MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.02

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020157	CAAGC	2	10	202	211	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020157	ACCCG	2	10	1193	1202	20 %	0 %	20 %	60 %	443329696
3	NC_020157	ATTAT	2	10	2646	2655	40 %	60 %	0 %	0 %	443329697
4	NC_020157	CGTTT	2	10	2682	2691	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020157	GAAAA	2	10	2877	2886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020157	GAACC	2	10	3014	3023	40 %	0 %	20 %	40 %	443329698
7	NC_020157	AAAAG	2	10	3710	3719	80 %	0 %	20 %	0 %	443329698
8	NC_020157	TTTGG	2	10	6015	6024	0 %	60 %	40 %	0 %	443329701
9	NC_020157	AAATT	2	10	6817	6826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020157	GAACG	2	10	10251	10260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020157	CTAAT	2	10	12295	12304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020157	TCCGG	2	10	12629	12638	0 %	20 %	40 %	40 %	443329708
13	NC_020157	TACCA	2	10	18386	18395	40 %	20 %	0 %	40 %	443329713
14	NC_020157	CTCTC	2	10	19242	19251	0 %	40 %	0 %	60 %	443329714
15	NC_020157	ATTTT	2	10	20584	20593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020157	ACTCA	2	10	21322	21331	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020157	AAAGT	2	10	23904	23913	60 %	20 %	20 %	0 %	443329718
18	NC_020157	AACCA	2	10	24209	24218	60 %	0 %	0 %	40 %	443329718
19	NC_020157	GAATT	2	10	24340	24349	40 %	40 %	20 %	0 %	443329718
20	NC_020157	CCGTT	2	10	26152	26161	0 %	40 %	20 %	40 %	443329718
21	NC_020157	GTTTT	2	10	31621	31630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020157	ATTTT	2	10	33433	33442	20 %	80 %	0 %	0 %	443329724
23	NC_020157	CAAAA	2	10	34698	34707	80 %	0 %	0 %	20 %	443329724
24	NC_020157	AATTA	2	10	39954	39963	60 %	40 %	0 %	0 %	443329728
25	NC_020157	ATTTG	2	10	39979	39988	20 %	60 %	20 %	0 %	443329728
26	NC_020157	ACTGA	2	10	40087	40096	40 %	20 %	20 %	20 %	443329728
27	NC_020157	GATTA	2	10	40623	40632	40 %	40 %	20 %	0 %	443329728
28	NC_020157	TGACA	2	10	41159	41168	40 %	20 %	20 %	20 %	443329729
29	NC_020157	TAGCC	2	10	42111	42120	20 %	20 %	20 %	40 %	443329730
30	NC_020157	TGTGA	2	10	43058	43067	20 %	40 %	40 %	0 %	443329732
31	NC_020157	CGGAG	2	10	44279	44288	20 %	0 %	60 %	20 %	443329733
32	NC_020157	TTGCC	2	10	47496	47505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020157	AGTGT	2	10	47542	47551	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020157	CTTTT	2	10	51629	51638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020157	CTGGT	2	10	52505	52514	0 %	40 %	40 %	20 %	443329738
36	NC_020157	TTTGA	2	10	52684	52693	20 %	60 %	20 %	0 %	443329738
37	NC_020157	TGATT	2	10	52815	52824	20 %	60 %	20 %	0 %	443329739
38	NC_020157	ACTCA	2	10	53458	53467	40 %	20 %	0 %	40 %	443329739
39	NC_020157	TAAGT	2	10	58204	58213	40 %	40 %	20 %	0 %	443329742
40	NC_020157	TCATT	2	10	60497	60506	20 %	60 %	0 %	20 %	443329744
41	NC_020157	TACAT	2	10	67740	67749	40 %	40 %	0 %	20 %	443329749
42	NC_020157	TTTTC	2	10	68631	68640	0 %	80 %	0 %	20 %	443329750
43	NC_020157	TTTTG	2	10	68811	68820	0 %	80 %	20 %	0 %	443329750
44	NC_020157	GGGAA	2	10	71654	71663	40 %	0 %	60 %	0 %	443329751
45	NC_020157	TTTAA	2	10	72408	72417	40 %	60 %	0 %	0 %	443329751
46	NC_020157	TTGAA	2	10	72464	72473	40 %	40 %	20 %	0 %	443329751
47	NC_020157	AATTT	2	10	72507	72516	40 %	60 %	0 %	0 %	443329751
48	NC_020157	ATTCC	2	10	72860	72869	20 %	40 %	0 %	40 %	443329751
49	NC_020157	AATTA	2	10	73097	73106	60 %	40 %	0 %	0 %	443329751
50	NC_020157	ATTTG	2	10	73147	73156	20 %	60 %	20 %	0 %	443329751
51	NC_020157	TACCT	2	10	79796	79805	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_020157	TAATA	2	10	83124	83133	60 %	40 %	0 %	0 %	443329758
53	NC_020157	CGCAC	2	10	86130	86139	20 %	0 %	20 %	60 %	443329760
