MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 1002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	AATGC	2	10	2188	2197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019942	GATAA	2	10	5862	5871	60 %	20 %	20 %	0 %	432327932
3	NC_019942	TGCTT	2	10	7416	7425	0 %	60 %	20 %	20 %	432327934
4	NC_019942	GATGA	2	10	8240	8249	40 %	20 %	40 %	0 %	432327935
5	NC_019942	ACACC	2	10	10256	10265	40 %	0 %	0 %	60 %	432327936
6	NC_019942	AATGA	2	10	11004	11013	60 %	20 %	20 %	0 %	432327936
7	NC_019942	CTTCA	2	10	11505	11514	20 %	40 %	0 %	40 %	432327936
8	NC_019942	TTCCT	2	10	11646	11655	0 %	60 %	0 %	40 %	432327936
9	NC_019942	TGGCT	2	10	15048	15057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019942	GACCC	2	10	15317	15326	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_019942	CTTTA	2	10	19670	19679	20 %	60 %	0 %	20 %	432327938
12	NC_019942	TCCTC	2	10	21374	21383	0 %	40 %	0 %	60 %	432327940
13	NC_019942	GAAAA	2	10	23662	23671	80 %	0 %	20 %	0 %	432327944
14	NC_019942	GAAAG	2	10	24171	24180	60 %	0 %	40 %	0 %	432327944
15	NC_019942	AATTC	2	10	24191	24200	40 %	40 %	0 %	20 %	432327944
16	NC_019942	CAGAA	2	10	24401	24410	60 %	0 %	20 %	20 %	432327944
17	NC_019942	ATGGA	2	10	25962	25971	40 %	20 %	40 %	0 %	432327944
18	NC_019942	AAGTG	2	10	26139	26148	40 %	20 %	40 %	0 %	432327944
19	NC_019942	CCCAA	2	10	28710	28719	40 %	0 %	0 %	60 %	432327946
20	NC_019942	CATAA	2	10	29675	29684	60 %	20 %	0 %	20 %	432327946
21	NC_019942	GTTGA	2	10	30000	30009	20 %	40 %	40 %	0 %	432327946
22	NC_019942	GCAGA	2	10	32395	32404	40 %	0 %	40 %	20 %	432327948
23	NC_019942	ATTCC	2	10	33127	33136	20 %	40 %	0 %	40 %	432327948
24	NC_019942	ACCTC	2	10	33285	33294	20 %	20 %	0 %	60 %	432327948
25	NC_019942	CAAGG	2	10	34451	34460	40 %	0 %	40 %	20 %	432327950
26	NC_019942	TTCAT	2	10	36433	36442	20 %	60 %	0 %	20 %	432327955
27	NC_019942	AAAAT	2	10	36957	36966	80 %	20 %	0 %	0 %	432327956
28	NC_019942	GCAGG	2	10	36995	37004	20 %	0 %	60 %	20 %	432327956
29	NC_019942	CATTC	2	10	38730	38739	20 %	40 %	0 %	40 %	432327959
30	NC_019942	GGGAA	2	10	39180	39189	40 %	0 %	60 %	0 %	432327960
31	NC_019942	AGATA	2	10	40337	40346	60 %	20 %	20 %	0 %	432327962
32	NC_019942	AAGAA	2	10	42840	42849	80 %	0 %	20 %	0 %	432327965
33	NC_019942	ATCAT	2	10	45846	45855	40 %	40 %	0 %	20 %	432327967
34	NC_019942	CCCCA	2	10	45863	45872	20 %	0 %	0 %	80 %	432327968
35	NC_019942	CCCCA	2	10	46029	46038	20 %	0 %	0 %	80 %	432327968
36	NC_019942	AACAA	2	10	48381	48390	80 %	0 %	0 %	20 %	432327969
37	NC_019942	ATTTT	2	10	50513	50522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019942	TCGCA	2	10	55350	55359	20 %	20 %	20 %	40 %	432327981
39	NC_019942	GGAAA	2	10	56086	56095	60 %	0 %	40 %	0 %	432327981
40	NC_019942	GGCAA	2	10	58230	58239	40 %	0 %	40 %	20 %	432327983
41	NC_019942	CGAAA	2	10	58540	58549	60 %	0 %	20 %	20 %	432327983
42	NC_019942	GATAA	2	10	60216	60225	60 %	20 %	20 %	0 %	432327985
43	NC_019942	ATCTA	2	10	60538	60547	40 %	40 %	0 %	20 %	432327985
44	NC_019942	GAGAA	2	10	61488	61497	60 %	0 %	40 %	0 %	432327985
45	NC_019942	CTCAA	2	10	65832	65841	40 %	20 %	0 %	40 %	432327990
46	NC_019942	TACTC	2	10	66194	66203	20 %	40 %	0 %	40 %	432327991
