MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 266867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017803	CG	3	6	31	36	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
2	NC_017803	CG	3	6	47	52	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
3	NC_017803	CGG	2	6	75	80	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845070
4	NC_017803	GTCG	2	8	162	169	0 %	25 %	50 %	25 %	386845070
5	NC_017803	CGCC	2	8	182	189	0 %	0 %	25 %	75 %	386845070
6	NC_017803	CTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
7	NC_017803	CCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845070
8	NC_017803	CG	3	6	285	290	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
9	NC_017803	GAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
10	NC_017803	TCA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845070
11	NC_017803	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
12	NC_017803	CTG	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
13	NC_017803	CGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
14	NC_017803	AGG	2	6	443	448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
15	NC_017803	TTC	2	6	451	456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845070
16	NC_017803	CGC	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
17	NC_017803	GCC	2	6	588	593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
18	NC_017803	AGA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845070
19	NC_017803	GCC	2	6	631	636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
20	NC_017803	CGA	2	6	657	662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
21	NC_017803	GC	3	6	716	721	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
22	NC_017803	GAG	2	6	781	786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
23	NC_017803	TGC	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
24	NC_017803	GCCGG	2	10	814	823	0 %	0 %	60 %	40 %	386845070
25	NC_017803	CCG	2	6	830	835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
26	NC_017803	ACT	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845070
27	NC_017803	GGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
28	NC_017803	CG	3	6	921	926	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
29	NC_017803	GACC	2	8	957	964	25 %	0 %	25 %	50 %	386845070
30	NC_017803	CGG	2	6	993	998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845070
31	NC_017803	ACCAC	2	10	1004	1013	40 %	0 %	0 %	60 %	386845070
32	NC_017803	CGCT	2	8	1060	1067	0 %	25 %	25 %	50 %	386845070
33	NC_017803	GGC	2	6	1136	1141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017803	GCCG	2	8	1184	1191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017803	AGC	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017803	CCG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017803	GCC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017803	CCT	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017803	CCG	2	6	1414	1419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017803	CAG	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017803	CT	3	6	1723	1728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017803	GACA	2	8	1797	1804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017803	GGA	2	6	1835	1840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017803	CCG	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017803	CT	3	6	2040	2045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017803	GAC	2	6	2093	2098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017803	TC	3	6	2105	2110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017803	ATC	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017803	GTGC	2	8	2149	2156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017803	CCG	2	6	2219	2224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017803	ATC	2	6	2267	2272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017803	GC	4	8	2305	2312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017803	GGA	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017803	CTCG	2	8	2478	2485	0 %	25 %	25 %	50 %	386845071
55	NC_017803	GCCG	2	8	2522	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
56	NC_017803	CTG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
57	NC_017803	CGGC	2	8	2571	2578	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
58	NC_017803	CCAG	2	8	2609	2616	25 %	0 %	25 %	50 %	386845071
59	NC_017803	TCGG	2	8	2722	2729	0 %	25 %	50 %	25 %	386845071
60	NC_017803	GGA	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845071
61	NC_017803	CGC	2	6	2838	2843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
62	NC_017803	CGC	2	6	2877	2882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
63	NC_017803	GAT	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845071
64	NC_017803	CCA	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
65	NC_017803	ACCG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	386845071
66	NC_017803	GAC	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845071
67	NC_017803	GCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845071
68	NC_017803	CCCTGG	2	12	3095	3106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386845071
69	NC_017803	CGC	2	6	3154	3159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
70	NC_017803	ACC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
71	NC_017803	GCC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
72	NC_017803	CCG	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
73	NC_017803	CGCT	2	8	3202	3209	0 %	25 %	25 %	50 %	386845071
74	NC_017803	CGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
75	NC_017803	GTC	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
76	NC_017803	CAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
77	NC_017803	TGC	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
78	NC_017803	GTC	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
79	NC_017803	CAC	2	6	3351	3356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
80	NC_017803	GAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845071
81	NC_017803	GC	3	6	3461	3466	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
82	NC_017803	TCGT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	386845071
83	NC_017803	ATC	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845071
84	NC_017803	TGC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
85	NC_017803	GTC	2	6	3703	3708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
86	NC_017803	CCA	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845072
87	NC_017803	CGC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845072
88	NC_017803	GTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845072
89	NC_017803	TCA	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845072
90	NC_017803	CGG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
91	NC_017803	CGA	2	6	3897	3902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
92	NC_017803	CGG	2	6	3963	3968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
93	NC_017803	CGG	2	6	4005	4010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
94	NC_017803	GCCG	2	8	4059	4066	0 %	0 %	50 %	50 %	386845072
95	NC_017803	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
96	NC_017803	ATC	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845072
97	NC_017803	CGT	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
98	NC_017803	GCT	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
99	NC_017803	CTG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
100	NC_017803	CGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
101	NC_017803	GAC	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
102	NC_017803	CGA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
103	NC_017803	GAC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
104	NC_017803	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
105	NC_017803	CGG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
106	NC_017803	TCG	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
107	NC_017803	GGT	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845073