54	NC_020157	CTAAA	2	10	87232	87241	60 %	20 %	0 %	20 %	443329760
55	NC_020157	AATTC	2	10	89547	89556	40 %	40 %	0 %	20 %	443329760
56	NC_020157	TTTTC	2	10	90698	90707	0 %	80 %	0 %	20 %	443329761
57	NC_020157	GGTTG	2	10	92923	92932	0 %	40 %	60 %	0 %	443329763
58	NC_020157	TGACT	2	10	97021	97030	20 %	40 %	20 %	20 %	443329767
59	NC_020157	TTGAG	2	10	98930	98939	20 %	40 %	40 %	0 %	443329769
60	NC_020157	TCTTT	2	10	101524	101533	0 %	80 %	0 %	20 %	443329770
61	NC_020157	AAAAT	2	10	103571	103580	80 %	20 %	0 %	0 %	443329772
62	NC_020157	TTTTC	2	10	104547	104556	0 %	80 %	0 %	20 %	443329773
63	NC_020157	TGAGT	2	10	104789	104798	20 %	40 %	40 %	0 %	443329773
64	NC_020157	TATTG	2	10	108716	108725	20 %	60 %	20 %	0 %	443329778
65	NC_020157	CTTTT	2	10	110764	110773	0 %	80 %	0 %	20 %	443329780
66	NC_020157	TAAAA	2	10	111805	111814	80 %	20 %	0 %	0 %	443329781
67	NC_020157	ACAAT	2	10	112419	112428	60 %	20 %	0 %	20 %	443329781
68	NC_020157	CTTTT	2	10	115662	115671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020157	ATTTG	2	10	116151	116160	20 %	60 %	20 %	0 %	443329784
70	NC_020157	GCTGT	2	10	117669	117678	0 %	40 %	40 %	20 %	443329785
71	NC_020157	GTAAT	2	10	118456	118465	40 %	40 %	20 %	0 %	443329785
72	NC_020157	TTCTA	2	10	118652	118661	20 %	60 %	0 %	20 %	443329785
73	NC_020157	TCAAA	2	10	118690	118699	60 %	20 %	0 %	20 %	443329785
74	NC_020157	TGATA	2	10	121357	121366	40 %	40 %	20 %	0 %	443329789
75	NC_020157	GTTGA	2	10	122396	122405	20 %	40 %	40 %	0 %	443329790
76	NC_020157	TTTGA	2	10	125905	125914	20 %	60 %	20 %	0 %	443329794
77	NC_020157	TCAGA	2	10	125936	125945	40 %	20 %	20 %	20 %	443329794
78	NC_020157	AATGC	2	10	126737	126746	40 %	20 %	20 %	20 %	443329795
79	NC_020157	GCTTT	2	10	127704	127713	0 %	60 %	20 %	20 %	443329796
80	NC_020157	AAATC	2	10	128516	128525	60 %	20 %	0 %	20 %	443329796
81	NC_020157	ATTTG	2	10	128930	128939	20 %	60 %	20 %	0 %	443329796
82	NC_020157	TATTT	2	10	133138	133147	20 %	80 %	0 %	0 %	443329800
83	NC_020157	ATACT	2	10	133970	133979	40 %	40 %	0 %	20 %	443329800
84	NC_020157	TAAAT	2	10	138094	138103	60 %	40 %	0 %	0 %	443329802
85	NC_020157	CAGAC	2	10	140153	140162	40 %	0 %	20 %	40 %	443329804
86	NC_020157	TTCTC	2	10	141607	141616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020157	ACCTG	2	10	141765	141774	20 %	20 %	20 %	40 %	443329805
88	NC_020157	TTCAT	2	10	144756	144765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020157	CATTC	2	10	145954	145963	20 %	40 %	0 %	40 %	443329809
90	NC_020157	AATTT	2	10	147726	147735	40 %	60 %	0 %	0 %	443329809
91	NC_020157	CGCTA	2	10	149419	149428	20 %	20 %	20 %	40 %	443329812
92	NC_020157	ATAGT	2	10	152101	152110	40 %	40 %	20 %	0 %	443329815
93	NC_020157	TAGCG	2	10	153414	153423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020157	TTTTG	2	10	153586	153595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020157	TTTCA	2	10	156515	156524	20 %	60 %	0 %	20 %	443329820
96	NC_020157	CAATT	2	10	157311	157320	40 %	40 %	0 %	20 %	443329820
97	NC_020157	TTAAC	2	10	158360	158369	40 %	40 %	0 %	20 %	443329820
98	NC_020157	ATTTT	2	10	160200	160209	20 %	80 %	0 %	0 %	443329821
99	NC_020157	GATTT	2	10	160365	160374	20 %	60 %	20 %	0 %	443329821
100	NC_020157	AACCC	2	10	161883	161892	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_020157	AAACC	2	10	162457	162466	60 %	0 %	0 %	40 %	443329823
102	NC_020157	TAAAT	2	10	166181	166190	60 %	40 %	0 %	0 %	443329826
103	NC_020157	CAATT	2	10	168693	168702	40 %	40 %	0 %	20 %	443329827
104	NC_020157	ATATC	2	10	169099	169108	40 %	40 %	0 %	20 %	443329827
105	NC_020157	TGATC	2	10	170000	170009	20 %	40 %	20 %	20 %	443329828
106	NC_020157	GGATA	2	10	177383	177392	40 %	20 %	40 %	0 %	443329835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.