MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agromonas oligotrophica S58 DNA

Total Repeats: 7204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020453	GCGAT	2	10	1245	1254	20 %	20 %	40 %	20 %	459286453
2	NC_020453	GCGCC	2	10	1255	1264	0 %	0 %	40 %	60 %	459286453
3	NC_020453	ACCAC	2	10	2323	2332	40 %	0 %	0 %	60 %	459286453
4	NC_020453	GCAAA	2	10	3869	3878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020453	CCTAC	2	10	3933	3942	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_020453	GCTTC	2	10	4026	4035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020453	GCGCC	2	10	4235	4244	0 %	0 %	40 %	60 %	459286455
8	NC_020453	TCGGC	2	10	4402	4411	0 %	20 %	40 %	40 %	459286455
9	NC_020453	CCCCG	2	10	5235	5244	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_020453	GGCCA	2	10	7229	7238	20 %	0 %	40 %	40 %	459286456
11	NC_020453	GTGCT	2	10	8669	8678	0 %	40 %	40 %	20 %	459286457
12	NC_020453	GCCGC	2	10	10204	10213	0 %	0 %	40 %	60 %	459286457
13	NC_020453	TGTCG	2	10	10619	10628	0 %	40 %	40 %	20 %	459286459
14	NC_020453	GATGG	2	10	12582	12591	20 %	20 %	60 %	0 %	459286461
15	NC_020453	TCGCG	2	10	13177	13186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020453	CGGCC	2	10	13390	13399	0 %	0 %	40 %	60 %	459286462
17	NC_020453	CGCTG	2	10	14491	14500	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_020453	CGACC	2	10	17672	17681	20 %	0 %	20 %	60 %	459286465
19	NC_020453	ACGGC	2	10	19755	19764	20 %	0 %	40 %	40 %	459286466
20	NC_020453	AGCAC	2	10	19918	19927	40 %	0 %	20 %	40 %	459286466
21	NC_020453	TCGTC	2	10	22193	22202	0 %	40 %	20 %	40 %	459286468
22	NC_020453	GCCGG	2	10	23070	23079	0 %	0 %	60 %	40 %	459286469
23	NC_020453	GGCGC	2	10	24299	24308	0 %	0 %	60 %	40 %	459286470
24	NC_020453	CGGGT	2	10	24528	24537	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020453	GGCGA	2	10	25587	25596	20 %	0 %	60 %	20 %	459286472
26	NC_020453	GATCT	2	10	27273	27282	20 %	40 %	20 %	20 %	459286474
27	NC_020453	GGGAC	2	10	27726	27735	20 %	0 %	60 %	20 %	459286475
28	NC_020453	GCTAA	2	10	28014	28023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020453	TGCTT	2	10	28545	28554	0 %	60 %	20 %	20 %	459286476
30	NC_020453	CGGCC	2	10	31391	31400	0 %	0 %	40 %	60 %	459286479
31	NC_020453	GGTGA	2	10	31510	31519	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020453	GGGAT	2	10	32375	32384	20 %	20 %	60 %	0 %	459286481
33	NC_020453	ACGCG	2	10	32570	32579	20 %	0 %	40 %	40 %	459286481
34	NC_020453	CGCGG	2	10	33918	33927	0 %	0 %	60 %	40 %	459286483
35	NC_020453	GACGC	2	10	35473	35482	20 %	0 %	40 %	40 %	459286484
36	NC_020453	GCGCC	2	10	36041	36050	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_020453	GCCGC	2	10	36065	36074	0 %	0 %	40 %	60 %	459286485
38	NC_020453	CGGCC	2	10	36335	36344	0 %	0 %	40 %	60 %	459286485
39	NC_020453	TCGCA	2	10	36610	36619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_020453	GAACG	2	10	36704	36713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020453	AGTGA	2	10	37915	37924	40 %	20 %	40 %	0 %	459286486
42	NC_020453	TGAGG	2	10	38853	38862	20 %	20 %	60 %	0 %	459286487
43	NC_020453	GCGCC	2	10	38867	38876	0 %	0 %	40 %	60 %	459286487
