MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 48934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018690	TAC	2	6	47443	47448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691642
1003	NC_018690	ATC	2	6	47524	47529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691642
1004	NC_018690	CAA	2	6	47614	47619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691642
1005	NC_018690	T	6	6	47654	47659	0 %	100 %	0 %	0 %	407691642
1006	NC_018690	T	6	6	47665	47670	0 %	100 %	0 %	0 %	407691642
1007	NC_018690	GCA	2	6	47681	47686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691642
1008	NC_018690	AGA	2	6	47724	47729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691642
1009	NC_018690	TCT	2	6	47738	47743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691642
1010	NC_018690	TCA	2	6	47798	47803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691642
1011	NC_018690	A	6	6	47861	47866	100 %	0 %	0 %	0 %	407691642
1012	NC_018690	TA	3	6	47890	47895	50 %	50 %	0 %	0 %	407691642
1013	NC_018690	AAT	2	6	48007	48012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691642
1014	NC_018690	GGT	2	6	48061	48066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691642
1015	NC_018690	ATG	2	6	48132	48137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691642
1016	NC_018690	AGG	2	6	48164	48169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407691642
1017	NC_018690	T	6	6	48178	48183	0 %	100 %	0 %	0 %	407691642
1018	NC_018690	TTA	2	6	48208	48213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691643
1019	NC_018690	T	6	6	48279	48284	0 %	100 %	0 %	0 %	407691643
1020	NC_018690	CTT	2	6	48332	48337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691643
1021	NC_018690	CAA	2	6	48413	48418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691643
1022	NC_018690	CTT	2	6	48439	48444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691643
1023	NC_018690	CT	3	6	48466	48471	0 %	50 %	0 %	50 %	407691643
1024	NC_018690	AAT	2	6	48546	48551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691643
1025	NC_018690	TTAAT	2	10	48563	48572	40 %	60 %	0 %	0 %	407691643
1026	NC_018690	AT	3	6	48659	48664	50 %	50 %	0 %	0 %	407691643
1027	NC_018690	TCA	2	6	48736	48741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691643
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1030	NC_018690	ACC	3	9	48846	48854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691643
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1033	NC_018690	A	6	6	48998	49003	100 %	0 %	0 %	0 %	407691643
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1035	NC_018690	ATTA	2	8	49078	49085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018690	T	7	7	49126	49132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018690	TCT	2	6	49134	49139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_018690	ATT	2	6	49167	49172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018690	CTG	2	6	49238	49243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018690	GGC	2	6	49252	49257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_018690	T	6	6	49263	49268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018690	AATA	2	8	49302	49309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018690	TAT	2	6	49320	49325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018690	AAAT	2	8	49387	49394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018690	TGT	2	6	49407	49412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018690	T	6	6	49424	49429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018690	ATA	2	6	49438	49443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018690	ATT	2	6	49450	49455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018690	T	7	7	49454	49460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018690	TGG	2	6	49582	49587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691644
1051	NC_018690	ATT	2	6	49621	49626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691644
1052	NC_018690	T	6	6	49767	49772	0 %	100 %	0 %	0 %	407691644
1053	NC_018690	AAAAT	2	10	49776	49785	80 %	20 %	0 %	0 %	407691644
1054	NC_018690	AAT	2	6	49859	49864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691644
1055	NC_018690	GAA	2	6	49889	49894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691644
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1057	NC_018690	TGG	2	6	49990	49995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691644
1058	NC_018690	AT	3	6	50023	50028	50 %	50 %	0 %	0 %	407691644
1059	NC_018690	AC	3	6	50234	50239	50 %	0 %	0 %	50 %	407691644
1060	NC_018690	ATG	2	6	50525	50530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691644
1061	NC_018690	A	7	7	50550	50556	100 %	0 %	0 %	0 %	407691644
1062	NC_018690	ATT	2	6	50581	50586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691644
1063	NC_018690	T	6	6	50625	50630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018690	ATG	2	6	50650	50655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018690	AAAAG	2	10	50702	50711	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018690	A	6	6	50713	50718	100 %	0 %	0 %	0 %	407691645
1067	NC_018690	CGC	2	6	50885	50890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691645
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1069	NC_018690	GCA	2	6	50934	50939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691645
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1075	NC_018690	TATCG	2	10	51192	51201	20 %	40 %	20 %	20 %	407691645
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1081	NC_018690	TA	3	6	51445	51450	50 %	50 %	0 %	0 %	407691645
1082	NC_018690	ATTT	2	8	51488	51495	25 %	75 %	0 %	0 %	407691645
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1092	NC_018690	TAT	2	6	51912	51917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691645
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1094	NC_018690	ATGTTG	2	12	51957	51968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407691645
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1096	NC_018690	ATT	2	6	52094	52099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_018690	ATA	2	6	52201	52206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691646
1099	NC_018690	ATT	2	6	52222	52227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691646
1100	NC_018690	CATCTT	2	12	52353	52364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407691646
1101	NC_018690	AGCG	2	8	52530	52537	25 %	0 %	50 %	25 %	407691646
1102	NC_018690	AGC	2	6	52558	52563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691646
1103	NC_018690	CAT	2	6	52641	52646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691646
1104	NC_018690	CTTG	2	8	52649	52656	0 %	50 %	25 %	25 %	407691646
1105	NC_018690	ATT	2	6	52720	52725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691646
1106	NC_018690	CGTAA	2	10	52959	52968	40 %	20 %	20 %	20 %	407691646
1107	NC_018690	ATC	2	6	53003	53008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691646
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1109	NC_018690	ATT	2	6	53041	53046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691646
1110	NC_018690	AATG	2	8	53128	53135	50 %	25 %	25 %	0 %	407691646
1111	NC_018690	GTT	2	6	53174	53179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691646
1112	NC_018690	ATC	2	6	53218	53223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691646
1113	NC_018690	TTC	2	6	53240	53245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691646
1114	NC_018690	TAA	2	6	53274	53279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691646
1115	NC_018690	AT	3	6	53297	53302	50 %	50 %	0 %	0 %	407691646
1116	NC_018690	GTT	2	6	53324	53329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691646
1117	NC_018690	CAC	2	6	53418	53423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691646
1118	NC_018690	GAT	2	6	53457	53462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691646
1119	NC_018690	GAAA	2	8	53593	53600	75 %	0 %	25 %	0 %	407691646
1120	NC_018690	CAT	2	6	53655	53660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691646
1121	NC_018690	ATTTA	2	10	53677	53686	40 %	60 %	0 %	0 %	407691646
1122	NC_018690	AAT	2	6	53830	53835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691646
1123	NC_018690	GAT	2	6	53870	53875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691646
1124	NC_018690	T	7	7	54014	54020	0 %	100 %	0 %	0 %	407691646
1125	NC_018690	ACA	2	6	54071	54076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691646
1126	NC_018690	ATT	2	6	54221	54226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018690	ATTGT	2	10	54237	54246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018690	TAAATT	2	12	54270	54281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018690	A	6	6	54321	54326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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