MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azotobacter vinelandii CA

Total Repeats: 4246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021149	TCCGC	2	10	350	359	0 %	20 %	20 %	60 %	482892565
2	NC_021149	AGTTC	2	10	4788	4797	20 %	40 %	20 %	20 %	482893086
3	NC_021149	TCCGC	2	10	6773	6782	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_021149	GGTCA	2	10	7372	7381	20 %	20 %	40 %	20 %	482897530
5	NC_021149	GTCTG	2	10	9000	9009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021149	GCCAG	2	10	9738	9747	20 %	0 %	40 %	40 %	482893643
7	NC_021149	TGGCG	2	10	10512	10521	0 %	20 %	60 %	20 %	482892960
8	NC_021149	CCCAG	2	10	13046	13055	20 %	0 %	20 %	60 %	482892959
9	NC_021149	CGCCC	2	10	14782	14791	0 %	0 %	20 %	80 %	482895785
10	NC_021149	CTGGC	2	10	17787	17796	0 %	20 %	40 %	40 %	482894070
11	NC_021149	GCGCC	3	15	19389	19403	0 %	0 %	40 %	60 %	482893075
12	NC_021149	GGCGC	2	10	21731	21740	0 %	0 %	60 %	40 %	482893466
13	NC_021149	CTGGC	2	10	21774	21783	0 %	20 %	40 %	40 %	482893466
14	NC_021149	GCCGC	2	10	22524	22533	0 %	0 %	40 %	60 %	482893466
15	NC_021149	CGGGG	2	10	22767	22776	0 %	0 %	80 %	20 %	482894160
16	NC_021149	AGGCG	2	10	23331	23340	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021149	ATCGA	2	10	24696	24705	40 %	20 %	20 %	20 %	482892629
18	NC_021149	TTTCC	2	10	27735	27744	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021149	CGGCC	3	15	27897	27911	0 %	0 %	40 %	60 %	482893889
20	NC_021149	GCCGC	2	10	29664	29673	0 %	0 %	40 %	60 %	482893890
21	NC_021149	TAAAA	2	10	35270	35279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021149	TGACA	2	10	35803	35812	40 %	20 %	20 %	20 %	482897522
23	NC_021149	CTTGC	2	10	36487	36496	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021149	CGCGC	2	10	38358	38367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_021149	TCGGC	2	10	38808	38817	0 %	20 %	40 %	40 %	482893182
26	NC_021149	GCGCT	2	10	39056	39065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_021149	GCGCG	2	10	40105	40114	0 %	0 %	60 %	40 %	482895780
28	NC_021149	GAAAA	2	10	43157	43166	80 %	0 %	20 %	0 %	482895778
29	NC_021149	GCCCG	2	10	47011	47020	0 %	0 %	40 %	60 %	482895776
30	NC_021149	GCCTG	2	10	47932	47941	0 %	20 %	40 %	40 %	482895774
31	NC_021149	GCGAT	2	10	53410	53419	20 %	20 %	40 %	20 %	482893238
32	NC_021149	GCCGC	2	10	53779	53788	0 %	0 %	40 %	60 %	482893228
33	NC_021149	ACAGC	2	10	53844	53853	40 %	0 %	20 %	40 %	482893228
34	NC_021149	TCGGC	2	10	56490	56499	0 %	20 %	40 %	40 %	482897516
35	NC_021149	GTACG	2	10	57299	57308	20 %	20 %	40 %	20 %	482895773
36	NC_021149	GGCAA	2	10	58343	58352	40 %	0 %	40 %	20 %	482895771
37	NC_021149	CGCGC	2	10	61256	61265	0 %	0 %	40 %	60 %	482897514
38	NC_021149	GCCGC	2	10	61531	61540	0 %	0 %	40 %	60 %	482897513
39	NC_021149	GGCCG	2	10	62200	62209	0 %	0 %	60 %	40 %	482897513
40	NC_021149	CAGGC	2	10	62585	62594	20 %	0 %	40 %	40 %	482897513
41	NC_021149	GCGAG	2	10	66188	66197	20 %	0 %	60 %	20 %	482892971
42	NC_021149	GCCCT	2	10	69181	69190	0 %	20 %	20 %	60 %	482892740
43	NC_021149	CCTCG	2	10	71060	71069	0 %	20 %	20 %	60 %	482895768
44	NC_021149	CGGAG	2	10	71257	71266	20 %	0 %	60 %	20 %	482895768
45	NC_021149	TCGCC	2	10	72356	72365	0 %	20 %	20 %	60 %	482897508
46	NC_021149	GCCGA	2	10	73165	73174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021149	CTTCT	2	10	74029	74038	0 %	60 %	0 %	40 %	482897507
48	NC_021149	TCGGG	2	10	76892	76901	0 %	20 %	60 %	20 %	482897505
49	NC_021149	TGGAA	2	10	77565	77574	40 %	20 %	40 %	0 %	482897504
50	NC_021149	GCCGG	2	10	78544	78553	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021149	AGGCA	2	10	79255	79264	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021149	GCCGA	2	10	82605	82614	20 %	0 %	40 %	40 %	482897499
53	NC_021149	CCGAG	2	10	82804	82813	20 %	0 %	40 %	40 %	482897499
54	NC_021149	CTTGT	2	10	84793	84802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021149	CGGCC	2	10	85096	85105	0 %	0 %	40 %	60 %	482897497
56	NC_021149	GCCGG	2	10	88931	88940	0 %	0 %	60 %	40 %	482897496