44	NC_020453	GCCGG	2	10	39438	39447	0 %	0 %	60 %	40 %	459286488
45	NC_020453	CGGCG	2	10	40617	40626	0 %	0 %	60 %	40 %	459286488
46	NC_020453	GACGG	2	10	42003	42012	20 %	0 %	60 %	20 %	459286489
47	NC_020453	CCGGC	2	10	44890	44899	0 %	0 %	40 %	60 %	459286494
48	NC_020453	AGCCG	2	10	46703	46712	20 %	0 %	40 %	40 %	459286497
49	NC_020453	CGCGG	2	10	47917	47926	0 %	0 %	60 %	40 %	459286498
50	NC_020453	CGGCC	2	10	48163	48172	0 %	0 %	40 %	60 %	459286498
51	NC_020453	CGGCT	2	10	48278	48287	0 %	20 %	40 %	40 %	459286498
52	NC_020453	CGCGC	2	10	49054	49063	0 %	0 %	40 %	60 %	459286499
53	NC_020453	GGCGC	2	10	49764	49773	0 %	0 %	60 %	40 %	459286500
54	NC_020453	GCGCT	2	10	53954	53963	0 %	20 %	40 %	40 %	459286503
55	NC_020453	CACCG	2	10	54048	54057	20 %	0 %	20 %	60 %	459286503
56	NC_020453	CTTGC	2	10	55665	55674	0 %	40 %	20 %	40 %	459286505
57	NC_020453	CAAGC	2	10	56410	56419	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_020453	CTCGT	2	10	56490	56499	0 %	40 %	20 %	40 %	459286506
59	NC_020453	TCGCC	2	10	57154	57163	0 %	20 %	20 %	60 %	459286506
60	NC_020453	GGCGA	2	10	57699	57708	20 %	0 %	60 %	20 %	459286507
61	NC_020453	AGGCG	2	10	60255	60264	20 %	0 %	60 %	20 %	459286509
62	NC_020453	GCCCG	2	10	60552	60561	0 %	0 %	40 %	60 %	459286509
63	NC_020453	CGCTG	2	10	62864	62873	0 %	20 %	40 %	40 %	459286510
64	NC_020453	GCCGC	2	10	63199	63208	0 %	0 %	40 %	60 %	459286511
65	NC_020453	CGCGC	2	10	66443	66452	0 %	0 %	40 %	60 %	459286513
66	NC_020453	GGCGA	2	10	66594	66603	20 %	0 %	60 %	20 %	459286513
67	NC_020453	GACCA	2	10	66867	66876	40 %	0 %	20 %	40 %	459286513
68	NC_020453	CTTGC	2	10	67095	67104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020453	GTCGC	2	10	67123	67132	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_020453	CCGCC	2	10	67223	67232	0 %	0 %	20 %	80 %	459286514
71	NC_020453	GCTGC	2	10	67529	67538	0 %	20 %	40 %	40 %	459286514
72	NC_020453	GATCT	2	10	68080	68089	20 %	40 %	20 %	20 %	459286515
73	NC_020453	GCACG	2	10	69561	69570	20 %	0 %	40 %	40 %	459286517
74	NC_020453	GCCGT	2	10	70748	70757	0 %	20 %	40 %	40 %	459286517
75	NC_020453	GTCCA	2	10	73366	73375	20 %	20 %	20 %	40 %	459286519
76	NC_020453	CGCCT	2	10	73953	73962	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_020453	CCGGG	2	10	74857	74866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_020453	GCTGG	2	10	75135	75144	0 %	20 %	60 %	20 %	459286521
79	NC_020453	ACTCA	2	10	76111	76120	40 %	20 %	0 %	40 %	459286522
80	NC_020453	TTGCG	2	10	76165	76174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020453	GGCGC	2	10	76978	76987	0 %	0 %	60 %	40 %	459286523
82	NC_020453	AGCTC	2	10	78368	78377	20 %	20 %	20 %	40 %	459286524
83	NC_020453	CGAGC	2	10	81472	81481	20 %	0 %	40 %	40 %	459286527
84	NC_020453	TCGAT	2	10	85108	85117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020453	CATGC	2	10	85863	85872	20 %	20 %	20 %	40 %	459286530
86	NC_020453	CGGCC	2	10	86067	86076	0 %	0 %	40 %	60 %	459286531
87	NC_020453	CGGCG	2	10	86108	86117	0 %	0 %	60 %	40 %	459286531
88	NC_020453	CCGCG	2	10	87850	87859	0 %	0 %	40 %	60 %	459286533
89	NC_020453	GTCTG	2	10	90116	90125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020453	CGGCG	2	10	92262	92271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_020453	CATTG	2	10	92526	92535	20 %	40 %	20 %	20 %	459286537
