MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	AG	3	6	827	832	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
2	NC_019394	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	410863775
3	NC_019394	GA	3	6	1134	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
4	NC_019394	CG	3	6	2643	2648	0 %	0 %	50 %	50 %	410863778
5	NC_019394	AT	3	6	3333	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	410863780
6	NC_019394	TG	3	6	6025	6030	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
7	NC_019394	GT	3	6	6042	6047	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
8	NC_019394	TA	3	6	6085	6090	50 %	50 %	0 %	0 %	410863786
9	NC_019394	GC	3	6	7901	7906	0 %	0 %	50 %	50 %	410863789
10	NC_019394	TG	3	6	8064	8069	0 %	50 %	50 %	0 %	410863790
11	NC_019394	TC	3	6	8180	8185	0 %	50 %	0 %	50 %	410863790
12	NC_019394	AG	3	6	8297	8302	50 %	0 %	50 %	0 %	410863790
13	NC_019394	AG	3	6	9221	9226	50 %	0 %	50 %	0 %	410863791
14	NC_019394	AG	3	6	9799	9804	50 %	0 %	50 %	0 %	410863791
15	NC_019394	AC	3	6	11213	11218	50 %	0 %	0 %	50 %	410863793
16	NC_019394	TG	3	6	12125	12130	0 %	50 %	50 %	0 %	410863794
17	NC_019394	AG	3	6	14201	14206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019394	CT	4	8	14217	14224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019394	CA	3	6	14656	14661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019394	AG	3	6	14917	14922	50 %	0 %	50 %	0 %	410863797
21	NC_019394	CT	3	6	14958	14963	0 %	50 %	0 %	50 %	410863797
22	NC_019394	TC	4	8	16947	16954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019394	AT	3	6	17223	17228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019394	TA	3	6	17421	17426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019394	AT	3	6	17637	17642	50 %	50 %	0 %	0 %	410863800
26	NC_019394	AG	4	8	17695	17702	50 %	0 %	50 %	0 %	410863801
27	NC_019394	GC	3	6	17723	17728	0 %	0 %	50 %	50 %	410863801
28	NC_019394	AG	3	6	17812	17817	50 %	0 %	50 %	0 %	410863801
29	NC_019394	CA	3	6	17995	18000	50 %	0 %	0 %	50 %	410863801
30	NC_019394	AC	3	6	18091	18096	50 %	0 %	0 %	50 %	410863801
31	NC_019394	AG	3	6	18424	18429	50 %	0 %	50 %	0 %	410863802
32	NC_019394	CA	3	6	18623	18628	50 %	0 %	0 %	50 %	410863802
33	NC_019394	TC	3	6	19062	19067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019394	GA	3	6	19188	19193	50 %	0 %	50 %	0 %	410863803
35	NC_019394	AT	3	6	19720	19725	50 %	50 %	0 %	0 %	410863803
36	NC_019394	AG	3	6	20070	20075	50 %	0 %	50 %	0 %	410863803
37	NC_019394	CA	3	6	20212	20217	50 %	0 %	0 %	50 %	410863804
38	NC_019394	CA	3	6	20833	20838	50 %	0 %	0 %	50 %	410863804
39	NC_019394	TC	3	6	22043	22048	0 %	50 %	0 %	50 %	410863806
40	NC_019394	TC	5	10	22365	22374	0 %	50 %	0 %	50 %	410863806
41	NC_019394	AG	3	6	23692	23697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019394	TA	3	6	25215	25220	50 %	50 %	0 %	0 %	410863811
43	NC_019394	GA	3	6	27134	27139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019394	CT	3	6	27746	27751	0 %	50 %	0 %	50 %	410863816
45	NC_019394	TA	3	6	27782	27787	50 %	50 %	0 %	0 %	410863816
46	NC_019394	AG	3	6	28691	28696	50 %	0 %	50 %	0 %	410863818
47	NC_019394	CT	3	6	29444	29449	0 %	50 %	0 %	50 %	410863820
48	NC_019394	AT	3	6	29510	29515	50 %	50 %	0 %	0 %	410863820
49	NC_019394	GA	3	6	30245	30250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019394	AC	3	6	31585	31590	50 %	0 %	0 %	50 %	410863823
51	NC_019394	GA	3	6	31898	31903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019394	GC	3	6	32916	32921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019394	AC	3	6	33912	33917	50 %	0 %	0 %	50 %	410863827
54	NC_019394	CT	3	6	34610	34615	0 %	50 %	0 %	50 %	410863829
55	NC_019394	AG	3	6	35002	35007	50 %	0 %	50 %	0 %	410863830
56	NC_019394	TC	3	6	35406	35411	0 %	50 %	0 %	50 %	410863830