108	NC_017803	GCT	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
109	NC_017803	GGGC	2	8	4771	4778	0 %	0 %	75 %	25 %	386845073
110	NC_017803	GGA	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845073
111	NC_017803	GAC	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
112	NC_017803	CTG	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
113	NC_017803	CGCC	2	8	4926	4933	0 %	0 %	25 %	75 %	386845073
114	NC_017803	GC	3	6	4953	4958	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
115	NC_017803	AGC	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
116	NC_017803	CTG	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
117	NC_017803	CGG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
118	NC_017803	GCT	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
119	NC_017803	GGC	2	6	5121	5126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
120	NC_017803	ACG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
121	NC_017803	CGGC	2	8	5168	5175	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
122	NC_017803	CGG	2	6	5180	5185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
123	NC_017803	GCTGC	2	10	5248	5257	0 %	20 %	40 %	40 %	386845073
124	NC_017803	GCCG	3	12	5276	5287	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
125	NC_017803	CAC	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845073
126	NC_017803	CGA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
127	NC_017803	GGC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
128	NC_017803	CTG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
129	NC_017803	CGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
130	NC_017803	GCCG	2	8	5491	5498	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
131	NC_017803	GCT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
132	NC_017803	GCCG	2	8	5571	5578	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
133	NC_017803	CTCGG	2	10	5608	5617	0 %	20 %	40 %	40 %	386845073
134	NC_017803	CA	3	6	5636	5641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017803	CCG	2	6	5699	5704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017803	G	6	6	5763	5768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017803	CTG	3	9	5797	5805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845074
138	NC_017803	GCC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845074
139	NC_017803	CGTGC	2	10	5835	5844	0 %	20 %	40 %	40 %	386845074
140	NC_017803	CGG	2	6	5865	5870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
141	NC_017803	CGG	3	9	5900	5908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
142	NC_017803	CG	3	6	5953	5958	0 %	0 %	50 %	50 %	386845074
143	NC_017803	TGC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845074
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161	NC_017803	CGG	2	6	6523	6528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845075
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240	NC_017803	GCT	2	6	9871	9876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_017803	TGAC	2	8	9981	9988	25 %	25 %	25 %	25 %	386845078
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264	NC_017803	ACCGG	2	10	10740	10749	20 %	0 %	40 %	40 %	386845078
265	NC_017803	GC	3	6	10768	10773	0 %	0 %	50 %	50 %	386845078
266	NC_017803	GGTCGA	2	12	10777	10788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386845078
267	NC_017803	GGA	2	6	10789	10794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845078
268	NC_017803	GGCC	2	8	10802	10809	0 %	0 %	50 %	50 %	386845078
269	NC_017803	AGG	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845078
270	NC_017803	TCC	2	6	10925	10930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845078
271	NC_017803	GGT	2	6	10984	10989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845078
272	NC_017803	CAA	2	6	10993	10998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845078
273	NC_017803	CTA	2	6	11098	11103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845078
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277	NC_017803	CGA	2	6	11212	11217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845078
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290	NC_017803	GCG	2	6	11625	11630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845078
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301	NC_017803	TGG	2	6	11985	11990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845078
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388	NC_017803	AGCCG	2	10	15272	15281	20 %	0 %	40 %	40 %	386845083
389	NC_017803	AGC	2	6	15298	15303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845083
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391	NC_017803	CTC	2	6	15318	15323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845083
392	NC_017803	CAGCAC	2	12	15336	15347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386845083
393	NC_017803	GC	3	6	15385	15390	0 %	0 %	50 %	50 %	386845083
394	NC_017803	TCG	2	6	15397	15402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845083
395	NC_017803	GGC	2	6	15412	15417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845083
396	NC_017803	GCA	2	6	15467	15472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845083
397	NC_017803	CGA	2	6	15497	15502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845083
398	NC_017803	GCA	3	9	15545	15553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845083
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400	NC_017803	CGT	2	6	15712	15717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845084
401	NC_017803	CCG	2	6	15738	15743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845084
402	NC_017803	GCT	2	6	15745	15750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845084
403	NC_017803	CAC	2	6	15755	15760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845084
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432	NC_017803	GCGG	2	8	16530	16537	0 %	0 %	75 %	25 %	386845084
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443	NC_017803	CAG	2	6	16772	16777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845084
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448	NC_017803	CGG	2	6	17002	17007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845085
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464	NC_017803	GGC	2	6	17493	17498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_017803	GCTG	2	8	17515	17522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_017803	CGG	2	6	17523	17528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_017803	GGC	2	6	17532	17537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_017803	CGG	2	6	17591	17596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017803	CT	3	6	17598	17603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_017803	GGC	2	6	17605	17610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_017803	TCG	2	6	18075	18080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845086
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490	NC_017803	CGAA	2	8	18258	18265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_017803	GCC	3	9	18271	18279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
492	NC_017803	GGC	2	6	18337	18342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845087
493	NC_017803	GTG	2	6	18345	18350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845087
494	NC_017803	GCG	2	6	18362	18367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845087
495	NC_017803	GAG	2	6	18391	18396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845087
496	NC_017803	GCG	2	6	18402	18407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845087
497	NC_017803	GAG	2	6	18418	18423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845087
498	NC_017803	TGG	2	6	18431	18436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845087
499	NC_017803	CGA	2	6	18534	18539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845087
500	NC_017803	TGCCGG	2	12	18575	18586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386845087

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