MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 239523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17003	NC_021252	ACG	2	6	634773	634778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929169
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17005	NC_021252	TCAAGA	2	12	634794	634805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	506929169
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17011	NC_021252	CGA	2	6	635000	635005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929170
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17103	NC_021252	CGGC	2	8	638744	638751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17118	NC_021252	TGG	2	6	639368	639373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929175
17119	NC_021252	AAG	2	6	639433	639438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929175
17120	NC_021252	CCGC	2	8	639542	639549	0 %	0 %	25 %	75 %	506929175
17121	NC_021252	GCC	2	6	639577	639582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929175
17122	NC_021252	GAGGCC	2	12	639583	639594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	506929175
17123	NC_021252	CGA	2	6	639618	639623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929175
17124	NC_021252	TGGC	2	8	639645	639652	0 %	25 %	50 %	25 %	506929175
17125	NC_021252	CGC	2	6	639663	639668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929175
17126	NC_021252	TGG	2	6	639881	639886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929175
17127	NC_021252	CGT	2	6	639929	639934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929175
17128	NC_021252	GAA	2	6	639954	639959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929175
17129	NC_021252	ACG	2	6	639973	639978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929175
17130	NC_021252	CCCGCA	2	12	640007	640018	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	506929175
17131	NC_021252	CCT	2	6	640020	640025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929175
17132	NC_021252	CGG	2	6	640082	640087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17133	NC_021252	GCC	2	6	640089	640094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17134	NC_021252	CGT	2	6	640132	640137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929176
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17138	NC_021252	CGT	2	6	640244	640249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17139	NC_021252	CG	4	8	640292	640299	0 %	0 %	50 %	50 %	506929176
17140	NC_021252	ACG	2	6	640324	640329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17141	NC_021252	CGA	2	6	640343	640348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929176
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17143	NC_021252	CGA	2	6	640394	640399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17144	NC_021252	GAT	2	6	640430	640435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929176
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17147	NC_021252	GGTCG	2	10	640490	640499	0 %	20 %	60 %	20 %	506929176
17148	NC_021252	TCG	2	6	640504	640509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17149	NC_021252	CGG	2	6	640514	640519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929176
17150	NC_021252	CGT	2	6	640532	640537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17151	NC_021252	GCT	2	6	640562	640567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929176
17152	NC_021252	CCG	2	6	640590	640595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929176
17153	NC_021252	GCGG	2	8	640631	640638	0 %	0 %	75 %	25 %	506929176
17154	NC_021252	GGC	2	6	640652	640657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929176
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17157	NC_021252	GGGCG	2	10	641060	641069	0 %	0 %	80 %	20 %	506929177
17158	NC_021252	TGT	2	6	641167	641172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506929177
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17160	NC_021252	GGCG	2	8	641372	641379	0 %	0 %	75 %	25 %	506929177
17161	NC_021252	TGGT	2	8	641445	641452	0 %	50 %	50 %	0 %	506929177
17162	NC_021252	GCC	4	12	641462	641473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929177
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17167	NC_021252	GCG	2	6	641647	641652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929177
17168	NC_021252	CGG	2	6	641666	641671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929177
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17171	NC_021252	TGC	3	9	641727	641735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929177
17172	NC_021252	CTG	2	6	641765	641770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929177
17173	NC_021252	CTG	2	6	641774	641779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929177
17174	NC_021252	CTC	2	6	641795	641800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506929177
17175	NC_021252	TCA	2	6	641874	641879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929177
17176	NC_021252	GCT	2	6	641881	641886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929177
17177	NC_021252	CGCCA	2	10	641888	641897	20 %	0 %	20 %	60 %	506929177
17178	NC_021252	ATG	2	6	641900	641905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17179	NC_021252	CCG	2	6	641929	641934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17180	NC_021252	TCT	2	6	642033	642038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17181	NC_021252	GGGC	2	8	642075	642082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17182	NC_021252	AGG	2	6	642092	642097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17183	NC_021252	ACG	2	6	642112	642117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17184	NC_021252	CGT	3	9	642120	642128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17185	NC_021252	TCG	2	6	642167	642172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17186	NC_021252	AG	3	6	642208	642213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17187	NC_021252	AGG	2	6	642239	642244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929178
