MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 1364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	CAAAG	2	10	744	753	60 %	0 %	20 %	20 %	406705599
2	NC_018643	AGAAA	2	10	770	779	80 %	0 %	20 %	0 %	406705599
3	NC_018643	AGGAC	2	10	2790	2799	40 %	0 %	40 %	20 %	406705601
4	NC_018643	AAGAA	2	10	3582	3591	80 %	0 %	20 %	0 %	406705602
5	NC_018643	ATAAA	2	10	5923	5932	80 %	20 %	0 %	0 %	406705603
6	NC_018643	TTTTA	2	10	6090	6099	20 %	80 %	0 %	0 %	406705603
7	NC_018643	TTAGA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	20 %	0 %	406705604
8	NC_018643	GTTAA	2	10	8238	8247	40 %	40 %	20 %	0 %	406705605
9	NC_018643	TAGAA	2	10	8638	8647	60 %	20 %	20 %	0 %	406705606
10	NC_018643	GATTT	2	10	9117	9126	20 %	60 %	20 %	0 %	406705606
11	NC_018643	GAAAA	2	10	9408	9417	80 %	0 %	20 %	0 %	406705606
12	NC_018643	ATTTT	2	10	11051	11060	20 %	80 %	0 %	0 %	406705608
13	NC_018643	ATTAT	2	10	11386	11395	40 %	60 %	0 %	0 %	406705609
14	NC_018643	TAATT	2	10	12953	12962	40 %	60 %	0 %	0 %	406705610
15	NC_018643	ATGGA	2	10	15390	15399	40 %	20 %	40 %	0 %	406705612
16	NC_018643	AATTA	2	10	17298	17307	60 %	40 %	0 %	0 %	406705614
17	NC_018643	GATGT	2	10	17444	17453	20 %	40 %	40 %	0 %	406705614
18	NC_018643	AATTA	2	10	22197	22206	60 %	40 %	0 %	0 %	406705617
19	NC_018643	TTTAT	2	10	24524	24533	20 %	80 %	0 %	0 %	406705619
20	NC_018643	TAATT	2	10	25039	25048	40 %	60 %	0 %	0 %	406705620
21	NC_018643	TAAAT	2	10	25198	25207	60 %	40 %	0 %	0 %	406705620
22	NC_018643	TTAAA	2	10	26529	26538	60 %	40 %	0 %	0 %	406705620
23	NC_018643	AAAAT	2	10	26550	26559	80 %	20 %	0 %	0 %	406705620
24	NC_018643	AAAAT	2	10	27286	27295	80 %	20 %	0 %	0 %	406705621
25	NC_018643	GGAAG	2	10	28288	28297	40 %	0 %	60 %	0 %	406705622
26	NC_018643	GATCT	2	10	28640	28649	20 %	40 %	20 %	20 %	406705622
27	NC_018643	AGCAC	2	10	29960	29969	40 %	0 %	20 %	40 %	406705624
28	NC_018643	TGACT	2	10	30758	30767	20 %	40 %	20 %	20 %	406705624
29	NC_018643	TTTAC	2	10	34472	34481	20 %	60 %	0 %	20 %	406705630
30	NC_018643	TATTT	2	10	34909	34918	20 %	80 %	0 %	0 %	406705630
31	NC_018643	AATTA	2	10	35182	35191	60 %	40 %	0 %	0 %	406705630
32	NC_018643	TACAT	2	10	38266	38275	40 %	40 %	0 %	20 %	406705635
33	NC_018643	TTTAA	2	10	38780	38789	40 %	60 %	0 %	0 %	406705635
34	NC_018643	ATTTT	2	10	38921	38930	20 %	80 %	0 %	0 %	406705635
35	NC_018643	TCTTT	2	10	40517	40526	0 %	80 %	0 %	20 %	406705637
36	NC_018643	TTTTA	2	10	41451	41460	20 %	80 %	0 %	0 %	406705638
37	NC_018643	GTGGG	2	10	41500	41509	0 %	20 %	80 %	0 %	406705638
38	NC_018643	TAAAA	2	10	41817	41826	80 %	20 %	0 %	0 %	406705638
39	NC_018643	TAATT	2	10	42527	42536	40 %	60 %	0 %	0 %	406705639
40	NC_018643	TAAAT	2	10	43544	43553	60 %	40 %	0 %	0 %	406705640
41	NC_018643	ATTTT	2	10	43555	43564	20 %	80 %	0 %	0 %	406705640
42	NC_018643	CATAA	2	10	43885	43894	60 %	20 %	0 %	20 %	406705640
43	NC_018643	TGATA	2	10	44190	44199	40 %	40 %	20 %	0 %	406705640
44	NC_018643	CTTTT	2	10	44416	44425	0 %	80 %	0 %	20 %	406705641
45	NC_018643	TAAAA	2	10	44590	44599	80 %	20 %	0 %	0 %	406705641
46	NC_018643	TTTGA	2	10	44859	44868	20 %	60 %	20 %	0 %	406705641