57	NC_021149	CCGAT	2	10	90563	90572	20 %	20 %	20 %	40 %	482893605
58	NC_021149	TGGCC	2	10	90588	90597	0 %	20 %	40 %	40 %	482893605
59	NC_021149	TCCGA	2	10	92289	92298	20 %	20 %	20 %	40 %	482893603
60	NC_021149	CGGCG	2	10	93445	93454	0 %	0 %	60 %	40 %	482893604
61	NC_021149	GCTTC	2	10	93853	93862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021149	CGCCT	2	10	96116	96125	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_021149	GCCGG	2	10	99289	99298	0 %	0 %	60 %	40 %	482897492
64	NC_021149	TGTCC	2	10	99983	99992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021149	GGCCG	2	10	103023	103032	0 %	0 %	60 %	40 %	482893420
66	NC_021149	TCGAG	2	10	104468	104477	20 %	20 %	40 %	20 %	482895759
67	NC_021149	GGGCA	2	10	104518	104527	20 %	0 %	60 %	20 %	482895759
68	NC_021149	GGCGA	2	10	105259	105268	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021149	GCCGA	2	10	106315	106324	20 %	0 %	40 %	40 %	482897489
70	NC_021149	GGCGC	2	10	112813	112822	0 %	0 %	60 %	40 %	482895755
71	NC_021149	CCGGG	2	10	113254	113263	0 %	0 %	60 %	40 %	482895755
72	NC_021149	GGGCA	2	10	115287	115296	20 %	0 %	60 %	20 %	482895754
73	NC_021149	CGGCG	2	10	117474	117483	0 %	0 %	60 %	40 %	482897484
74	NC_021149	TGGTC	2	10	120506	120515	0 %	40 %	40 %	20 %	482897483
75	NC_021149	GGCCG	2	10	121071	121080	0 %	0 %	60 %	40 %	482893969
76	NC_021149	GCCAC	2	10	122237	122246	20 %	0 %	20 %	60 %	482893257
77	NC_021149	CGCAG	2	10	124469	124478	20 %	0 %	40 %	40 %	482897481
78	NC_021149	TCAGC	2	10	126250	126259	20 %	20 %	20 %	40 %	482897479
79	NC_021149	GGCCC	2	10	126883	126892	0 %	0 %	40 %	60 %	482897479
80	NC_021149	GCCGC	2	10	127604	127613	0 %	0 %	40 %	60 %	482897478
81	NC_021149	CCAGG	2	10	127946	127955	20 %	0 %	40 %	40 %	482897478
82	NC_021149	CGTTC	2	10	129023	129032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021149	CAGCC	2	10	130547	130556	20 %	0 %	20 %	60 %	482895791
84	NC_021149	GAAAA	2	10	134760	134769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021149	CGAGC	2	10	136261	136270	20 %	0 %	40 %	40 %	482897474
86	NC_021149	TGCGT	2	10	138497	138506	0 %	40 %	40 %	20 %	482893839
87	NC_021149	CTGGA	2	10	140300	140309	20 %	20 %	40 %	20 %	482893843
88	NC_021149	GCGCC	2	10	142486	142495	0 %	0 %	40 %	60 %	482893750
89	NC_021149	GTGCT	2	10	145243	145252	0 %	40 %	40 %	20 %	482892954
90	NC_021149	CCCGA	2	10	146113	146122	20 %	0 %	20 %	60 %	482893853
91	NC_021149	GGCAC	2	10	147345	147354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_021149	CCGCA	2	10	147572	147581	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_021149	ATCGC	2	10	147914	147923	20 %	20 %	20 %	40 %	482893517
94	NC_021149	GCGCT	2	10	148164	148173	0 %	20 %	40 %	40 %	482895742
95	NC_021149	GCCGG	2	10	149692	149701	0 %	0 %	60 %	40 %	482895740
96	NC_021149	TCTGC	2	10	149771	149780	0 %	40 %	20 %	40 %	482895739
97	NC_021149	CTGGC	2	10	151425	151434	0 %	20 %	40 %	40 %	482897472
98	NC_021149	ATGCA	2	10	151891	151900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021149	CTGCG	2	10	152188	152197	0 %	20 %	40 %	40 %	482895738
100	NC_021149	TGCGC	2	10	153535	153544	0 %	20 %	40 %	40 %	482893850
101	NC_021149	GGGCG	2	10	156275	156284	0 %	0 %	80 %	20 %	482893851
102	NC_021149	TGAGC	2	10	158499	158508	20 %	20 %	40 %	20 %	482893852
103	NC_021149	CCTCG	2	10	158744	158753	0 %	20 %	20 %	60 %	482893855
104	NC_021149	TTTTC	2	10	162032	162041	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021149	CCCGC	2	10	163385	163394	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
106	NC_021149	TGGAG	2	10	164583	164592	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021149	CGAGG	2	10	165370	165379	20 %	0 %	60 %	20 %	482897469
108	NC_021149	GAGCC	2	10	167052	167061	20 %	0 %	40 %	40 %	482897467
109	NC_021149	CCAGG	2	10	168970	168979	20 %	0 %	40 %	40 %	482897466
110	NC_021149	GCGCT	2	10	170391	170400	0 %	20 %	40 %	40 %	482897465
111	NC_021149	GGCGG	2	10	172094	172103	0 %	0 %	80 %	20 %	482897465
