MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019439	TTCTCA	2	12	1211	1222	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079099
2	NC_019439	CATATC	2	12	2148	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019439	TAAAGG	2	12	2460	2471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019439	GCTGTG	2	12	12959	12970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079104
5	NC_019439	GGGGTT	2	12	15767	15778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019439	TAGCAT	2	12	17170	17181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079109
7	NC_019439	CACAAA	2	12	17256	17267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079109
8	NC_019439	AAAGTG	2	12	18794	18805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079110
9	NC_019439	CCCTAG	2	12	23330	23341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019439	AGCTGT	2	12	23931	23942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414079117
11	NC_019439	ATCACC	2	12	24823	24834	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414079117
12	NC_019439	ACCGAA	2	12	25006	25017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079117
13	NC_019439	GATTAC	2	12	25480	25491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079117
14	NC_019439	ATACTG	2	12	25673	25684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079118
15	NC_019439	TAGATT	2	12	26555	26566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079119
16	NC_019439	ACAACC	2	12	26601	26612	50 %	0 %	0 %	50 %	414079119
17	NC_019439	AAACCA	2	12	29217	29228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079121
18	NC_019439	AGCCAT	2	12	29858	29869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079121
19	NC_019439	AAATTG	2	12	29973	29984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079121
20	NC_019439	ATTTTT	2	12	32254	32265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019439	AAAGTT	2	12	32683	32694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079125
22	NC_019439	GTTCCT	2	12	34177	34188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079126
23	NC_019439	GCTTCA	2	12	40197	40208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079129
24	NC_019439	TTACGA	2	12	45800	45811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079134
25	NC_019439	AAAACC	2	12	48869	48880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079138
26	NC_019439	ATTGTG	2	12	52154	52165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079142
27	NC_019439	ATAGCT	2	12	52750	52761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079142
28	NC_019439	ACTTCG	2	12	56034	56045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019439	TCAGAA	2	12	58367	58378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079145
30	NC_019439	ATTTAC	2	12	60324	60335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079145
31	NC_019439	AAAGAT	2	12	60893	60904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414079145
32	NC_019439	AACAAT	2	12	61340	61351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019439	AACAAT	2	12	61421	61432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019439	AACAAT	2	12	61502	61513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019439	AACAAT	2	12	61584	61595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019439	GTATCA	2	12	61974	61985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079146
37	NC_019439	AAATCA	2	12	63927	63938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079147
38	NC_019439	TTAATT	2	12	66366	66377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079148
39	NC_019439	TTTTGA	2	12	72306	72317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414079152
40	NC_019439	GCAGAA	2	12	74650	74661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079156
41	NC_019439	ACCGTT	2	12	74698	74709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079156
42	NC_019439	CGGGTT	2	12	75695	75706	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079156
43	NC_019439	AATTGA	2	12	76173	76184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079156
44	NC_019439	AGATAA	2	12	78362	78373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414079158
45	NC_019439	TATAAA	2	12	79413	79424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019439	GAAAAA	2	12	79866	79877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079161
47	NC_019439	TCTAAT	2	12	81800	81811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079164
48	NC_019439	AAGAAA	2	12	83919	83930	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079166
49	NC_019439	TGGGCT	2	12	86448	86459	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079169
50	NC_019439	CAGAAT	2	12	87096	87107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079170
51	NC_019439	CCAGAA	2	12	92440	92451	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079174
52	NC_019439	GGGAAA	2	12	95948	95959	50 %	0 %	50 %	0 %	414079175
53	NC_019439	CAGAAA	2	12	98472	98483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414079179
54	NC_019439	TACCCA	2	12	99543	99554	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414079179
55	NC_019439	TAGCCT	2	12	99582	99593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079179
56	NC_019439	AACTCA	2	12	99660	99671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414079179
57	NC_019439	CGAAAG	2	12	101424	101435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079181
58	NC_019439	GTTGAA	2	12	101835	101846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079182
59	NC_019439	AATTAG	2	12	102834	102845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019439	TGGTAA	2	12	105755	105766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079184
61	NC_019439	GGCATC	2	12	107093	107104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414079184
62	NC_019439	GTGATT	2	12	114656	114667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079191
63	NC_019439	AAAGAC	2	12	116034	116045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414079193
64	NC_019439	AATCTC	2	12	116592	116603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079193
