MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B

Total Repeats: 2125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021991	GCAGG	2	10	2627008	2627017	20 %	0 %	60 %	20 %	529232496
2002	NC_021991	AAAAG	2	10	2627071	2627080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021991	ACCGT	2	10	2627215	2627224	20 %	20 %	20 %	40 %	529232497
2004	NC_021991	AATGT	2	10	2627769	2627778	40 %	40 %	20 %	0 %	529232497
2005	NC_021991	GAACA	2	10	2627814	2627823	60 %	0 %	20 %	20 %	529232497
2006	NC_021991	CCAGC	2	10	2628675	2628684	20 %	0 %	20 %	60 %	529232498
2007	NC_021991	CCTTC	2	10	2629002	2629011	0 %	40 %	0 %	60 %	529232498
2008	NC_021991	GAAAA	2	10	2630077	2630086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_021991	GGTAA	2	10	2632050	2632059	40 %	20 %	40 %	0 %	529232500
2010	NC_021991	GCGCC	2	10	2632403	2632412	0 %	0 %	40 %	60 %	529232500
2011	NC_021991	AATGG	2	10	2633284	2633293	40 %	20 %	40 %	0 %	529232500
2012	NC_021991	CAGCG	2	10	2634013	2634022	20 %	0 %	40 %	40 %	529232501
2013	NC_021991	TGATC	2	10	2636709	2636718	20 %	40 %	20 %	20 %	529232505
2014	NC_021991	TGCGG	2	10	2638653	2638662	0 %	20 %	60 %	20 %	529247512
2015	NC_021991	GTGAA	2	10	2639222	2639231	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_021991	ATGGC	2	10	2640104	2640113	20 %	20 %	40 %	20 %	529247513
2017	NC_021991	CCCGC	2	10	2642814	2642823	0 %	0 %	20 %	80 %	529232514
2018	NC_021991	CACAT	2	10	2643985	2643994	40 %	20 %	0 %	40 %	529232515
2019	NC_021991	ACTGC	2	10	2647006	2647015	20 %	20 %	20 %	40 %	529232517
2020	NC_021991	GGGCA	2	10	2647648	2647657	20 %	0 %	60 %	20 %	529232518
2021	NC_021991	GCCCC	2	10	2647992	2648001	0 %	0 %	20 %	80 %	529232518
2022	NC_021991	AGGGC	2	10	2650212	2650221	20 %	0 %	60 %	20 %	529232520
2023	NC_021991	CGCTG	2	10	2653484	2653493	0 %	20 %	40 %	40 %	529232524
2024	NC_021991	TAAAG	2	10	2656590	2656599	60 %	20 %	20 %	0 %	529232528
2025	NC_021991	GCGGT	2	10	2659710	2659719	0 %	20 %	60 %	20 %	529232530
2026	NC_021991	CCGTT	2	10	2660296	2660305	0 %	40 %	20 %	40 %	529232530
2027	NC_021991	CATCA	2	10	2663410	2663419	40 %	20 %	0 %	40 %	529232532
2028	NC_021991	AACAG	2	10	2665423	2665432	60 %	0 %	20 %	20 %	529232535
2029	NC_021991	TTCTG	2	10	2666197	2666206	0 %	60 %	20 %	20 %	529232535
2030	NC_021991	GCACA	2	10	2667684	2667693	40 %	0 %	20 %	40 %	529232536
2031	NC_021991	GCAAC	2	10	2669295	2669304	40 %	0 %	20 %	40 %	529232538
2032	NC_021991	ACGGC	2	10	2669636	2669645	20 %	0 %	40 %	40 %	529232538
2033	NC_021991	CCGGG	2	10	2670268	2670277	0 %	0 %	60 %	40 %	529232539
2034	NC_021991	AGTTC	2	10	2671175	2671184	20 %	40 %	20 %	20 %	529232539
2035	NC_021991	AGGTG	2	10	2672108	2672117	20 %	20 %	60 %	0 %	529232539
2036	NC_021991	CCGTG	2	10	2673839	2673848	0 %	20 %	40 %	40 %	529232539
2037	NC_021991	ATCAA	2	10	2677208	2677217	60 %	20 %	0 %	20 %	529232543
2038	NC_021991	GCAGG	2	10	2677810	2677819	20 %	0 %	60 %	20 %	529232543
2039	NC_021991	GTACT	2	10	2678275	2678284	20 %	40 %	20 %	20 %	529232543
2040	NC_021991	TGGCC	2	10	2679597	2679606	0 %	20 %	40 %	40 %	529232545
2041	NC_021991	AACTG	2	10	2683343	2683352	40 %	20 %	20 %	20 %	529232550
2042	NC_021991	GAAAA	2	10	2686085	2686094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_021991	TCACA	2	10	2686345	2686354	40 %	20 %	0 %	40 %	529247515
2044	NC_021991	GCAGG	2	10	2686414	2686423	20 %	0 %	60 %	20 %	529247515
2045	NC_021991	CGTCT	2	10	2687513	2687522	0 %	40 %	20 %	40 %	529232554
2046	NC_021991	TGCGT	2	10	2687999	2688008	0 %	40 %	40 %	20 %	529232555
2047	NC_021991	CACGG	2	10	2688870	2688879	20 %	0 %	40 %	40 %	529232556
2048	NC_021991	GGGCA	2	10	2691646	2691655	20 %	0 %	60 %	20 %	529232560
2049	NC_021991	TGCCT	2	10	2693909	2693918	0 %	40 %	20 %	40 %	529232562
2050	NC_021991	GGCCG	2	10	2694232	2694241	0 %	0 %	60 %	40 %	529232562
2051	NC_021991	TGGCG	2	10	2695153	2695162	0 %	20 %	60 %	20 %	529232563
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2053	NC_021991	CCCGG	2	10	2696801	2696810	0 %	0 %	40 %	60 %	529232564
2054	NC_021991	CGGCA	2	10	2697163	2697172	20 %	0 %	40 %	40 %	529232564
2055	NC_021991	CCACC	2	10	2697855	2697864	20 %	0 %	0 %	80 %	529232564
2056	NC_021991	TTTCA	2	10	2699954	2699963	20 %	60 %	0 %	20 %	529232565
2057	NC_021991	TTTGT	2	10	2700247	2700256	0 %	80 %	20 %	0 %	529232567
2058	NC_021991	CTTGG	2	10	2700563	2700572	0 %	40 %	40 %	20 %	529232567
2059	NC_021991	GGCAC	2	10	2701312	2701321	20 %	0 %	40 %	40 %	529232568
2060	NC_021991	ACATC	2	10	2704975	2704984	40 %	20 %	0 %	40 %	529232570
2061	NC_021991	AAAAT	2	10	2707986	2707995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_021991	TCTGT	2	10	2708041	2708050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2063	NC_021991	TAAAA	2	10	2708141	2708150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_021991	CGCAA	2	10	2714067	2714076	40 %	0 %	20 %	40 %	529232582
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2067	NC_021991	TTCCT	2	10	2717058	2717067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2068	NC_021991	TCGAT	2	10	2717571	2717580	20 %	40 %	20 %	20 %	529247516
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2081	NC_021991	AACAG	2	10	2740116	2740125	60 %	0 %	20 %	20 %	529232607
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2107	NC_021991	GTTTT	2	10	2781425	2781434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_021991	TCTTT	2	10	2785526	2785535	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2122	NC_021991	GCGCT	2	10	2812946	2812955	0 %	20 %	40 %	40 %	529232684
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2125	NC_021991	GGACA	2	10	2815347	2815356	40 %	0 %	40 %	20 %	529232686

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.