MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amycolatopsis mediterranei RB

Total Repeats: 9847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022116	ACGGC	2	10	125	134	20 %	0 %	40 %	40 %	532456682
2	NC_022116	GCGCG	2	10	186	195	0 %	0 %	60 %	40 %	532456682
3	NC_022116	AACAA	2	10	2271	2280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022116	CCTCC	2	10	2583	2592	0 %	20 %	0 %	80 %	532456683
5	NC_022116	CGAAG	2	10	7441	7450	40 %	0 %	40 %	20 %	532456687
6	NC_022116	CCGCG	2	10	7567	7576	0 %	0 %	40 %	60 %	532456687
7	NC_022116	CACGG	2	10	11251	11260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022116	GAACG	2	10	11313	11322	40 %	0 %	40 %	20 %	532456689
9	NC_022116	GCAGC	2	10	11456	11465	20 %	0 %	40 %	40 %	532456689
10	NC_022116	CGGCG	2	10	17341	17350	0 %	0 %	60 %	40 %	532456692
11	NC_022116	CGGCG	2	10	17852	17861	0 %	0 %	60 %	40 %	532456693
12	NC_022116	TGCGG	2	10	18890	18899	0 %	20 %	60 %	20 %	532456695
13	NC_022116	CGGCG	2	10	19425	19434	0 %	0 %	60 %	40 %	532456696
14	NC_022116	GCAGC	2	10	20914	20923	20 %	0 %	40 %	40 %	532456699
15	NC_022116	CAGCC	2	10	21189	21198	20 %	0 %	20 %	60 %	532456699
16	NC_022116	ATCCC	2	10	22001	22010	20 %	20 %	0 %	60 %	532456700
17	NC_022116	CGACG	2	10	28376	28385	20 %	0 %	40 %	40 %	532456702
18	NC_022116	TGTCG	2	10	29408	29417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022116	CGCGG	2	10	30722	30731	0 %	0 %	60 %	40 %	532456706
20	NC_022116	GGCCA	2	10	31654	31663	20 %	0 %	40 %	40 %	532456705
21	NC_022116	CGGCG	2	10	32444	32453	0 %	0 %	60 %	40 %	532456705
22	NC_022116	TCGGC	2	10	33254	33263	0 %	20 %	40 %	40 %	532456705
23	NC_022116	GAAAG	2	10	34368	34377	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022116	CGGCG	2	10	35076	35085	0 %	0 %	60 %	40 %	532456708
25	NC_022116	CGGGG	2	10	39040	39049	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022116	CCGGC	2	10	40686	40695	0 %	0 %	40 %	60 %	532456714
27	NC_022116	CGTGG	2	10	41978	41987	0 %	20 %	60 %	20 %	532456715
28	NC_022116	CCAGG	2	10	42390	42399	20 %	0 %	40 %	40 %	532456717
29	NC_022116	CCTCT	2	10	43376	43385	0 %	40 %	0 %	60 %	532456718
30	NC_022116	GTTTC	2	10	45238	45247	0 %	60 %	20 %	20 %	532456721
31	NC_022116	GCGGT	2	10	45770	45779	0 %	20 %	60 %	20 %	532456722
32	NC_022116	ACCTA	2	10	49947	49956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022116	CGGTC	2	10	55757	55766	0 %	20 %	40 %	40 %	532456731
34	NC_022116	CCGTG	2	10	56051	56060	0 %	20 %	40 %	40 %	532456732
35	NC_022116	AGGCC	2	10	58624	58633	20 %	0 %	40 %	40 %	532456733
36	NC_022116	GGCTC	2	10	59709	59718	0 %	20 %	40 %	40 %	532456734
37	NC_022116	GCCGC	2	10	62573	62582	0 %	0 %	40 %	60 %	532456737
38	NC_022116	TCGAC	2	10	63337	63346	20 %	20 %	20 %	40 %	532456738
39	NC_022116	CCGCG	2	10	64217	64226	0 %	0 %	40 %	60 %	532456739
40	NC_022116	ACCGC	2	10	65278	65287	20 %	0 %	20 %	60 %	532456740
41	NC_022116	CTCGC	2	10	65475	65484	0 %	20 %	20 %	60 %	532456740