47	NC_019942	ATACT	2	10	68066	68075	40 %	40 %	0 %	20 %	432327993
48	NC_019942	TAAGA	2	10	70702	70711	60 %	20 %	20 %	0 %	432327995
49	NC_019942	GAACA	2	10	70930	70939	60 %	0 %	20 %	20 %	432327995
50	NC_019942	GAATT	2	10	72769	72778	40 %	40 %	20 %	0 %	432327997
51	NC_019942	CACCT	2	10	74781	74790	20 %	20 %	0 %	60 %	432328000
52	NC_019942	GAGAG	2	10	77865	77874	40 %	0 %	60 %	0 %	432328003
53	NC_019942	GCTGC	2	10	83663	83672	0 %	20 %	40 %	40 %	432328005
54	NC_019942	GGAAT	2	10	86552	86561	40 %	20 %	40 %	0 %	432328008
55	NC_019942	CTCCC	2	10	88258	88267	0 %	20 %	0 %	80 %	432328009
56	NC_019942	GCCCA	2	10	88408	88417	20 %	0 %	20 %	60 %	432328009
57	NC_019942	TCCTC	2	10	89282	89291	0 %	40 %	0 %	60 %	432328009
58	NC_019942	GTCTG	2	10	90429	90438	0 %	40 %	40 %	20 %	432328010
59	NC_019942	GCTTC	2	10	90451	90460	0 %	40 %	20 %	40 %	432328010
60	NC_019942	GATAT	2	10	91699	91708	40 %	40 %	20 %	0 %	432328013
61	NC_019942	ACTTT	2	10	95030	95039	20 %	60 %	0 %	20 %	432328016
62	NC_019942	TTGTG	2	10	98071	98080	0 %	60 %	40 %	0 %	432328020
63	NC_019942	TTTCC	2	10	99762	99771	0 %	60 %	0 %	40 %	432328021
64	NC_019942	TTTCA	2	10	99997	100006	20 %	60 %	0 %	20 %	432328021
65	NC_019942	ACCCT	2	10	100603	100612	20 %	20 %	0 %	60 %	432328023
66	NC_019942	TTATG	2	10	100877	100886	20 %	60 %	20 %	0 %	432328023
67	NC_019942	CCCAG	2	10	107362	107371	20 %	0 %	20 %	60 %	432328031
68	NC_019942	GCCAA	2	10	108873	108882	40 %	0 %	20 %	40 %	432328032
69	NC_019942	ATTTT	2	10	110804	110813	20 %	80 %	0 %	0 %	432328034
70	NC_019942	TGCTC	2	10	110944	110953	0 %	40 %	20 %	40 %	432328035
71	NC_019942	GGAGA	2	10	112527	112536	40 %	0 %	60 %	0 %	432328038
72	NC_019942	GATAG	2	10	113331	113340	40 %	20 %	40 %	0 %	432328038
73	NC_019942	CAATT	2	10	113710	113719	40 %	40 %	0 %	20 %	432328039
74	NC_019942	CACAT	2	10	119925	119934	40 %	20 %	0 %	40 %	432328049
75	NC_019942	CCTTT	2	10	120335	120344	0 %	60 %	0 %	40 %	432328050
76	NC_019942	TCAAA	2	10	120750	120759	60 %	20 %	0 %	20 %	432328051
77	NC_019942	AGATA	2	10	127269	127278	60 %	20 %	20 %	0 %	432328060
78	NC_019942	CAGGG	2	10	127315	127324	20 %	0 %	60 %	20 %	432328060
79	NC_019942	GAATT	2	10	127559	127568	40 %	40 %	20 %	0 %	432328061
80	NC_019942	CCATT	2	10	127786	127795	20 %	40 %	0 %	40 %	432328061
81	NC_019942	TTCCC	2	10	127796	127805	0 %	40 %	0 %	60 %	432328061
82	NC_019942	AAGGA	2	10	130859	130868	60 %	0 %	40 %	0 %	432328066
83	NC_019942	TGAAA	2	10	131362	131371	60 %	20 %	20 %	0 %	432328066
84	NC_019942	CCCTT	2	10	133791	133800	0 %	40 %	0 %	60 %	432328071
85	NC_019942	CCTTT	2	10	138677	138686	0 %	60 %	0 %	40 %	432328074
86	NC_019942	GGAGA	2	10	140195	140204	40 %	0 %	60 %	0 %	432328075
87	NC_019942	CATTT	2	10	140301	140310	20 %	60 %	0 %	20 %	432328075
88	NC_019942	GGGCA	2	10	140956	140965	20 %	0 %	60 %	20 %	432328075
89	NC_019942	TATCT	2	10	142737	142746	20 %	60 %	0 %	20 %	432328078
90	NC_019942	TCTCA	2	10	148967	148976	20 %	40 %	0 %	40 %	432328081
91	NC_019942	TTTTA	2	10	154809	154818	20 %	80 %	0 %	0 %	432328088
92	NC_019942	CATCC	2	10	158270	158279	20 %	20 %	0 %	60 %	432328092
93	NC_019942	CCTTT	2	10	158397	158406	0 %	60 %	0 %	40 %	432328092
94	NC_019942	CAAAA	2	10	158564	158573	80 %	0 %	0 %	20 %	432328092
