MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 19299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_018643	TGT	2	6	1286460	1286465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706965
18503	NC_018643	GAA	2	6	1286468	1286473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706965
18504	NC_018643	TCT	2	6	1286524	1286529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706965
18505	NC_018643	TTC	2	6	1286538	1286543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706965
18506	NC_018643	TCA	2	6	1286578	1286583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706965
18507	NC_018643	CTT	2	6	1286665	1286670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706965
18508	NC_018643	TCA	2	6	1286725	1286730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706965
18509	NC_018643	CTG	2	6	1286783	1286788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706965
18510	NC_018643	CCA	2	6	1286794	1286799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706965
18511	NC_018643	GCT	2	6	1286926	1286931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706965
18512	NC_018643	GTT	2	6	1286951	1286956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706965
18513	NC_018643	AAT	2	6	1287000	1287005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706965
18514	NC_018643	ATT	3	9	1287180	1287188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706965
18515	NC_018643	TGA	2	6	1287330	1287335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706965
18516	NC_018643	TTA	2	6	1287343	1287348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706965
18517	NC_018643	CTT	2	6	1287660	1287665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706966
18518	NC_018643	GTT	2	6	1287751	1287756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706966
18519	NC_018643	TTG	2	6	1287814	1287819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706966
18520	NC_018643	TAA	2	6	1287850	1287855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706966
18521	NC_018643	AAT	2	6	1287858	1287863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706966
18522	NC_018643	TTC	2	6	1287968	1287973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706967
18523	NC_018643	ATT	2	6	1288045	1288050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706967
18524	NC_018643	ATT	2	6	1288118	1288123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706967
18525	NC_018643	TGA	2	6	1288173	1288178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706967
18526	NC_018643	ATA	2	6	1288238	1288243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18527	NC_018643	ATT	2	6	1288322	1288327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706967
18528	NC_018643	GCC	2	6	1288330	1288335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406706967
18529	NC_018643	CAC	2	6	1288643	1288648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706967
18530	NC_018643	GTA	2	6	1288697	1288702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706967
18531	NC_018643	TAA	2	6	1288752	1288757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18532	NC_018643	CAG	2	6	1288793	1288798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706967
18533	NC_018643	TGA	2	6	1288908	1288913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706967
18534	NC_018643	AAT	2	6	1288926	1288931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18535	NC_018643	TTC	2	6	1289066	1289071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706967
18536	NC_018643	TAA	2	6	1289162	1289167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18537	NC_018643	AGA	2	6	1289169	1289174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706967
18538	NC_018643	TGT	2	6	1289308	1289313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706967
18539	NC_018643	TCA	2	6	1289322	1289327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706967
18540	NC_018643	ATT	2	6	1289341	1289346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706967
18541	NC_018643	ATA	2	6	1289408	1289413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18542	NC_018643	TCT	2	6	1289649	1289654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706967
18543	NC_018643	TAA	2	6	1289678	1289683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18544	NC_018643	AAT	2	6	1289695	1289700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18545	NC_018643	TGC	2	6	1289709	1289714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706967
18546	NC_018643	AAT	2	6	1289770	1289775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18547	NC_018643	TAA	2	6	1289865	1289870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706967
18548	NC_018643	AGC	2	6	1289950	1289955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18549	NC_018643	GCA	2	6	1290017	1290022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18550	NC_018643	CAC	2	6	1290027	1290032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706968
18551	NC_018643	ATT	2	6	1290092	1290097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706968
18552	NC_018643	TGC	2	6	1290112	1290117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18553	NC_018643	ACC	2	6	1290121	1290126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706968
18554	NC_018643	TCA	2	6	1290173	1290178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706968
18555	NC_018643	ACC	2	6	1290322	1290327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706968
18556	NC_018643	ACC	2	6	1290400	1290405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706968
18557	NC_018643	CAT	2	6	1290459	1290464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706968
18558	NC_018643	ACC	2	6	1290526	1290531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706968
18559	NC_018643	CTG	2	6	1290696	1290701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18560	NC_018643	GCT	2	6	1290794	1290799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18561	NC_018643	ATA	2	6	1290861	1290866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706968
18562	NC_018643	TGC	2	6	1290901	1290906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706968
18563	NC_018643	ATT	2	6	1290941	1290946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706968
18564	NC_018643	TTA	2	6	1290969	1290974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_018643	ATT	2	6	1291029	1291034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706969
18566	NC_018643	TTA	2	6	1291224	1291229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706969
18567	NC_018643	ATA	2	6	1291351	1291356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706969
18568	NC_018643	CGT	2	6	1291396	1291401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706969
18569	NC_018643	AGA	2	6	1291407	1291412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706969
18570	NC_018643	ATG	2	6	1291507	1291512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706969
18571	NC_018643	TAG	2	6	1291556	1291561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706969
18572	NC_018643	TAT	2	6	1291613	1291618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706969
18573	NC_018643	GAT	2	6	1291638	1291643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706969
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