42	NC_022116	CGACC	2	10	66395	66404	20 %	0 %	20 %	60 %	532456740
43	NC_022116	TCGGT	2	10	67642	67651	0 %	40 %	40 %	20 %	532456740
44	NC_022116	CCCGG	2	10	67802	67811	0 %	0 %	40 %	60 %	532456740
45	NC_022116	GGTCG	2	10	68196	68205	0 %	20 %	60 %	20 %	532456741
46	NC_022116	CCGTC	2	10	70064	70073	0 %	20 %	20 %	60 %	532456744
47	NC_022116	CGGCC	2	10	71059	71068	0 %	0 %	40 %	60 %	532456743
48	NC_022116	CCGTT	2	10	71432	71441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_022116	CCCGG	2	10	72401	72410	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_022116	CCGGA	2	10	72707	72716	20 %	0 %	40 %	40 %	532456746
51	NC_022116	CCTGA	2	10	79360	79369	20 %	20 %	20 %	40 %	532456753
52	NC_022116	CTTCG	2	10	81715	81724	0 %	40 %	20 %	40 %	532456754
53	NC_022116	GGCCG	2	10	83677	83686	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022116	GGTCG	2	10	85010	85019	0 %	20 %	60 %	20 %	532456758
55	NC_022116	GGCCG	2	10	85091	85100	0 %	0 %	60 %	40 %	532456758
56	NC_022116	GCCGG	2	10	85800	85809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022116	ACGCC	2	10	85976	85985	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_022116	GCTGG	2	10	86200	86209	0 %	20 %	60 %	20 %	532456759
59	NC_022116	GCCGG	2	10	86971	86980	0 %	0 %	60 %	40 %	532456760
60	NC_022116	GCACC	2	10	87333	87342	20 %	0 %	20 %	60 %	532456760
61	NC_022116	GGCGA	2	10	87373	87382	20 %	0 %	60 %	20 %	532456760
62	NC_022116	GCCCG	2	10	92777	92786	0 %	0 %	40 %	60 %	532456765
63	NC_022116	CGCGC	2	10	93113	93122	0 %	0 %	40 %	60 %	532456765
64	NC_022116	CGGAC	2	10	93455	93464	20 %	0 %	40 %	40 %	532456766
65	NC_022116	CGGCG	2	10	93504	93513	0 %	0 %	60 %	40 %	532456766
66	NC_022116	GGGGA	2	10	94552	94561	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022116	GCGCG	2	10	95306	95315	0 %	0 %	60 %	40 %	532456768
68	NC_022116	TCGCG	2	10	96022	96031	0 %	20 %	40 %	40 %	532456769
69	NC_022116	GGCCG	2	10	97651	97660	0 %	0 %	60 %	40 %	532456770
70	NC_022116	GACGT	2	10	98053	98062	20 %	20 %	40 %	20 %	532456770
71	NC_022116	AGCGC	2	10	98982	98991	20 %	0 %	40 %	40 %	532456771
72	NC_022116	GCCGC	2	10	100972	100981	0 %	0 %	40 %	60 %	532456774
73	NC_022116	CTGGC	2	10	102140	102149	0 %	20 %	40 %	40 %	532456775
74	NC_022116	TCCGC	2	10	105586	105595	0 %	20 %	20 %	60 %	532456779
75	NC_022116	TCGGC	2	10	106013	106022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_022116	GCGCC	2	10	106879	106888	0 %	0 %	40 %	60 %	532456780
77	NC_022116	TCCGG	2	10	108088	108097	0 %	20 %	40 %	40 %	532456781
78	NC_022116	TTCGG	2	10	108506	108515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022116	CCGGG	2	10	110065	110074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022116	CCGGA	2	10	110679	110688	20 %	0 %	40 %	40 %	532456784
81	NC_022116	TTGAA	2	10	111616	111625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022116	CGTCC	2	10	111635	111644	0 %	20 %	20 %	60 %	532456786
83	NC_022116	CGGCC	2	10	113129	113138	0 %	0 %	40 %	60 %	532456786