95	NC_019942	ATCTC	2	10	159623	159632	20 %	40 %	0 %	40 %	432328098
96	NC_019942	GGGCC	2	10	160144	160153	0 %	0 %	60 %	40 %	432328099
97	NC_019942	TTGGA	2	10	160794	160803	20 %	40 %	40 %	0 %	432328099
98	NC_019942	AAAAG	2	10	160865	160874	80 %	0 %	20 %	0 %	432328099
99	NC_019942	TCCGC	2	10	161786	161795	0 %	20 %	20 %	60 %	432328101
100	NC_019942	AATGC	2	10	162053	162062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019942	TTGCA	2	10	164797	164806	20 %	40 %	20 %	20 %	432328106
102	NC_019942	TCTCT	2	10	165894	165903	0 %	60 %	0 %	40 %	432328108
103	NC_019942	ATCTC	2	10	166120	166129	20 %	40 %	0 %	40 %	432328109
104	NC_019942	CTCTT	2	10	166412	166421	0 %	60 %	0 %	40 %	432328111
105	NC_019942	TTGCT	2	10	166473	166482	0 %	60 %	20 %	20 %	432328111
106	NC_019942	TTTTA	2	10	167150	167159	20 %	80 %	0 %	0 %	432328112
107	NC_019942	AATGC	2	10	167226	167235	40 %	20 %	20 %	20 %	432328112
108	NC_019942	TGCAT	2	10	167379	167388	20 %	40 %	20 %	20 %	432328112
109	NC_019942	TGTTT	2	10	168958	168967	0 %	80 %	20 %	0 %	432328113
110	NC_019942	CCAAC	2	10	168986	168995	40 %	0 %	0 %	60 %	432328113
111	NC_019942	CCAGT	2	10	170377	170386	20 %	20 %	20 %	40 %	432328116
112	NC_019942	ATGCT	2	10	170909	170918	20 %	40 %	20 %	20 %	432328116
113	NC_019942	GGCTG	2	10	170982	170991	0 %	20 %	60 %	20 %	432328116
114	NC_019942	CATCC	2	10	172591	172600	20 %	20 %	0 %	60 %	432328117
115	NC_019942	TGAAC	2	10	173777	173786	40 %	20 %	20 %	20 %	432328120
116	NC_019942	CATCC	2	10	175791	175800	20 %	20 %	0 %	60 %	432328125
117	NC_019942	CCTTT	2	10	175918	175927	0 %	60 %	0 %	40 %	432328125
118	NC_019942	CAAAA	2	10	176085	176094	80 %	0 %	0 %	20 %	432328125
119	NC_019942	ATCTC	2	10	177144	177153	20 %	40 %	0 %	40 %	432328130
120	NC_019942	GGGCC	2	10	177665	177674	0 %	0 %	60 %	40 %	432328131
121	NC_019942	TTGGA	2	10	178315	178324	20 %	40 %	40 %	0 %	432328131
122	NC_019942	AAAAG	2	10	178386	178395	80 %	0 %	20 %	0 %	432328131
123	NC_019942	TCCGC	2	10	179307	179316	0 %	20 %	20 %	60 %	432328133
124	NC_019942	AATGC	2	10	179574	179583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019942	TTGCA	2	10	182318	182327	20 %	40 %	20 %	20 %	432328138
126	NC_019942	TCTCT	2	10	183415	183424	0 %	60 %	0 %	40 %	432328140
127	NC_019942	ATCTC	2	10	183641	183650	20 %	40 %	0 %	40 %	432328141
128	NC_019942	CTCTT	2	10	183933	183942	0 %	60 %	0 %	40 %	432328143
129	NC_019942	TTGCT	2	10	183994	184003	0 %	60 %	20 %	20 %	432328143
130	NC_019942	TTTTA	2	10	184671	184680	20 %	80 %	0 %	0 %	432328144
131	NC_019942	AATGC	2	10	184747	184756	40 %	20 %	20 %	20 %	432328144
132	NC_019942	TGCAT	2	10	184900	184909	20 %	40 %	20 %	20 %	432328144
133	NC_019942	TGTTT	2	10	186479	186488	0 %	80 %	20 %	0 %	432328145
134	NC_019942	CCAAC	2	10	186507	186516	40 %	0 %	0 %	60 %	432328145
135	NC_019942	CCAGT	2	10	187899	187908	20 %	20 %	20 %	40 %	432328148
136	NC_019942	ATGCT	2	10	188431	188440	20 %	40 %	20 %	20 %	432328148
137	NC_019942	GGCTG	2	10	188504	188513	0 %	20 %	60 %	20 %	432328148
138	NC_019942	CATCC	2	10	190113	190122	20 %	20 %	0 %	60 %	432328149
139	NC_019942	TGAAC	2	10	191299	191308	40 %	20 %	20 %	20 %	432328152