112	NC_021149	CGCTG	2	10	173762	173771	0 %	20 %	40 %	40 %	482897462
113	NC_021149	GGCAG	2	10	177157	177166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021149	TCGTG	2	10	178484	178493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021149	GCAAG	2	10	179158	179167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021149	ACCGA	2	10	180210	180219	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021149	AGTCG	2	10	180585	180594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021149	GAGAT	2	10	182252	182261	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021149	ATCCC	2	10	182574	182583	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_021149	AGCGA	2	10	183745	183754	40 %	0 %	40 %	20 %	482895735
121	NC_021149	GGCGA	2	10	185078	185087	20 %	0 %	60 %	20 %	482895734
122	NC_021149	TGGTT	2	10	185697	185706	0 %	60 %	40 %	0 %	482895734
123	NC_021149	GGGCC	2	10	190170	190179	0 %	0 %	60 %	40 %	482897458
124	NC_021149	GCATC	2	10	190919	190928	20 %	20 %	20 %	40 %	482897457
125	NC_021149	GCCTG	2	10	191475	191484	0 %	20 %	40 %	40 %	482895731
126	NC_021149	TCGTT	2	10	191663	191672	0 %	60 %	20 %	20 %	482897456
127	NC_021149	CGTCG	2	10	191761	191770	0 %	20 %	40 %	40 %	482897456
128	NC_021149	GTGCC	2	10	192591	192600	0 %	20 %	40 %	40 %	482897455
129	NC_021149	TGCTG	2	10	193042	193051	0 %	40 %	40 %	20 %	482897455
130	NC_021149	GCTCG	2	10	193883	193892	0 %	20 %	40 %	40 %	482893467
131	NC_021149	CGGCG	2	10	195720	195729	0 %	0 %	60 %	40 %	482892554
132	NC_021149	TGGCC	2	10	196274	196283	0 %	20 %	40 %	40 %	482892711
133	NC_021149	GGCCA	2	10	196959	196968	20 %	0 %	40 %	40 %	482892711
134	NC_021149	CGGCG	2	10	198936	198945	0 %	0 %	60 %	40 %	482897454
135	NC_021149	GGCGC	2	10	200120	200129	0 %	0 %	60 %	40 %	482892568
136	NC_021149	CCGCG	2	10	201443	201452	0 %	0 %	40 %	60 %	482892743
137	NC_021149	CGCTG	2	10	201803	201812	0 %	20 %	40 %	40 %	482892743
138	NC_021149	GCGCG	2	10	203532	203541	0 %	0 %	60 %	40 %	482897453
139	NC_021149	GGGCC	2	10	204050	204059	0 %	0 %	60 %	40 %	482897453
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147	NC_021149	GCCTG	2	10	217293	217302	0 %	20 %	40 %	40 %	482897445
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149	NC_021149	ATGGC	2	10	218612	218621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_021149	CATGG	2	10	220216	220225	20 %	20 %	40 %	20 %	482897443
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240	NC_021149	CCGGG	2	10	323467	323476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
241	NC_021149	GCGGG	2	10	323494	323503	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
242	NC_021149	GCCGC	2	10	325189	325198	0 %	0 %	40 %	60 %	482897400
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260	NC_021149	TGGGC	2	10	343185	343194	0 %	20 %	60 %	20 %	482895693
261	NC_021149	CGGCG	2	10	343295	343304	0 %	0 %	60 %	40 %	482895693
262	NC_021149	GGCGC	2	10	343406	343415	0 %	0 %	60 %	40 %	482895693
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267	NC_021149	CTGTG	2	10	351935	351944	0 %	40 %	40 %	20 %	482895691
268	NC_021149	CGGAC	2	10	352146	352155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_021149	GCGCC	2	10	354120	354129	0 %	0 %	40 %	60 %	482895689
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387	NC_021149	CCCGG	2	10	508409	508418	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
388	NC_021149	CGTCG	2	10	508516	508525	0 %	20 %	40 %	40 %	482897326
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402	NC_021149	GGCCC	2	10	532374	532383	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
403	NC_021149	CGAAG	2	10	532400	532409	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_021149	GCTGG	2	10	535932	535941	0 %	20 %	60 %	20 %	482892759
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406	NC_021149	CGGTC	2	10	539225	539234	0 %	20 %	40 %	40 %	482892883
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441	NC_021149	CGCGG	2	10	577543	577552	0 %	0 %	60 %	40 %	482897298
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