84	NC_022116	GGTGT	2	10	113925	113934	0 %	40 %	60 %	0 %	532456785
85	NC_022116	CGAGT	2	10	114128	114137	20 %	20 %	40 %	20 %	532456785
86	NC_022116	CCCTG	2	10	115211	115220	0 %	20 %	20 %	60 %	532456787
87	NC_022116	CACGC	2	10	115336	115345	20 %	0 %	20 %	60 %	532456787
88	NC_022116	GCACC	2	10	115553	115562	20 %	0 %	20 %	60 %	532456787
89	NC_022116	CCAGC	2	10	116044	116053	20 %	0 %	20 %	60 %	532456788
90	NC_022116	CGCGG	2	10	116708	116717	0 %	0 %	60 %	40 %	532456789
91	NC_022116	GCGCG	2	10	118310	118319	0 %	0 %	60 %	40 %	532456790
92	NC_022116	TGCTC	2	10	121535	121544	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_022116	GCGCG	2	10	123444	123453	0 %	0 %	60 %	40 %	532456795
94	NC_022116	CCGGA	2	10	123604	123613	20 %	0 %	40 %	40 %	532456796
95	NC_022116	GCCGC	2	10	124492	124501	0 %	0 %	40 %	60 %	532456796
96	NC_022116	GCCGT	2	10	124663	124672	0 %	20 %	40 %	40 %	532456796
97	NC_022116	TCGCC	2	10	124848	124857	0 %	20 %	20 %	60 %	532456796
98	NC_022116	GATCG	2	10	124858	124867	20 %	20 %	40 %	20 %	532456796
99	NC_022116	CGAGG	2	10	125014	125023	20 %	0 %	60 %	20 %	532456796
100	NC_022116	GGCCG	2	10	126426	126435	0 %	0 %	60 %	40 %	532456797
101	NC_022116	CGCTG	2	10	127157	127166	0 %	20 %	40 %	40 %	532456798
102	NC_022116	CCGGG	2	10	129085	129094	0 %	0 %	60 %	40 %	532456799
103	NC_022116	GCCGA	2	10	129939	129948	20 %	0 %	40 %	40 %	532456799
104	NC_022116	CCGGT	2	10	130224	130233	0 %	20 %	40 %	40 %	532456799
105	NC_022116	GCCGG	2	10	131236	131245	0 %	0 %	60 %	40 %	532456800
106	NC_022116	TCCGC	2	10	131612	131621	0 %	20 %	20 %	60 %	532456800
107	NC_022116	GGACA	2	10	131850	131859	40 %	0 %	40 %	20 %	532456800
108	NC_022116	CGGGT	2	10	132811	132820	0 %	20 %	60 %	20 %	532456801
109	NC_022116	GGCGG	2	10	133014	133023	0 %	0 %	80 %	20 %	532456801
110	NC_022116	GTCGA	2	10	133215	133224	20 %	20 %	40 %	20 %	532456801
111	NC_022116	CTCGG	2	10	134596	134605	0 %	20 %	40 %	40 %	532456802
112	NC_022116	GCCGG	2	10	138191	138200	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_022116	CGGGG	2	10	138545	138554	0 %	0 %	80 %	20 %	532456807
114	NC_022116	GCGGA	2	10	138855	138864	20 %	0 %	60 %	20 %	532456807
115	NC_022116	GGCCG	2	10	139109	139118	0 %	0 %	60 %	40 %	532456807
116	NC_022116	TCGGG	2	10	139126	139135	0 %	20 %	60 %	20 %	532456807
117	NC_022116	CGGCA	2	10	140588	140597	20 %	0 %	40 %	40 %	532456809
118	NC_022116	CCGGG	2	10	140745	140754	0 %	0 %	60 %	40 %	532456809
119	NC_022116	CGCAC	2	10	143155	143164	20 %	0 %	20 %	60 %	532456811
120	NC_022116	GCCGA	2	10	143523	143532	20 %	0 %	40 %	40 %	532456811
121	NC_022116	CGACG	2	10	144546	144555	20 %	0 %	40 %	40 %	532456812
122	NC_022116	CGGCT	2	10	147008	147017	0 %	20 %	40 %	40 %	532456815
123	NC_022116	GCCGC	2	10	149150	149159	0 %	0 %	40 %	60 %	532456818
124	NC_022116	CCCGC	2	10	149564	149573	0 %	0 %	20 %	80 %	532456818
125	NC_022116	CGACG	2	10	150759	150768	20 %	0 %	40 %	40 %	532456819
126	NC_022116	CTCGG	2	10	151585	151594	0 %	20 %	40 %	40 %	532456819