92	NC_020453	CCGCA	2	10	92725	92734	20 %	0 %	20 %	60 %	459286537
93	NC_020453	CCGTG	2	10	92784	92793	0 %	20 %	40 %	40 %	459286537
94	NC_020453	GTGCC	2	10	93864	93873	0 %	20 %	40 %	40 %	459286537
95	NC_020453	TGCGC	2	10	94062	94071	0 %	20 %	40 %	40 %	459286537
96	NC_020453	GCGTC	2	10	94455	94464	0 %	20 %	40 %	40 %	459286537
97	NC_020453	CTCCC	2	10	96359	96368	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_020453	GGGGA	2	10	96546	96555	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020453	ACGCT	2	10	96647	96656	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_020453	GCGCG	2	10	99128	99137	0 %	0 %	60 %	40 %	459286541
101	NC_020453	CACCT	2	10	99728	99737	20 %	20 %	0 %	60 %	459286541
102	NC_020453	GCCGC	2	10	99873	99882	0 %	0 %	40 %	60 %	459286541
103	NC_020453	TCGCC	2	10	100131	100140	0 %	20 %	20 %	60 %	459286541
104	NC_020453	CGGCG	2	10	100243	100252	0 %	0 %	60 %	40 %	459286541
105	NC_020453	TGCGC	2	10	101008	101017	0 %	20 %	40 %	40 %	459286541
106	NC_020453	GCCCC	2	10	101679	101688	0 %	0 %	20 %	80 %	459286542
107	NC_020453	GCGCC	2	10	102678	102687	0 %	0 %	40 %	60 %	459286542
108	NC_020453	GGCGC	2	10	104466	104475	0 %	0 %	60 %	40 %	459286542
109	NC_020453	GCGCC	2	10	105514	105523	0 %	0 %	40 %	60 %	459286543
110	NC_020453	CCGCA	2	10	107017	107026	20 %	0 %	20 %	60 %	459286545
111	NC_020453	ACGCC	2	10	107634	107643	20 %	0 %	20 %	60 %	459286546
112	NC_020453	GCTTC	2	10	109220	109229	0 %	40 %	20 %	40 %	459286547
113	NC_020453	TCGCC	2	10	109370	109379	0 %	20 %	20 %	60 %	459286547
114	NC_020453	ATCGG	2	10	110552	110561	20 %	20 %	40 %	20 %	459286548
115	NC_020453	CGCGC	2	10	111972	111981	0 %	0 %	40 %	60 %	459286550
116	NC_020453	CGCGT	2	10	112185	112194	0 %	20 %	40 %	40 %	459286550
117	NC_020453	GCCGG	2	10	112728	112737	0 %	0 %	60 %	40 %	459286551
118	NC_020453	CCGAT	2	10	113695	113704	20 %	20 %	20 %	40 %	459286553
119	NC_020453	GTCTC	2	10	114803	114812	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_020453	GGGCA	2	10	114942	114951	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020453	GGGGT	2	10	115125	115134	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020453	CACCC	2	10	115170	115179	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
123	NC_020453	GCGGG	2	10	115238	115247	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020453	TGACC	2	10	116415	116424	20 %	20 %	20 %	40 %	459286554
125	NC_020453	GAGGC	2	10	118015	118024	20 %	0 %	60 %	20 %	459286556
126	NC_020453	GCATG	2	10	119919	119928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020453	CTGGT	2	10	120541	120550	0 %	40 %	40 %	20 %	459286558
128	NC_020453	AGCGG	2	10	120848	120857	20 %	0 %	60 %	20 %	459286559
129	NC_020453	CGATC	2	10	121144	121153	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_020453	CCTCG	2	10	122109	122118	0 %	20 %	20 %	60 %	459286561
131	NC_020453	GGCGT	2	10	122914	122923	0 %	20 %	60 %	20 %	459286561
132	NC_020453	CGCAG	2	10	123119	123128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020453	TTCCG	2	10	125867	125876	0 %	40 %	20 %	40 %	459286564
134	NC_020453	CAACG	2	10	129740	129749	40 %	0 %	20 %	40 %	459286570
