MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 8026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021030	GAAA	2	8	279	286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021030	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021030	CGAC	2	8	828	835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021030	GTAG	2	8	1722	1729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021030	CCCT	2	8	2825	2832	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_021030	CGGT	2	8	2858	2865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021030	CGGT	2	8	3548	3555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021030	GCCG	2	8	4036	4043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021030	GGCG	2	8	4190	4197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021030	TCCG	2	8	4223	4230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021030	GTCG	2	8	4409	4416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021030	CGAG	2	8	4849	4856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021030	TCGC	2	8	5964	5971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021030	CGGC	2	8	7534	7541	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
15	NC_021030	GGGC	2	8	8550	8557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021030	GGTC	2	8	8765	8772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021030	TGGC	2	8	9010	9017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021030	GTCG	2	8	9111	9118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021030	TCCA	2	8	10123	10130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021030	CGTC	2	8	10513	10520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021030	GTCG	2	8	10593	10600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021030	ACGG	2	8	11160	11167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021030	GCAG	2	8	11183	11190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021030	CGGG	2	8	11368	11375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021030	CGCC	2	8	12425	12432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_021030	AGGT	2	8	12561	12568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021030	GGCG	2	8	12689	12696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021030	GCCT	2	8	13252	13259	0 %	25 %	25 %	50 %	479185173
29	NC_021030	CGAC	2	8	13769	13776	25 %	0 %	25 %	50 %	479185173
30	NC_021030	CGTC	2	8	15759	15766	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
31	NC_021030	ACCG	2	8	16605	16612	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
32	NC_021030	CCGG	2	8	16658	16665	0 %	0 %	50 %	50 %	479185174
33	NC_021030	GTCC	2	8	16784	16791	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
34	NC_021030	TTGG	2	8	16845	16852	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
35	NC_021030	GGCG	2	8	17040	17047	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
36	NC_021030	GCGG	2	8	17448	17455	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
37	NC_021030	TGGT	2	8	17458	17465	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
38	NC_021030	GACC	2	8	17727	17734	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
39	NC_021030	CCAG	2	8	18335	18342	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
40	NC_021030	TCCG	2	8	18351	18358	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
41	NC_021030	GCGT	2	8	18696	18703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021030	AGCC	2	8	18912	18919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021030	TCGG	2	8	20107	20114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021030	CGGT	2	8	20523	20530	0 %	25 %	50 %	25 %	479185175
