MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 31043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021879	TTTC	2	8	1475219	1475226	0 %	75 %	0 %	25 %	526462220
31002	NC_021879	A	6	6	1475300	1475305	100 %	0 %	0 %	0 %	526462220
31003	NC_021879	CAA	2	6	1475330	1475335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462220
31004	NC_021879	ATGTA	2	10	1475381	1475390	40 %	40 %	20 %	0 %	526462220
31005	NC_021879	T	8	8	1475436	1475443	0 %	100 %	0 %	0 %	526462220
31006	NC_021879	TGT	2	6	1475482	1475487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462220
31007	NC_021879	TTG	2	6	1475506	1475511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462220
31008	NC_021879	TGCA	2	8	1475523	1475530	25 %	25 %	25 %	25 %	526462220
31009	NC_021879	T	7	7	1475782	1475788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_021879	CAAG	2	8	1475901	1475908	50 %	0 %	25 %	25 %	526462838
31011	NC_021879	AT	3	6	1475928	1475933	50 %	50 %	0 %	0 %	526462838
31012	NC_021879	GC	3	6	1475944	1475949	0 %	0 %	50 %	50 %	526462838
31013	NC_021879	ATA	2	6	1475978	1475983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_021879	CTG	2	6	1476004	1476009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31015	NC_021879	ATT	2	6	1476022	1476027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_021879	ATA	2	6	1476062	1476067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_021879	ACT	2	6	1476191	1476196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31018	NC_021879	AAGT	2	8	1476239	1476246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_021879	ATC	2	6	1476275	1476280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31020	NC_021879	ACT	2	6	1476293	1476298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_021879	TGT	2	6	1476354	1476359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_021879	CAG	2	6	1476370	1476375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31023	NC_021879	ATA	2	6	1476406	1476411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_021879	CAT	2	6	1476474	1476479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31025	NC_021879	ACA	2	6	1476497	1476502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31026	NC_021879	A	7	7	1476603	1476609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31027	NC_021879	ATA	2	6	1476706	1476711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_021879	GCA	2	6	1476712	1476717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31029	NC_021879	A	6	6	1476740	1476745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31030	NC_021879	CAC	2	6	1476754	1476759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31031	NC_021879	AAT	2	6	1476874	1476879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_021879	TAA	2	6	1476965	1476970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_021879	GT	3	6	1477018	1477023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31034	NC_021879	GT	5	10	1477026	1477035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31035	NC_021879	A	6	6	1477091	1477096	100 %	0 %	0 %	0 %	526462839
31036	NC_021879	CCA	2	6	1477161	1477166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526462839
31037	NC_021879	TTGCC	2	10	1477289	1477298	0 %	40 %	20 %	40 %	526462839
31038	NC_021879	GAAC	2	8	1477353	1477360	50 %	0 %	25 %	25 %	526462839
31039	NC_021879	TGA	2	6	1477388	1477393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462839
31040	NC_021879	GC	3	6	1477403	1477408	0 %	0 %	50 %	50 %	526462839
31041	NC_021879	TGC	2	6	1477506	1477511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462839
31042	NC_021879	AACT	3	12	1477521	1477532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31043	NC_021879	TTA	3	9	1477558	1477566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.