47	NC_018643	TTTTA	2	10	44951	44960	20 %	80 %	0 %	0 %	406705641
48	NC_018643	TCCAC	2	10	45951	45960	20 %	20 %	0 %	60 %	406705642
49	NC_018643	TTAAA	2	10	47004	47013	60 %	40 %	0 %	0 %	406705643
50	NC_018643	AAAAT	2	10	47061	47070	80 %	20 %	0 %	0 %	406705643
51	NC_018643	AAAAT	2	10	47802	47811	80 %	20 %	0 %	0 %	406705643
52	NC_018643	CCAAA	2	10	48262	48271	60 %	0 %	0 %	40 %	406705644
53	NC_018643	GAAAA	2	10	49394	49403	80 %	0 %	20 %	0 %	406705644
54	NC_018643	GGTTT	2	10	49774	49783	0 %	60 %	40 %	0 %	406705645
55	NC_018643	AAACT	2	10	50095	50104	60 %	20 %	0 %	20 %	406705645
56	NC_018643	AAAAT	2	10	50230	50239	80 %	20 %	0 %	0 %	406705645
57	NC_018643	CATTT	2	10	51391	51400	20 %	60 %	0 %	20 %	406705647
58	NC_018643	GTTTT	2	10	51764	51773	0 %	80 %	20 %	0 %	406705648
59	NC_018643	ATGAT	2	10	51897	51906	40 %	40 %	20 %	0 %	406705648
60	NC_018643	AACCA	2	10	52808	52817	60 %	0 %	0 %	40 %	406705649
61	NC_018643	ATATT	2	10	53175	53184	40 %	60 %	0 %	0 %	406705649
62	NC_018643	TAAAT	2	10	53513	53522	60 %	40 %	0 %	0 %	406705650
63	NC_018643	AAAGG	2	10	53619	53628	60 %	0 %	40 %	0 %	406705650
64	NC_018643	CTAAC	2	10	54129	54138	40 %	20 %	0 %	40 %	406705650
65	NC_018643	AGTAA	2	10	55611	55620	60 %	20 %	20 %	0 %	406705652
66	NC_018643	TTATT	2	10	55902	55911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018643	AAAAC	2	10	56679	56688	80 %	0 %	0 %	20 %	406705653
68	NC_018643	ATTCA	2	10	56915	56924	40 %	40 %	0 %	20 %	406705653
69	NC_018643	TATAA	2	10	58456	58465	60 %	40 %	0 %	0 %	406705653
70	NC_018643	AAAAG	2	10	60274	60283	80 %	0 %	20 %	0 %	406705655
71	NC_018643	AAGTT	2	10	62768	62777	40 %	40 %	20 %	0 %	406705657
72	NC_018643	AATTA	2	10	64728	64737	60 %	40 %	0 %	0 %	406705660
73	NC_018643	TTCAT	2	10	64861	64870	20 %	60 %	0 %	20 %	406705660
74	NC_018643	ATTTG	2	10	66479	66488	20 %	60 %	20 %	0 %	406705663
75	NC_018643	CAATA	2	10	66625	66634	60 %	20 %	0 %	20 %	406705663
76	NC_018643	ACATT	2	10	66789	66798	40 %	40 %	0 %	20 %	406705663
77	NC_018643	TCTGA	2	10	66956	66965	20 %	40 %	20 %	20 %	406705663
78	NC_018643	ATTCT	2	10	67185	67194	20 %	60 %	0 %	20 %	406705663
79	NC_018643	GCAAT	2	10	68190	68199	40 %	20 %	20 %	20 %	406705663
80	NC_018643	TTTTA	2	10	69319	69328	20 %	80 %	0 %	0 %	406705664
81	NC_018643	ATTTT	2	10	70606	70615	20 %	80 %	0 %	0 %	406705665
82	NC_018643	ATGTC	2	10	70663	70672	20 %	40 %	20 %	20 %	406705665
83	NC_018643	AAGAT	2	10	72396	72405	60 %	20 %	20 %	0 %	406705668
84	NC_018643	CAATA	2	10	72966	72975	60 %	20 %	0 %	20 %	406705668
85	NC_018643	CATTC	2	10	74961	74970	20 %	40 %	0 %	40 %	406705672
86	NC_018643	TTTAT	2	10	76214	76223	20 %	80 %	0 %	0 %	406705673
87	NC_018643	TTGTT	2	10	76739	76748	0 %	80 %	20 %	0 %	406705674
88	NC_018643	TATTC	2	10	77864	77873	20 %	60 %	0 %	20 %	406705675
89	NC_018643	TAATT	2	10	78916	78925	40 %	60 %	0 %	0 %	406705675
90	NC_018643	TATTT	2	10	79308	79317	20 %	80 %	0 %	0 %	406705676
91	NC_018643	ATCTT	2	10	79720	79729	20 %	60 %	0 %	20 %	406705677
92	NC_018643	AATTA	2	10	80400	80409	60 %	40 %	0 %	0 %	406705677
