MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021879	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	526461593
2	NC_021879	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	526461593
3	NC_021879	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	526461593
4	NC_021879	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	526461594
5	NC_021879	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	526461594
6	NC_021879	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	526461595
7	NC_021879	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	526461595
8	NC_021879	TCGTA	2	10	6909	6918	20 %	40 %	20 %	20 %	526462222
9	NC_021879	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021879	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021879	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021879	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021879	GAGTT	2	10	13569	13578	20 %	40 %	40 %	0 %	526461601
14	NC_021879	TGCGA	2	10	14759	14768	20 %	20 %	40 %	20 %	526461601
15	NC_021879	TTGTA	2	10	16249	16258	20 %	60 %	20 %	0 %	526461602
16	NC_021879	AAAGC	2	10	18840	18849	60 %	0 %	20 %	20 %	526461605
17	NC_021879	CTTCT	2	10	20220	20229	0 %	60 %	0 %	40 %	526461606
18	NC_021879	TGTAA	2	10	20354	20363	40 %	40 %	20 %	0 %	526461606
19	NC_021879	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021879	ACAAT	2	10	21549	21558	60 %	20 %	0 %	20 %	526461607
21	NC_021879	TTCTT	2	10	22300	22309	0 %	80 %	0 %	20 %	526461608
22	NC_021879	TTATT	2	10	23332	23341	20 %	80 %	0 %	0 %	526461609
23	NC_021879	TGATG	2	10	25621	25630	20 %	40 %	40 %	0 %	526461611
24	NC_021879	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021879	GCAAC	2	10	32550	32559	40 %	0 %	20 %	40 %	526461612
26	NC_021879	AAATA	2	10	34291	34300	80 %	20 %	0 %	0 %	526461614
27	NC_021879	AACTC	2	10	35527	35536	40 %	20 %	0 %	40 %	526461615
28	NC_021879	GTTTT	2	10	35557	35566	0 %	80 %	20 %	0 %	526461615
29	NC_021879	CTGAC	2	10	35643	35652	20 %	20 %	20 %	40 %	526461615
30	NC_021879	TAGGT	2	10	37043	37052	20 %	40 %	40 %	0 %	526461617
31	NC_021879	CTGTT	2	10	39389	39398	0 %	60 %	20 %	20 %	526461619
32	NC_021879	AAAGC	2	10	42138	42147	60 %	0 %	20 %	20 %	526462231
33	NC_021879	TTTCC	2	10	42698	42707	0 %	60 %	0 %	40 %	526462231
34	NC_021879	AATAC	2	10	42904	42913	60 %	20 %	0 %	20 %	526462231
35	NC_021879	CTTCA	2	10	43747	43756	20 %	40 %	0 %	40 %	526462231
36	NC_021879	CTTTT	2	10	44687	44696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021879	GCTTG	2	10	45406	45415	0 %	40 %	40 %	20 %	526461620
38	NC_021879	TAGGA	2	10	46805	46814	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021879	AAGTG	2	10	47898	47907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021879	TATGA	2	10	48372	48381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021879	TTGCA	2	10	53520	53529	20 %	40 %	20 %	20 %	526462233
42	NC_021879	TTCTA	2	10	55429	55438	20 %	60 %	0 %	20 %	526462233
43	NC_021879	AAATT	2	10	56213	56222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021879	ATCAA	2	10	56886	56895	60 %	20 %	0 %	20 %	526462234
45	NC_021879	ATGGC	2	10	57143	57152	20 %	20 %	40 %	20 %	526462234
46	NC_021879	TACTA	2	10	57236	57245	40 %	40 %	0 %	20 %	526462234
47	NC_021879	ATTAG	2	10	59129	59138	40 %	40 %	20 %	0 %	526462234
48	NC_021879	AACCC	2	10	62589	62598	40 %	0 %	0 %	60 %	526461626
49	NC_021879	CATAC	2	10	63522	63531	40 %	20 %	0 %	40 %	526461626
50	NC_021879	TTCCT	2	10	68894	68903	0 %	60 %	0 %	40 %	526461630