45	NC_021030	CGAG	2	8	20824	20831	25 %	0 %	50 %	25 %	479185175
46	NC_021030	CGTT	2	8	21498	21505	0 %	50 %	25 %	25 %	479185175
47	NC_021030	GCCA	2	8	22038	22045	25 %	0 %	25 %	50 %	479185175
48	NC_021030	CGAC	2	8	22417	22424	25 %	0 %	25 %	50 %	479185175
49	NC_021030	TTCG	2	8	22467	22474	0 %	50 %	25 %	25 %	479185176
50	NC_021030	CTGG	2	8	22614	22621	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
51	NC_021030	CGGT	2	8	22679	22686	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
52	NC_021030	ACGA	2	8	23089	23096	50 %	0 %	25 %	25 %	479185176
53	NC_021030	CGCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	479185176
54	NC_021030	TGCA	2	8	24495	24502	25 %	25 %	25 %	25 %	479185177
55	NC_021030	GCCG	2	8	24515	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
56	NC_021030	CGGT	2	8	24915	24922	0 %	25 %	50 %	25 %	479185177
57	NC_021030	CAAT	2	8	27011	27018	50 %	25 %	0 %	25 %	479185178
58	NC_021030	CGGG	2	8	27029	27036	0 %	0 %	75 %	25 %	479185178
59	NC_021030	GCCG	2	8	29656	29663	0 %	0 %	50 %	50 %	479185179
60	NC_021030	GTCG	2	8	29983	29990	0 %	25 %	50 %	25 %	479185179
61	NC_021030	TGCT	2	8	30434	30441	0 %	50 %	25 %	25 %	479185179
62	NC_021030	CCCG	2	8	31099	31106	0 %	0 %	25 %	75 %	479185179
63	NC_021030	TCGA	2	8	31721	31728	25 %	25 %	25 %	25 %	479185179
64	NC_021030	GTTG	2	8	31797	31804	0 %	50 %	50 %	0 %	479185179
65	NC_021030	TTTG	2	8	32149	32156	0 %	75 %	25 %	0 %	479185180
66	NC_021030	GCGT	2	8	32731	32738	0 %	25 %	50 %	25 %	479185180
67	NC_021030	TACG	2	8	33579	33586	25 %	25 %	25 %	25 %	479185181
68	NC_021030	CCGG	2	8	33632	33639	0 %	0 %	50 %	50 %	479185181
69	NC_021030	GCGG	2	8	33830	33837	0 %	0 %	75 %	25 %	479185181
70	NC_021030	TGGC	2	8	34175	34182	0 %	25 %	50 %	25 %	479185181
71	NC_021030	GACG	2	8	34210	34217	25 %	0 %	50 %	25 %	479185181
72	NC_021030	CGGC	2	8	34498	34505	0 %	0 %	50 %	50 %	479185181
73	NC_021030	CGGA	2	8	34641	34648	25 %	0 %	50 %	25 %	479185181
74	NC_021030	CGGG	2	8	34819	34826	0 %	0 %	75 %	25 %	479185181
75	NC_021030	TCGG	2	8	35665	35672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021030	TCTG	2	8	36647	36654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021030	GATC	2	8	37167	37174	25 %	25 %	25 %	25 %	479185184
78	NC_021030	GCCT	2	8	37419	37426	0 %	25 %	25 %	50 %	479185184
79	NC_021030	ACGA	2	8	37628	37635	50 %	0 %	25 %	25 %	479185184
80	NC_021030	CTCG	2	8	37837	37844	0 %	25 %	25 %	50 %	479185184
81	NC_021030	CAGG	2	8	39126	39133	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
82	NC_021030	GCCG	2	8	39916	39923	0 %	0 %	50 %	50 %	479185185
83	NC_021030	GATT	2	8	40000	40007	25 %	50 %	25 %	0 %	479185185
84	NC_021030	CAGC	2	8	40041	40048	25 %	0 %	25 %	50 %	479185185
85	NC_021030	AGGC	2	8	40131	40138	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
86	NC_021030	GTCG	2	8	40288	40295	0 %	25 %	50 %	25 %	479185185
87	NC_021030	TCCG	2	8	40312	40319	0 %	25 %	25 %	50 %	479185185
88	NC_021030	TTCG	2	8	40365	40372	0 %	50 %	25 %	25 %	479185185
89	NC_021030	CGAC	2	8	40495	40502	25 %	0 %	25 %	50 %	479185185
90	NC_021030	CGAG	2	8	40744	40751	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
91	NC_021030	TTCG	2	8	41984	41991	0 %	50 %	25 %	25 %	479185186
92	NC_021030	GCAT	2	8	44052	44059	25 %	25 %	25 %	25 %	479185187
93	NC_021030	ATCG	2	8	44943	44950	25 %	25 %	25 %	25 %	479185187
94	NC_021030	ATCA	2	8	45309	45316	50 %	25 %	0 %	25 %	479185187
