MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_022521	TCC	2	6	1457638	1457643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33002	NC_022521	GCA	2	6	1457652	1457657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456146
33003	NC_022521	GTAGGG	2	12	1457678	1457689	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	549456146
33004	NC_022521	GCCT	2	8	1457748	1457755	0 %	25 %	25 %	50 %	549456146
33005	NC_022521	CCT	2	6	1457911	1457916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33006	NC_022521	CTC	2	6	1457922	1457927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33007	NC_022521	CGC	2	6	1457942	1457947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456146
33008	NC_022521	CCCGT	2	10	1457970	1457979	0 %	20 %	20 %	60 %	549456146
33009	NC_022521	GTG	2	6	1457982	1457987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456146
33010	NC_022521	TCC	2	6	1457998	1458003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33011	NC_022521	C	6	6	1458024	1458029	0 %	0 %	0 %	100 %	549456146
33012	NC_022521	C	6	6	1458058	1458063	0 %	0 %	0 %	100 %	549456146
33013	NC_022521	C	6	6	1458072	1458077	0 %	0 %	0 %	100 %	549456146
33014	NC_022521	GAC	2	6	1458080	1458085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456146
33015	NC_022521	CGC	2	6	1458122	1458127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456146
33016	NC_022521	CCTCGG	2	12	1458172	1458183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549456146
33017	NC_022521	AAC	2	6	1458197	1458202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456146
33018	NC_022521	TAT	2	6	1458215	1458220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456146
33019	NC_022521	CTT	2	6	1458224	1458229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456146
33020	NC_022521	CCT	2	6	1458235	1458240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33021	NC_022521	TAT	2	6	1458341	1458346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456146
33022	NC_022521	AGC	2	6	1458374	1458379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456146
33023	NC_022521	GTC	2	6	1458392	1458397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456146
33024	NC_022521	AAC	2	6	1458422	1458427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456146
33025	NC_022521	G	6	6	1458431	1458436	0 %	0 %	100 %	0 %	549456146
33026	NC_022521	CGT	2	6	1458439	1458444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456146
33027	NC_022521	TCC	2	6	1458601	1458606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456146
33028	NC_022521	AGT	2	6	1458662	1458667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_022521	AGGC	2	8	1458698	1458705	25 %	0 %	50 %	25 %	549456147
33030	NC_022521	AGG	2	6	1458726	1458731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456147
33031	NC_022521	TGC	2	6	1458743	1458748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456147
33032	NC_022521	GCC	2	6	1458750	1458755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456147
33033	NC_022521	GAG	3	9	1458852	1458860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456147
33034	NC_022521	AGG	2	6	1458873	1458878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456147
33035	NC_022521	AGCC	2	8	1458884	1458891	25 %	0 %	25 %	50 %	549456147
33036	NC_022521	CCCCCT	2	12	1458917	1458928	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	549456147
33037	NC_022521	GCCT	2	8	1458972	1458979	0 %	25 %	25 %	50 %	549456147
33038	NC_022521	AGCC	2	8	1459001	1459008	25 %	0 %	25 %	50 %	549456147
33039	NC_022521	AG	3	6	1459064	1459069	50 %	0 %	50 %	0 %	549456147
33040	NC_022521	CCCG	2	8	1459208	1459215	0 %	0 %	25 %	75 %	549456147
33041	NC_022521	GCC	2	6	1459388	1459393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456148
33042	NC_022521	CCT	2	6	1459429	1459434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456148
33043	NC_022521	ACCCT	2	10	1459478	1459487	20 %	20 %	0 %	60 %	549456148
33044	NC_022521	GAC	2	6	1459495	1459500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456148
33045	NC_022521	GCG	2	6	1459517	1459522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456148
33046	NC_022521	AAC	2	6	1459633	1459638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456148
33047	NC_022521	AG	3	6	1459672	1459677	50 %	0 %	50 %	0 %	549456148
33048	NC_022521	CTC	2	6	1459712	1459717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456148
33049	NC_022521	CCAGC	2	10	1459731	1459740	20 %	0 %	20 %	60 %	549456148
33050	NC_022521	AGG	2	6	1459748	1459753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456148
33051	NC_022521	CCT	2	6	1459852	1459857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456148
33052	NC_022521	AGC	2	6	1459889	1459894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456148
33053	NC_022521	GAG	2	6	1459909	1459914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456148
33054	NC_022521	CGT	2	6	1459915	1459920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456148
33055	NC_022521	CTG	2	6	1459947	1459952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456148
33056	NC_022521	C	6	6	1460041	1460046	0 %	0 %	0 %	100 %	549456149
33057	NC_022521	AGG	2	6	1460149	1460154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456149
33058	NC_022521	AGT	2	6	1460206	1460211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456149
33059	NC_022521	GAG	2	6	1460214	1460219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456149
33060	NC_022521	AG	3	6	1460328	1460333	50 %	0 %	50 %	0 %	549456149
33061	NC_022521	CCT	2	6	1460343	1460348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456149
33062	NC_022521	GAG	2	6	1460352	1460357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456149
33063	NC_022521	CTC	2	6	1460373	1460378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456149
33064	NC_022521	AGCC	2	8	1460379	1460386	25 %	0 %	25 %	50 %	549456149
33065	NC_022521	CCTC	2	8	1460393	1460400	0 %	25 %	0 %	75 %	549456149
33066	NC_022521	CGG	2	6	1460412	1460417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456149
33067	NC_022521	CTC	2	6	1460448	1460453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456149
33068	NC_022521	AT	3	6	1460547	1460552	50 %	50 %	0 %	0 %	549456149
