MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6004	NC_021030	GCT	2	6	274570	274575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185350
6005	NC_021030	CGG	2	6	274603	274608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185350
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6012	NC_021030	GCGCG	2	10	274792	274801	0 %	0 %	60 %	40 %	479185350
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6117	NC_021030	N	303	303	278886	279188	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_021030	GCA	2	6	279437	279442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185356
6123	NC_021030	GTA	2	6	279467	279472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185356
6124	NC_021030	CCG	2	6	279484	279489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185356
6125	NC_021030	CCGC	2	8	279531	279538	0 %	0 %	25 %	75 %	479185356
6126	NC_021030	CAG	2	6	279599	279604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185356
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6128	NC_021030	GTC	2	6	279633	279638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185356
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6133	NC_021030	TGT	2	6	279877	279882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185356
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6144	NC_021030	GC	3	6	280203	280208	0 %	0 %	50 %	50 %	479185356
6145	NC_021030	CTC	2	6	280229	280234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185356
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6152	NC_021030	GAT	2	6	280493	280498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185356
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6163	NC_021030	GCC	2	6	280931	280936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185357
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6165	NC_021030	CGTTT	2	10	280975	280984	0 %	60 %	20 %	20 %	479185357
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6243	NC_021030	GCC	2	6	283943	283948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185359
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6245	NC_021030	TTG	2	6	283965	283970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185359
6246	NC_021030	CTT	2	6	283982	283987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185359
6247	NC_021030	GCCT	2	8	283988	283995	0 %	25 %	25 %	50 %	479185359
6248	NC_021030	GCC	2	6	284001	284006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185359
6249	NC_021030	CCA	2	6	284032	284037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185359
6250	NC_021030	CAC	3	9	284045	284053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185359
6251	NC_021030	GCC	2	6	284060	284065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185359
6252	NC_021030	CCT	2	6	284089	284094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185359
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6254	NC_021030	AGA	2	6	284345	284350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185360
6255	NC_021030	GTT	2	6	284382	284387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185360
6256	NC_021030	TTCGAA	2	12	284394	284405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479185360
6257	NC_021030	CGG	3	9	284612	284620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185360
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6259	NC_021030	CGA	2	6	284829	284834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185360
6260	NC_021030	CGA	2	6	284838	284843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185360
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6262	NC_021030	GCGT	2	8	284864	284871	0 %	25 %	50 %	25 %	479185360
6263	NC_021030	TCA	2	6	284918	284923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185360
6264	NC_021030	TCGAG	2	10	284933	284942	20 %	20 %	40 %	20 %	479185360
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6267	NC_021030	CCA	2	6	285029	285034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185360
6268	NC_021030	CCA	2	6	285071	285076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185360
6269	NC_021030	CCA	2	6	285177	285182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185360
6270	NC_021030	TC	3	6	285209	285214	0 %	50 %	0 %	50 %	479185360
6271	NC_021030	GC	3	6	285278	285283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6272	NC_021030	T	6	6	285288	285293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6273	NC_021030	CGC	2	6	285366	285371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6274	NC_021030	CAT	2	6	285435	285440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185361
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6277	NC_021030	TCT	2	6	285530	285535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185361
6278	NC_021030	CGG	2	6	285549	285554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185361
6279	NC_021030	TGA	2	6	285656	285661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185361
6280	NC_021030	CGA	2	6	285705	285710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185361
6281	NC_021030	ACGGT	2	10	285824	285833	20 %	20 %	40 %	20 %	479185361
6282	NC_021030	CG	3	6	285836	285841	0 %	0 %	50 %	50 %	479185361
6283	NC_021030	GCG	2	6	285848	285853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185361
6284	NC_021030	CGA	2	6	285945	285950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185361
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6286	NC_021030	CTT	2	6	286005	286010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185361
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6290	NC_021030	ACGGC	2	10	286112	286121	20 %	0 %	40 %	40 %	479185361
6291	NC_021030	TGC	2	6	286133	286138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185361
