MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

< Previous12...60616263646566676869707172Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_022521	CAG	2	6	1346999	1347004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456033
30503	NC_022521	CGT	2	6	1347141	1347146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456033
30504	NC_022521	GTG	2	6	1347244	1347249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456033
30505	NC_022521	AGT	2	6	1347251	1347256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456033
30506	NC_022521	CGA	2	6	1347296	1347301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30507	NC_022521	ATG	2	6	1347372	1347377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456034
30508	NC_022521	AGGCTG	2	12	1347378	1347389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549456034
30509	NC_022521	GAG	2	6	1347447	1347452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456034
30510	NC_022521	GGC	2	6	1347453	1347458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456034
30511	NC_022521	GAC	2	6	1347479	1347484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30512	NC_022521	GAG	2	6	1347498	1347503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456034
30513	NC_022521	CTG	2	6	1347510	1347515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30514	NC_022521	GAA	2	6	1347521	1347526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456034
30515	NC_022521	CGT	2	6	1347659	1347664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30516	NC_022521	GTC	2	6	1347690	1347695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30517	NC_022521	ATA	2	6	1347711	1347716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456034
30518	NC_022521	TAG	2	6	1347754	1347759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456034
30519	NC_022521	CGA	2	6	1347914	1347919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456034
30520	NC_022521	GAG	3	9	1347945	1347953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456034
30521	NC_022521	AAG	2	6	1347963	1347968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456034
30522	NC_022521	GCG	2	6	1347993	1347998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456034
30523	NC_022521	GA	3	6	1347999	1348004	50 %	0 %	50 %	0 %	549456034
30524	NC_022521	AGG	3	9	1348056	1348064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456034
30525	NC_022521	C	6	6	1348135	1348140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30526	NC_022521	GA	3	6	1348271	1348276	50 %	0 %	50 %	0 %	549456035
30527	NC_022521	TCC	2	6	1348314	1348319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456035
30528	NC_022521	CCT	2	6	1348348	1348353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456035
30529	NC_022521	AGC	2	6	1348533	1348538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456035
30530	NC_022521	TGCT	2	8	1348539	1348546	0 %	50 %	25 %	25 %	549456035
30531	NC_022521	GAG	2	6	1348561	1348566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456035
30532	NC_022521	C	6	6	1348661	1348666	0 %	0 %	0 %	100 %	549456035
30533	NC_022521	CTG	2	6	1348670	1348675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456035
30534	NC_022521	CGA	2	6	1348696	1348701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456035
30535	NC_022521	TCC	2	6	1348716	1348721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456035
30536	NC_022521	AGG	3	9	1348838	1348846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456035
30537	NC_022521	TCTACG	2	12	1348851	1348862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549456035
30538	NC_022521	GAGG	2	8	1348882	1348889	25 %	0 %	75 %	0 %	549456035
30539	NC_022521	GAG	2	6	1348903	1348908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456035
30540	NC_022521	GAG	2	6	1348924	1348929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456035
30541	NC_022521	GAA	2	6	1348987	1348992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456035
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30543	NC_022521	CCTG	2	8	1349085	1349092	0 %	25 %	25 %	50 %	549456035
30544	NC_022521	GGA	2	6	1349104	1349109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456035
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30552	NC_022521	GAG	2	6	1349408	1349413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456036
30553	NC_022521	GCCAG	2	10	1349527	1349536	20 %	0 %	40 %	40 %	549456036
30554	NC_022521	TCC	2	6	1349557	1349562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456036
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30565	NC_022521	AGG	2	6	1349889	1349894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456036
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30588	NC_022521	CGCC	2	8	1350863	1350870	0 %	0 %	25 %	75 %	549456037
30589	NC_022521	AGT	2	6	1350943	1350948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30591	NC_022521	GAG	2	6	1351036	1351041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456038
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30600	NC_022521	GGT	2	6	1351512	1351517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30601	NC_022521	GAG	2	6	1351531	1351536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456039
30602	NC_022521	CGA	2	6	1351547	1351552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456039
30603	NC_022521	CAG	2	6	1351583	1351588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456039
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30606	NC_022521	TAC	2	6	1351678	1351683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456039
30607	NC_022521	G	6	6	1351710	1351715	0 %	0 %	100 %	0 %	549456039
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30612	NC_022521	GCT	2	6	1351955	1351960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456039
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30614	NC_022521	CCCT	2	8	1352028	1352035	0 %	25 %	0 %	75 %	549456039
30615	NC_022521	CA	3	6	1352064	1352069	50 %	0 %	0 %	50 %	549456039
30616	NC_022521	GGA	2	6	1352180	1352185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456039
30617	NC_022521	AGG	2	6	1352193	1352198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456039
30618	NC_022521	AG	3	6	1352240	1352245	50 %	0 %	50 %	0 %	549456039
30619	NC_022521	GGA	2	6	1352279	1352284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456039
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30622	NC_022521	GA	3	6	1352348	1352353	50 %	0 %	50 %	0 %	549456039
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30624	NC_022521	AG	3	6	1352385	1352390	50 %	0 %	50 %	0 %	549456039
30625	NC_022521	A	6	6	1352397	1352402	100 %	0 %	0 %	0 %	549456039
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30632	NC_022521	G	6	6	1352685	1352690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30633	NC_022521	TGGC	2	8	1352805	1352812	0 %	25 %	50 %	25 %	549456041
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30653	NC_022521	C	6	6	1353684	1353689	0 %	0 %	0 %	100 %	549456041