33069	NC_022521	TCG	2	6	1460555	1460560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456149
33070	NC_022521	C	6	6	1460693	1460698	0 %	0 %	0 %	100 %	549456149
33071	NC_022521	CCTC	2	8	1460767	1460774	0 %	25 %	0 %	75 %	549456150
33072	NC_022521	GCC	2	6	1460870	1460875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456150
33073	NC_022521	TGG	2	6	1460890	1460895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456150
33074	NC_022521	CGT	2	6	1460896	1460901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456150
33075	NC_022521	CAAC	2	8	1460905	1460912	50 %	0 %	0 %	50 %	549456150
33076	NC_022521	CCT	2	6	1460935	1460940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456150
33077	NC_022521	G	6	6	1461066	1461071	0 %	0 %	100 %	0 %	549456150
33078	NC_022521	CCA	2	6	1461112	1461117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456150
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33081	NC_022521	AGG	2	6	1461201	1461206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456150
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33084	NC_022521	GTT	2	6	1461262	1461267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456151
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33086	NC_022521	AGG	2	6	1461367	1461372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456151
33087	NC_022521	ACG	2	6	1461379	1461384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456151
33088	NC_022521	AGA	2	6	1461403	1461408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456151
33089	NC_022521	CCG	2	6	1461410	1461415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456151
33090	NC_022521	CAG	2	6	1461438	1461443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456151
33091	NC_022521	AAG	2	6	1461465	1461470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456151
33092	NC_022521	GCC	2	6	1461483	1461488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456151
33093	NC_022521	GGCGAG	2	12	1461540	1461551	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549456151
33094	NC_022521	CAC	2	6	1461562	1461567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456151
33095	NC_022521	TGC	2	6	1461604	1461609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456151
33096	NC_022521	TGA	2	6	1461644	1461649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456151
33097	NC_022521	GGA	2	6	1461772	1461777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33098	NC_022521	GTG	2	6	1461856	1461861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33099	NC_022521	AAC	2	6	1461892	1461897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33100	NC_022521	GTGC	2	8	1461943	1461950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33101	NC_022521	GCT	2	6	1462058	1462063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456152
33102	NC_022521	GGC	2	6	1462064	1462069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456152
33103	NC_022521	AACG	2	8	1462289	1462296	50 %	0 %	25 %	25 %	549456152
33104	NC_022521	GAG	2	6	1462407	1462412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456152
33105	NC_022521	ATG	2	6	1462423	1462428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456152
33106	NC_022521	CCG	2	6	1462443	1462448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456152
33107	NC_022521	CA	3	6	1462466	1462471	50 %	0 %	0 %	50 %	549456152
33108	NC_022521	TGA	2	6	1462529	1462534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456152
33109	NC_022521	TCACC	2	10	1462588	1462597	20 %	20 %	0 %	60 %	549456152
33110	NC_022521	TAA	2	6	1462599	1462604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456152
33111	NC_022521	ATA	2	6	1462648	1462653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33112	NC_022521	TA	3	6	1462658	1462663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_022521	CAG	2	6	1462796	1462801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456153
33114	NC_022521	ACA	2	6	1462832	1462837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456153
33115	NC_022521	CGA	2	6	1462869	1462874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456153
33116	NC_022521	GAC	2	6	1462909	1462914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456153
33117	NC_022521	CGA	2	6	1463007	1463012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456153
33118	NC_022521	CTA	2	6	1463088	1463093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456153
33119	NC_022521	CA	3	6	1463094	1463099	50 %	0 %	0 %	50 %	549456153
33120	NC_022521	ATAA	2	8	1463206	1463213	75 %	25 %	0 %	0 %	549456153
33121	NC_022521	TGG	2	6	1463266	1463271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456153
33122	NC_022521	AAC	2	6	1463275	1463280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456153
33123	NC_022521	CGC	2	6	1463310	1463315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456153
33124	NC_022521	GTG	2	6	1463332	1463337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456153
33125	NC_022521	AGG	2	6	1463342	1463347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456153
33126	NC_022521	TGA	2	6	1463349	1463354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456153
33127	NC_022521	TGT	2	6	1463376	1463381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456153
33128	NC_022521	GGA	2	6	1463424	1463429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456153
33129	NC_022521	ATTTT	2	10	1463511	1463520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33130	NC_022521	T	6	6	1463517	1463522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33131	NC_022521	ATT	2	6	1463539	1463544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33132	NC_022521	TA	3	6	1463556	1463561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33133	NC_022521	GAA	2	6	1463612	1463617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33134	NC_022521	TAC	2	6	1463651	1463656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456154
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33136	NC_022521	ACC	2	6	1463685	1463690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456154
33137	NC_022521	GCA	2	6	1463778	1463783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456154
33138	NC_022521	CGG	2	6	1463792	1463797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456154
