MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 35939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31003	NC_018644	CAGT	2	8	1225310	1225317	25 %	25 %	25 %	25 %	406708337
31004	NC_018644	CT	4	8	1225347	1225354	0 %	50 %	0 %	50 %	406708337
31005	NC_018644	TCCA	2	8	1225359	1225366	25 %	25 %	0 %	50 %	406708337
31006	NC_018644	CTT	2	6	1225383	1225388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708337
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31009	NC_018644	TCA	2	6	1225433	1225438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708337
31010	NC_018644	CAT	2	6	1225527	1225532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708337
31011	NC_018644	CCA	2	6	1225637	1225642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708337
31012	NC_018644	TCTTCC	2	12	1225666	1225677	0 %	50 %	0 %	50 %	406708337
31013	NC_018644	A	6	6	1225704	1225709	100 %	0 %	0 %	0 %	406708337
31014	NC_018644	T	6	6	1225710	1225715	0 %	100 %	0 %	0 %	406708337
31015	NC_018644	CAT	2	6	1225767	1225772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708337
31016	NC_018644	AT	3	6	1225828	1225833	50 %	50 %	0 %	0 %	406708337
31017	NC_018644	ACA	2	6	1225865	1225870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708337
31018	NC_018644	A	6	6	1225892	1225897	100 %	0 %	0 %	0 %	406708337
31019	NC_018644	TAC	2	6	1225917	1225922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708337
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31021	NC_018644	TA	3	6	1226030	1226035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31023	NC_018644	A	7	7	1226061	1226067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_018644	A	6	6	1226100	1226105	100 %	0 %	0 %	0 %	406708338
31025	NC_018644	CTTC	2	8	1226117	1226124	0 %	50 %	0 %	50 %	406708338
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31053	NC_018644	TAA	2	6	1227195	1227200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708339
31054	NC_018644	TTA	2	6	1227236	1227241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708339
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31056	NC_018644	T	6	6	1227364	1227369	0 %	100 %	0 %	0 %	406708339
31057	NC_018644	ATA	2	6	1227415	1227420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31058	NC_018644	TTGG	2	8	1227445	1227452	0 %	50 %	50 %	0 %	406708340
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31103	NC_018644	AAAT	2	8	1229798	1229805	75 %	25 %	0 %	0 %	406708341
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31111	NC_018644	A	7	7	1230097	1230103	100 %	0 %	0 %	0 %	406708341
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31119	NC_018644	CGA	2	6	1230636	1230641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708342
31120	NC_018644	ATAA	2	8	1230728	1230735	75 %	25 %	0 %	0 %	406708342
31121	NC_018644	TCC	2	6	1230742	1230747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708342
31122	NC_018644	TCC	2	6	1230769	1230774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708342
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31129	NC_018644	AAT	2	6	1230970	1230975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708342
31130	NC_018644	TAAT	2	8	1230983	1230990	50 %	50 %	0 %	0 %	406708342
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31162	NC_018644	ATA	2	6	1232124	1232129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708342
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31218	NC_018644	TAT	2	6	1234227	1234232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31219	NC_018644	ATT	2	6	1234256	1234261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31220	NC_018644	A	6	6	1234277	1234282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31221	NC_018644	A	6	6	1234310	1234315	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31222	NC_018644	A	6	6	1234318	1234323	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31223	NC_018644	TAA	2	6	1234361	1234366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708345
31224	NC_018644	A	10	10	1234383	1234392	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31225	NC_018644	CAA	2	6	1234450	1234455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708345
31226	NC_018644	GAT	2	6	1234510	1234515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708345
31227	NC_018644	A	7	7	1234530	1234536	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31228	NC_018644	A	7	7	1234541	1234547	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31229	NC_018644	AT	4	8	1234553	1234560	50 %	50 %	0 %	0 %	406708345
31230	NC_018644	TA	3	6	1234597	1234602	50 %	50 %	0 %	0 %	406708345
31231	NC_018644	TAA	2	6	1234629	1234634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708345
31232	NC_018644	GAAT	2	8	1234703	1234710	50 %	25 %	25 %	0 %	406708345
31233	NC_018644	GAA	2	6	1234729	1234734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708345
