MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 20316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021879	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021879	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021879	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021879	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021879	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
6	NC_021879	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
7	NC_021879	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
8	NC_021879	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
9	NC_021879	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
10	NC_021879	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
11	NC_021879	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
12	NC_021879	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
13	NC_021879	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
14	NC_021879	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461593
15	NC_021879	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
16	NC_021879	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
17	NC_021879	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
18	NC_021879	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
19	NC_021879	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
20	NC_021879	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
21	NC_021879	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
22	NC_021879	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526461593
23	NC_021879	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461593
24	NC_021879	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
25	NC_021879	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
26	NC_021879	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461593
27	NC_021879	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
28	NC_021879	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
29	NC_021879	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
30	NC_021879	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
31	NC_021879	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461593
32	NC_021879	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
33	NC_021879	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461593
34	NC_021879	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
35	NC_021879	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
36	NC_021879	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461593
37	NC_021879	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461593
38	NC_021879	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
39	NC_021879	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461593
40	NC_021879	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
41	NC_021879	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461593
42	NC_021879	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461593
43	NC_021879	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461594
44	NC_021879	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461594
45	NC_021879	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461594
46	NC_021879	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461594
47	NC_021879	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461594
48	NC_021879	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461594
49	NC_021879	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461594
50	NC_021879	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461594
51	NC_021879	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461594
52	NC_021879	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461594
53	NC_021879	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461594
54	NC_021879	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461594
55	NC_021879	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461594
56	NC_021879	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461595
57	NC_021879	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461595
58	NC_021879	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526461595
59	NC_021879	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461595
60	NC_021879	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461595
61	NC_021879	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461595
62	NC_021879	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461595
63	NC_021879	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461596
64	NC_021879	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461596
65	NC_021879	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461596
66	NC_021879	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461596
67	NC_021879	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461596
68	NC_021879	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461596
69	NC_021879	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021879	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021879	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021879	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462221
73	NC_021879	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462221
74	NC_021879	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
75	NC_021879	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
76	NC_021879	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462221
77	NC_021879	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462221
78	NC_021879	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021879	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021879	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021879	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021879	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021879	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021879	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021879	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462222
86	NC_021879	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462222
87	NC_021879	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462222
88	NC_021879	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462222
89	NC_021879	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462222
90	NC_021879	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462222
91	NC_021879	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462222
92	NC_021879	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462222
93	NC_021879	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462222
94	NC_021879	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462222
95	NC_021879	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462222
96	NC_021879	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462222
97	NC_021879	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021879	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461597
99	NC_021879	GAA	3	9	7214	7222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461597
100	NC_021879	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461597
101	NC_021879	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461597
102	NC_021879	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461597
103	NC_021879	TGC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461597
104	NC_021879	TAG	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461597
105	NC_021879	GCG	2	6	7539	7544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526461597
106	NC_021879	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461597
107	NC_021879	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021879	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021879	TAC	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461598
110	NC_021879	CCG	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526461598
111	NC_021879	CCT	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526461598
112	NC_021879	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461598
113	NC_021879	GAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461598
114	NC_021879	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461598
115	NC_021879	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461598
116	NC_021879	TGC	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461598
117	NC_021879	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461598
118	NC_021879	ACT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461598
119	NC_021879	TCC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526461598
120	NC_021879	CTA	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461598
121	NC_021879	AGT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461598
122	NC_021879	ATC	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461598
123	NC_021879	TAA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461598
124	NC_021879	TGT	2	6	9046	9051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461598
125	NC_021879	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021879	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021879	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021879	ATA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021879	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021879	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461599
131	NC_021879	TGT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461599
132	NC_021879	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461599
133	NC_021879	TAG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461599
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149	NC_021879	ATA	2	6	10790	10795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021879	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021879	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021879	CTG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021879	GCA	2	6	11087	11092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021879	TAT	2	6	11095	11100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021879	AGC	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_021879	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021879	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021879	ACT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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210	NC_021879	GAA	2	6	15427	15432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_021879	ACG	2	6	16881	16886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461603
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229	NC_021879	TCT	2	6	17259	17264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461603
230	NC_021879	TTC	2	6	17318	17323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461603
231	NC_021879	AAT	2	6	17360	17365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461603
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233	NC_021879	ATC	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_021879	CTA	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462224
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237	NC_021879	TAG	2	6	17776	17781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462224
238	NC_021879	GGC	2	6	17832	17837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462224
239	NC_021879	GTG	2	6	18001	18006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462224
240	NC_021879	GCT	2	6	18152	18157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461604
241	NC_021879	AAG	2	6	18186	18191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461604
242	NC_021879	AGA	2	6	18211	18216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461604
243	NC_021879	TAG	2	6	18282	18287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461604
244	NC_021879	AGC	2	6	18337	18342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461604
245	NC_021879	AAT	2	6	18430	18435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461604
246	NC_021879	AGG	2	6	18486	18491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461604
247	NC_021879	GAG	2	6	18514	18519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461604
248	NC_021879	ATG	2	6	18599	18604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461604
249	NC_021879	TAA	2	6	18613	18618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461605
250	NC_021879	AAC	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
251	NC_021879	CAA	2	6	18735	18740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
252	NC_021879	AAG	2	6	18747	18752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
253	NC_021879	AGA	2	6	18806	18811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
254	NC_021879	AGA	2	6	18926	18931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461605
255	NC_021879	GTC	2	6	18938	18943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461605
256	NC_021879	TAA	2	6	18989	18994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461605
257	NC_021879	AAT	2	6	19078	19083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461605
258	NC_021879	ACA	3	9	19236	19244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
259	NC_021879	CAA	2	6	19254	19259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461605
260	NC_021879	TTG	2	6	19273	19278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461605
261	NC_021879	TGA	2	6	19351	19356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461605
262	NC_021879	ACT	2	6	19388	19393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461605
263	NC_021879	ATG	2	6	19403	19408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461605
264	NC_021879	GTT	2	6	19414	19419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461605
265	NC_021879	ATA	2	6	19441	19446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461605
266	NC_021879	CTT	2	6	19532	19537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461606
267	NC_021879	TAT	2	6	19582	19587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461606
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271	NC_021879	CAA	2	6	19887	19892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461606
272	NC_021879	GTG	2	6	19991	19996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461606
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275	NC_021879	TGC	2	6	20323	20328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461606
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277	NC_021879	TGG	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461606
278	NC_021879	AAT	2	6	20649	20654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_021879	ACA	2	6	20735	20740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021879	GAA	2	6	20960	20965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461607
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289	NC_021879	GTA	2	6	21441	21446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461607
290	NC_021879	ATA	2	6	21473	21478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461607
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382	NC_021879	CTA	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462228
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