022760	TAG	2	6	651840	651845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_022760	AGC	2	6	651911	651916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_022760	CTA	2	6	651917	651922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12025	NC_022760	GCA	2	6	651978	651983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_022760	TGC	2	6	652054	652059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_022760	AG	3	6	652195	652200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_022760	TGC	2	6	652386	652391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_022760	GTT	2	6	652409	652414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_022760	AGA	2	6	652459	652464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_022760	ATA	2	6	652467	652472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_022760	GAC	2	6	652502	652507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12033	NC_022760	GAG	2	6	652546	652551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_022760	TGC	2	6	652552	652557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_022760	GTG	2	6	652563	652568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_022760	AAG	2	6	652572	652577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_022760	GAT	2	6	652592	652597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_022760	CAG	2	6	652605	652610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_022760	GTTT	2	8	652621	652628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_022760	TGAA	2	8	652713	652720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_022760	TGG	2	6	652725	652730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_022760	CCA	2	6	652788	652793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12043	NC_022760	CA	3	6	652854	652859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12044	NC_022760	GCA	2	6	652970	652975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_022760	AGG	2	6	652981	652986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_022760	GA	3	6	653063	653068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_022760	GGC	2	6	653110	653115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12048	NC_022760	AGG	2	6	653130	653135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_022760	CAG	2	6	653149	653154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12050	NC_022760	GCCTA	2	10	653170	653179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12051	NC_022760	TGA	2	6	653185	653190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_022760	GGC	2	6	653212	653217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_022760	AGA	2	6	653439	653444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_022760	CGCTG	2	10	653500	653509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12055	NC_022760	AGC	2	6	653548	653553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_022760	GGT	2	6	653582	653587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_022760	CAG	2	6	653652	653657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12058	NC_022760	CA	3	6	653675	653680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12059	NC_022760	T	7	7	653746	653752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_022760	CG	3	6	653789	653794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12061	NC_022760	GCA	2	6	653798	653803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_022760	TTA	2	6	653889	653894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_022760	AG	3	6	653944	653949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_022760	GC	3	6	653980	653985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12065	NC_022760	ACC	2	6	653987	653992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12066	NC_022760	GCA	2	6	653993	653998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12067	NC_022760	GCAC	2	8	654029	654036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12068	NC_022760	GCA	2	6	654125	654130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12069	NC_022760	CAA	2	6	654152	654157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12070	NC_022760	TCG	2	6	654161	654166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_022760	TAC	2	6	654231	654236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12072	NC_022760	AC	3	6	654360	654365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12073	NC_022760	GCA	2	6	654379	654384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12074	NC_022760	CAG	2	6	654423	654428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12075	NC_022760	ACG	2	6	654498	654503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12077	NC_022760	AGC	2	6	654542	654547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12078	NC_022760	GCA	2	6	654593	654598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12079	NC_022760	TTG	2	6	654672	654677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_022760	GGC	2	6	654784	654789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12081	NC_022760	GC	3	6	654788	654793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12082	NC_022760	TGC	2	6	654868	654873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12083	NC_022760	GATG	2	8	654874	654881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_022760	GCA	2	6	654886	654891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12085	NC_022760	ATC	2	6	654904	654909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_022760	GTG	2	6	654921	654926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12087	NC_022760	GACAA	2	10	654935	654944	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12088	NC_022760	CA	3	6	654946	654951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12089	NC_022760	CTG	2	6	654971	654976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_022760	AT	3	6	655010	655015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_022760	AC	3	6	655017	655022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12092	NC_022760	GCA	2	6	655081	655086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12093	NC_022760	ACTA	2	8	655105	655112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12094	NC_022760	AGG	2	6	655167	655172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_022760	AGC	2	6	655216	655221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12096	NC_022760	ATT	2	6	655276	655281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_022760	CAA	2	6	655295	655300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12098	NC_022760	GCCA	2	8	655307	655314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12099	NC_022760	TGC	2	6	655411	