95	NC_021030	GTCG	2	8	45365	45372	0 %	25 %	50 %	25 %	479185187
96	NC_021030	TTGA	2	8	47106	47113	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188
97	NC_021030	TGAT	2	8	47656	47663	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188
98	NC_021030	CGAA	2	8	47829	47836	50 %	0 %	25 %	25 %	479185188
99	NC_021030	ATGT	2	8	48393	48400	25 %	50 %	25 %	0 %	479185189
100	NC_021030	AATA	2	8	48603	48610	75 %	25 %	0 %	0 %	479185189
101	NC_021030	CCGA	2	8	48690	48697	25 %	0 %	25 %	50 %	479185189
102	NC_021030	TTCG	2	8	49250	49257	0 %	50 %	25 %	25 %	479185189
103	NC_021030	CGTC	2	8	49312	49319	0 %	25 %	25 %	50 %	479185189
104	NC_021030	TCCG	2	8	50377	50384	0 %	25 %	25 %	50 %	479185190
105	NC_021030	ACCG	2	8	51029	51036	25 %	0 %	25 %	50 %	479185190
106	NC_021030	GAAT	2	8	51112	51119	50 %	25 %	25 %	0 %	479185190
107	NC_021030	TTCC	2	8	51994	52001	0 %	50 %	0 %	50 %	479185190
108	NC_021030	CAGG	2	8	52220	52227	25 %	0 %	50 %	25 %	479185190
109	NC_021030	TTCG	2	8	52231	52238	0 %	50 %	25 %	25 %	479185190
110	NC_021030	CGAT	2	8	52995	53002	25 %	25 %	25 %	25 %	479185190
111	NC_021030	CTCG	2	8	53137	53144	0 %	25 %	25 %	50 %	479185190
112	NC_021030	TCGT	2	8	53859	53866	0 %	50 %	25 %	25 %	479185191
113	NC_021030	GGCC	2	8	54430	54437	0 %	0 %	50 %	50 %	479185191
114	NC_021030	GGAA	2	8	54722	54729	50 %	0 %	50 %	0 %	479185191
115	NC_021030	ATTC	2	8	54800	54807	25 %	50 %	0 %	25 %	479185191
116	NC_021030	GGTT	2	8	55642	55649	0 %	50 %	50 %	0 %	479185191
117	NC_021030	TTTC	2	8	55991	55998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021030	GAAA	2	8	56577	56584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021030	TATG	2	8	57179	57186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021030	CTAT	2	8	57261	57268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021030	CGAC	2	8	57273	57280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021030	ATTT	2	8	57547	57554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021030	ACGG	2	8	58241	58248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021030	TCGG	2	8	58368	58375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021030	CGAG	2	8	58558	58565	25 %	0 %	50 %	25 %	479185192
126	NC_021030	TTGG	2	8	59626	59633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021030	CTTG	2	8	59641	59648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021030	GCTT	2	8	59964	59971	0 %	50 %	25 %	25 %	479185193
129	NC_021030	GACG	2	8	60199	60206	25 %	0 %	50 %	25 %	479185193
130	NC_021030	CGGT	2	8	60293	60300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021030	TGAG	2	8	60489	60496	25 %	25 %	50 %	0 %	479185194
132	NC_021030	CCGT	2	8	60519	60526	0 %	25 %	25 %	50 %	479185194
133	NC_021030	CCGT	2	8	60578	60585	0 %	25 %	25 %	50 %	479185194
134	NC_021030	TTTC	2	8	62124	62131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021030	GTAT	2	8	62263	62270	25 %	50 %	25 %	0 %	479185195
136	NC_021030	GTCG	2	8	62504	62511	0 %	25 %	50 %	25 %	479185195
137	NC_021030	CGGC	2	8	62514	62521	0 %	0 %	50 %	50 %	479185195
138	NC_021030	AAGG	2	8	63180	63187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021030	AGGC	2	8	64518	64525	25 %	0 %	50 %	25 %	479185197
140	NC_021030	TCGA	2	8	64778	64785	25 %	25 %	25 %	25 %	479185198
141	NC_021030	ACAT	2	8	65065	65072	50 %	25 %	0 %	25 %	479185198
142	NC_021030	CATT	2	8	65226	65233	25 %	50 %	0 %	25 %	479185198
143	NC_021030	GCAA	2	8	65447	65454	50 %	0 %	25 %	25 %	479185198
144	NC_021030	ATTT	2	8	65509	65516	25 %	75 %	0 %	0 %	479185198
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