135	NC_020453	CTGCC	2	10	129878	129887	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_020453	TGATG	2	10	130856	130865	20 %	40 %	40 %	0 %	459286572
137	NC_020453	GATCG	2	10	132691	132700	20 %	20 %	40 %	20 %	459286573
138	NC_020453	CGCTT	2	10	133492	133501	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_020453	GCGAC	2	10	136163	136172	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_020453	TTCGC	2	10	136306	136315	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_020453	GCCTT	2	10	137627	137636	0 %	40 %	20 %	40 %	459286579
142	NC_020453	CCCAG	2	10	139582	139591	20 %	0 %	20 %	60 %	459286582
143	NC_020453	GCGCC	2	10	140192	140201	0 %	0 %	40 %	60 %	459286582
144	NC_020453	GGTCG	2	10	140606	140615	0 %	20 %	60 %	20 %	459286582
145	NC_020453	TCCGC	2	10	141517	141526	0 %	20 %	20 %	60 %	459286584
146	NC_020453	AGGCA	2	10	142421	142430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020453	AGGGG	2	10	142481	142490	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020453	CTCGC	2	10	144831	144840	0 %	20 %	20 %	60 %	459286587
149	NC_020453	TCCAG	2	10	145228	145237	20 %	20 %	20 %	40 %	459286587
150	NC_020453	TGCGT	2	10	145657	145666	0 %	40 %	40 %	20 %	459286588
151	NC_020453	GCGAT	2	10	148081	148090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_020453	AGCGA	2	10	150427	150436	40 %	0 %	40 %	20 %	459286591
153	NC_020453	GGGGT	2	10	150447	150456	0 %	20 %	80 %	0 %	459286591
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155	NC_020453	CCCCT	2	10	150527	150536	0 %	20 %	0 %	80 %	459286591
156	NC_020453	CACAC	2	10	152108	152117	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
157	NC_020453	TGATC	2	10	152977	152986	20 %	40 %	20 %	20 %	459286594
158	NC_020453	CACGA	2	10	153107	153116	40 %	0 %	20 %	40 %	459286594
159	NC_020453	CGGCT	2	10	154084	154093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_020453	GCGAC	2	10	154976	154985	20 %	0 %	40 %	40 %	459286596
161	NC_020453	ATCCG	2	10	155013	155022	20 %	20 %	20 %	40 %	459286596
162	NC_020453	CCTCG	2	10	158374	158383	0 %	20 %	20 %	60 %	459286602
163	NC_020453	TGGGG	2	10	159514	159523	0 %	20 %	80 %	0 %	459286603
164	NC_020453	GTGCG	2	10	160220	160229	0 %	20 %	60 %	20 %	459286604
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166	NC_020453	TGCTC	2	10	164788	164797	0 %	40 %	20 %	40 %	459286607
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169	NC_020453	AACGA	2	10	165741	165750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_020453	GCACT	2	10	166629	166638	20 %	20 %	20 %	40 %	459286608
171	NC_020453	CGCGC	2	10	166844	166853	0 %	0 %	40 %	60 %	459286608
172	NC_020453	CGGCG	2	10	167255	167264	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_020453	CGGCG	2	10	168175	168184	0 %	0 %	60 %	40 %	459286610
174	NC_020453	CGCTC	2	10	169791	169800	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
175	NC_020453	GGCTG	2	10	170070	170079	0 %	20 %	60 %	20 %	459286611
176	NC_020453	GCCCT	2	10	170349	170358	0 %	20 %	20 %	60 %	459286611
177	NC_020453	GCCGC	2	10	173578	173587	0 %	0 %	40 %	60 %	459286614
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179	NC_020453	GGCCC	2	10	179003	179012	0 %	0 %	40 %	60 %	459286618