655416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12100	NC_022760	ATG	2	6	655431	655436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_022760	N	9	9	655580	655588	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_022760	TGGA	3	12	655747	655758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_022760	GC	3	6	655814	655819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12104	NC_022760	GCA	2	6	655821	655826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12105	NC_022760	AAC	2	6	655896	655901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_022760	AGG	2	6	655990	655995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_022760	TTGG	2	8	656016	656023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_022760	CGG	2	6	656087	656092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_022760	AGT	2	6	656174	656179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12110	NC_022760	GCA	2	6	656199	656204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_022760	GCA	2	6	656247	656252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_022760	ACCCAG	2	12	656310	656321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12113	NC_022760	GCT	2	6	656331	656336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_022760	CTG	2	6	656353	656358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_022760	TTG	2	6	656377	656382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_022760	ATC	2	6	656387	656392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_022760	GTT	2	6	656496	656501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_022760	AGG	2	6	656601	656606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_022760	AGC	2	6	656665	656670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_022760	AGC	2	6	656700	656705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_022760	GCA	2	6	657055	657060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_022760	GTT	2	6	657065	657070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_022760	ACTCT	2	10	657075	657084	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12124	NC_022760	GA	3	6	657106	657111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_022760	CTG	2	6	657120	657125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12126	NC_022760	CCGG	2	8	657210	657217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12127	NC_022760	AC	3	6	657286	657291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12128	NC_022760	TG	3	6	657315	657320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_022760	AGC	2	6	657419	657424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12130	NC_022760	CAA	2	6	657457	657462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_022760	GCT	3	9	657487	657495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12132	NC_022760	CTT	2	6	657568	657573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12133	NC_022760	AGG	2	6	657617	657622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_022760	GCT	2	6	657650	657655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12135	NC_022760	GCCG	2	8	657667	657674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12136	NC_022760	TAC	2	6	657694	657699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12140	NC_022760	GC	3	6	657899	657904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12141	NC_022760	GAT	2	6	657938	657943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12153	NC_022760	CAA	2	6	658284	658289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12157	NC_022760	AGA	2	6	658417	658422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12158	NC_022760	AGT	2	6	658453	658458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12163	NC_022760	CCTC	2	8	658588	658595	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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12170	NC_022760	GAG	2	6	658755	658760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12171	NC_022760	N	12	12	658768	658779	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12172	NC_022760	GT	3	6	658805	658810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12173	NC_022760	CA	3	6	658890	658895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12174	NC_022760	GCAA	2	8	658915	658922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12207	NC_022760	AAG	2	6	662140	662145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12240	NC_022760	CTATG	2	10	663206	663215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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12242	NC_022760	CAG	2	6	663241	663246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12243	NC_022760	CTA	2	6	663250	663255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12244	NC_022760	CAG	2	6	663269	663274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12245	NC_022760	N	28	28	663286	663313	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_022760	CAT	2	6	663350	663355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12248	NC_022760	CAT	2	6	663380	663385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12249	NC_022760	N	19	19	663422	663440	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12250	NC_022760	AG	3	6	663442	663447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12251	NC_022760	TGC	2	6	663451	663456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12252	NC_022760	GTG	2	6	663516	663521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_022760	GTA	2	6	663555	663560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12254	NC_022760	CTG	2	6	663589	663594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12255	NC_022760	N	2227	2227	663635	665861	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_022760	CTT	2	6	665863	665868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12257	NC_022760	CGC	2	6	665913	665918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12258	NC_022760	TCAA	2	8	665925	665932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12259	NC_022760	GCC	2	6	665957	665962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12260	NC_022760	CCAG	2	8	666078	666085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12385	NC_022760	CAT	2	6	672104	672109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237812
12386	NC_022760	CCA	3	9	672116	672124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237812
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12388	NC_022760	TGC	2	6	672244	672249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237812
12389	NC_022760	GGC	2	6	672349	672354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237812
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