65	NC_019439	AGGTTT	2	12	117028	117039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079193
66	NC_019439	TCCAAT	2	12	117942	117953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079194
67	NC_019439	CTAATT	2	12	122566	122577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079198
68	NC_019439	GGAAAT	2	12	123575	123586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079198
69	NC_019439	GCTAAA	2	12	123899	123910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079199
70	NC_019439	AATTTC	2	12	124918	124929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019439	TCAAAA	2	12	127162	127173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019439	ATTAGC	2	12	127466	127477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019439	AAAAGA	2	12	127844	127855	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019439	TAGGTT	2	12	128029	128040	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019439	ATCGAA	2	12	130162	130173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079205
76	NC_019439	ATAGGT	2	12	131878	131889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079207
77	NC_019439	GGTTTG	2	12	132379	132390	0 %	50 %	50 %	0 %	414079207
78	NC_019439	CAATTG	2	12	134157	134168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079209
79	NC_019439	CAGATA	2	12	134358	134369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079209
80	NC_019439	CTACAG	2	12	134393	134404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079209
81	NC_019439	ATAGTA	2	12	136383	136394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079209
82	NC_019439	TAGTAA	2	12	138217	138228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079210
83	NC_019439	AAATAC	2	12	138715	138726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079210
84	NC_019439	TGGAAT	2	12	142031	142042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079214
85	NC_019439	CTTCAC	2	12	144388	144399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414079217
86	NC_019439	TCTAAT	2	12	144549	144560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079217
87	NC_019439	TAGCAG	2	12	151024	151035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414079221
88	NC_019439	AATATG	2	12	152895	152906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019439	AAAACT	2	12	155739	155750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079224
90	NC_019439	GCGGTA	2	12	160596	160607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414079228
91	NC_019439	ACCAAA	2	12	163324	163335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079230
92	NC_019439	GAATTG	2	12	166934	166945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079232
93	NC_019439	TCTACT	2	12	168194	168205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079233
94	NC_019439	TCAGCT	2	12	171479	171490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079237
95	NC_019439	CTACAT	2	12	172284	172295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079237
96	NC_019439	CCAGAA	2	12	174667	174678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079239
97	NC_019439	ATTAAT	2	12	176855	176866	50 %	50 %	0 %	0 %	414079241
98	NC_019439	AGTTAA	2	12	181445	181456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019439	AATAAC	2	12	181976	181987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079247
100	NC_019439	ATTTCT	2	12	182649	182660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019439	ATTTTT	2	12	182661	182672	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019439	TAGATA	2	12	184199	184210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079249
103	NC_019439	AAAAGA	2	12	188126	188137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079250
104	NC_019439	AAATAT	2	12	192866	192877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019439	ATGAAG	2	12	193500	193511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079254
106	NC_019439	TTAAAT	2	12	194535	194546	50 %	50 %	0 %	0 %	414079255
107	NC_019439	AATTGA	2	12	200403	200414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079258
108	NC_019439	AAGTTT	2	12	202244	202255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079259
109	NC_019439	AAAAGA	2	12	205781	205792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079261
110	NC_019439	GGAAAT	2	12	205844	205855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079261
111	NC_019439	ACCAAA	2	12	216253	216264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079274
112	NC_019439	GGTGAT	2	12	217989	218000	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079275
113	NC_019439	CTGGTG	2	12	218593	218604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079276
114	NC_019439	ATGTAT	2	12	219298	219309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079277
115	NC_019439	TTAAAT	2	12	219852	219863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019439	TTCTAA	2	12	224849	224860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079281
117	NC_019439	ATAGCT	2	12	225921	225932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079282
118	NC_019439	TGGTAA	2	12	227248	227259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079283
119	NC_019439	CAATGG	2	12	231931	231942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414079287
120	NC_019439	TAAAAC	2	12	235229	235240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079291
121	NC_019439	ATGTTC	2	12	236015	236026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414079291
122	NC_019439	ATTGGG	2	12	237751	237762	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079293
123	NC_019439	AGTTTT	2	12	238261	238272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019439	ACCAGA	2	12	239521	239532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079294
125	NC_019439	CAATTA	2	12	243852	243863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079296
126	NC_019439	TAGAAT	2	12	247417	247428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079299
127	NC_019439	CCACTT	2	12	251058	251069	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414079301
