MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	ACTT	2	8	148	155	25 %	50 %	0 %	25 %	387125795
2	NC_017848	CTAT	2	8	720	727	25 %	50 %	0 %	25 %	387125795
3	NC_017848	TGAT	2	8	800	807	25 %	50 %	25 %	0 %	387125795
4	NC_017848	AAAT	2	8	826	833	75 %	25 %	0 %	0 %	387125795
5	NC_017848	TGTT	2	8	1261	1268	0 %	75 %	25 %	0 %	387125796
6	NC_017848	TATT	2	8	1524	1531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017848	AAAG	2	8	1583	1590	75 %	0 %	25 %	0 %	387125797
8	NC_017848	ATAG	2	8	2358	2365	50 %	25 %	25 %	0 %	387125798
9	NC_017848	ATCT	2	8	2499	2506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017848	TTTC	2	8	2963	2970	0 %	75 %	0 %	25 %	387125799
11	NC_017848	AATT	2	8	3396	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	387125800
12	NC_017848	TAAT	2	8	3699	3706	50 %	50 %	0 %	0 %	387125800
13	NC_017848	GAAT	2	8	3890	3897	50 %	25 %	25 %	0 %	387125800
14	NC_017848	CAAT	2	8	4080	4087	50 %	25 %	0 %	25 %	387125800
15	NC_017848	CGGT	2	8	4096	4103	0 %	25 %	50 %	25 %	387125800
16	NC_017848	ATAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	387125800
17	NC_017848	CTTT	2	8	4307	4314	0 %	75 %	0 %	25 %	387125800
18	NC_017848	ATTT	2	8	5107	5114	25 %	75 %	0 %	0 %	387125801
19	NC_017848	TTGA	2	8	5232	5239	25 %	50 %	25 %	0 %	387125801
20	NC_017848	TATC	2	8	5284	5291	25 %	50 %	0 %	25 %	387125801
21	NC_017848	GGTT	2	8	5604	5611	0 %	50 %	50 %	0 %	387125802
22	NC_017848	ATAA	2	8	5673	5680	75 %	25 %	0 %	0 %	387125802
23	NC_017848	AAAT	2	8	5846	5853	75 %	25 %	0 %	0 %	387125802
24	NC_017848	TTGA	2	8	6320	6327	25 %	50 %	25 %	0 %	387125803
25	NC_017848	CTTT	2	8	6647	6654	0 %	75 %	0 %	25 %	387125803
26	NC_017848	AAAT	2	8	6932	6939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017848	CTTT	2	8	7706	7713	0 %	75 %	0 %	25 %	387125806
28	NC_017848	TAAA	2	8	8088	8095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017848	TCTT	2	8	8201	8208	0 %	75 %	0 %	25 %	387125807
30	NC_017848	TAAT	2	8	8562	8569	50 %	50 %	0 %	0 %	387125807
31	NC_017848	ATCA	2	8	9322	9329	50 %	25 %	0 %	25 %	387125809
32	NC_017848	CTTT	2	8	9406	9413	0 %	75 %	0 %	25 %	387125809
33	NC_017848	ATTG	2	8	9431	9438	25 %	50 %	25 %	0 %	387125809
34	NC_017848	TGTA	2	8	9509	9516	25 %	50 %	25 %	0 %	387125810
35	NC_017848	CTTT	2	8	9612	9619	0 %	75 %	0 %	25 %	387125810
36	NC_017848	ATCT	2	8	9646	9653	25 %	50 %	0 %	25 %	387125810
37	NC_017848	CAAA	2	8	9747	9754	75 %	0 %	0 %	25 %	387125810
38	NC_017848	ATCA	2	8	10994	11001	50 %	25 %	0 %	25 %	387125813
39	NC_017848	TAGT	2	8	11178	11185	25 %	50 %	25 %	0 %	387125814
40	NC_017848	CAAG	2	8	11306	11313	50 %	0 %	25 %	25 %	387125814
41	NC_017848	AGAA	2	8	11395	11402	75 %	0 %	25 %	0 %	387125814
42	NC_017848	AATG	2	8	11807	11814	50 %	25 %	25 %	0 %	387125815
43	NC_017848	ACTT	2	8	11900	11907	25 %	50 %	0 %	25 %	387125815
44	NC_017848	AAAT	2	8	12362	12369	75 %	25 %	0 %	0 %	387125815
45	NC_017848	TTTC	2	8	12699	12706	0 %	75 %	0 %	25 %	387125815
46	NC_017848	TTCA	2	8	12867	12874	25 %	50 %	0 %	25 %	387125816
47	NC_017848	TTCT	2	8	12939	12946	0 %	75 %	0 %	25 %	387125816
48	NC_017848	AATT	2	8	13005	13012	50 %	50 %	0 %	0 %	387125816
49	NC_017848	GATT	2	8	13491	13498	25 %	50 %	25 %	0 %	387125816