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17192	NC_021252	TCG	2	6	642464	642469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929178
17193	NC_021252	CGC	2	6	642486	642491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929178
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17197	NC_021252	GCC	2	6	642661	642666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929178
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17199	NC_021252	GGA	2	6	642717	642722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929178
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17201	NC_021252	AGC	2	6	642747	642752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929178
17202	NC_021252	CCG	2	6	642761	642766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929178
17203	NC_021252	ACCCCC	2	12	642777	642788	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
17204	NC_021252	AG	3	6	642807	642812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17205	NC_021252	CCA	2	6	642818	642823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929179
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17224	NC_021252	GCC	2	6	643165	643170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929179
17225	NC_021252	GCA	2	6	643239	643244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17226	NC_021252	GGGC	2	8	643254	643261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17227	NC_021252	GCCC	2	8	643274	643281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17228	NC_021252	GCG	2	6	643407	643412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17229	NC_021252	GGGGC	2	10	643468	643477	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17230	NC_021252	GGC	2	6	643539	643544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17231	NC_021252	AGAAA	2	10	643578	643587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17232	NC_021252	CGA	2	6	643695	643700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17233	NC_021252	GGT	2	6	643736	643741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506929180
17234	NC_021252	GTCC	2	8	643834	643841	0 %	25 %	25 %	50 %	506929180
17235	NC_021252	TCT	2	6	643858	643863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929180
17236	NC_021252	GAT	2	6	643871	643876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506929180
17237	NC_021252	GC	3	6	643993	643998	0 %	0 %	50 %	50 %	506929180
17238	NC_021252	GAA	2	6	644054	644059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929180
17239	NC_021252	CCG	2	6	644075	644080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929180
17240	NC_021252	AAG	2	6	644127	644132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929180
17241	NC_021252	CGG	2	6	644150	644155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929180
17242	NC_021252	ATC	2	6	644205	644210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929180
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17272	NC_021252	GCA	2	6	645175	645180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929181
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17349	NC_021252	GGGCA	2	10	648186	648195	20 %	0 %	60 %	20 %	506929184
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17356	NC_021252	CTG	2	6	648387	648392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929184
17357	NC_021252	CCA	2	6	648412	648417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929184
17358	NC_021252	GACAAG	2	12	648426	648437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	506929184
17359	NC_021252	CAC	2	6	648476	648481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929184
17360	NC_021252	CA	3	6	648492	648497	50 %	0 %	0 %	50 %	506929184
17361	NC_021252	GCA	2	6	648527	648532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929184
17362	NC_021252	CTCG	2	8	648584	648591	0 %	25 %	25 %	50 %	506929184
17363	NC_021252	GAC	2	6	648605	648610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929184
17364	NC_021252	CGC	2	6	648656	648661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929184
17365	NC_021252	GAA	2	6	648677	648682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506929184
17366	NC_021252	TCG	2	6	648703	648708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929184
17367	NC_021252	CCG	2	6	648757	648762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929184
17368	NC_021252	CTT	2	6	648782	648787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929184
17369	NC_021252	GCT	2	6	648851	648856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929184
17370	NC_021252	CCGATC	2	12	648908	648919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	506929185
17371	NC_021252	TGC	3	9	648939	648947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17372	NC_021252	CGC	2	6	648958	648963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929185
17373	NC_021252	CGG	3	9	648991	648999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929185
17374	NC_021252	ACC	2	6	649001	649006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929185
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17376	NC_021252	ACG	2	6	649050	649055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17377	NC_021252	TCAAGG	2	12	649128	649139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	506929185
17378	NC_021252	CTGG	2	8	649144	649151	0 %	25 %	50 %	25 %	506929185
17379	NC_021252	GCG	2	6	649166	649171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929185