128	NC_019439	CAGTTA	2	12	251452	251463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019439	TTAGAA	2	12	254058	254069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079303
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132	NC_019439	AAAAAT	2	12	255688	255699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414079304
133	NC_019439	TAGATT	2	12	255710	255721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079304
134	NC_019439	TGGAGA	2	12	255805	255816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414079305
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136	NC_019439	GAACCA	2	12	257106	257117	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079306
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138	NC_019439	AACCTA	2	12	258326	258337	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019439	ATATTT	2	12	260800	260811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019439	CCACAG	2	12	262218	262229	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414079310
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144	NC_019439	AAAATA	2	12	274951	274962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019439	AATCAA	2	12	275000	275011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079324
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148	NC_019439	TAGTGC	2	12	280582	280593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414079333
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153	NC_019439	TTTTGA	2	12	286276	286287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_019439	CCAACT	2	12	288558	288569	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_019439	TACTTG	2	12	293412	293423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414079346
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229	NC_019439	ATGTAA	2	12	469615	469626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_019439	TTTCTG	2	12	474984	474995	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414079501
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238	NC_019439	TGAATC	2	12	485186	485197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079511
239	NC_019439	CATTTA	2	12	485278	485289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079511
240	NC_019439	GGACAA	2	12	486593	486604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079514
241	NC_019439	AGAATT	2	12	490091	490102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079517
242	NC_019439	AAGAAC	2	12	491360	491371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414079517
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245	NC_019439	CTGTAC	2	12	498087	498098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_019439	AGATGA	2	12	504111	504122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079528
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250	NC_019439	AATAGA	2	12	511023	511034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019439	TAAAAT	2	12	511277	511288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019439	GATTTA	2	12	512158	512169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079533
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259	NC_019439	TCTCTT	2	12	526940	526951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_019439	ATTGAG	2	12	529204	529215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079548
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264	NC_019439	ACTCTG	2	12	539158	539169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079558
265	NC_019439	AAGAGT	2	12	540411	540422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079558
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276	NC_019439	AATCTG	2	12	557928	557939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079572
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280	NC_019439	CCAACC	2	12	566867	566878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079583
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317	NC_019439	AATACT	2	12	649071	649082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079655
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324	NC_019439	CCTACT	2	12	661639	661650	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
325	NC_019439	CCGCAG	2	12	661863	661874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414079664
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337	NC_019439	CAATGT	2	12	692554	692565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079689
338	NC_019439	TCAAAA	2	12	693249	693260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
339	NC_019439	CGATGC	2	12	694827	694838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
340	NC_019439	AGAACG	2	12	696575	696586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079692
341	NC_019439	CTAAAA	2	12	697062	697073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079692
342	NC_019439	CATCTT	2	12	697231	697242	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079692
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345	NC_019439	GTCCTT	2	12	703385	703396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079696
346	NC_019439	AATTCA	2	12	704473	704484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079697
347	NC_019439	TTTCAA	2	12	704771	704782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079697
348	NC_019439	CTGGGG	2	12	707589	707600	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	414079700
349	NC_019439	TCCATA	2	12	708370	708381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079701
350	NC_019439	TGTAAC	2	12	712633	712644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079704
351	NC_019439	CTTTGA	2	12	715536	715547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414079706
352	NC_019439	GATTTC	2	12	715879	715890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
353	NC_019439	ATCTTT	2	12	721793	721804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414079711
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.