140	NC_019942	AGCGA	2	10	194712	194721	40 %	0 %	40 %	20 %	432328158
141	NC_019942	AAGGG	2	10	195212	195221	40 %	0 %	60 %	0 %	432328159
142	NC_019942	CAAAG	2	10	195453	195462	60 %	0 %	20 %	20 %	432328159
143	NC_019942	GATAG	2	10	195641	195650	40 %	20 %	40 %	0 %	432328159
144	NC_019942	ATTCC	2	10	196284	196293	20 %	40 %	0 %	40 %	432328160
145	NC_019942	TAGAA	2	10	199754	199763	60 %	20 %	20 %	0 %	432328164
146	NC_019942	ATCTC	2	10	203299	203308	20 %	40 %	0 %	40 %	432328168
147	NC_019942	TTCCT	2	10	206538	206547	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019942	GAAAT	2	10	210144	210153	60 %	20 %	20 %	0 %	432328174
149	NC_019942	TCCCC	2	10	212069	212078	0 %	20 %	0 %	80 %	432328176
150	NC_019942	TGGGC	2	10	212113	212122	0 %	20 %	60 %	20 %	432328176
151	NC_019942	GAAGA	2	10	212434	212443	60 %	0 %	40 %	0 %	432328176
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153	NC_019942	ATCCC	2	10	215462	215471	20 %	20 %	0 %	60 %	432328179
154	NC_019942	GGAAT	2	10	215965	215974	40 %	20 %	40 %	0 %	432328179
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156	NC_019942	ATATC	2	10	221826	221835	40 %	40 %	0 %	20 %	432328185
157	NC_019942	AGATG	2	10	222520	222529	40 %	20 %	40 %	0 %	432328186
158	NC_019942	CTGGG	2	10	222620	222629	0 %	20 %	60 %	20 %	432328186
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160	NC_019942	TCGCC	2	10	224043	224052	0 %	20 %	20 %	60 %	432328187
161	NC_019942	TGCGT	2	10	224594	224603	0 %	40 %	40 %	20 %	432328187
162	NC_019942	GTTCT	2	10	224711	224720	0 %	60 %	20 %	20 %	432328187
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164	NC_019942	CTCTC	2	10	226179	226188	0 %	40 %	0 %	60 %	432328188
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167	NC_019942	CTATC	2	10	231697	231706	20 %	40 %	0 %	40 %	432328196
168	NC_019942	TTTTA	2	10	233458	233467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019942	GAATA	2	10	234517	234526	60 %	20 %	20 %	0 %	432328200
170	NC_019942	AAAAG	2	10	235589	235598	80 %	0 %	20 %	0 %	432328200
171	NC_019942	GGAGA	2	10	236385	236394	40 %	0 %	60 %	0 %	432328201
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173	NC_019942	TCCAT	2	10	238163	238172	20 %	40 %	0 %	40 %	432328201
174	NC_019942	ATCCT	2	10	238302	238311	20 %	40 %	0 %	40 %	432328201
175	NC_019942	CAGCC	2	10	238450	238459	20 %	0 %	20 %	60 %	432328201
176	NC_019942	TATCG	2	10	238505	238514	20 %	40 %	20 %	20 %	432328201
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193	NC_019942	GGAAG	2	10	260773	260782	40 %	0 %	60 %	0 %	432328221
194	NC_019942	TCCTC	2	10	262772	262781	0 %	40 %	0 %	60 %	432328224
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196	NC_019942	CCTTG	2	10	267851	267860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_019942	TAGCT	2	10	267990	267999	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_019942	GAACG	2	10	271406	271415	40 %	0 %	40 %	20 %	432328231
199	NC_019942	CGATA	2	10	271495	271504	40 %	20 %	20 %	20 %	432328232
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212	NC_019942	ATGCC	2	10	287462	287471	20 %	20 %	20 %	40 %	432328247
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227	NC_019942	ACATA	2	10	311353	311362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