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30712	NC_022521	AC	3	6	1356460	1356465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30713	NC_022521	AGT	2	6	1356534	1356539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30723	NC_022521	GAT	2	6	1357104	1357109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30724	NC_022521	ATTCAT	2	12	1357117	1357128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30725	NC_022521	TAAC	2	8	1357143	1357150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30726	NC_022521	AAG	2	6	1357156	1357161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30727	NC_022521	CTA	2	6	1357224	1357229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30728	NC_022521	TCG	2	6	1357291	1357296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30729	NC_022521	CCT	2	6	1357337	1357342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30730	NC_022521	CTG	3	9	1357393	1357401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30731	NC_022521	GAA	2	6	1357412	1357417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30732	NC_022521	TGG	2	6	1357484	1357489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456046
30733	NC_022521	CTA	2	6	1357551	1357556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456046
30734	NC_022521	GTC	2	6	1357635	1357640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456046
30735	NC_022521	ACTATG	2	12	1357683	1357694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30736	NC_022521	CAGAG	2	10	1357758	1357767	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30737	NC_022521	CGA	2	6	1357772	1357777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30738	NC_022521	TGT	2	6	1357816	1357821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456047
30739	NC_022521	CTA	2	6	1357958	1357963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456047
30740	NC_022521	CAA	2	6	1358021	1358026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549456047
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30745	NC_022521	TTTCA	2	10	1358169	1358178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30746	NC_022521	AGA	2	6	1358214	1358219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30747	NC_022521	ATT	2	6	1358241	1358246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30748	NC_022521	TAA	2	6	1358248	1358253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30749	NC_022521	GCA	2	6	1358266	1358271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30750	NC_022521	CCGGG	2	10	1358369	1358378	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30751	NC_022521	CTC	2	6	1358475	1358480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30752	NC_022521	ATC	2	6	1358498	1358503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30753	NC_022521	C	6	6	1358505	1358510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30754	NC_022521	TATG	2	8	1358545	1358552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30755	NC_022521	CTG	2	6	1358558	1358563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30756	NC_022521	TA	3	6	1358569	1358574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30757	NC_022521	CAC	2	6	1358585	1358590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30758	NC_022521	TGGC	2	8	1358627	1358634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30759	NC_022521	GTTG	2	8	1358639	1358646	0 %	50 %	50 %	0 %	549456048
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30762	NC_022521	GAG	2	6	1358748	1358753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456048
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30765	NC_022521	CCTCG	2	10	1358946	1358955	0 %	20 %	20 %	60 %	549456048
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30772	NC_022521	GA	3	6	1359196	1359201	50 %	0 %	50 %	0 %	549456049
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30801	NC_022521	GTT	2	6	1360469	1360474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456050
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30804	NC_022521	GCGTAG	2	12	1360605	1360616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549456050
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30806	NC_022521	AG	3	6	1360660	1360665	50 %	0 %	50 %	0 %	549456050
30807	NC_022521	AGT	2	6	1360697	1360702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456050
30808	NC_022521	TCG	2	6	1360713	1360718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456050
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30831	NC_022521	GACA	2	8	1361707	1361714	50 %	0 %	25 %	25 %	549456052
30832	NC_022521	AAG	2	6	1361729	1361734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456052
30833	NC_022521	GCA	2	6	1361751	1361756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456052
30834	NC_022521	G	6	6	1361767	1361772	0 %	0 %	100 %	0 %	549456052
30835	NC_022521	CTC	2	6	1361783	1361788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456052
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30837	NC_022521	TAC	2	6	1361833	1361838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456052
30838	NC_022521	TGC	2	6	1361871	1361876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30839	NC_022521	AC	3	6	1361897	1361902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30840	NC_022521	GTGGG	2	10	1361927	1361936	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30841	NC_022521	GAA	2	6	1362018	1362023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456053
30842	NC_022521	GAG	2	6	1362036	1362041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456053
30843	NC_022521	GCT	2	6	1362058	1362063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456053
30844	NC_022521	CTC	2	6	1362168	1362173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456053
30845	NC_022521	CCAG	3	12	1362174	1362185	25 %	0 %	25 %	50 %	549456053
30846	NC_022521	CAG	2	6	1362203	1362208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456053
30847	NC_022521	CCA	2	6	1362243	1362248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456053
30848	NC_022521	CTG	2	6	1362259	1362264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456053
30849	NC_022521	CTCCA	2	10	1362283	1362292	20 %	20 %	0 %	60 %	549456053
30850	NC_022521	GAA	2	6	1362312	1362317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456053
30851	NC_022521	GCC	2	6	1362355	1362360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456053
30852	NC_022521	TAT	2	6	1362369	1362374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456053
30853	NC_022521	CTC	2	6	1362393	1362398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456053
30854	NC_022521	TAT	2	6	1362423	1362428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456053
30855	NC_022521	C	6	6	1362506	1362511	0 %	0 %	0 %	100 %	549456053
30856	NC_022521	AGC	2	6	1362709	1362714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456053
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30860	NC_022521	TAT	2	6	1362771	1362776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456053
30861	NC_022521	AGT	2	6	1362790	1362795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456053
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30886	NC_022521	CCT	2	6	1363817	1363822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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