31234	NC_018644	A	6	6	1234764	1234769	100 %	0 %	0 %	0 %	406708345
31235	NC_018644	CAG	2	6	1234799	1234804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708345
31236	NC_018644	TAA	2	6	1234857	1234862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708345
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31238	NC_018644	TCA	2	6	1234894	1234899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708345
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31330	NC_018644	ACA	2	6	1238757	1238762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708347
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31332	NC_018644	TA	3	6	1238807	1238812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31333	NC_018644	AAG	2	6	1238838	1238843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708348
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31336	NC_018644	GAC	2	6	1239180	1239185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708348
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31338	NC_018644	CT	3	6	1239228	1239233	0 %	50 %	0 %	50 %	406708348
31339	NC_018644	TG	3	6	1239246	1239251	0 %	50 %	50 %	0 %	406708348
31340	NC_018644	CTT	2	6	1239275	1239280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708348
31341	NC_018644	TTC	2	6	1239303	1239308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708348
31342	NC_018644	ATTT	2	8	1239345	1239352	25 %	75 %	0 %	0 %	406708348
31343	NC_018644	ATAG	2	8	1239390	1239397	50 %	25 %	25 %	0 %	406708348
31344	NC_018644	TAT	3	9	1239410	1239418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708348
31345	NC_018644	TAA	2	6	1239456	1239461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708348
31346	NC_018644	T	6	6	1239484	1239489	0 %	100 %	0 %	0 %	406708348
31347	NC_018644	T	6	6	1239526	1239531	0 %	100 %	0 %	0 %	406708348
31348	NC_018644	ATT	2	6	1239544	1239549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708348
31349	NC_018644	AG	3	6	1239622	1239627	50 %	0 %	50 %	0 %	406708348
31350	NC_018644	TCA	2	6	1239682	1239687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708348
31351	NC_018644	ATA	2	6	1239832	1239837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708349
31352	NC_018644	GGT	2	6	1239853	1239858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708349
31353	NC_018644	AAT	2	6	1239918	1239923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708349
31354	NC_018644	ATA	2	6	1239949	1239954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708349
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31475	NC_018644	ATG	2	6	1245526	1245531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708353
31476	NC_018644	ACA	2	6	1245545	1245550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708353
31477	NC_018644	AAT	2	6	1245613	1245618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708353
31478	NC_018644	GTTG	2	8	1245620	1245627	0 %	50 %	50 %	0 %	406708353
31479	NC_018644	CA	3	6	1245635	1245640	50 %	0 %	0 %	50 %	406708353
31480	NC_018644	AAT	2	6	1245654	1245659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708353
31481	NC_018644	ATT	2	6	1245721	1245726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708353
31482	NC_018644	A	6	6	1245870	1245875	100 %	0 %	0 %	0 %	406708353
31483	NC_018644	AATA	2	8	1245906	1245913	75 %	25 %	0 %	0 %	406708353
31484	NC_018644	A	7	7	1245975	1245981	100 %	0 %	0 %	0 %	406708353
31485	NC_018644	TAA	2	6	1245984	1245989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708353
31486	NC_018644	A	7	7	1246113	1246119	100 %	0 %	0 %	0 %	406708353
31487	NC_018644	AAT	2	6	1246125	1246130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708353
31488	NC_018644	CGA	2	6	1246224	1246229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708353
31489	NC_018644	A	6	6	1246303	1246308	100 %	0 %	0 %	0 %	406708353
31490	NC_018644	ATT	2	6	1246327	1246332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708353
31491	NC_018644	A	7	7	1246348	1246354	100 %	0 %	0 %	0 %	406708353
31492	NC_018644	T	10	10	1246365	1246374	0 %	100 %	0 %	0 %	406708353
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31494	NC_018644	TAT	2	6	1246436	1246441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708354
31495	NC_018644	TAT	3	9	1246467	1246475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708354
31496	NC_018644	CAA	2	6	1246488	1246493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708354
31497	NC_018644	TCA	2	6	1246547	1246552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708354
31498	NC_018644	GCA	2	6	1246661	1246666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708354
31499	NC_018644	CAA	2	6	1246725	1246730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708354
31500	NC_018644	GAG	2	6	1246761	1246766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708354

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