127	NC_022116	CGGCT	3	15	154788	154802	0 %	20 %	40 %	40 %	532456822
128	NC_022116	GCCAG	2	10	156525	156534	20 %	0 %	40 %	40 %	532456824
129	NC_022116	GCCCG	2	10	156912	156921	0 %	0 %	40 %	60 %	532456825
130	NC_022116	GCCGG	2	10	158483	158492	0 %	0 %	60 %	40 %	532456827
131	NC_022116	ATCGA	2	10	159278	159287	40 %	20 %	20 %	20 %	532456827
132	NC_022116	GCCGG	2	10	159334	159343	0 %	0 %	60 %	40 %	532456827
133	NC_022116	CCGCG	2	10	160296	160305	0 %	0 %	40 %	60 %	532456830
134	NC_022116	GCGCC	2	10	162142	162151	0 %	0 %	40 %	60 %	532456831
135	NC_022116	CGGCG	2	10	162490	162499	0 %	0 %	60 %	40 %	532456831
136	NC_022116	TGCCG	2	10	163821	163830	0 %	20 %	40 %	40 %	532456834
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146	NC_022116	GTCGA	2	10	173076	173085	20 %	20 %	40 %	20 %	532456842
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237	NC_022116	GCCCG	2	10	274674	274683	0 %	0 %	40 %	60 %	532456938
238	NC_022116	CCGGA	2	10	276950	276959	20 %	0 %	40 %	40 %	532456938
239	NC_022116	GTCGA	2	10	281457	281466	20 %	20 %	40 %	20 %	532456942
240	NC_022116	TGCCG	2	10	281750	281759	0 %	20 %	40 %	40 %	532456942
241	NC_022116	CTGAC	2	10	284406	284415	20 %	20 %	20 %	40 %	532456946
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243	NC_022116	TGGAG	2	10	292032	292041	20 %	20 %	60 %	0 %	532456952
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247	NC_022116	GCCGC	2	10	299137	299146	0 %	0 %	40 %	60 %	532456957
248	NC_022116	GCCGC	2	10	302024	302033	0 %	0 %	40 %	60 %	532456961
249	NC_022116	AGGCA	2	10	302269	302278	40 %	0 %	40 %	20 %	532456961
250	NC_022116	CAGCG	2	10	302815	302824	20 %	0 %	40 %	40 %	532456962
251	NC_022116	CCGGG	2	10	303911	303920	0 %	0 %	60 %	40 %	532456963
252	NC_022116	CAAAC	2	10	305934	305943	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
253	NC_022116	CGACG	2	10	306598	306607	20 %	0 %	40 %	40 %	532456968
254	NC_022116	AGCGA	2	10	308368	308377	40 %	0 %	40 %	20 %	532456970
255	NC_022116	CCGCG	2	10	308908	308917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
256	NC_022116	ACCGG	2	10	310846	310855	20 %	0 %	40 %	40 %	532456974
257	NC_022116	GCGAC	2	10	311783	311792	20 %	0 %	40 %	40 %	532456973
258	NC_022116	GCTCG	2	10	313441	313450	0 %	20 %	40 %	40 %	532456975
259	NC_022116	GAAGA	2	10	314351	314360	60 %	0 %	40 %	0 %	532456977
260	NC_022116	CGGCG	2	10	315773	315782	0 %	0 %	60 %	40 %	532456979
261	NC_022116	GCACG	2	10	317652	317661	20 %	0 %	40 %	40 %	532456982
262	NC_022116	GCGCG	2	10	320732	320741	0 %	0 %	60 %	40 %	532456984
263	NC_022116	TCGCC	2	10	324388	324397	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_022116	CCGGC	2	10	324726	324735	0 %	0 %	40 %	60 %	532456988
265	NC_022116	GCCGA	2	10	325686	325695	20 %	0 %	40 %	40 %	532456990
266	NC_022116	ACCGC	2	10	325702	325711	20 %	0 %	20 %	60 %	532456990
267	NC_022116	CCGGT	2	10	329633	329642	0 %	20 %	40 %	40 %	532456993