57	NC_019394	TA	4	8	35972	35979	50 %	50 %	0 %	0 %	410863831
58	NC_019394	GT	3	6	36378	36383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019394	TG	3	6	37920	37925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019394	CA	3	6	39113	39118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019394	TA	4	8	39296	39303	50 %	50 %	0 %	0 %	410863836
62	NC_019394	TC	3	6	40649	40654	0 %	50 %	0 %	50 %	410863837
63	NC_019394	TG	3	6	40725	40730	0 %	50 %	50 %	0 %	410863837
64	NC_019394	AG	3	6	44341	44346	50 %	0 %	50 %	0 %	410863841
65	NC_019394	AT	3	6	44349	44354	50 %	50 %	0 %	0 %	410863841
66	NC_019394	TC	3	6	44806	44811	0 %	50 %	0 %	50 %	410863841
67	NC_019394	GA	3	6	45235	45240	50 %	0 %	50 %	0 %	410863841
68	NC_019394	GA	3	6	45435	45440	50 %	0 %	50 %	0 %	410863842
69	NC_019394	CA	3	6	46200	46205	50 %	0 %	0 %	50 %	410863843
70	NC_019394	TA	3	6	47374	47379	50 %	50 %	0 %	0 %	410863845
71	NC_019394	TA	4	8	47802	47809	50 %	50 %	0 %	0 %	410863845
72	NC_019394	GT	3	6	48889	48894	0 %	50 %	50 %	0 %	410863846
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78	NC_019394	CT	3	6	54146	54151	0 %	50 %	0 %	50 %	410863851
79	NC_019394	CT	3	6	56213	56218	0 %	50 %	0 %	50 %	410863853
80	NC_019394	AG	3	6	56481	56486	50 %	0 %	50 %	0 %	410863853
81	NC_019394	CT	3	6	57394	57399	0 %	50 %	0 %	50 %	410863854
82	NC_019394	AT	3	6	57770	57775	50 %	50 %	0 %	0 %	410863854
83	NC_019394	AT	3	6	59001	59006	50 %	50 %	0 %	0 %	410863854
84	NC_019394	GT	3	6	59699	59704	0 %	50 %	50 %	0 %	410863855
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99	NC_019394	TA	3	6	71940	71945	50 %	50 %	0 %	0 %	410863859
100	NC_019394	TA	4	8	73573	73580	50 %	50 %	0 %	0 %	410863859
101	NC_019394	TA	3	6	73632	73637	50 %	50 %	0 %	0 %	410863859
102	NC_019394	AT	3	6	74465	74470	50 %	50 %	0 %	0 %	410863859
103	NC_019394	TA	3	6	74597	74602	50 %	50 %	0 %	0 %	410863859
104	NC_019394	CT	3	6	75356	75361	0 %	50 %	0 %	50 %	410863859
105	NC_019394	CT	3	6	75509	75514	0 %	50 %	0 %	50 %	410863859
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108	NC_019394	TG	3	6	76691	76696	0 %	50 %	50 %	0 %	410863860
109	NC_019394	AG	3	6	76708	76713	50 %	0 %	50 %	0 %	410863860
110	NC_019394	AG	3	6	76812	76817	50 %	0 %	50 %	0 %	410863860
111	NC_019394	GT	3	6	77292	77297	0 %	50 %	50 %	0 %	410863860
112	NC_019394	AT	3	6	77477	77482	50 %	50 %	0 %	0 %	410863860
113	NC_019394	TC	3	6	78461	78466	0 %	50 %	0 %	50 %	410863861
114	NC_019394	TG	3	6	79005	79010	0 %	50 %	50 %	0 %	410863862
115	NC_019394	TC	3	6	79102	79107	0 %	50 %	0 %	50 %	410863862
116	NC_019394	CA	3	6	79247	79252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019394	GT	3	6	79334	79339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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120	NC_019394	AT	3	6	80762	80767	50 %	50 %	0 %	0 %	410863865
121	NC_019394	TA	3	6	80928	80933	50 %	50 %	0 %	0 %	410863865
122	NC_019394	CT	3	6	81664	81669	0 %	50 %	0 %	50 %	410863866
123	NC_019394	TG	3	6	82094	82099	0 %	50 %	50 %	0 %	410863867
124	NC_019394	GA	3	6	83081	83086	50 %	0 %	50 %	0 %	410863867
125	NC_019394	AT	3	6	83344	83349	50 %	50 %	0 %	0 %	410863867
126	NC_019394	TA	3	6	86197	86202	50 %	50 %	0 %	0 %	410863867
127	NC_019394	AG	3	6	88109	88114	50 %	0 %	50 %	0 %	410863868
128	NC_019394	AT	3	6	90560	90565	50 %	50 %	0 %	0 %	410863872
129	NC_019394	TA	3	6	91435	91440	50 %	50 %	0 %	0 %	410863872
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132	NC_019394	GT	3	6	94612	94617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_019394	AT	3	6	95584	95589	50 %	50 %	0 %	0 %	410863875
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136	NC_019394	TA	3	6	96852	96857	50 %	50 %	0 %	0 %	410863876
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140	NC_019394	AG	3	6	98893	98898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.