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6297	NC_021030	TTC	2	6	286458	286463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6298	NC_021030	TAT	2	6	286489	286494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6299	NC_021030	CTGC	2	8	286577	286584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6300	NC_021030	CTGC	2	8	286586	286593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6301	NC_021030	CCAG	3	12	286603	286614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6302	NC_021030	CGC	2	6	286621	286626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6303	NC_021030	CTGC	2	8	286632	286639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6304	NC_021030	CTGC	2	8	286641	286648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6305	NC_021030	CTGC	2	8	286666	286673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6306	NC_021030	GCCT	2	8	286682	286689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6307	NC_021030	A	8	8	286692	286699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6308	NC_021030	N	275	275	286700	286974	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6309	NC_021030	T	7	7	286978	286984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6310	NC_021030	C	8	8	287010	287017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6311	NC_021030	GCT	2	6	287057	287062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185362
6312	NC_021030	TC	3	6	287096	287101	0 %	50 %	0 %	50 %	479185362
6313	NC_021030	GTC	2	6	287136	287141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185362
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6316	NC_021030	CAG	2	6	287256	287261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185362
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6319	NC_021030	TTG	2	6	287399	287404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185362
6320	NC_021030	CGT	2	6	287405	287410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185362
6321	NC_021030	GAA	2	6	287453	287458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185363
6322	NC_021030	TAACCG	2	12	287523	287534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479185363
6323	NC_021030	CGG	2	6	287562	287567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185363
6324	NC_021030	TGT	2	6	287596	287601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185363
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6326	NC_021030	TA	3	6	287676	287681	50 %	50 %	0 %	0 %	479185363
6327	NC_021030	CGGT	2	8	287697	287704	0 %	25 %	50 %	25 %	479185363
6328	NC_021030	GGCG	2	8	287729	287736	0 %	0 %	75 %	25 %	479185363
6329	NC_021030	CCG	2	6	287815	287820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185363
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6332	NC_021030	TGCTGT	2	12	287938	287949	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479185363
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6336	NC_021030	CAG	2	6	287996	288001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
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6339	NC_021030	CGA	2	6	288074	288079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
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6343	NC_021030	TGC	2	6	288391	288396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185363
6344	NC_021030	TCGA	2	8	288408	288415	25 %	25 %	25 %	25 %	479185363
6345	NC_021030	CT	3	6	288426	288431	0 %	50 %	0 %	50 %	479185363
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6347	NC_021030	CAG	2	6	288470	288475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
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6350	NC_021030	TCC	2	6	288576	288581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185363
6351	NC_021030	CGA	2	6	288632	288637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
6352	NC_021030	GAT	2	6	288638	288643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185363
6353	NC_021030	CGC	2	6	288648	288653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185363
6354	NC_021030	CGG	2	6	288655	288660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185363
6355	NC_021030	CAG	2	6	288662	288667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
6356	NC_021030	CAG	2	6	288713	288718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185363
6357	NC_021030	GCG	2	6	288725	288730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185363
6358	NC_021030	GCC	2	6	288789	288794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185363
6359	NC_021030	AGGT	2	8	288834	288841	25 %	25 %	50 %	0 %	479185363
6360	NC_021030	GC	3	6	288920	288925	0 %	0 %	50 %	50 %	479185363
6361	NC_021030	CCA	2	6	288943	288948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185363
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6363	NC_021030	TGA	2	6	289027	289032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185363
6364	NC_021030	CGAC	2	8	289045	289052	25 %	0 %	25 %	50 %	479185363
6365	NC_021030	GC	3	6	289119	289124	0 %	0 %	50 %	50 %	479185363
6366	NC_021030	GTT	2	6	289136	289141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185363
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6368	NC_021030	TTG	2	6	289170	289175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185363
6369	NC_021030	GTCC	2	8	289215	289222	0 %	25 %	25 %	50 %	479185363
6370	NC_021030	CAC	2	6	289289	289294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185363
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6375	NC_021030	GTTGTC	2	12	289442	289453	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479185363
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6393	NC_021030	CG	3	6	290107	290112	0 %	0 %	50 %	50 %	479185364
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6405	NC_021030	T	7	7	290805	290811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6490	NC_021030	CGC	2	6	294228	294233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185367
6491	NC_021030	GCCGT	2	10	294244	294253	0 %	20 %	40 %	40 %	479185367
6492	NC_021030	GC	4	8	294303	294310	0 %	0 %	50 %	50 %	479185367
6493	NC_021030	GCA	2	6	294339	294344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185367
6494	NC_021030	GCG	2	6	294420	294425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185367
6495	NC_021030	GGCCGA	2	12	294450	294461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479185367
6496	NC_021030	GAG	2	6	294478	294483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185367
6497	NC_021030	CAC	2	6	294517	294522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185367
6498	NC_021030	TGA	2	6	294524	294529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185367
6499	NC_021030	ACG	2	6	294530	294535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185367
6500	NC_021030	CGA	2	6	294591	294596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185367

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