50	NC_017848	TACT	2	8	14079	14086	25 %	50 %	0 %	25 %	387125818
51	NC_017848	TTCA	2	8	14102	14109	25 %	50 %	0 %	25 %	387125818
52	NC_017848	TCAA	2	8	14163	14170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017848	ATAA	2	8	14241	14248	75 %	25 %	0 %	0 %	387125819
54	NC_017848	TTGC	2	8	15397	15404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017848	TCAA	2	8	15560	15567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017848	ATTT	2	8	15626	15633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017848	TGCT	2	8	15870	15877	0 %	50 %	25 %	25 %	387125820
58	NC_017848	AATG	2	8	16378	16385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017848	ACCG	2	8	16515	16522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017848	TCTT	2	8	16579	16586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017848	TTAT	2	8	16915	16922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017848	ATTT	2	8	17039	17046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017848	AATC	2	8	17374	17381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017848	ATAG	2	8	17865	17872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017848	ATCT	2	8	18006	18013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017848	ATTG	2	8	18900	18907	25 %	50 %	25 %	0 %	387125823
67	NC_017848	AAAT	2	8	19120	19127	75 %	25 %	0 %	0 %	387125823
68	NC_017848	TCTT	2	8	19138	19145	0 %	75 %	0 %	25 %	387125823
69	NC_017848	ATTG	2	8	19389	19396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017848	ATTG	3	12	21408	21419	25 %	50 %	25 %	0 %	387125825
71	NC_017848	ACAT	2	8	22279	22286	50 %	25 %	0 %	25 %	387125825
72	NC_017848	TACC	2	8	22763	22770	25 %	25 %	0 %	50 %	387125825
73	NC_017848	ATTG	2	8	23087	23094	25 %	50 %	25 %	0 %	387125826
74	NC_017848	AATT	2	8	23356	23363	50 %	50 %	0 %	0 %	387125826
75	NC_017848	TTTA	2	8	24196	24203	25 %	75 %	0 %	0 %	387125826
76	NC_017848	ATAA	2	8	24305	24312	75 %	25 %	0 %	0 %	387125826
77	NC_017848	TTCA	2	8	24400	24407	25 %	50 %	0 %	25 %	387125826
78	NC_017848	AGAT	2	8	24438	24445	50 %	25 %	25 %	0 %	387125826
79	NC_017848	TTCG	2	8	24561	24568	0 %	50 %	25 %	25 %	387125827
80	NC_017848	ATTT	2	8	25113	25120	25 %	75 %	0 %	0 %	387125827
81	NC_017848	GAAG	2	8	26711	26718	50 %	0 %	50 %	0 %	387125828
82	NC_017848	GTTT	2	8	27002	27009	0 %	75 %	25 %	0 %	387125828
83	NC_017848	ACTG	2	8	27064	27071	25 %	25 %	25 %	25 %	387125828
84	NC_017848	AACT	2	8	27245	27252	50 %	25 %	0 %	25 %	387125828
85	NC_017848	TCTT	2	8	27642	27649	0 %	75 %	0 %	25 %	387125828
86	NC_017848	TTTA	2	8	27686	27693	25 %	75 %	0 %	0 %	387125828
87	NC_017848	TCGT	2	8	27726	27733	0 %	50 %	25 %	25 %	387125828
88	NC_017848	AAAG	2	8	28019	28026	75 %	0 %	25 %	0 %	387125829
89	NC_017848	TGCA	2	8	28081	28088	25 %	25 %	25 %	25 %	387125829
90	NC_017848	GAAA	2	8	28660	28667	75 %	0 %	25 %	0 %	387125829
91	NC_017848	CAAT	2	8	28714	28721	50 %	25 %	0 %	25 %	387125830
92	NC_017848	TTTC	2	8	28759	28766	0 %	75 %	0 %	25 %	387125830
93	NC_017848	TTTG	2	8	28874	28881	0 %	75 %	25 %	0 %	387125830
94	NC_017848	TGTT	2	8	31110	31117	0 %	75 %	25 %	0 %	387125833
95	NC_017848	TCTA	2	8	31311	31318	25 %	50 %	0 %	25 %	387125833