51	NC_021879	GGCGC	2	10	70189	70198	0 %	0 %	60 %	40 %	526461633
52	NC_021879	ACTTC	2	10	72176	72185	20 %	40 %	0 %	40 %	526461635
53	NC_021879	CAGCT	2	10	73154	73163	20 %	20 %	20 %	40 %	526461635
54	NC_021879	GCTGC	2	10	73371	73380	0 %	20 %	40 %	40 %	526461635
55	NC_021879	GGAAA	2	10	73452	73461	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021879	CTACA	2	10	73969	73978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021879	TTTAG	2	10	75174	75183	20 %	60 %	20 %	0 %	526462239
58	NC_021879	TTGTA	2	10	77451	77460	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021879	AGGAA	2	10	78705	78714	60 %	0 %	40 %	0 %	526462240
60	NC_021879	GCAAG	2	10	78916	78925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021879	GGGTA	2	10	79572	79581	20 %	20 %	60 %	0 %	526461639
62	NC_021879	GGCAG	2	10	80395	80404	20 %	0 %	60 %	20 %	526461639
63	NC_021879	CCCTA	2	10	80880	80889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_021879	GAAGC	2	10	81136	81145	40 %	0 %	40 %	20 %	526461640
65	NC_021879	TCATT	2	10	82071	82080	20 %	60 %	0 %	20 %	526461640
66	NC_021879	ATCTT	2	10	83807	83816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021879	ACATA	2	10	85837	85846	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021879	CCGTA	2	10	86468	86477	20 %	20 %	20 %	40 %	526461646
69	NC_021879	TTTTG	2	10	87341	87350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021879	TCTCG	2	10	87643	87652	0 %	40 %	20 %	40 %	526461647
71	NC_021879	AACGC	2	10	88913	88922	40 %	0 %	20 %	40 %	526462243
72	NC_021879	CCGTA	2	10	91415	91424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021879	AGATT	2	10	92568	92577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021879	ATTTT	2	10	92873	92882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021879	TGGTA	2	10	93418	93427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021879	TTCTA	2	10	93932	93941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021879	GTACT	2	10	94423	94432	20 %	40 %	20 %	20 %	526461648
78	NC_021879	CTTCG	2	10	96813	96822	0 %	40 %	20 %	40 %	526461650
79	NC_021879	AATAA	2	10	97402	97411	80 %	20 %	0 %	0 %	526462244
80	NC_021879	GATGC	2	10	98880	98889	20 %	20 %	40 %	20 %	526461652
81	NC_021879	GAGAG	2	10	99716	99725	40 %	0 %	60 %	0 %	526461654
82	NC_021879	AAATA	2	10	102688	102697	80 %	20 %	0 %	0 %	526461656
83	NC_021879	GAGGC	2	10	103094	103103	20 %	0 %	60 %	20 %	526461657
84	NC_021879	AGTAT	2	10	104876	104885	40 %	40 %	20 %	0 %	526461658
85	NC_021879	CAGAT	2	10	107318	107327	40 %	20 %	20 %	20 %	526461659
86	NC_021879	TGTCA	2	10	107670	107679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021879	TTTAG	2	10	107966	107975	20 %	60 %	20 %	0 %	526462248
88	NC_021879	TTTTC	2	10	108359	108368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021879	GTATT	2	10	109307	109316	20 %	60 %	20 %	0 %	526461660
90	NC_021879	ATGGA	2	10	109493	109502	40 %	20 %	40 %	0 %	526461660
91	NC_021879	GGTGC	2	10	111323	111332	0 %	20 %	60 %	20 %	526461661
92	NC_021879	TTGTT	2	10	112196	112205	0 %	80 %	20 %	0 %	526461661
93	NC_021879	TTTTG	2	10	114729	114738	0 %	80 %	20 %	0 %	526461663
94	NC_021879	TGTGT	2	10	117597	117606	0 %	60 %	40 %	0 %	526462253
95	NC_021879	ATTGC	2	10	119063	119072	20 %	40 %	20 %	20 %	526462254
96	NC_021879	GTAGG	2	10	121176	121185	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021879	TGTTT	2	10	121402	121411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021879	ATTGC	2	10	121840	121849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021879	CAATC	2	10	122676	122685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021879	GTCTA	2	10	123199	123208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021879	ATAGT	2	10	126745	126754	40 %	40 %	20 %	0 %	526462258