33139	NC_022521	TCT	2	6	1463822	1463827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456154
33140	NC_022521	CT	3	6	1463830	1463835	0 %	50 %	0 %	50 %	549456154
33141	NC_022521	TCTA	2	8	1463899	1463906	25 %	50 %	0 %	25 %	549456154
33142	NC_022521	GCC	2	6	1463940	1463945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456154
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33144	NC_022521	CTT	2	6	1464059	1464064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456154
33145	NC_022521	GCT	2	6	1464294	1464299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456155
33146	NC_022521	AGG	2	6	1464332	1464337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456155
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33148	NC_022521	GCC	2	6	1464357	1464362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456155
33149	NC_022521	CGC	2	6	1464433	1464438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456155
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33151	NC_022521	TTA	2	6	1464536	1464541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456155
33152	NC_022521	TA	3	6	1464540	1464545	50 %	50 %	0 %	0 %	549456155
33153	NC_022521	TAT	2	6	1464559	1464564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456155
33154	NC_022521	TGGC	2	8	1464577	1464584	0 %	25 %	50 %	25 %	549456155
33155	NC_022521	GAG	2	6	1464585	1464590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456155
33156	NC_022521	GGA	2	6	1464613	1464618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456155
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33160	NC_022521	GTCATA	2	12	1464912	1464923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549456155
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33162	NC_022521	TAC	2	6	1465047	1465052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456155
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33164	NC_022521	GCA	2	6	1465072	1465077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456155
33165	NC_022521	ATAGTC	2	12	1465104	1465115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549456155
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33168	NC_022521	CGG	2	6	1465328	1465333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456155
33169	NC_022521	GGTG	2	8	1465406	1465413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33170	NC_022521	ATG	2	6	1465437	1465442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33171	NC_022521	AAC	2	6	1465501	1465506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456156
33172	NC_022521	TGA	2	6	1465516	1465521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456156
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33176	NC_022521	TAG	2	6	1465714	1465719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456156
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33180	NC_022521	CGG	2	6	1465900	1465905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456156
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33183	NC_022521	GAG	2	6	1466124	1466129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456156
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33189	NC_022521	TAC	2	6	1466355	1466360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456156
33190	NC_022521	TGC	2	6	1466551	1466556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456156
33191	NC_022521	GAA	2	6	1466747	1466752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456156
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33197	NC_022521	ATTTG	2	10	1466946	1466955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33198	NC_022521	TAA	2	6	1466971	1466976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33199	NC_022521	TA	3	6	1467072	1467077	50 %	50 %	0 %	0 %	549456157
33200	NC_022521	AGGG	2	8	1467093	1467100	25 %	0 %	75 %	0 %	549456157
33201	NC_022521	AGG	2	6	1467168	1467173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456157
33202	NC_022521	T	6	6	1467192	1467197	0 %	100 %	0 %	0 %	549456157
33203	NC_022521	GA	3	6	1467293	1467298	50 %	0 %	50 %	0 %	549456157
33204	NC_022521	TCAT	2	8	1467380	1467387	25 %	50 %	0 %	25 %	549456157
33205	NC_022521	GATATC	2	12	1467458	1467469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33206	NC_022521	CGT	2	6	1467490	1467495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33207	NC_022521	GTG	2	6	1467496	1467501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33208	NC_022521	GCC	2	6	1467504	1467509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33209	NC_022521	ACC	2	6	1467526	1467531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33210	NC_022521	GAC	2	6	1467564	1467569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33211	NC_022521	GCC	2	6	1467571	1467576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33212	NC_022521	G	6	6	1467640	1467645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33213	NC_022521	CT	3	6	1467653	1467658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33214	NC_022521	GTT	2	6	1467702	1467707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456158
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33221	NC_022521	ATC	2	6	1468033	1468038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456158
33222	NC_022521	CT	3	6	1468092	1468097	0 %	50 %	0 %	50 %	549456158
33223	NC_022521	ACC	2	6	1468098	1468103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456158
33224	NC_022521	TAT	2	6	1468104	1468109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456158
33225	NC_022521	AGG	2	6	1468129	1468134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456158
33226	NC_022521	CGC	2	6	1468161	1468166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456158
33227	NC_022521	ACT	2	6	1468210	1468215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456158
33228	NC_022521	GGACT	2	10	1468248	1468257	20 %	20 %	40 %	20 %	549456158
33229	NC_022521	TAT	2	6	1468263	1468268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456158
33230	NC_022521	G	6	6	1468299	1468304	0 %	0 %	100 %	0 %	549456158
33231	NC_022521	CAT	2	6	1468326	1468331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456158
33232	NC_022521	AAC	2	6	1468350	1468355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456158
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