17380	NC_021252	ATCAAG	2	12	649172	649183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	506929185
17381	NC_021252	CGA	2	6	649248	649253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17382	NC_021252	CGA	2	6	649321	649326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17383	NC_021252	ACG	2	6	649334	649339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17384	NC_021252	TCA	2	6	649362	649367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929185
17385	NC_021252	GC	3	6	649404	649409	0 %	0 %	50 %	50 %	506929185
17386	NC_021252	TCG	2	6	649503	649508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17387	NC_021252	GCT	2	6	649531	649536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17388	NC_021252	CAA	2	6	649546	649551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506929185
17389	NC_021252	GCT	2	6	649552	649557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
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17391	NC_021252	GCT	2	6	649594	649599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17392	NC_021252	CGA	2	6	649642	649647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17393	NC_021252	ACG	2	6	649650	649655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929185
17394	NC_021252	TGC	2	6	649701	649706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929185
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17398	NC_021252	GTC	2	6	649930	649935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929186
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17400	NC_021252	ATC	2	6	650146	650151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506929186
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17415	NC_021252	TCG	2	6	650788	650793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929186
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17417	NC_021252	GCC	2	6	650835	650840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929186
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17430	NC_021252	GCT	3	9	651494	651502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929187
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17442	NC_021252	CGT	2	6	652064	652069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929187
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17455	NC_021252	TCG	2	6	652572	652577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929188
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17457	NC_021252	CCGA	2	8	652706	652713	25 %	0 %	25 %	50 %	506929188
17458	NC_021252	GTC	2	6	652727	652732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929188
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17462	NC_021252	GCT	2	6	652843	652848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929188
17463	NC_021252	GGGC	2	8	652855	652862	0 %	0 %	75 %	25 %	506929188
17464	NC_021252	CAA	2	6	652921	652926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506929188
17465	NC_021252	CT	3	6	652928	652933	0 %	50 %	0 %	50 %	506929188
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17472	NC_021252	CG	3	6	653267	653272	0 %	0 %	50 %	50 %	506929188
17473	NC_021252	GAC	2	6	653279	653284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929188
17474	NC_021252	GCCGA	2	10	653294	653303	20 %	0 %	40 %	40 %	506929188
17475	NC_021252	GCCG	2	8	653393	653400	0 %	0 %	50 %	50 %	506929188
17476	NC_021252	GC	3	6	653425	653430	0 %	0 %	50 %	50 %	506929188
17477	NC_021252	GCT	2	6	653491	653496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929188
17478	NC_021252	TTC	2	6	653549	653554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929189
17479	NC_021252	GCG	3	9	653580	653588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506929189
17480	NC_021252	GCC	2	6	653598	653603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929189
17481	NC_021252	CGC	2	6	653609	653614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929189
17482	NC_021252	GAC	2	6	653652	653657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17483	NC_021252	GC	3	6	653670	653675	0 %	0 %	50 %	50 %	506929189
17484	NC_021252	GGCG	2	8	653696	653703	0 %	0 %	75 %	25 %	506929189
17485	NC_021252	CGA	2	6	653747	653752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17486	NC_021252	TTC	2	6	653754	653759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506929189
17487	NC_021252	CGA	2	6	653780	653785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17488	NC_021252	CAG	2	6	653796	653801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17489	NC_021252	ACC	2	6	653862	653867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506929189
17490	NC_021252	CGA	2	6	653894	653899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17491	NC_021252	CGC	2	6	653924	653929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506929189
17492	NC_021252	TCG	2	6	654046	654051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506929189
17493	NC_021252	C	6	6	654096	654101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17494	NC_021252	GCA	2	6	654121	654126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17495	NC_021252	CCG	2	6	654129	654134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17496	NC_021252	GCC	2	6	654139	654144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17497	NC_021252	GGCC	2	8	654152	654159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17498	NC_021252	CTT	2	6	654190	654195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17499	NC_021252	GAGGTC	2	12	654216	654227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	506929190
17500	NC_021252	GAG	2	6	654228	654233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506929190

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