102	NC_021879	CTCAA	2	10	126882	126891	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021879	TTGCG	2	10	128425	128434	0 %	40 %	40 %	20 %	526461668
104	NC_021879	CCTAC	2	10	130308	130317	20 %	20 %	0 %	60 %	526461669
105	NC_021879	TACTG	2	10	134830	134839	20 %	40 %	20 %	20 %	526461672
106	NC_021879	CTCAT	2	10	137594	137603	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021879	CACAG	2	10	137764	137773	40 %	0 %	20 %	40 %	526462263
108	NC_021879	GTATG	2	10	139417	139426	20 %	40 %	40 %	0 %	526461675
109	NC_021879	TCTTT	2	10	139766	139775	0 %	80 %	0 %	20 %	526461675
110	NC_021879	GTTGT	2	10	140301	140310	0 %	60 %	40 %	0 %	526461675
111	NC_021879	ACTAC	2	10	142115	142124	40 %	20 %	0 %	40 %	526461676
112	NC_021879	ATGAG	2	10	145623	145632	40 %	20 %	40 %	0 %	526462266
113	NC_021879	AGCCA	2	10	145808	145817	40 %	0 %	20 %	40 %	526462266
114	NC_021879	ATTCT	2	10	150002	150011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021879	GCATT	2	10	153011	153020	20 %	40 %	20 %	20 %	526461681
116	NC_021879	TTGCT	2	10	155066	155075	0 %	60 %	20 %	20 %	526461684
117	NC_021879	TTAGG	2	10	156839	156848	20 %	40 %	40 %	0 %	526461686
118	NC_021879	TTGCT	2	10	157205	157214	0 %	60 %	20 %	20 %	526462271
119	NC_021879	GCATT	2	10	157950	157959	20 %	40 %	20 %	20 %	526461687
120	NC_021879	TTGTT	2	10	159628	159637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021879	AGTTA	2	10	159787	159796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021879	TGAAG	2	10	161529	161538	40 %	20 %	40 %	0 %	526461688
123	NC_021879	GTTAT	2	10	162567	162576	20 %	60 %	20 %	0 %	526462272
124	NC_021879	TGAAG	2	10	164307	164316	40 %	20 %	40 %	0 %	526461690
125	NC_021879	ATGTT	2	10	166162	166171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021879	AGTGT	2	10	167243	167252	20 %	40 %	40 %	0 %	526461693
127	NC_021879	GTTGC	2	10	167701	167710	0 %	40 %	40 %	20 %	526462273
128	NC_021879	AAGAT	2	10	168740	168749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021879	TAGAA	2	10	172200	172209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021879	ATTGT	2	10	172609	172618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021879	GAACA	2	10	179914	179923	60 %	0 %	20 %	20 %	526461701
132	NC_021879	AACAA	2	10	182406	182415	80 %	0 %	0 %	20 %	526461703
133	NC_021879	GCAGA	2	10	182478	182487	40 %	0 %	40 %	20 %	526461703
134	NC_021879	GCAAA	2	10	182531	182540	60 %	0 %	20 %	20 %	526461703
135	NC_021879	ATAGC	2	10	187251	187260	40 %	20 %	20 %	20 %	526462278
136	NC_021879	TGTTT	2	10	191513	191522	0 %	80 %	20 %	0 %	526461707
137	NC_021879	TGCAA	2	10	191665	191674	40 %	20 %	20 %	20 %	526461707
138	NC_021879	GAGGT	2	10	192294	192303	20 %	20 %	60 %	0 %	526461708
139	NC_021879	GGTAC	2	10	192705	192714	20 %	20 %	40 %	20 %	526461708
140	NC_021879	TGAGG	2	10	195225	195234	20 %	20 %	60 %	0 %	526461709
141	NC_021879	ACAAA	2	10	196920	196929	80 %	0 %	0 %	20 %	526461710
142	NC_021879	TTCTG	2	10	197542	197551	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021879	CCTTA	2	10	203166	203175	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021879	AATGA	2	10	204241	204250	60 %	20 %	20 %	0 %	526461715
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148	NC_021879	AAGCA	2	10	208814	208823	60 %	0 %	20 %	20 %	526461717