228	NC_019942	GAATA	2	10	311486	311495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
229	NC_019942	CTATG	2	10	312657	312666	20 %	40 %	20 %	20 %	432328272
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231	NC_019942	AAGGA	2	10	315559	315568	60 %	0 %	40 %	0 %	432328274
232	NC_019942	ATCCT	2	10	316737	316746	20 %	40 %	0 %	40 %	432328275
233	NC_019942	TTTGA	2	10	317595	317604	20 %	60 %	20 %	0 %	432328277
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239	NC_019942	TGCAG	2	10	323304	323313	20 %	20 %	40 %	20 %	432328282
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243	NC_019942	CTTTC	2	10	331054	331063	0 %	60 %	0 %	40 %	432328292
244	NC_019942	CACTG	2	10	334974	334983	20 %	20 %	20 %	40 %	432328298
245	NC_019942	CCACA	2	10	335240	335249	40 %	0 %	0 %	60 %	432328298
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247	NC_019942	GAGGT	2	10	338355	338364	20 %	20 %	60 %	0 %	432328303
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249	NC_019942	TCATA	2	10	340518	340527	40 %	40 %	0 %	20 %	432328305
250	NC_019942	ATGGC	2	10	341124	341133	20 %	20 %	40 %	20 %	432328307
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252	NC_019942	TCCCC	2	10	344162	344171	0 %	20 %	0 %	80 %	432328309
253	NC_019942	TTTAA	2	10	344752	344761	40 %	60 %	0 %	0 %	432328310
254	NC_019942	TACGG	2	10	344908	344917	20 %	20 %	40 %	20 %	432328310
255	NC_019942	CTTTT	2	10	345857	345866	0 %	80 %	0 %	20 %	432328311
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257	NC_019942	TCCTC	2	10	346004	346013	0 %	40 %	0 %	60 %	432328311
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259	NC_019942	AGGAG	2	10	347263	347272	40 %	0 %	60 %	0 %	432328312
260	NC_019942	GGAGA	2	10	347422	347431	40 %	0 %	60 %	0 %	432328312
261	NC_019942	AAAGG	2	10	348161	348170	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019942	CCTGT	2	10	351490	351499	0 %	40 %	20 %	40 %	432328317
263	NC_019942	CTTTT	2	10	351908	351917	0 %	80 %	0 %	20 %	432328318
264	NC_019942	ATTTC	2	10	352067	352076	20 %	60 %	0 %	20 %	432328318
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266	NC_019942	GAAGA	2	10	353708	353717	60 %	0 %	40 %	0 %	432328322
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380	NC_019942	CAGGG	2	10	509229	509238	20 %	0 %	60 %	20 %	432328492
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382	NC_019942	ATCGC	2	10	510650	510659	20 %	20 %	20 %	40 %	432328493
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384	NC_019942	CTTGG	2	10	513773	513782	0 %	40 %	40 %	20 %	432328497
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387	NC_019942	CAGGA	2	10	516187	516196	40 %	0 %	40 %	20 %	432328501
388	NC_019942	CTTTG	2	10	519015	519024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_019942	TCCGT	2	10	704725	704734	0 %	40 %	20 %	40 %	432328700
498	NC_019942	TCGAA	2	10	704981	704990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
499	NC_019942	TCGGA	2	10	704993	705002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_019942	ATTAT	2	10	706577	706586	40 %	60 %	0 %	0 %	432328702

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