180	NC_020453	GGCTT	2	10	179116	179125	0 %	40 %	40 %	20 %	459286618
181	NC_020453	GCTTC	2	10	180836	180845	0 %	40 %	20 %	40 %	459286620
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183	NC_020453	CGGCG	2	10	182198	182207	0 %	0 %	60 %	40 %	459286622
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187	NC_020453	CCGAC	2	10	185073	185082	20 %	0 %	20 %	60 %	459286626
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189	NC_020453	GGCGC	2	10	186926	186935	0 %	0 %	60 %	40 %	459286628
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191	NC_020453	GTCCT	2	10	189289	189298	0 %	40 %	20 %	40 %	459286629
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194	NC_020453	CATCG	2	10	192863	192872	20 %	20 %	20 %	40 %	459286631
195	NC_020453	CGGCG	2	10	193721	193730	0 %	0 %	60 %	40 %	459286632
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199	NC_020453	TGGCC	2	10	197293	197302	0 %	20 %	40 %	40 %	459286636
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201	NC_020453	CGGCG	2	10	198994	199003	0 %	0 %	60 %	40 %	459286638
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217	NC_020453	CGATC	2	10	214133	214142	20 %	20 %	20 %	40 %	459286652
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251	NC_020453	GCGCA	2	10	259809	259818	20 %	0 %	40 %	40 %	459286695
252	NC_020453	CCTCG	2	10	260264	260273	0 %	20 %	20 %	60 %	459286695
253	NC_020453	CGGCT	2	10	260610	260619	0 %	20 %	40 %	40 %	459286695
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259	NC_020453	CTCAG	2	10	266438	266447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_020453	CGGGG	2	10	268027	268036	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
264	NC_020453	ATGTT	2	10	268139	268148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_020453	GCGCC	2	10	268512	268521	0 %	0 %	40 %	60 %	459286701
266	NC_020453	GCGCC	2	10	268559	268568	0 %	0 %	40 %	60 %	459286701
267	NC_020453	GGGCC	2	10	268898	268907	0 %	0 %	60 %	40 %	459286701
268	NC_020453	GGCCG	2	10	269470	269479	0 %	0 %	60 %	40 %	459286702
269	NC_020453	GGCGA	2	10	272179	272188	20 %	0 %	60 %	20 %	459286704
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271	NC_020453	GCTTC	2	10	273503	273512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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387	NC_020453	GGTTC	2	10	395962	395971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
388	NC_020453	GGCGG	2	10	397517	397526	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_020453	ATCGA	2	10	406801	406810	40 %	20 %	20 %	20 %	459286833
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399	NC_020453	GCGTG	2	10	412289	412298	0 %	20 %	60 %	20 %	459286838
400	NC_020453	GCAGG	2	10	413158	413167	20 %	0 %	60 %	20 %	459286838
401	NC_020453	GGGGA	2	10	413850	413859	20 %	0 %	80 %	0 %	459286839
402	NC_020453	AGCGC	2	10	414195	414204	20 %	0 %	40 %	40 %	459286839
403	NC_020453	ACGGC	2	10	415207	415216	20 %	0 %	40 %	40 %	459286840
404	NC_020453	ATGGA	2	10	415442	415451	40 %	20 %	40 %	0 %	459286841
405	NC_020453	GCTTC	2	10	416122	416131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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