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150	NC_021879	ATCCC	2	10	211283	211292	20 %	20 %	0 %	60 %	526461718
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152	NC_021879	GGGTG	2	10	212129	212138	0 %	20 %	80 %	0 %	526461718
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158	NC_021879	TTGCG	2	10	220766	220775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_021879	TGTGA	2	10	220894	220903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021879	GCGTT	2	10	223738	223747	0 %	40 %	40 %	20 %	526461723
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172	NC_021879	TAGCT	2	10	243932	243941	20 %	40 %	20 %	20 %	526461733
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239	NC_021879	TGTGT	2	10	344069	344078	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021879	ACTGA	2	10	344877	344886	40 %	20 %	20 %	20 %	526462332
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244	NC_021879	TAGAA	2	10	349885	349894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
245	NC_021879	TTGAA	2	10	351117	351126	40 %	40 %	20 %	0 %	526461811
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249	NC_021879	ATAGT	2	10	364256	364265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021879	GTGCA	2	10	365958	365967	20 %	20 %	40 %	20 %	526461817
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252	NC_021879	AGAGG	2	10	371329	371338	40 %	0 %	60 %	0 %	526462340
253	NC_021879	AAGGT	2	10	371955	371964	40 %	20 %	40 %	0 %	526462340
254	NC_021879	TTTTG	2	10	372101	372110	0 %	80 %	20 %	0 %	526462340
255	NC_021879	GCTAC	2	10	375126	375135	20 %	20 %	20 %	40 %	526462341
256	NC_021879	GAAGC	2	10	375344	375353	40 %	0 %	40 %	20 %	526462341
257	NC_021879	TGGTA	2	10	378633	378642	20 %	40 %	40 %	0 %	526462342
258	NC_021879	ATGCA	2	10	380624	380633	40 %	20 %	20 %	20 %	526462342
259	NC_021879	GAGAT	2	10	380846	380855	40 %	20 %	40 %	0 %	526462342
260	NC_021879	CGCAG	2	10	390147	390156	20 %	0 %	40 %	40 %	526462342
261	NC_021879	TATAG	2	10	390864	390873	40 %	40 %	20 %	0 %	526461819
262	NC_021879	AAGAA	2	10	393518	393527	80 %	0 %	20 %	0 %	526461821
263	NC_021879	GCACC	2	10	395503	395512	20 %	0 %	20 %	60 %	526461822
264	NC_021879	CAAAA	2	10	398436	398445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_021879	ATATG	2	10	398873	398882	40 %	40 %	20 %	0 %	526462346
266	NC_021879	CTGCA	2	10	399985	399994	20 %	20 %	20 %	40 %	526462346
267	NC_021879	TCAGG	2	10	407458	407467	20 %	20 %	40 %	20 %	526461823
268	NC_021879	CTATG	2	10	407838	407847	20 %	40 %	20 %	20 %	526461823
269	NC_021879	GCATT	2	10	410301	410310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_021879	AATTT	2	10	412604	412613	40 %	60 %	0 %	0 %	526461825
271	NC_021879	GTAGT	2	10	415093	415102	20 %	40 %	40 %	0 %	526461827
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389	NC_021879	CCTAT	2	10	621138	621147	20 %	40 %	0 %	40 %	526462439
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392	NC_021879	AGTTT	2	10	624055	624064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_021879	ATTCT	2	10	636653	636662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
401	NC_021879	CGCTT	2	10	636973	636982	0 %	40 %	20 %	40 %	526462448
402	NC_021879	GTTTT	2	10	638120	638129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
403	NC_021879	ACCTA	2	10	638382	638391	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
404	NC_021879	ACTGT	2	10	639241	639250	20 %	40 %	20 %	20 %	526461916
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