268	NC_022116	AGACG	2	10	331391	331400	40 %	0 %	40 %	20 %	532456995
269	NC_022116	GACCG	2	10	331443	331452	20 %	0 %	40 %	40 %	532456995
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271	NC_022116	CCGCC	2	10	333301	333310	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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277	NC_022116	CAGGT	2	10	337512	337521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_022116	GTCCG	2	10	341517	341526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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303	NC_022116	CCCGG	2	10	360487	360496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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343	NC_022116	GCCGG	2	10	399387	399396	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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381	NC_022116	GGCCG	2	10	446547	446556	0 %	0 %	60 %	40 %	532457112
382	NC_022116	GACCC	2	10	447789	447798	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
383	NC_022116	GGGCG	2	10	447945	447954	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
384	NC_022116	TCGGT	2	10	448293	448302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
385	NC_022116	GCGCC	2	10	448761	448770	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
386	NC_022116	GGGCG	2	10	452037	452046	0 %	0 %	80 %	20 %	532457118
387	NC_022116	TCGGC	2	10	455294	455303	0 %	20 %	40 %	40 %	532457123
388	NC_022116	GTGCG	2	10	456419	456428	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
389	NC_022116	CGGCC	2	10	460063	460072	0 %	0 %	40 %	60 %	532457128
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391	NC_022116	GGTGC	2	10	460515	460524	0 %	20 %	60 %	20 %	532457129
392	NC_022116	CCGGC	2	10	460674	460683	0 %	0 %	40 %	60 %	532457129
393	NC_022116	CGAGC	2	10	460762	460771	20 %	0 %	40 %	40 %	532457129
394	NC_022116	GTTGC	2	10	461368	461377	0 %	40 %	40 %	20 %	532457130
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399	NC_022116	GGCGT	2	10	466910	466919	0 %	20 %	60 %	20 %	532457136
400	NC_022116	GCCCG	2	10	470053	470062	0 %	0 %	40 %	60 %	532457139
401	NC_022116	CGGTG	2	10	470800	470809	0 %	20 %	60 %	20 %	532457140
402	NC_022116	ACCCG	2	10	472614	472623	20 %	0 %	20 %	60 %	532457141
403	NC_022116	GCCGG	2	10	472949	472958	0 %	0 %	60 %	40 %	532457142
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407	NC_022116	CGCCC	2	10	474901	474910	0 %	0 %	20 %	80 %	532457143
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415	NC_022116	GCGCC	2	10	485955	485964	0 %	0 %	40 %	60 %	532457154
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437	NC_022116	GCCCG	2	10	516586	516595	0 %	0 %	40 %	60 %	532457187
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476	NC_022116	CCGGG	2	10	565855	565864	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
477	NC_022116	GCTGC	2	10	566560	566569	0 %	20 %	40 %	40 %	532457230
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