93	NC_018643	TTACA	2	10	81713	81722	40 %	40 %	0 %	20 %	406705679
94	NC_018643	TAAAA	2	10	82989	82998	80 %	20 %	0 %	0 %	406705680
95	NC_018643	ATTTT	2	10	84033	84042	20 %	80 %	0 %	0 %	406705681
96	NC_018643	GGTTT	2	10	84902	84911	0 %	60 %	40 %	0 %	406705683
97	NC_018643	ATGAT	2	10	86021	86030	40 %	40 %	20 %	0 %	406705683
98	NC_018643	AATTT	2	10	87902	87911	40 %	60 %	0 %	0 %	406705685
99	NC_018643	ATAAA	2	10	87981	87990	80 %	20 %	0 %	0 %	406705685
100	NC_018643	TAAAA	2	10	88309	88318	80 %	20 %	0 %	0 %	406705685
101	NC_018643	AATAA	2	10	88415	88424	80 %	20 %	0 %	0 %	406705685
102	NC_018643	ATTTG	2	10	88930	88939	20 %	60 %	20 %	0 %	406705686
103	NC_018643	TCACC	2	10	88991	89000	20 %	20 %	0 %	60 %	406705686
104	NC_018643	CTTCT	2	10	90496	90505	0 %	60 %	0 %	40 %	406705688
105	NC_018643	GTTTT	2	10	91018	91027	0 %	80 %	20 %	0 %	406705688
106	NC_018643	TAAGT	2	10	94131	94140	40 %	40 %	20 %	0 %	406705691
107	NC_018643	TTAAA	2	10	95291	95300	60 %	40 %	0 %	0 %	406705692
108	NC_018643	GAAAA	2	10	95660	95669	80 %	0 %	20 %	0 %	406705692
109	NC_018643	GAAAA	2	10	95871	95880	80 %	0 %	20 %	0 %	406705693
110	NC_018643	ATTTA	2	10	96601	96610	40 %	60 %	0 %	0 %	406705693
111	NC_018643	ACCAG	2	10	97115	97124	40 %	0 %	20 %	40 %	406705693
112	NC_018643	TTTTA	2	10	98709	98718	20 %	80 %	0 %	0 %	406705694
113	NC_018643	AGTTT	2	10	99333	99342	20 %	60 %	20 %	0 %	406705696
114	NC_018643	TAAAA	2	10	99566	99575	80 %	20 %	0 %	0 %	406705696
115	NC_018643	TAATT	2	10	99839	99848	40 %	60 %	0 %	0 %	406705696
116	NC_018643	CAAAA	2	10	99912	99921	80 %	0 %	0 %	20 %	406705696
117	NC_018643	AATTA	2	10	100568	100577	60 %	40 %	0 %	0 %	406705697
118	NC_018643	GTTTA	2	10	100640	100649	20 %	60 %	20 %	0 %	406705697
119	NC_018643	TATAT	2	10	101896	101905	40 %	60 %	0 %	0 %	406705698
120	NC_018643	AGAAA	2	10	103372	103381	80 %	0 %	20 %	0 %	406705701
121	NC_018643	GTTTT	2	10	104279	104288	0 %	80 %	20 %	0 %	406705702
122	NC_018643	ATTTT	2	10	105688	105697	20 %	80 %	0 %	0 %	406705704
123	NC_018643	TCTGT	2	10	106655	106664	0 %	60 %	20 %	20 %	406705704
124	NC_018643	GGGTG	2	10	110184	110193	0 %	20 %	80 %	0 %	406705708
125	NC_018643	AACTT	2	10	111745	111754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018643	CAAAT	2	10	111953	111962	60 %	20 %	0 %	20 %	406705712
127	NC_018643	TTTTG	2	10	116070	116079	0 %	80 %	20 %	0 %	406705717
128	NC_018643	ATTTA	2	10	117869	117878	40 %	60 %	0 %	0 %	406705719
129	NC_018643	ATAAA	2	10	118415	118424	80 %	20 %	0 %	0 %	406705720
130	NC_018643	ACTTT	2	10	121455	121464	20 %	60 %	0 %	20 %	406705724
131	NC_018643	CCAAA	2	10	122339	122348	60 %	0 %	0 %	40 %	406705725
132	NC_018643	AATGA	2	10	122440	122449	60 %	20 %	20 %	0 %	406705725
133	NC_018643	AATTT	2	10	124723	124732	40 %	60 %	0 %	0 %	406705727
134	NC_018643	AATTT	2	10	126162	126171	40 %	60 %	0 %	0 %	406705728
135	NC_018643	TATTT	2	10	126711	126720	20 %	80 %	0 %	0 %	406705729
136	NC_018643	TTAAG	2	10	127587	127596	40 %	40 %	20 %	0 %	406705730
137	NC_018643	CTTTT	2	10	129805	129814	0 %	80 %	0 %	20 %	406705734
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