96	NC_017848	CAAA	2	8	31897	31904	75 %	0 %	0 %	25 %	387125834
97	NC_017848	CCAA	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	387125834
98	NC_017848	TTCG	2	8	32335	32342	0 %	50 %	25 %	25 %	387125834
99	NC_017848	CGAC	2	8	32400	32407	25 %	0 %	25 %	50 %	387125834
100	NC_017848	ATTA	2	8	32780	32787	50 %	50 %	0 %	0 %	387125834
101	NC_017848	AATG	2	8	33032	33039	50 %	25 %	25 %	0 %	387125834
102	NC_017848	ATAC	2	8	33926	33933	50 %	25 %	0 %	25 %	387125834
103	NC_017848	TTTG	2	8	34033	34040	0 %	75 %	25 %	0 %	387125834
104	NC_017848	CATT	2	8	34054	34061	25 %	50 %	0 %	25 %	387125834
105	NC_017848	AGGT	2	8	34533	34540	25 %	25 %	50 %	0 %	387125835
106	NC_017848	TGAT	2	8	34931	34938	25 %	50 %	25 %	0 %	387125836
107	NC_017848	ATTG	2	8	35031	35038	25 %	50 %	25 %	0 %	387125836
108	NC_017848	GATA	2	8	35420	35427	50 %	25 %	25 %	0 %	387125836
109	NC_017848	ACTA	2	8	35800	35807	50 %	25 %	0 %	25 %	387125837
110	NC_017848	CGAA	2	8	36092	36099	50 %	0 %	25 %	25 %	387125837
111	NC_017848	TCAT	2	8	36230	36237	25 %	50 %	0 %	25 %	387125837
112	NC_017848	TGTT	2	8	36329	36336	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
113	NC_017848	TTCA	2	8	36448	36455	25 %	50 %	0 %	25 %	387125837
114	NC_017848	ATAA	2	8	36656	36663	75 %	25 %	0 %	0 %	387125837
115	NC_017848	TTTG	2	8	36728	36735	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
116	NC_017848	GTTT	2	8	36745	36752	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
117	NC_017848	AGGT	2	8	37602	37609	25 %	25 %	50 %	0 %	387125839
118	NC_017848	CAAA	2	8	38291	38298	75 %	0 %	0 %	25 %	387125840
119	NC_017848	GAAC	2	8	38853	38860	50 %	0 %	25 %	25 %	387125842
120	NC_017848	TTCA	2	8	38920	38927	25 %	50 %	0 %	25 %	387125842
121	NC_017848	AGCA	2	8	39293	39300	50 %	0 %	25 %	25 %	387125843
122	NC_017848	AAAT	2	8	39335	39342	75 %	25 %	0 %	0 %	387125843
123	NC_017848	CTTT	2	8	39595	39602	0 %	75 %	0 %	25 %	387125843
124	NC_017848	ACAG	2	8	39701	39708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017848	TTAC	2	8	39736	39743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017848	TTAT	2	8	39812	39819	25 %	75 %	0 %	0 %	387125844
127	NC_017848	TGAA	2	8	39947	39954	50 %	25 %	25 %	0 %	387125845
128	NC_017848	TTTC	2	8	40271	40278	0 %	75 %	0 %	25 %	387125846
129	NC_017848	CTAA	2	8	40759	40766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017848	ATTA	2	8	40849	40856	50 %	50 %	0 %	0 %	387125847
131	NC_017848	TGAA	2	8	41853	41860	50 %	25 %	25 %	0 %	387125849
132	NC_017848	ATTA	2	8	42453	42460	50 %	50 %	0 %	0 %	387125849
133	NC_017848	GTAT	2	8	42537	42544	25 %	50 %	25 %	0 %	387125850
134	NC_017848	GATT	2	8	42921	42928	25 %	50 %	25 %	0 %	387125851
135	NC_017848	ACAT	2	8	43205	43212	50 %	25 %	0 %	25 %	387125852
136	NC_017848	AATT	2	8	44142	44149	50 %	50 %	0 %	0 %	387125854
137	NC_017848	TTTA	2	8	44274	44281	25 %	75 %	0 %	0 %	387125854
138	NC_017848	TATG	2	8	44578	44585	25 %	50 %	25 %	0 %	387125855
139	NC_017848	ATTG	2	8	44976	44983	25 %	50 %	25 %	0 %	387125856
140	NC_017848	CTTA	2	8	45103	45110	25 %	50 %	0 %	25 %	387125856
141	NC_017848	CATT	2	8	45344	45351	25 %	50 %	0 %	25 %	387125856
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.